MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_017474	GGAAT	2	10	2353988	2353997	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45003	NC_017474	T	6	6	2354063	2354068	0 %	100 %	0 %	0 %	385824098
45004	NC_017474	GTC	2	6	2354097	2354102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824098
45005	NC_017474	GAA	2	6	2354114	2354119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824098
45006	NC_017474	TGAT	2	8	2354121	2354128	25 %	50 %	25 %	0 %	385824098
45007	NC_017474	TC	3	6	2354194	2354199	0 %	50 %	0 %	50 %	385824098
45008	NC_017474	GCTG	2	8	2354221	2354228	0 %	25 %	50 %	25 %	385824098
45009	NC_017474	TTGG	2	8	2354238	2354245	0 %	50 %	50 %	0 %	385824098
45010	NC_017474	AAC	2	6	2354254	2354259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824098
45011	NC_017474	GTTG	2	8	2354272	2354279	0 %	50 %	50 %	0 %	385824098
45012	NC_017474	ATT	2	6	2354351	2354356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824098
45013	NC_017474	GAA	2	6	2354395	2354400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824098
45014	NC_017474	GATT	2	8	2354407	2354414	25 %	50 %	25 %	0 %	385824098
45015	NC_017474	ATT	2	6	2354454	2354459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824098
45016	NC_017474	GCT	2	6	2354488	2354493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824098
45017	NC_017474	ATG	2	6	2354522	2354527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824098
45018	NC_017474	TCTGAG	2	12	2354578	2354589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385824098
45019	NC_017474	ATG	2	6	2354625	2354630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824098
45020	NC_017474	CAT	2	6	2354680	2354685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824098
45021	NC_017474	TTGT	2	8	2354702	2354709	0 %	75 %	25 %	0 %	385824098
45022	NC_017474	CAC	3	9	2354719	2354727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824098
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45026	NC_017474	CAAG	2	8	2354839	2354846	50 %	0 %	25 %	25 %	385824098
45027	NC_017474	CAT	2	6	2354890	2354895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824098
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45029	NC_017474	TGG	2	6	2354983	2354988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824098
45030	NC_017474	GAA	2	6	2355023	2355028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824098
45031	NC_017474	TGA	2	6	2355055	2355060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824098
45032	NC_017474	TGA	2	6	2355067	2355072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824098
45033	NC_017474	GAT	2	6	2355089	2355094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824098
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45035	NC_017474	ATC	2	6	2355185	2355190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824098
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45038	NC_017474	AAAC	2	8	2355335	2355342	75 %	0 %	0 %	25 %	385824098
45039	NC_017474	AAG	2	6	2355360	2355365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824098
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45041	NC_017474	T	7	7	2355443	2355449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45042	NC_017474	TAAAC	2	10	2355498	2355507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45043	NC_017474	ATT	2	6	2355529	2355534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45044	NC_017474	TTG	2	6	2355597	2355602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824099
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45049	NC_017474	TAT	2	6	2355791	2355796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824099
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45051	NC_017474	TTG	2	6	2355887	2355892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824099
45052	NC_017474	CTG	2	6	2355915	2355920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824099
45053	NC_017474	TTA	2	6	2356120	2356125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824099
45054	NC_017474	TGC	2	6	2356133	2356138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824099
45055	NC_017474	TGC	2	6	2356147	2356152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824099
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45061	NC_017474	TGCG	2	8	2356341	2356348	0 %	25 %	50 %	25 %	385824099
45062	NC_017474	TGGT	2	8	2356447	2356454	0 %	50 %	50 %	0 %	385824099
45063	NC_017474	GTG	2	6	2356492	2356497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824099
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45067	NC_017474	GGCT	2	8	2356600	2356607	0 %	25 %	50 %	25 %	385824099
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45070	NC_017474	ATCA	2	8	2356776	2356783	50 %	25 %	0 %	25 %	385824099
45071	NC_017474	CGG	2	6	2356789	2356794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824099
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45075	NC_017474	TCG	2	6	2357070	2357075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824100
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45084	NC_017474	ACT	2	6	2357903	2357908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45085	NC_017474	A	7	7	2357916	2357922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45086	NC_017474	T	6	6	2357969	2357974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45087	NC_017474	TATT	2	8	2357984	2357991	25 %	75 %	0 %	0 %	385824103
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45091	NC_017474	GTC	2	6	2358186	2358191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824103
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45101	NC_017474	TCA	2	6	2358741	2358746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824104
45102	NC_017474	CCA	2	6	2358807	2358812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824104
45103	NC_017474	TCT	2	6	2358827	2358832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824104
45104	NC_017474	GAT	2	6	2358858	2358863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824104
45105	NC_017474	CAA	3	9	2358867	2358875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824104
45106	NC_017474	GAT	2	6	2358930	2358935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824104
45107	NC_017474	TGT	2	6	2358992	2358997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824104
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45111	NC_017474	ATC	2	6	2359285	2359290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824104
45112	NC_017474	CTC	2	6	2359336	2359341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824104
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45115	NC_017474	TGC	2	6	2359394	2359399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824104
45116	NC_017474	GCA	2	6	2359622	2359627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824104
45117	NC_017474	TGA	2	6	2359641	2359646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824104
45118	NC_017474	CCA	2	6	2359665	2359670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824104
45119	NC_017474	GC	3	6	2359843	2359848	0 %	0 %	50 %	50 %	385824104
45120	NC_017474	CAC	2	6	2359909	2359914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824104
45121	NC_017474	CAT	2	6	2359923	2359928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824104
45122	NC_017474	CAGTT	2	10	2359996	2360005	20 %	40 %	20 %	20 %	385824104
45123	NC_017474	TGC	2	6	2360006	2360011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824104
45124	NC_017474	GT	3	6	2360037	2360042	0 %	50 %	50 %	0 %	385824104
45125	NC_017474	GAA	2	6	2360044	2360049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824104
45126	NC_017474	AATG	2	8	2360219	2360226	50 %	25 %	25 %	0 %	385824104
45127	NC_017474	TAAA	2	8	2360232	2360239	75 %	25 %	0 %	0 %	385824104
45128	NC_017474	CGT	2	6	2360245	2360250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824104
45129	NC_017474	TGG	2	6	2360262	2360267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824104
45130	NC_017474	ACA	2	6	2360414	2360419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824104
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45132	NC_017474	CTT	3	9	2360504	2360512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824105
45133	NC_017474	GCC	2	6	2360562	2360567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824105
45134	NC_017474	TTC	2	6	2360627	2360632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824105
45135	NC_017474	AAC	2	6	2360634	2360639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824105
45136	NC_017474	TTG	2	6	2360645	2360650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824105
45137	NC_017474	GCG	2	6	2360662	2360667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824105
45138	NC_017474	CAT	2	6	2360804	2360809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824105
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45142	NC_017474	TGCCG	2	10	2360993	2361002	0 %	20 %	40 %	40 %	385824105
45143	NC_017474	TCA	2	6	2361012	2361017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824105
45144	NC_017474	ATC	2	6	2361107	2361112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824105
45145	NC_017474	ATG	2	6	2361285	2361290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824105
45146	NC_017474	CGT	2	6	2361292	2361297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824105
45147	NC_017474	ACC	2	6	2361347	2361352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824105
45148	NC_017474	GCAT	2	8	2361378	2361385	25 %	25 %	25 %	25 %	385824105
45149	NC_017474	TTTC	2	8	2361574	2361581	0 %	75 %	0 %	25 %	385824105
45150	NC_017474	TTG	2	6	2361696	2361701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824105
45151	NC_017474	GT	3	6	2361715	2361720	0 %	50 %	50 %	0 %	385824105
45152	NC_017474	TTC	2	6	2361777	2361782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824105
45153	NC_017474	GGA	2	6	2361823	2361828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824105
45154	NC_017474	CGG	2	6	2361854	2361859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824105
45155	NC_017474	AATC	2	8	2361881	2361888	50 %	25 %	0 %	25 %	385824105
45156	NC_017474	CAT	2	6	2361940	2361945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824105
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45158	NC_017474	A	6	6	2362103	2362108	100 %	0 %	0 %	0 %	385824105
45159	NC_017474	ACA	2	6	2362234	2362239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824105
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45161	NC_017474	AATA	2	8	2362380	2362387	75 %	25 %	0 %	0 %	385824105
45162	NC_017474	TCG	2	6	2362459	2362464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824105
45163	NC_017474	CTTG	2	8	2362501	2362508	0 %	50 %	25 %	25 %	385824105
45164	NC_017474	CGT	2	6	2362519	2362524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824105
45165	NC_017474	TGG	2	6	2362558	2362563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824105
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45169	NC_017474	CAT	3	9	2362954	2362962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824105
45170	NC_017474	CTG	2	6	2363036	2363041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824105
45171	NC_017474	CAT	2	6	2363042	2363047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824105
45172	NC_017474	T	6	6	2363062	2363067	0 %	100 %	0 %	0 %	385824105
45173	NC_017474	CTTT	2	8	2363098	2363105	0 %	75 %	0 %	25 %	385824106
45174	NC_017474	TCAAA	2	10	2363286	2363295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45175	NC_017474	A	6	6	2363293	2363298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45176	NC_017474	GATCA	2	10	2363300	2363309	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45177	NC_017474	AGT	2	6	2363331	2363336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45178	NC_017474	CTT	2	6	2363344	2363349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824107
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45180	NC_017474	GC	3	6	2363402	2363407	0 %	0 %	50 %	50 %	385824107
45181	NC_017474	TTGGT	2	10	2363417	2363426	0 %	60 %	40 %	0 %	385824107
45182	NC_017474	GAA	2	6	2363430	2363435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824107
45183	NC_017474	T	6	6	2363446	2363451	0 %	100 %	0 %	0 %	385824107
45184	NC_017474	GGC	2	6	2363500	2363505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824107
45185	NC_017474	GC	3	6	2363509	2363514	0 %	0 %	50 %	50 %	385824107
45186	NC_017474	ATG	2	6	2363559	2363564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824107
45187	NC_017474	CAA	2	6	2363574	2363579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824107
45188	NC_017474	CG	3	6	2363599	2363604	0 %	0 %	50 %	50 %	385824107
45189	NC_017474	CG	4	8	2363704	2363711	0 %	0 %	50 %	50 %	385824107
45190	NC_017474	TGC	2	6	2363748	2363753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824107
45191	NC_017474	TGT	2	6	2363765	2363770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824107
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45194	NC_017474	AAC	2	6	2364265	2364270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824107
45195	NC_017474	GTA	2	6	2364271	2364276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824107
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45198	NC_017474	TTCTT	2	10	2364431	2364440	0 %	80 %	0 %	20 %	385824107
45199	NC_017474	CAGT	2	8	2364486	2364493	25 %	25 %	25 %	25 %	385824107
45200	NC_017474	GAT	2	6	2364616	2364621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824107
45201	NC_017474	GAC	2	6	2364634	2364639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824107
45202	NC_017474	A	6	6	2364665	2364670	100 %	0 %	0 %	0 %	385824107
45203	NC_017474	TCA	2	6	2364705	2364710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824107
45204	NC_017474	ATG	2	6	2364719	2364724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824107
45205	NC_017474	AATC	2	8	2364822	2364829	50 %	25 %	0 %	25 %	385824107
45206	NC_017474	ACA	2	6	2364884	2364889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824107
45207	NC_017474	CGC	3	9	2364894	2364902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824107
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45209	NC_017474	GATAG	2	10	2364930	2364939	40 %	20 %	40 %	0 %	385824107
45210	NC_017474	GTC	2	6	2365013	2365018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824107
45211	NC_017474	AGA	2	6	2365123	2365128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824107
45212	NC_017474	CAT	2	6	2365165	2365170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824107
45213	NC_017474	ACAA	2	8	2365221	2365228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45214	NC_017474	TCA	2	6	2365229	2365234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45215	NC_017474	AAT	2	6	2365315	2365320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45216	NC_017474	ATG	2	6	2365336	2365341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45217	NC_017474	A	6	6	2365345	2365350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45218	NC_017474	CAT	2	6	2365423	2365428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824108
45219	NC_017474	AGC	2	6	2365472	2365477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824108
45220	NC_017474	AATC	2	8	2365534	2365541	50 %	25 %	0 %	25 %	385824108
45221	NC_017474	ATG	2	6	2365554	2365559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824108
45222	NC_017474	GAC	2	6	2365577	2365582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824108
45223	NC_017474	TAA	2	6	2365608	2365613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824108
45224	NC_017474	TA	3	6	2365633	2365638	50 %	50 %	0 %	0 %	385824108
45225	NC_017474	A	6	6	2365643	2365648	100 %	0 %	0 %	0 %	385824108
45226	NC_017474	TCA	2	6	2365741	2365746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824108
45227	NC_017474	T	7	7	2365756	2365762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45228	NC_017474	GTGAGC	2	12	2365765	2365776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45229	NC_017474	GC	3	6	2365779	2365784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45230	NC_017474	GGTC	2	8	2365820	2365827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45231	NC_017474	CGCTG	2	10	2365863	2365872	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45232	NC_017474	TCT	2	6	2365971	2365976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45233	NC_017474	TGA	2	6	2366025	2366030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45234	NC_017474	CAT	2	6	2366045	2366050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45237	NC_017474	TTAA	2	8	2366119	2366126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45238	NC_017474	ACA	2	6	2366170	2366175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45352	NC_017474	TAAA	2	8	2371241	2371248	75 %	25 %	0 %	0 %	385824114
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45375	NC_017474	TAT	2	6	2372482	2372487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45379	NC_017474	A	6	6	2372562	2372567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45380	NC_017474	GCG	2	6	2372577	2372582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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45456	NC_017474	CTG	2	6	2375945	2375950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824118
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45468	NC_017474	GTT	2	6	2376349	2376354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824119
45469	NC_017474	CCG	2	6	2376409	2376414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824119
45470	NC_017474	TCT	2	6	2376435	2376440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824119
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45473	NC_017474	CTT	2	6	2376592	2376597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824119
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45481	NC_017474	CTA	2	6	2376880	2376885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824119
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45491	NC_017474	AATT	2	8	2377127	2377134	50 %	50 %	0 %	0 %	385824119
45492	NC_017474	TGC	2	6	2377139	2377144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824119
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45496	NC_017474	T	6	6	2377238	2377243	0 %	100 %	0 %	0 %	385824120
45497	NC_017474	T	6	6	2377321	2377326	0 %	100 %	0 %	0 %	385824120
45498	NC_017474	AATC	2	8	2377336	2377343	50 %	25 %	0 %	25 %	385824120
45499	NC_017474	A	6	6	2377368	2377373	100 %	0 %	0 %	0 %	385824120
45500	NC_017474	A	6	6	2377527	2377532	100 %	0 %	0 %	0 %	385824120

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