MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017474	TTTC	2	8	677096	677103	0 %	75 %	0 %	25 %	385822392
13003	NC_017474	TGA	2	6	677171	677176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822392
13004	NC_017474	ATA	2	6	677179	677184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385822392
13005	NC_017474	TTC	2	6	677224	677229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822392
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13007	NC_017474	GGT	2	6	677325	677330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822392
13008	NC_017474	ATA	2	6	677380	677385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385822392
13009	NC_017474	GTT	2	6	677391	677396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822392
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13011	NC_017474	GAC	2	6	677429	677434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_017474	TGAG	2	8	677463	677470	25 %	25 %	50 %	0 %	385822393
13013	NC_017474	ACG	2	6	677488	677493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822393
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13015	NC_017474	TGCA	2	8	677556	677563	25 %	25 %	25 %	25 %	385822393
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13018	NC_017474	GGT	2	6	677673	677678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_017474	CAG	2	6	677688	677693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822394
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13021	NC_017474	AACC	2	8	677741	677748	50 %	0 %	0 %	50 %	385822394
13022	NC_017474	T	6	6	677753	677758	0 %	100 %	0 %	0 %	385822394
13023	NC_017474	AGC	2	6	677761	677766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822394
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13025	NC_017474	AT	3	6	677815	677820	50 %	50 %	0 %	0 %	385822394
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13029	NC_017474	CGGAC	2	10	678157	678166	20 %	0 %	40 %	40 %	385822394
13030	NC_017474	CGG	2	6	678177	678182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822394
13031	NC_017474	GC	3	6	678200	678205	0 %	0 %	50 %	50 %	385822394
13032	NC_017474	TGGC	2	8	678372	678379	0 %	25 %	50 %	25 %	385822394
13033	NC_017474	GCGG	2	8	678382	678389	0 %	0 %	75 %	25 %	385822394
13034	NC_017474	GAG	2	6	678437	678442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385822394
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13041	NC_017474	ATTA	2	8	679037	679044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_017474	A	7	7	679046	679052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_017474	AAT	2	6	679058	679063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_017474	T	7	7	679070	679076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_017474	CAT	2	6	679121	679126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_017474	TGT	3	9	679162	679170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_017474	TCA	2	6	679246	679251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822395
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13050	NC_017474	TGCGAC	2	12	679485	679496	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13052	NC_017474	GCG	2	6	679506	679511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_017474	GTA	2	6	679521	679526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13055	NC_017474	TGC	2	6	679568	679573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822396
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13088	NC_017474	GTTTT	2	10	680729	680738	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13106	NC_017474	CGTT	2	8	681594	681601	0 %	50 %	25 %	25 %	385822398
13107	NC_017474	CAGTT	2	10	681642	681651	20 %	40 %	20 %	20 %	385822398
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13110	NC_017474	TTG	2	6	681795	681800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822398
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13113	NC_017474	TGAA	2	8	681880	681887	50 %	25 %	25 %	0 %	385822398
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13118	NC_017474	CAT	2	6	682229	682234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822398
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13121	NC_017474	CAA	2	6	682413	682418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_017474	A	6	6	682417	682422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_017474	TGA	3	9	682515	682523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13125	NC_017474	GTC	2	6	682618	682623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822399
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13242	NC_017474	T	6	6	688720	688725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_017474	GTT	2	6	688738	688743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13370	NC_017474	CTG	2	6	695565	695570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13486	NC_017474	GCA	2	6	701559	701564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822417
13487	NC_017474	TCC	2	6	701621	701626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13488	NC_017474	GATG	2	8	701635	701642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13489	NC_017474	GTA	2	6	701708	701713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13490	NC_017474	TAA	2	6	701869	701874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13491	NC_017474	T	7	7	701901	701907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13492	NC_017474	ACT	2	6	701914	701919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_017474	TA	3	6	701952	701957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_017474	TC	3	6	702040	702045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13495	NC_017474	AGAGA	2	10	702069	702078	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_017474	T	6	6	702086	702091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_017474	CCA	2	6	702114	702119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13498	NC_017474	CGG	2	6	702137	702142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13499	NC_017474	TGT	2	6	702150	702155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_017474	AAG	2	6	702374	702379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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