MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_017474	CGT	2	6	2403714	2403719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824146
46003	NC_017474	CCTT	2	8	2403731	2403738	0 %	50 %	0 %	50 %	385824146
46004	NC_017474	GCG	2	6	2403752	2403757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824146
46005	NC_017474	CGT	2	6	2403855	2403860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824146
46006	NC_017474	AGC	2	6	2403871	2403876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824146
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46008	NC_017474	CAG	2	6	2403903	2403908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824146
46009	NC_017474	TCGA	2	8	2403944	2403951	25 %	25 %	25 %	25 %	385824146
46010	NC_017474	ATG	2	6	2404001	2404006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824146
46011	NC_017474	CATCTA	2	12	2404008	2404019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824146
46012	NC_017474	TGTT	2	8	2404026	2404033	0 %	75 %	25 %	0 %	385824146
46013	NC_017474	TCC	2	6	2404034	2404039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46014	NC_017474	TTA	2	6	2404042	2404047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46015	NC_017474	GCA	2	6	2404071	2404076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824147
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46017	NC_017474	CAGAA	2	10	2404142	2404151	60 %	0 %	20 %	20 %	385824147
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46030	NC_017474	T	6	6	2404840	2404845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46031	NC_017474	ATTA	2	8	2404958	2404965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46032	NC_017474	GCA	2	6	2405030	2405035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824148
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46052	NC_017474	ACA	2	6	2406218	2406223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824148
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46105	NC_017474	A	6	6	2409121	2409126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46118	NC_017474	TGC	2	6	2409904	2409909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824152
46119	NC_017474	GCTC	2	8	2409923	2409930	0 %	25 %	25 %	50 %	385824152
46120	NC_017474	AATG	2	8	2409970	2409977	50 %	25 %	25 %	0 %	385824152
46121	NC_017474	TGA	3	9	2410092	2410100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824152
46122	NC_017474	ACCA	2	8	2410108	2410115	50 %	0 %	0 %	50 %	385824152
46123	NC_017474	ATA	2	6	2410147	2410152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824152
46124	NC_017474	CAG	2	6	2410218	2410223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824152
46125	NC_017474	CAA	2	6	2410246	2410251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824152
46126	NC_017474	CTT	2	6	2410314	2410319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824152
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46128	NC_017474	GCA	2	6	2410385	2410390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824152
46129	NC_017474	TGC	2	6	2410405	2410410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824152
46130	NC_017474	T	6	6	2410506	2410511	0 %	100 %	0 %	0 %	385824152
46131	NC_017474	TACT	2	8	2410574	2410581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46132	NC_017474	AATT	2	8	2410622	2410629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46133	NC_017474	TAA	2	6	2410640	2410645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46134	NC_017474	CA	3	6	2410650	2410655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46135	NC_017474	A	7	7	2410689	2410695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46136	NC_017474	TCATG	2	10	2410718	2410727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46137	NC_017474	TGCT	2	8	2410819	2410826	0 %	50 %	25 %	25 %	385824153
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46143	NC_017474	GCAACG	2	12	2411082	2411093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824153
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46147	NC_017474	GCA	2	6	2411233	2411238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824153
46148	NC_017474	CTG	2	6	2411255	2411260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824153
46149	NC_017474	CTT	2	6	2411353	2411358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824153
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46153	NC_017474	CTTCGA	2	12	2411533	2411544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385824154
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46161	NC_017474	CCT	2	6	2411962	2411967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46162	NC_017474	ATG	2	6	2411986	2411991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46164	NC_017474	TAA	2	6	2412134	2412139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46165	NC_017474	GTTT	2	8	2412154	2412161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46166	NC_017474	GCG	2	6	2412185	2412190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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46172	NC_017474	GC	3	6	2412454	2412459	0 %	0 %	50 %	50 %	385824155
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46193	NC_017474	GTT	2	6	2413385	2413390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824155
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46200	NC_017474	T	6	6	2413637	2413642	0 %	100 %	0 %	0 %	385824155
46201	NC_017474	TCG	2	6	2413669	2413674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824155
46202	NC_017474	GCA	2	6	2413760	2413765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824155
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46211	NC_017474	ACG	2	6	2414422	2414427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824155
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46214	NC_017474	ATC	2	6	2414560	2414565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824155
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46216	NC_017474	CAT	2	6	2414585	2414590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824155
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46219	NC_017474	T	6	6	2414828	2414833	0 %	100 %	0 %	0 %	385824155
46220	NC_017474	TCT	2	6	2414864	2414869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824155
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46222	NC_017474	GTT	2	6	2414984	2414989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46223	NC_017474	ATG	2	6	2415136	2415141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824156
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46229	NC_017474	AC	3	6	2415420	2415425	50 %	0 %	0 %	50 %	385824156
46230	NC_017474	TCA	2	6	2415461	2415466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824156
46231	NC_017474	TGG	2	6	2415636	2415641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824156
46232	NC_017474	CTT	2	6	2415662	2415667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824156
46233	NC_017474	GTGGC	2	10	2415726	2415735	0 %	20 %	60 %	20 %	385824156
46234	NC_017474	CATC	2	8	2415746	2415753	25 %	25 %	0 %	50 %	385824156
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46236	NC_017474	AGCT	2	8	2415818	2415825	25 %	25 %	25 %	25 %	385824156
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46346	NC_017474	GT	3	6	2422610	2422615	0 %	50 %	50 %	0 %	385824164
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46351	NC_017474	TCT	2	6	2422694	2422699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824164
46352	NC_017474	TTC	4	12	2422722	2422733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824164
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46354	NC_017474	A	6	6	2422957	2422962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46355	NC_017474	AAAT	2	8	2423033	2423040	75 %	25 %	0 %	0 %	385824165
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46364	NC_017474	TTCA	2	8	2423415	2423422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46365	NC_017474	AAT	2	6	2423429	2423434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46366	NC_017474	CAAT	2	8	2423483	2423490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46367	NC_017474	A	6	6	2423506	2423511	100 %	0 %	0 %	0 %	385824167
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46457	NC_017474	A	6	6	2427644	2427649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46459	NC_017474	TAT	2	6	2427665	2427670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46460	NC_017474	T	7	7	2427719	2427725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46461	NC_017474	TCG	2	6	2427870	2427875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824171
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46466	NC_017474	TTG	2	6	2428347	2428352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824171
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46468	NC_017474	GAA	2	6	2428549	2428554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824171
46469	NC_017474	AAC	2	6	2428712	2428717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824171
46470	NC_017474	TGT	2	6	2428747	2428752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824171
46471	NC_017474	AAGCT	2	10	2428854	2428863	40 %	20 %	20 %	20 %	385824171
46472	NC_017474	ACAA	2	8	2428869	2428876	75 %	0 %	0 %	25 %	385824171
46473	NC_017474	CAT	2	6	2428945	2428950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824171
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46475	NC_017474	TGA	2	6	2428986	2428991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824171
46476	NC_017474	TTA	2	6	2429035	2429040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824171
46477	NC_017474	TTC	2	6	2429066	2429071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824171
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46480	NC_017474	CAGC	2	8	2429249	2429256	25 %	0 %	25 %	50 %	385824171
46481	NC_017474	GTG	2	6	2429265	2429270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824171
46482	NC_017474	CTG	3	9	2429274	2429282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824171
46483	NC_017474	GCA	2	6	2429300	2429305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824171
46484	NC_017474	GCT	2	6	2429312	2429317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824171
46485	NC_017474	GCA	2	6	2429324	2429329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824171
46486	NC_017474	TCT	2	6	2429346	2429351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824171
46487	NC_017474	ATG	2	6	2429381	2429386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824171
46488	NC_017474	TAC	2	6	2429411	2429416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824171
46489	NC_017474	CTT	2	6	2429455	2429460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824171
46490	NC_017474	CAT	2	6	2429479	2429484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824171
46491	NC_017474	TCT	2	6	2429565	2429570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824171
46492	NC_017474	GAT	2	6	2429605	2429610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824171
46493	NC_017474	T	6	6	2429793	2429798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46494	NC_017474	TGT	2	6	2429813	2429818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46495	NC_017474	GCT	2	6	2429839	2429844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46496	NC_017474	CATGAA	2	12	2429884	2429895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46497	NC_017474	ATC	2	6	2429984	2429989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824172
46498	NC_017474	CAG	2	6	2430050	2430055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824172
46499	NC_017474	CAA	2	6	2430056	2430061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824172
46500	NC_017474	GTC	2	6	2430089	2430094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824172

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