MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017474	CTAA	2	8	2251077	2251084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43002	NC_017474	CAA	3	9	2251120	2251128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43003	NC_017474	TGCT	2	8	2251200	2251207	0 %	50 %	25 %	25 %	385823993
43004	NC_017474	CG	3	6	2251244	2251249	0 %	0 %	50 %	50 %	385823993
43005	NC_017474	GGC	2	6	2251267	2251272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385823993
43006	NC_017474	TCAAAG	2	12	2251279	2251290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385823993
43007	NC_017474	GCC	2	6	2251335	2251340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385823993
43008	NC_017474	GAT	2	6	2251368	2251373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823993
43009	NC_017474	CCA	2	6	2251442	2251447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823993
43010	NC_017474	TC	3	6	2251469	2251474	0 %	50 %	0 %	50 %	385823993
43011	NC_017474	CAT	2	6	2251509	2251514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823993
43012	NC_017474	CAC	2	6	2251581	2251586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823993
43013	NC_017474	A	7	7	2251606	2251612	100 %	0 %	0 %	0 %	385823993
43014	NC_017474	TGC	2	6	2251631	2251636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823993
43015	NC_017474	TC	3	6	2251640	2251645	0 %	50 %	0 %	50 %	385823993
43016	NC_017474	AAC	2	6	2251804	2251809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823994
43017	NC_017474	CCAA	2	8	2251811	2251818	50 %	0 %	0 %	50 %	385823994
43018	NC_017474	CAAA	2	8	2251828	2251835	75 %	0 %	0 %	25 %	385823994
43019	NC_017474	GAC	2	6	2251838	2251843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823994
43020	NC_017474	TCG	2	6	2251948	2251953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823995
43021	NC_017474	ACA	2	6	2251963	2251968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823995
43022	NC_017474	ATG	2	6	2251996	2252001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823995
43023	NC_017474	GC	3	6	2252038	2252043	0 %	0 %	50 %	50 %	385823995
43024	NC_017474	GAT	2	6	2252064	2252069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823995
43025	NC_017474	GCCA	2	8	2252079	2252086	25 %	0 %	25 %	50 %	385823995
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43028	NC_017474	AGC	2	6	2252202	2252207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823995
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43031	NC_017474	ACGA	2	8	2252252	2252259	50 %	0 %	25 %	25 %	385823995
43032	NC_017474	CTT	2	6	2252304	2252309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385823995
43033	NC_017474	CGTT	2	8	2252338	2252345	0 %	50 %	25 %	25 %	385823995
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43035	NC_017474	CG	3	6	2252418	2252423	0 %	0 %	50 %	50 %	385823995
43036	NC_017474	GCTT	2	8	2252464	2252471	0 %	50 %	25 %	25 %	385823995
43037	NC_017474	TGCTT	2	10	2252488	2252497	0 %	60 %	20 %	20 %	385823995
43038	NC_017474	TTGG	2	8	2252544	2252551	0 %	50 %	50 %	0 %	385823995
43039	NC_017474	TCT	2	6	2252634	2252639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43040	NC_017474	TTG	2	6	2252715	2252720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43041	NC_017474	ACG	2	6	2252733	2252738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43042	NC_017474	A	7	7	2252837	2252843	100 %	0 %	0 %	0 %	385823996
43043	NC_017474	TCA	2	6	2252871	2252876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823996
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43046	NC_017474	T	6	6	2253053	2253058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43047	NC_017474	CATA	2	8	2253108	2253115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43048	NC_017474	ATA	2	6	2253164	2253169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385823997
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43055	NC_017474	CA	3	6	2253435	2253440	50 %	0 %	0 %	50 %	385823997
43056	NC_017474	CAG	2	6	2253493	2253498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823997
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43060	NC_017474	TGA	2	6	2253797	2253802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823997
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43070	NC_017474	GTC	2	6	2254302	2254307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43081	NC_017474	GTCCA	2	10	2254899	2254908	20 %	20 %	20 %	40 %	385823998
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43084	NC_017474	TGA	2	6	2255316	2255321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823998
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43088	NC_017474	CAAT	2	8	2255522	2255529	50 %	25 %	0 %	25 %	385823999
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43102	NC_017474	ACA	2	6	2256413	2256418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823999
43103	NC_017474	ATT	2	6	2256441	2256446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43104	NC_017474	A	7	7	2256519	2256525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43105	NC_017474	TCGC	2	8	2256536	2256543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43106	NC_017474	ACTG	2	8	2256595	2256602	25 %	25 %	25 %	25 %	385824000
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43108	NC_017474	CAT	2	6	2256689	2256694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824000
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43112	NC_017474	T	6	6	2256872	2256877	0 %	100 %	0 %	0 %	385824000
43113	NC_017474	TGCC	2	8	2256893	2256900	0 %	25 %	25 %	50 %	385824000
43114	NC_017474	TTG	2	6	2257078	2257083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824000
43115	NC_017474	GAT	2	6	2257124	2257129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824000
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43117	NC_017474	T	6	6	2257236	2257241	0 %	100 %	0 %	0 %	385824000
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43119	NC_017474	CTC	2	6	2257264	2257269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43122	NC_017474	GTT	2	6	2257358	2257363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43210	NC_017474	ATT	2	6	2261198	2261203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43211	NC_017474	GAGGT	2	10	2261217	2261226	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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43218	NC_017474	A	7	7	2261448	2261454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43219	NC_017474	TCA	2	6	2261491	2261496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43230	NC_017474	TGC	3	9	2262327	2262335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824005
43231	NC_017474	GGC	2	6	2262337	2262342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824005
43232	NC_017474	A	6	6	2262392	2262397	100 %	0 %	0 %	0 %	385824005
43233	NC_017474	CCT	2	6	2262410	2262415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824006
43234	NC_017474	ATG	2	6	2262454	2262459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824006
43235	NC_017474	CCG	2	6	2262493	2262498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824006
43236	NC_017474	CAT	2	6	2262503	2262508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824006
43237	NC_017474	ATC	2	6	2262556	2262561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824006
43238	NC_017474	AAC	2	6	2262570	2262575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824006
43239	NC_017474	CAT	2	6	2262591	2262596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824006
43240	NC_017474	CAA	2	6	2262651	2262656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824006
43241	NC_017474	TTG	2	6	2262657	2262662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824006
43242	NC_017474	GCT	2	6	2262688	2262693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824006
43243	NC_017474	AAAG	2	8	2262801	2262808	75 %	0 %	25 %	0 %	385824006
43244	NC_017474	CAC	2	6	2262870	2262875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824006
43245	NC_017474	GAT	2	6	2263089	2263094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824006
43246	NC_017474	GCC	2	6	2263146	2263151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824006
43247	NC_017474	GAA	2	6	2263173	2263178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824006
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43249	NC_017474	GACATT	2	12	2263261	2263272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385824006
43250	NC_017474	CCT	2	6	2263275	2263280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824007
43251	NC_017474	ATG	2	6	2263313	2263318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824007
43252	NC_017474	GTG	2	6	2263367	2263372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824007
43253	NC_017474	CGT	2	6	2263482	2263487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824007
43254	NC_017474	CGA	2	6	2263503	2263508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824007
43255	NC_017474	CCG	2	6	2263561	2263566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824007
43256	NC_017474	ATC	2	6	2263616	2263621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824007
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43260	NC_017474	T	6	6	2263809	2263814	0 %	100 %	0 %	0 %	385824007
43261	NC_017474	TCT	2	6	2263820	2263825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824007
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43263	NC_017474	CGA	2	6	2263856	2263861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824007
43264	NC_017474	CAG	2	6	2263897	2263902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824007
43265	NC_017474	GC	3	6	2263923	2263928	0 %	0 %	50 %	50 %	385824007
43266	NC_017474	TGC	2	6	2263946	2263951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824007
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43269	NC_017474	TTG	2	6	2264018	2264023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824007
43270	NC_017474	GCA	2	6	2264075	2264080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824007
43271	NC_017474	TCA	2	6	2264186	2264191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824007
43272	NC_017474	TCAA	2	8	2264222	2264229	50 %	25 %	0 %	25 %	385824007
43273	NC_017474	TTTC	2	8	2264388	2264395	0 %	75 %	0 %	25 %	385824007
43274	NC_017474	ACTC	2	8	2264484	2264491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43275	NC_017474	TG	4	8	2264552	2264559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43276	NC_017474	TCATTT	2	12	2264577	2264588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43277	NC_017474	CGC	2	6	2264590	2264595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43278	NC_017474	A	7	7	2264634	2264640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43279	NC_017474	ATT	2	6	2264745	2264750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824008
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43282	NC_017474	GTT	2	6	2265027	2265032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824008
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43289	NC_017474	TCC	2	6	2265490	2265495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43290	NC_017474	TTG	2	6	2265498	2265503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43291	NC_017474	GCC	2	6	2265511	2265516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43292	NC_017474	GAA	2	6	2265544	2265549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43293	NC_017474	TGC	2	6	2265570	2265575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43304	NC_017474	TCA	2	6	2266166	2266171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824010
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43307	NC_017474	TCA	2	6	2266333	2266338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824010
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43314	NC_017474	GTTGC	2	10	2266903	2266912	0 %	40 %	40 %	20 %	385824010
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43320	NC_017474	ATC	2	6	2267272	2267277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824010
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43322	NC_017474	CCATA	2	10	2267294	2267303	40 %	20 %	0 %	40 %	385824010
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43326	NC_017474	TCCG	2	8	2267513	2267520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43327	NC_017474	CAC	2	6	2267548	2267553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43328	NC_017474	AAT	2	6	2267588	2267593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43329	NC_017474	A	6	6	2267602	2267607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43330	NC_017474	ACTC	2	8	2267640	2267647	25 %	25 %	0 %	50 %	385824011
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43333	NC_017474	GCA	3	9	2267742	2267750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824011
43334	NC_017474	GAACCA	2	12	2267778	2267789	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385824011
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43337	NC_017474	TGA	2	6	2267826	2267831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824011
43338	NC_017474	CG	3	6	2267858	2267863	0 %	0 %	50 %	50 %	385824011
43339	NC_017474	TAA	2	6	2267900	2267905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824011
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43341	NC_017474	CGG	2	6	2268000	2268005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824011
43342	NC_017474	ATC	2	6	2268191	2268196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824011
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43344	NC_017474	ACC	2	6	2268233	2268238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824011
43345	NC_017474	CTG	2	6	2268283	2268288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824011
43346	NC_017474	TTG	2	6	2268372	2268377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824011
43347	NC_017474	ATC	2	6	2268519	2268524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824011
43348	NC_017474	CCT	2	6	2268533	2268538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824012
43349	NC_017474	CGC	2	6	2268540	2268545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824012
43350	NC_017474	AAT	2	6	2268549	2268554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824012
43351	NC_017474	CAA	2	6	2268581	2268586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824012
43352	NC_017474	CGG	2	6	2268627	2268632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824012
43353	NC_017474	GCA	2	6	2268670	2268675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824012
43354	NC_017474	TCA	2	6	2268679	2268684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824012
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43357	NC_017474	CTG	2	6	2268792	2268797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824012
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43363	NC_017474	AC	3	6	2269100	2269105	50 %	0 %	0 %	50 %	385824012
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43374	NC_017474	ATC	2	6	2269749	2269754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824012
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43378	NC_017474	ACAA	2	8	2269912	2269919	75 %	0 %	0 %	25 %	385824012
43379	NC_017474	CTT	2	6	2269925	2269930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824012
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43382	NC_017474	GATATG	2	12	2270039	2270050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43383	NC_017474	GCG	2	6	2270149	2270154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824013
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43401	NC_017474	GCA	2	6	2271240	2271245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824013
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43405	NC_017474	CTG	2	6	2271506	2271511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824014
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43428	NC_017474	A	6	6	2272682	2272687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43429	NC_017474	T	6	6	2272723	2272728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43430	NC_017474	AAC	2	6	2272759	2272764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43452	NC_017474	GC	3	6	2273853	2273858	0 %	0 %	50 %	50 %	385824015
43453	NC_017474	GCC	2	6	2273928	2273933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824015
43454	NC_017474	CTT	2	6	2273944	2273949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824015
43455	NC_017474	GAT	2	6	2273987	2273992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824015
43456	NC_017474	TTG	2	6	2274002	2274007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824015
43457	NC_017474	TG	3	6	2274006	2274011	0 %	50 %	50 %	0 %	385824015
43458	NC_017474	CGTG	2	8	2274038	2274045	0 %	25 %	50 %	25 %	385824015
43459	NC_017474	GAAC	2	8	2274089	2274096	50 %	0 %	25 %	25 %	385824015
43460	NC_017474	AAAATC	2	12	2274228	2274239	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385824015
43461	NC_017474	CTC	2	6	2274297	2274302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43462	NC_017474	CTTG	2	8	2274364	2274371	0 %	50 %	25 %	25 %	385824016
43463	NC_017474	ATG	2	6	2274378	2274383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824016
43464	NC_017474	ACC	2	6	2274458	2274463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824016
43465	NC_017474	CAA	2	6	2274521	2274526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824016
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43467	NC_017474	A	6	6	2274679	2274684	100 %	0 %	0 %	0 %	385824016
43468	NC_017474	TTG	2	6	2274686	2274691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824016
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