MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_017474	GAT	2	6	2198832	2198837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823942
42003	NC_017474	TCA	2	6	2198852	2198857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823942
42004	NC_017474	TCG	2	6	2198874	2198879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823942
42005	NC_017474	TGC	2	6	2198902	2198907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823942
42006	NC_017474	CG	3	6	2198946	2198951	0 %	0 %	50 %	50 %	385823942
42007	NC_017474	CTGA	2	8	2198995	2199002	25 %	25 %	25 %	25 %	385823942
42008	NC_017474	GAT	2	6	2199082	2199087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823942
42009	NC_017474	CCA	2	6	2199095	2199100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823942
42010	NC_017474	GCC	2	6	2199182	2199187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385823942
42011	NC_017474	ACC	2	6	2199283	2199288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823942
42012	NC_017474	TGC	2	6	2199356	2199361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823942
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42014	NC_017474	ATG	2	6	2199398	2199403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823942
42015	NC_017474	CAC	2	6	2199429	2199434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823942
42016	NC_017474	AGTC	2	8	2199489	2199496	25 %	25 %	25 %	25 %	385823942
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42018	NC_017474	CGC	2	6	2199547	2199552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385823942
42019	NC_017474	TTGG	2	8	2199566	2199573	0 %	50 %	50 %	0 %	385823942
42020	NC_017474	CAT	2	6	2199633	2199638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823942
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42024	NC_017474	CGT	2	6	2199969	2199974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823942
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42053	NC_017474	CGC	2	6	2201238	2201243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385823943
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42097	NC_017474	GTTT	2	8	2202700	2202707	0 %	75 %	25 %	0 %	385823944
42098	NC_017474	TAA	2	6	2202739	2202744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42099	NC_017474	A	7	7	2202896	2202902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42100	NC_017474	CGA	2	6	2202904	2202909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42101	NC_017474	GTC	2	6	2202949	2202954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42102	NC_017474	GCC	3	9	2203050	2203058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42103	NC_017474	CAT	2	6	2203128	2203133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823945
42104	NC_017474	CATC	2	8	2203181	2203188	25 %	25 %	0 %	50 %	385823945
42105	NC_017474	ATA	2	6	2203245	2203250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385823945
42106	NC_017474	CAA	2	6	2203254	2203259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823945
42107	NC_017474	CTT	2	6	2203260	2203265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385823945
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42115	NC_017474	TCA	2	6	2203426	2203431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823945
42116	NC_017474	TCC	2	6	2203432	2203437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385823945
42117	NC_017474	TTCA	2	8	2203533	2203540	25 %	50 %	0 %	25 %	385823945
42118	NC_017474	A	7	7	2203565	2203571	100 %	0 %	0 %	0 %	385823945
42119	NC_017474	AAC	2	6	2203579	2203584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823945
42120	NC_017474	TCA	2	6	2203631	2203636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823945
42121	NC_017474	AACA	2	8	2203683	2203690	75 %	0 %	0 %	25 %	385823945
42122	NC_017474	ACA	2	6	2203694	2203699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823945
42123	NC_017474	A	6	6	2203826	2203831	100 %	0 %	0 %	0 %	385823945
42124	NC_017474	GGA	2	6	2203890	2203895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42125	NC_017474	CA	3	6	2203920	2203925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42126	NC_017474	CAAT	2	8	2203927	2203934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42127	NC_017474	A	6	6	2204150	2204155	100 %	0 %	0 %	0 %	385823946
42128	NC_017474	ACC	2	6	2204226	2204231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823946
42129	NC_017474	ATC	2	6	2204234	2204239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823946
42130	NC_017474	ACT	2	6	2204609	2204614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823946
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42132	NC_017474	CTC	2	6	2204684	2204689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385823946
42133	NC_017474	ATT	2	6	2204699	2204704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385823946
42134	NC_017474	GTA	2	6	2204747	2204752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823946
42135	NC_017474	CAAC	2	8	2204761	2204768	50 %	0 %	0 %	50 %	385823946
42136	NC_017474	AGT	2	6	2204921	2204926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823946
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42146	NC_017474	CTG	2	6	2205545	2205550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823946
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42153	NC_017474	CTGA	2	8	2205989	2205996	25 %	25 %	25 %	25 %	385823946
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42156	NC_017474	TAA	2	6	2206316	2206321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42157	NC_017474	TTCT	2	8	2206361	2206368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42158	NC_017474	TTC	2	6	2206431	2206436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42159	NC_017474	AAG	2	6	2206490	2206495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42162	NC_017474	A	8	8	2206610	2206617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42163	NC_017474	TTA	2	6	2206674	2206679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385823947
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42187	NC_017474	TTTA	2	8	2207952	2207959	25 %	75 %	0 %	0 %	385823947
42188	NC_017474	CTTT	2	8	2207968	2207975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42189	NC_017474	T	6	6	2207993	2207998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42190	NC_017474	TATC	2	8	2208010	2208017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42231	NC_017474	AGT	2	6	2210521	2210526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823950
42232	NC_017474	AGAC	2	8	2210531	2210538	50 %	0 %	25 %	25 %	385823950
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42455	NC_017474	GATA	2	8	2221966	2221973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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42473	NC_017474	GGTT	2	8	2223196	2223203	0 %	50 %	50 %	0 %	385823959
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42476	NC_017474	CGT	2	6	2223289	2223294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823959
42477	NC_017474	TCA	2	6	2223353	2223358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823959
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42482	NC_017474	A	6	6	2223560	2223565	100 %	0 %	0 %	0 %	385823959
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42498	NC_017474	TAGAT	2	10	2224328	2224337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42499	NC_017474	AAC	2	6	2224443	2224448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42500	NC_017474	TGT	2	6	2224472	2224477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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