MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44004	NC_017474	ATT	2	6	2301255	2301260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824044
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44006	NC_017474	CAT	2	6	2301351	2301356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824044
44007	NC_017474	GT	3	6	2301389	2301394	0 %	50 %	50 %	0 %	385824044
44008	NC_017474	ATGGC	2	10	2301431	2301440	20 %	20 %	40 %	20 %	385824044
44009	NC_017474	TCA	3	9	2301452	2301460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824044
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44011	NC_017474	GC	3	6	2301505	2301510	0 %	0 %	50 %	50 %	385824044
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44014	NC_017474	A	6	6	2301605	2301610	100 %	0 %	0 %	0 %	385824045
44015	NC_017474	TCCG	2	8	2301630	2301637	0 %	25 %	25 %	50 %	385824045
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44020	NC_017474	GGA	2	6	2302022	2302027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44021	NC_017474	TGAT	2	8	2302036	2302043	25 %	50 %	25 %	0 %	385824046
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44052	NC_017474	TGCA	2	8	2304305	2304312	25 %	25 %	25 %	25 %	385824047
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44104	NC_017474	TA	3	6	2307407	2307412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44105	NC_017474	ATTTT	2	10	2307439	2307448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44106	NC_017474	T	7	7	2307445	2307451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44107	NC_017474	A	6	6	2307459	2307464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44118	NC_017474	TAG	2	6	2307996	2308001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824051
44119	NC_017474	GAT	2	6	2308024	2308029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824051
44120	NC_017474	TCC	2	6	2308047	2308052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824051
44121	NC_017474	CGC	2	6	2308123	2308128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824051
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44124	NC_017474	CAT	2	6	2308204	2308209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824051
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44130	NC_017474	TACTT	2	10	2308422	2308431	20 %	60 %	0 %	20 %	385824051
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44136	NC_017474	CCTTG	2	10	2308825	2308834	0 %	40 %	20 %	40 %	385824051
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44148	NC_017474	TGC	2	6	2309935	2309940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824052
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44171	NC_017474	A	7	7	2311265	2311271	100 %	0 %	0 %	0 %	385824053
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44214	NC_017474	GCC	3	9	2313584	2313592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824055
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44220	NC_017474	GAT	2	6	2313871	2313876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824055
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44226	NC_017474	ATG	2	6	2314037	2314042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824055
44227	NC_017474	CTT	2	6	2314049	2314054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824056
44228	NC_017474	GCTG	2	8	2314093	2314100	0 %	25 %	50 %	25 %	385824056
44229	NC_017474	TGA	2	6	2314138	2314143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824056
44230	NC_017474	AAC	2	6	2314158	2314163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824056
44231	NC_017474	CGC	2	6	2314236	2314241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824056
44232	NC_017474	GCA	2	6	2314252	2314257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824056
44233	NC_017474	GCA	2	6	2314261	2314266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824056
44234	NC_017474	TCG	2	6	2314285	2314290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824056
44235	NC_017474	GC	3	6	2314323	2314328	0 %	0 %	50 %	50 %	385824056
44236	NC_017474	CTG	2	6	2314338	2314343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824056
44237	NC_017474	TCA	2	6	2314435	2314440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824056
44238	NC_017474	TGC	2	6	2314447	2314452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824056
44239	NC_017474	ATTG	2	8	2314466	2314473	25 %	50 %	25 %	0 %	385824056
44240	NC_017474	A	6	6	2314505	2314510	100 %	0 %	0 %	0 %	385824056
44241	NC_017474	AGC	2	6	2314521	2314526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824056
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44244	NC_017474	CAA	2	6	2314623	2314628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824056
44245	NC_017474	GTC	2	6	2314810	2314815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824056
44246	NC_017474	CAT	3	9	2314908	2314916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824056
44247	NC_017474	GCA	2	6	2314948	2314953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824056
44248	NC_017474	GCA	2	6	2314966	2314971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824056
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44251	NC_017474	TGCC	2	8	2315073	2315080	0 %	25 %	25 %	50 %	385824056
44252	NC_017474	ATC	2	6	2315094	2315099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824056
44253	NC_017474	GT	3	6	2315144	2315149	0 %	50 %	50 %	0 %	385824056
44254	NC_017474	TCAT	2	8	2315164	2315171	25 %	50 %	0 %	25 %	385824056
44255	NC_017474	ACC	2	6	2315178	2315183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824056
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44260	NC_017474	GCCA	2	8	2315290	2315297	25 %	0 %	25 %	50 %	385824056
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44267	NC_017474	AAT	2	6	2315785	2315790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44268	NC_017474	T	7	7	2315809	2315815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44269	NC_017474	TCA	2	6	2315864	2315869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44283	NC_017474	TCA	2	6	2316486	2316491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44287	NC_017474	TC	3	6	2316699	2316704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44288	NC_017474	AGGA	2	8	2316708	2316715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44289	NC_017474	CAAA	2	8	2316750	2316757	75 %	0 %	0 %	25 %	385824059
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44291	NC_017474	GGCCA	2	10	2316850	2316859	20 %	0 %	40 %	40 %	385824059
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44312	NC_017474	GATG	2	8	2318057	2318064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44313	NC_017474	ATA	2	6	2318072	2318077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44315	NC_017474	ACA	2	6	2318112	2318117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44330	NC_017474	TGAT	2	8	2318616	2318623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44331	NC_017474	TGAT	2	8	2318682	2318689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44332	NC_017474	GAGACC	2	12	2318703	2318714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44334	NC_017474	CG	3	6	2318773	2318778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44335	NC_017474	TGAT	2	8	2318814	2318821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44336	NC_017474	GTT	2	6	2318844	2318849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44338	NC_017474	TGAT	2	8	2318946	2318953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44339	NC_017474	TTC	2	6	2318975	2318980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44340	NC_017474	TGAT	2	8	2319012	2319019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44341	NC_017474	TGT	2	6	2319046	2319051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44342	NC_017474	TCA	2	6	2319058	2319063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44343	NC_017474	TGAT	2	8	2319078	2319085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44344	NC_017474	TGAT	2	8	2319144	2319151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44345	NC_017474	GTC	2	6	2319179	2319184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44346	NC_017474	TGAT	2	8	2319210	2319217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44347	NC_017474	TGAT	2	8	2319276	2319283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44348	NC_017474	TTG	2	6	2319310	2319315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44349	NC_017474	TGAT	2	8	2319342	2319349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44350	NC_017474	TGT	2	6	2319379	2319384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44351	NC_017474	TGAT	2	8	2319408	2319415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44352	NC_017474	CA	3	6	2319443	2319448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44353	NC_017474	AATC	2	8	2319456	2319463	50 %	25 %	0 %	25 %	385824062
44354	NC_017474	CTT	2	6	2319524	2319529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824062
44355	NC_017474	CGA	2	6	2319596	2319601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824062
44356	NC_017474	AAT	2	6	2319619	2319624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824062
44357	NC_017474	TCC	2	6	2319657	2319662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824062
44358	NC_017474	TCA	2	6	2319723	2319728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824062
44359	NC_017474	TTG	2	6	2319833	2319838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824062
44360	NC_017474	GATC	2	8	2319844	2319851	25 %	25 %	25 %	25 %	385824062
44361	NC_017474	TCAA	2	8	2319873	2319880	50 %	25 %	0 %	25 %	385824062
44362	NC_017474	TGT	2	6	2320097	2320102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824062
44363	NC_017474	TAG	2	6	2320119	2320124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824062
44364	NC_017474	AAT	2	6	2320135	2320140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824062
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44375	NC_017474	GCT	2	6	2320709	2320714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824064
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44379	NC_017474	CAA	2	6	2320993	2320998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824064
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44382	NC_017474	TAG	2	6	2321174	2321179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824064
44383	NC_017474	GTT	2	6	2321187	2321192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824064
44384	NC_017474	TGAT	2	8	2321205	2321212	25 %	50 %	25 %	0 %	385824064
44385	NC_017474	ATT	2	6	2321228	2321233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824064
44386	NC_017474	AAC	2	6	2321252	2321257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824064
44387	NC_017474	GTC	2	6	2321274	2321279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824064
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44391	NC_017474	CAAA	2	8	2321427	2321434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44392	NC_017474	CATA	2	8	2321473	2321480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44393	NC_017474	T	7	7	2321509	2321515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44394	NC_017474	CAGAT	2	10	2321521	2321530	40 %	20 %	20 %	20 %	385824065
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44453	NC_017474	CAT	2	6	2324550	2324555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824065
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44456	NC_017474	ATC	2	6	2324614	2324619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824065
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44459	NC_017474	CTG	2	6	2324881	2324886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824065
44460	NC_017474	AT	3	6	2324892	2324897	50 %	50 %	0 %	0 %	385824065
44461	NC_017474	CAA	2	6	2324917	2324922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824065
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44463	NC_017474	TTGT	2	8	2325086	2325093	0 %	75 %	25 %	0 %	385824065
44464	NC_017474	ATG	2	6	2325148	2325153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824065
44465	NC_017474	AAAT	2	8	2325161	2325168	75 %	25 %	0 %	0 %	385824065
44466	NC_017474	TCCG	2	8	2325254	2325261	0 %	25 %	25 %	50 %	385824065
44467	NC_017474	GAA	2	6	2325337	2325342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824065
44468	NC_017474	A	7	7	2325373	2325379	100 %	0 %	0 %	0 %	385824065
44469	NC_017474	A	6	6	2325386	2325391	100 %	0 %	0 %	0 %	385824065
44470	NC_017474	GCC	2	6	2325396	2325401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824065
44471	NC_017474	ACG	2	6	2325418	2325423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824065
44472	NC_017474	GCT	3	9	2325452	2325460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824065
44473	NC_017474	CTT	2	6	2325465	2325470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824065
44474	NC_017474	TTG	2	6	2325648	2325653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44475	NC_017474	TAA	2	6	2325678	2325683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44476	NC_017474	A	7	7	2325710	2325716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44477	NC_017474	TCA	2	6	2325720	2325725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44478	NC_017474	AAAT	2	8	2325807	2325814	75 %	25 %	0 %	0 %	385824066
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44480	NC_017474	CTAG	2	8	2326025	2326032	25 %	25 %	25 %	25 %	385824066
44481	NC_017474	ATC	2	6	2326037	2326042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824066
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44494	NC_017474	CGC	2	6	2326657	2326662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824067
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44497	NC_017474	TCT	2	6	2326764	2326769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824067
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