MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 56021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_017482	TGA	2	6	1337321	1337326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828006
25003	NC_017482	TGAT	2	8	1337516	1337523	25 %	50 %	25 %	0 %	385828006
25004	NC_017482	TTGGCG	2	12	1337528	1337539	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385828006
25005	NC_017482	GTT	2	6	1337632	1337637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828006
25006	NC_017482	GTTT	2	8	1337664	1337671	0 %	75 %	25 %	0 %	385828006
25007	NC_017482	CTT	2	6	1337802	1337807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828006
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25009	NC_017482	TCA	2	6	1337846	1337851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828006
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25011	NC_017482	A	6	6	1337892	1337897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25012	NC_017482	T	7	7	1337916	1337922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25013	NC_017482	AAC	2	6	1337947	1337952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25014	NC_017482	AGG	2	6	1337956	1337961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25015	NC_017482	CGG	3	9	1338052	1338060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828007
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25053	NC_017482	T	7	7	1340327	1340333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25054	NC_017482	TGA	2	6	1340572	1340577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25120	NC_017482	AAT	2	6	1344062	1344067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828014
25121	NC_017482	CAA	2	6	1344143	1344148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828014
25122	NC_017482	ATT	2	6	1344228	1344233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828014
25123	NC_017482	ATT	2	6	1344245	1344250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828014
25124	NC_017482	TCG	2	6	1344303	1344308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828014
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25126	NC_017482	CAG	2	6	1344377	1344382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828014
25127	NC_017482	GCAG	2	8	1344415	1344422	25 %	0 %	50 %	25 %	385828014
25128	NC_017482	CGC	2	6	1344441	1344446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828014
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25142	NC_017482	CG	3	6	1344925	1344930	0 %	0 %	50 %	50 %	385828014
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25144	NC_017482	CCG	2	6	1344975	1344980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828014
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25147	NC_017482	TTG	2	6	1345119	1345124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828014
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25151	NC_017482	A	7	7	1345386	1345392	100 %	0 %	0 %	0 %	385828015
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25223	NC_017482	ATG	2	6	1348854	1348859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828017
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25228	NC_017482	A	6	6	1349250	1349255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25229	NC_017482	TTACT	2	10	1349323	1349332	20 %	60 %	0 %	20 %	385828019
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25231	NC_017482	GAT	2	6	1349627	1349632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25232	NC_017482	A	7	7	1349643	1349649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25233	NC_017482	AGG	2	6	1349718	1349723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25234	NC_017482	TAT	2	6	1349725	1349730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828020
25235	NC_017482	CAA	2	6	1349834	1349839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828020
25236	NC_017482	TCA	2	6	1349979	1349984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828020
25237	NC_017482	GCTG	2	8	1350043	1350050	0 %	25 %	50 %	25 %	385828020
25238	NC_017482	CGC	2	6	1350071	1350076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828020
25239	NC_017482	TAT	2	6	1350101	1350106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828020
25240	NC_017482	TAA	2	6	1350130	1350135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828020
25241	NC_017482	GAT	2	6	1350353	1350358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828020
25242	NC_017482	TGC	2	6	1350555	1350560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828020
25243	NC_017482	TCA	2	6	1350603	1350608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828020
25244	NC_017482	TGA	2	6	1350732	1350737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828020
25245	NC_017482	TAG	2	6	1350792	1350797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828020
25246	NC_017482	GGT	2	6	1351057	1351062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828020
25247	NC_017482	TTTTG	2	10	1351117	1351126	0 %	80 %	20 %	0 %	385828020
25248	NC_017482	GCA	2	6	1351178	1351183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828020
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25251	NC_017482	TTGGC	2	10	1351564	1351573	0 %	40 %	40 %	20 %	385828021
25252	NC_017482	GGT	2	6	1351608	1351613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828021
25253	NC_017482	CAA	2	6	1351614	1351619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828021
25254	NC_017482	CG	3	6	1351638	1351643	0 %	0 %	50 %	50 %	385828021
25255	NC_017482	TGATG	2	10	1351658	1351667	20 %	40 %	40 %	0 %	385828021
25256	NC_017482	TGGT	2	8	1351705	1351712	0 %	50 %	50 %	0 %	385828021
25257	NC_017482	GTG	2	6	1351764	1351769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828021
25258	NC_017482	ATGG	2	8	1351818	1351825	25 %	25 %	50 %	0 %	385828021
25259	NC_017482	AAG	2	6	1351876	1351881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828021
25260	NC_017482	CTTT	2	8	1351895	1351902	0 %	75 %	0 %	25 %	385828021
25261	NC_017482	AAT	2	6	1351918	1351923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828021
25262	NC_017482	TCA	2	6	1351926	1351931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25263	NC_017482	T	7	7	1351966	1351972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25264	NC_017482	TGG	2	6	1351985	1351990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25265	NC_017482	CA	3	6	1352137	1352142	50 %	0 %	0 %	50 %	385828022
25266	NC_017482	ATT	2	6	1352211	1352216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828022
25267	NC_017482	TGG	2	6	1352296	1352301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828022
25268	NC_017482	CTTG	2	8	1352354	1352361	0 %	50 %	25 %	25 %	385828022
25269	NC_017482	TTA	2	6	1352390	1352395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828022
25270	NC_017482	CGG	2	6	1352492	1352497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828022
25271	NC_017482	CTA	2	6	1352498	1352503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828022
25272	NC_017482	CGC	2	6	1352574	1352579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828022
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25274	NC_017482	CAAGGC	2	12	1352717	1352728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828022
25275	NC_017482	GC	3	6	1352750	1352755	0 %	0 %	50 %	50 %	385828022
25276	NC_017482	TTA	2	6	1352804	1352809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828022
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25291	NC_017482	TGAAT	2	10	1353542	1353551	40 %	40 %	20 %	0 %	385828022
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25294	NC_017482	TGC	2	6	1353796	1353801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828022
25295	NC_017482	AAG	2	6	1353829	1353834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828022
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25297	NC_017482	T	6	6	1353957	1353962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25298	NC_017482	T	6	6	1354029	1354034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25299	NC_017482	ATT	2	6	1354040	1354045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25300	NC_017482	A	7	7	1354088	1354094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25301	NC_017482	TTTAA	2	10	1354124	1354133	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25302	NC_017482	GCG	2	6	1354222	1354227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828023
25303	NC_017482	ATG	2	6	1354228	1354233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828023
25304	NC_017482	GAG	2	6	1354304	1354309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385828023
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25306	NC_017482	GAT	2	6	1354377	1354382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828023
25307	NC_017482	GAA	2	6	1354494	1354499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828023
25308	NC_017482	TGG	2	6	1354524	1354529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828023
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25310	NC_017482	TTG	2	6	1354621	1354626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828023
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25323	NC_017482	ATGA	2	8	1355122	1355129	50 %	25 %	25 %	0 %	385828023
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25326	NC_017482	GCC	2	6	1355220	1355225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828023
25327	NC_017482	TTCACT	2	12	1355235	1355246	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385828023
25328	NC_017482	CAG	2	6	1355267	1355272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828023
25329	NC_017482	TTC	2	6	1355304	1355309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828023
25330	NC_017482	T	6	6	1355391	1355396	0 %	100 %	0 %	0 %	385828023
25331	NC_017482	GCT	2	6	1355524	1355529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828023
25332	NC_017482	GCAG	2	8	1355562	1355569	25 %	0 %	50 %	25 %	385828023
25333	NC_017482	GCTT	2	8	1355620	1355627	0 %	50 %	25 %	25 %	385828023
25334	NC_017482	CTT	2	6	1355645	1355650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828023
25335	NC_017482	CTT	3	9	1355663	1355671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828023
25336	NC_017482	GCT	2	6	1355686	1355691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828023
25337	NC_017482	TCA	2	6	1355728	1355733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828023
25338	NC_017482	AGC	2	6	1355802	1355807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828023
25339	NC_017482	GAA	2	6	1355847	1355852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828023
25340	NC_017482	TGATTC	2	12	1355985	1355996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385828023
25341	NC_017482	CGTCAG	2	12	1356023	1356034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385828023
25342	NC_017482	TCA	2	6	1356070	1356075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828023
25343	NC_017482	TGG	2	6	1356089	1356094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828023
25344	NC_017482	T	6	6	1356121	1356126	0 %	100 %	0 %	0 %	385828023
25345	NC_017482	AGT	2	6	1356127	1356132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828023
25346	NC_017482	TCC	2	6	1356154	1356159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385828024
25347	NC_017482	CTT	2	6	1356164	1356169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828024
25348	NC_017482	CAT	2	6	1356278	1356283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828024
25349	NC_017482	ACCG	2	8	1356333	1356340	25 %	0 %	25 %	50 %	385828024
25350	NC_017482	CAG	2	6	1356347	1356352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828024
25351	NC_017482	CAC	2	6	1356404	1356409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828024
25352	NC_017482	TGT	2	6	1356433	1356438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828024
25353	NC_017482	GCG	2	6	1356456	1356461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828024
25354	NC_017482	AGC	2	6	1356513	1356518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828024
25355	NC_017482	CAA	2	6	1356542	1356547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828024
25356	NC_017482	GAT	2	6	1356551	1356556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828024
25357	NC_017482	AGT	2	6	1356571	1356576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828024
25358	NC_017482	GGT	2	6	1356585	1356590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828024
25359	NC_017482	ATA	2	6	1356682	1356687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828024
25360	NC_017482	AGCTT	2	10	1356715	1356724	20 %	40 %	20 %	20 %	385828024
25361	NC_017482	CGT	2	6	1356980	1356985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828024
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25364	NC_017482	ACTT	2	8	1357192	1357199	25 %	50 %	0 %	25 %	385828025
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25366	NC_017482	GTG	2	6	1357275	1357280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828025
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25373	NC_017482	ACTT	2	8	1357606	1357613	25 %	50 %	0 %	25 %	385828025
25374	NC_017482	GCT	2	6	1357683	1357688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828025
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25379	NC_017482	CTG	2	6	1357892	1357897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25380	NC_017482	TTG	2	6	1357941	1357946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25381	NC_017482	T	6	6	1358046	1358051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25382	NC_017482	GGT	2	6	1358171	1358176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828026
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25405	NC_017482	TGG	2	6	1359397	1359402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25441	NC_017482	GTATG	2	10	1361598	1361607	20 %	40 %	40 %	0 %	385828028
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25459	NC_017482	GTT	2	6	1362596	1362601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25461	NC_017482	AGG	2	6	1362729	1362734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25462	NC_017482	A	6	6	1362748	1362753	100 %	0 %	0 %	0 %	385828029
25463	NC_017482	GGCT	2	8	1362783	1362790	0 %	25 %	50 %	25 %	385828029
25464	NC_017482	GGC	2	6	1362813	1362818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828029
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25466	NC_017482	TCAGGC	2	12	1362870	1362881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385828029
25467	NC_017482	GCG	2	6	1362955	1362960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828029
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25469	NC_017482	CAA	2	6	1363211	1363216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828029
25470	NC_017482	ACG	2	6	1363282	1363287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828029
25471	NC_017482	T	6	6	1363314	1363319	0 %	100 %	0 %	0 %	385828029
25472	NC_017482	CTGG	2	8	1363359	1363366	0 %	25 %	50 %	25 %	385828029
25473	NC_017482	GC	3	6	1363387	1363392	0 %	0 %	50 %	50 %	385828029
25474	NC_017482	CG	3	6	1363439	1363444	0 %	0 %	50 %	50 %	385828029
25475	NC_017482	TGA	2	6	1363445	1363450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828029
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25479	NC_017482	A	6	6	1363519	1363524	100 %	0 %	0 %	0 %	385828029
25480	NC_017482	TAT	2	6	1363561	1363566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828030
25481	NC_017482	ATT	2	6	1363592	1363597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828030
25482	NC_017482	CTT	2	6	1363633	1363638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828030
25483	NC_017482	CGGTG	2	10	1363693	1363702	0 %	20 %	60 %	20 %	385828030
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25485	NC_017482	AAG	2	6	1363742	1363747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828030
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25487	NC_017482	AAACG	2	10	1363866	1363875	60 %	0 %	20 %	20 %	385828030
25488	NC_017482	T	6	6	1363896	1363901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25489	NC_017482	ATG	2	6	1363974	1363979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25490	NC_017482	TGC	2	6	1364025	1364030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828031
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25493	NC_017482	AGC	2	6	1364330	1364335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828031
25494	NC_017482	ACA	2	6	1364339	1364344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828031
25495	NC_017482	TATT	2	8	1364356	1364363	25 %	75 %	0 %	0 %	385828031
25496	NC_017482	GAT	2	6	1364365	1364370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828031
25497	NC_017482	CGG	2	6	1364418	1364423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828031
25498	NC_017482	AAG	2	6	1364495	1364500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828031
25499	NC_017482	GAA	2	6	1364539	1364544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828031
25500	NC_017482	ATT	2	6	1364695	1364700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385828031

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