MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 56021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_017482	CCACG	2	10	2304717	2304726	20 %	0 %	20 %	60 %	385828872
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43004	NC_017482	ATT	2	6	2304802	2304807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43005	NC_017482	T	6	6	2304806	2304811	0 %	100 %	0 %	0 %	385828873
43006	NC_017482	ACTTC	2	10	2304866	2304875	20 %	40 %	0 %	40 %	385828873
43007	NC_017482	CAA	2	6	2304971	2304976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828873
43008	NC_017482	TTG	2	6	2305006	2305011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828873
43009	NC_017482	GCC	2	6	2305023	2305028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828873
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43011	NC_017482	T	6	6	2305112	2305117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_017482	T	6	6	2305224	2305229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43013	NC_017482	TAT	2	6	2305270	2305275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828874
43014	NC_017482	CCT	2	6	2305306	2305311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385828874
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43018	NC_017482	TGGT	2	8	2305509	2305516	0 %	50 %	50 %	0 %	385828874
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43022	NC_017482	GGC	2	6	2305700	2305705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828874
43023	NC_017482	GC	3	6	2305704	2305709	0 %	0 %	50 %	50 %	385828874
43024	NC_017482	CCT	2	6	2305720	2305725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385828874
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43029	NC_017482	AAT	2	6	2305939	2305944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43030	NC_017482	CCG	2	6	2306005	2306010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828875
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43040	NC_017482	CGG	2	6	2306365	2306370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828875
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43052	NC_017482	ATCA	2	8	2307060	2307067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43053	NC_017482	A	6	6	2307076	2307081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43054	NC_017482	T	6	6	2307123	2307128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43055	NC_017482	CGC	2	6	2307222	2307227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828876
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43102	NC_017482	TAT	2	6	2309513	2309518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43103	NC_017482	TAT	2	6	2309525	2309530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43104	NC_017482	CGC	2	6	2309562	2309567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43105	NC_017482	ACG	2	6	2309585	2309590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43109	NC_017482	CATC	2	8	2309854	2309861	25 %	25 %	0 %	50 %	385828879
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43117	NC_017482	GAT	2	6	2310242	2310247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828879
43118	NC_017482	AAGC	2	8	2310262	2310269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43119	NC_017482	TCT	2	6	2310320	2310325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43120	NC_017482	GC	3	6	2310412	2310417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43121	NC_017482	AAG	2	6	2310464	2310469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43122	NC_017482	CAA	2	6	2310496	2310501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828880
43123	NC_017482	ATT	2	6	2310528	2310533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828880
43124	NC_017482	TTG	2	6	2310578	2310583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828880
43125	NC_017482	GCT	2	6	2310609	2310614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828880
43126	NC_017482	GGTCA	2	10	2310649	2310658	20 %	20 %	40 %	20 %	385828880
43127	NC_017482	CCA	2	6	2310659	2310664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828880
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43129	NC_017482	GCT	2	6	2310829	2310834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828880
43130	NC_017482	GCA	2	6	2310867	2310872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828880
43131	NC_017482	GGT	2	6	2310982	2310987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828880
43132	NC_017482	CTG	3	9	2311015	2311023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828880
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43134	NC_017482	ATC	2	6	2311061	2311066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828880
43135	NC_017482	GTCA	2	8	2311132	2311139	25 %	25 %	25 %	25 %	385828880
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43138	NC_017482	GAA	2	6	2311288	2311293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828880
43139	NC_017482	CAC	2	6	2311341	2311346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828880
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43142	NC_017482	ACCG	2	8	2311401	2311408	25 %	0 %	25 %	50 %	385828880
43143	NC_017482	GAT	2	6	2311411	2311416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828880
43144	NC_017482	ATCGC	2	10	2311550	2311559	20 %	20 %	20 %	40 %	385828880
43145	NC_017482	TTA	2	6	2311668	2311673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828880
43146	NC_017482	CAA	2	6	2311687	2311692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828880
43147	NC_017482	GAT	2	6	2311729	2311734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828880
43148	NC_017482	GAT	2	6	2311740	2311745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828880
43149	NC_017482	TGC	2	6	2311773	2311778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828880
43150	NC_017482	CTT	2	6	2311779	2311784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828880
43151	NC_017482	GAT	2	6	2311795	2311800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828880
43152	NC_017482	CGG	2	6	2311827	2311832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828880
43153	NC_017482	CGA	2	6	2311901	2311906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828880
43154	NC_017482	AAG	2	6	2311928	2311933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828880
43155	NC_017482	ACGGT	2	10	2311961	2311970	20 %	20 %	40 %	20 %	385828880
43156	NC_017482	TTGT	2	8	2311972	2311979	0 %	75 %	25 %	0 %	385828880
43157	NC_017482	TCA	2	6	2311997	2312002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828880
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43159	NC_017482	ATCGCC	2	12	2312023	2312034	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385828880
43160	NC_017482	ACT	2	6	2312069	2312074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828880
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43170	NC_017482	CTAA	2	8	2312423	2312430	50 %	25 %	0 %	25 %	385828880
43171	NC_017482	CAA	3	9	2312497	2312505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43172	NC_017482	CTG	2	6	2312509	2312514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43173	NC_017482	T	7	7	2312528	2312534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43174	NC_017482	TGG	2	6	2312545	2312550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43175	NC_017482	AGT	2	6	2312572	2312577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828881
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43180	NC_017482	T	6	6	2312870	2312875	0 %	100 %	0 %	0 %	385828881
43181	NC_017482	ATC	2	6	2312887	2312892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43182	NC_017482	AAC	2	6	2312901	2312906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43183	NC_017482	TAAGT	2	10	2312915	2312924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43184	NC_017482	GGC	2	6	2313105	2313110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828882
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43188	NC_017482	CCA	2	6	2313259	2313264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828882
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43191	NC_017482	ATCG	2	8	2313439	2313446	25 %	25 %	25 %	25 %	385828882
43192	NC_017482	CTT	2	6	2313448	2313453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828882
43193	NC_017482	GCA	2	6	2313510	2313515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828882
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43200	NC_017482	GGTCA	2	10	2313770	2313779	20 %	20 %	40 %	20 %	385828882
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43202	NC_017482	GAC	2	6	2313844	2313849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828882
43203	NC_017482	CGC	2	6	2313868	2313873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828882
43204	NC_017482	TGA	2	6	2313882	2313887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828882
43205	NC_017482	GCT	2	6	2313965	2313970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828882
43206	NC_017482	AATT	2	8	2313983	2313990	50 %	50 %	0 %	0 %	385828882
43207	NC_017482	TGC	2	6	2313995	2314000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828882
43208	NC_017482	ATT	2	6	2314004	2314009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43209	NC_017482	GAT	2	6	2314025	2314030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43210	NC_017482	CAT	3	9	2314068	2314076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828883
43211	NC_017482	ATA	2	6	2314087	2314092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828883
43212	NC_017482	T	6	6	2314096	2314101	0 %	100 %	0 %	0 %	385828883
43213	NC_017482	TTC	2	6	2314104	2314109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828883
43214	NC_017482	CCA	2	6	2314320	2314325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828883
43215	NC_017482	AGA	2	6	2314383	2314388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828883
43216	NC_017482	TGC	2	6	2314441	2314446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828883
43217	NC_017482	TCA	2	6	2314526	2314531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828883
43218	NC_017482	CGT	2	6	2314534	2314539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828883
43219	NC_017482	CAT	2	6	2314576	2314581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828884
43220	NC_017482	GTT	2	6	2314610	2314615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828884
43221	NC_017482	AAACCG	2	12	2314657	2314668	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385828884
43222	NC_017482	AAT	2	6	2314760	2314765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828884
43223	NC_017482	GCA	2	6	2314782	2314787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828884
43224	NC_017482	CAA	2	6	2314795	2314800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828884
43225	NC_017482	CTGG	2	8	2314807	2314814	0 %	25 %	50 %	25 %	385828884
43226	NC_017482	AGC	3	9	2314836	2314844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828884
43227	NC_017482	CAC	2	6	2314868	2314873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828884
43228	NC_017482	CAG	2	6	2314877	2314882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828884
43229	NC_017482	ATT	2	6	2314919	2314924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828884
43230	NC_017482	GC	3	6	2314928	2314933	0 %	0 %	50 %	50 %	385828884
43231	NC_017482	ATC	2	6	2314950	2314955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828884
43232	NC_017482	ACCA	2	8	2315003	2315010	50 %	0 %	0 %	50 %	385828884
43233	NC_017482	AGT	2	6	2315045	2315050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828884
43234	NC_017482	GCA	2	6	2315133	2315138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828884
43235	NC_017482	GCA	2	6	2315158	2315163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828884
43236	NC_017482	GTT	2	6	2315196	2315201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828884
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43239	NC_017482	CCTC	2	8	2315286	2315293	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43240	NC_017482	GT	3	6	2315372	2315377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43341	NC_017482	TTTGAT	2	12	2320589	2320600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385828891
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43348	NC_017482	CTGTT	2	10	2320838	2320847	0 %	60 %	20 %	20 %	385828892
43349	NC_017482	GGC	2	6	2320921	2320926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828892
43350	NC_017482	GCT	2	6	2320966	2320971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828892
43351	NC_017482	AGCC	2	8	2321015	2321022	25 %	0 %	25 %	50 %	385828892
43352	NC_017482	TAA	2	6	2321129	2321134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828892
43353	NC_017482	ATC	2	6	2321165	2321170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828892
43354	NC_017482	CTT	2	6	2321251	2321256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828892
43355	NC_017482	TTC	2	6	2321384	2321389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828892
43356	NC_017482	A	6	6	2321390	2321395	100 %	0 %	0 %	0 %	385828892
43357	NC_017482	CAT	2	6	2321546	2321551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828892
43358	NC_017482	GAT	2	6	2321560	2321565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828892
43359	NC_017482	GCGCA	2	10	2321639	2321648	20 %	0 %	40 %	40 %	385828892
43360	NC_017482	CAGC	2	8	2321656	2321663	25 %	0 %	25 %	50 %	385828892
43361	NC_017482	CAAA	2	8	2321692	2321699	75 %	0 %	0 %	25 %	385828892
43362	NC_017482	CAA	2	6	2321746	2321751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828892
43363	NC_017482	GCA	2	6	2321814	2321819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828893
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43367	NC_017482	TCA	2	6	2321954	2321959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828893
43368	NC_017482	ATA	2	6	2321981	2321986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828893
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43372	NC_017482	GCT	2	6	2322064	2322069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828893
43373	NC_017482	ATA	2	6	2322116	2322121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828893
43374	NC_017482	TCC	2	6	2322122	2322127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43375	NC_017482	CATTC	2	10	2322163	2322172	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43376	NC_017482	CGC	2	6	2322219	2322224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828894
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43378	NC_017482	GCA	2	6	2322304	2322309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828894
43379	NC_017482	TGA	2	6	2322370	2322375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828894
43380	NC_017482	GATCC	2	10	2322381	2322390	20 %	20 %	20 %	40 %	385828894
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43382	NC_017482	CGTG	2	8	2322624	2322631	0 %	25 %	50 %	25 %	385828894
43383	NC_017482	T	6	6	2322835	2322840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43384	NC_017482	ATC	2	6	2322968	2322973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43387	NC_017482	GCC	2	6	2323243	2323248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828895
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43391	NC_017482	TCCT	2	8	2323342	2323349	0 %	50 %	0 %	50 %	385828896
43392	NC_017482	GC	3	6	2323454	2323459	0 %	0 %	50 %	50 %	385828896
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43400	NC_017482	ATC	2	6	2324169	2324174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828897
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43434	NC_017482	TGC	2	6	2326040	2326045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828898
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43436	NC_017482	ACA	2	6	2326179	2326184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43437	NC_017482	ACCT	2	8	2326247	2326254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43438	NC_017482	TGC	2	6	2326258	2326263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43439	NC_017482	TTCC	2	8	2326264	2326271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43440	NC_017482	CAT	2	6	2326295	2326300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43441	NC_017482	A	6	6	2326395	2326400	100 %	0 %	0 %	0 %	385828899
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43445	NC_017482	TCT	2	6	2326611	2326616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828899
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43450	NC_017482	TGAT	2	8	2326812	2326819	25 %	50 %	25 %	0 %	385828899
43451	NC_017482	AGC	2	6	2326849	2326854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43454	NC_017482	TGC	2	6	2327037	2327042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828900
43455	NC_017482	TCA	2	6	2327155	2327160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828900
43456	NC_017482	TCT	2	6	2327210	2327215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828900
43457	NC_017482	CAAA	2	8	2327281	2327288	75 %	0 %	0 %	25 %	385828900
43458	NC_017482	CAG	2	6	2327306	2327311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828900
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43460	NC_017482	CACGT	2	10	2327388	2327397	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43461	NC_017482	TAA	2	6	2327430	2327435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828901
43462	NC_017482	TAA	2	6	2327449	2327454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828901
43463	NC_017482	T	7	7	2327511	2327517	0 %	100 %	0 %	0 %	385828901
43464	NC_017482	GCC	2	6	2327537	2327542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828901
43465	NC_017482	GCT	2	6	2327559	2327564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828901
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43467	NC_017482	ACG	2	6	2327619	2327624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828901
43468	NC_017482	ATC	2	6	2327636	2327641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828901
43469	NC_017482	GAT	2	6	2327666	2327671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828901
43470	NC_017482	TTTGC	2	10	2327704	2327713	0 %	60 %	20 %	20 %	385828901
43471	NC_017482	A	6	6	2327896	2327901	100 %	0 %	0 %	0 %	385828901
43472	NC_017482	TCGT	2	8	2327982	2327989	0 %	50 %	25 %	25 %	385828901
43473	NC_017482	ATA	2	6	2327990	2327995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828901
43474	NC_017482	TGC	2	6	2327997	2328002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828901
43475	NC_017482	CCT	2	6	2328010	2328015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43476	NC_017482	CCA	2	6	2328201	2328206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828902
43477	NC_017482	ACC	2	6	2328241	2328246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828902
43478	NC_017482	CAA	2	6	2328258	2328263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828902
43479	NC_017482	GCT	2	6	2328479	2328484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828902
43480	NC_017482	AAC	2	6	2328633	2328638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828902
43481	NC_017482	GGT	2	6	2328763	2328768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828902
43482	NC_017482	CTTT	2	8	2329058	2329065	0 %	75 %	0 %	25 %	385828902
43483	NC_017482	AAG	2	6	2329072	2329077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828902
43484	NC_017482	TGAC	2	8	2329141	2329148	25 %	25 %	25 %	25 %	385828902
43485	NC_017482	GCC	2	6	2329155	2329160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828902
43486	NC_017482	CTC	2	6	2329188	2329193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385828902
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43488	NC_017482	AAG	2	6	2329315	2329320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828902
43489	NC_017482	ATCA	2	8	2329410	2329417	50 %	25 %	0 %	25 %	385828902
43490	NC_017482	CGC	2	6	2329462	2329467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828902
43491	NC_017482	A	7	7	2329498	2329504	100 %	0 %	0 %	0 %	385828902
43492	NC_017482	CGA	2	6	2329550	2329555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828902
43493	NC_017482	GCAACA	2	12	2329733	2329744	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385828902
43494	NC_017482	ACA	2	6	2329910	2329915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828902
43495	NC_017482	ACA	2	6	2329921	2329926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828902
43496	NC_017482	AAG	2	6	2330095	2330100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828902
43497	NC_017482	CACC	2	8	2330110	2330117	25 %	0 %	0 %	75 %	385828902
43498	NC_017482	GAA	2	6	2330175	2330180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828902
43499	NC_017482	CAA	2	6	2330211	2330216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828902
43500	NC_017482	CCA	2	6	2330233	2330238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828902

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