MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017474	TGG	3	9	548846	548854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822238
10502	NC_017474	TTGA	2	8	548887	548894	25 %	50 %	25 %	0 %	385822238
10503	NC_017474	AGC	2	6	548955	548960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822238
10504	NC_017474	GAA	2	6	549016	549021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822238
10505	NC_017474	T	6	6	549105	549110	0 %	100 %	0 %	0 %	385822239
10506	NC_017474	GCACTG	2	12	549118	549129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385822239
10507	NC_017474	CAA	2	6	549211	549216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822239
10508	NC_017474	GCG	2	6	549262	549267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10509	NC_017474	TCT	2	6	549368	549373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822239
10510	NC_017474	CAT	2	6	549381	549386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822239
10511	NC_017474	GGC	2	6	549405	549410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10512	NC_017474	TCT	2	6	549513	549518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822239
10513	NC_017474	TTC	2	6	549559	549564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822239
10514	NC_017474	GGC	2	6	549568	549573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10515	NC_017474	GCG	2	6	549577	549582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10516	NC_017474	TCA	2	6	549608	549613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822239
10517	NC_017474	GCG	2	6	549617	549622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10518	NC_017474	GCTG	2	8	549627	549634	0 %	25 %	50 %	25 %	385822239
10519	NC_017474	TGCCAT	2	12	549639	549650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385822239
10520	NC_017474	A	6	6	549710	549715	100 %	0 %	0 %	0 %	385822239
10521	NC_017474	GGC	2	6	549738	549743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10522	NC_017474	ACC	2	6	549769	549774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822239
10523	NC_017474	TGGTT	2	10	549779	549788	0 %	60 %	40 %	0 %	385822239
10524	NC_017474	GGC	2	6	549810	549815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10525	NC_017474	AAAG	2	8	549913	549920	75 %	0 %	25 %	0 %	385822239
10526	NC_017474	CGA	2	6	549941	549946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822239
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10528	NC_017474	GGC	2	6	550036	550041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822239
10529	NC_017474	CAA	2	6	550061	550066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822239
10530	NC_017474	TTC	2	6	550075	550080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822239
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10532	NC_017474	CAC	2	6	550190	550195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822239
10533	NC_017474	GAT	2	6	550197	550202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822239
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10535	NC_017474	CTG	2	6	550379	550384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822240
10536	NC_017474	ATG	2	6	550439	550444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822240
10537	NC_017474	GGT	2	6	550519	550524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822240
10538	NC_017474	GTT	2	6	550560	550565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822240
10539	NC_017474	GCCG	2	8	550578	550585	0 %	0 %	50 %	50 %	385822240
10540	NC_017474	GCGATT	2	12	550744	550755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385822240
10541	NC_017474	AGC	2	6	550758	550763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822240
10542	NC_017474	TCG	2	6	550797	550802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822240
10543	NC_017474	CAT	2	6	550839	550844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822240
10544	NC_017474	GAT	2	6	550885	550890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822240
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10546	NC_017474	AAG	2	6	551069	551074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822240
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10548	NC_017474	GCC	3	9	551125	551133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822240
10549	NC_017474	CGG	2	6	551198	551203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822240
10550	NC_017474	AAG	2	6	551223	551228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822241
10551	NC_017474	A	6	6	551279	551284	100 %	0 %	0 %	0 %	385822241
10552	NC_017474	A	6	6	551299	551304	100 %	0 %	0 %	0 %	385822241
10553	NC_017474	CTGA	2	8	551376	551383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_017474	AT	3	6	551428	551433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_017474	GTT	2	6	551445	551450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_017474	TAGT	2	8	551465	551472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_017474	GGA	2	6	551489	551494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_017474	AGG	2	6	551653	551658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_017474	CATG	2	8	551703	551710	25 %	25 %	25 %	25 %	385822242
10560	NC_017474	TAC	2	6	551782	551787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822242
10561	NC_017474	CGGA	2	8	551805	551812	25 %	0 %	50 %	25 %	385822242
10562	NC_017474	CGA	2	6	551867	551872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822242
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10569	NC_017474	CA	3	6	552272	552277	50 %	0 %	0 %	50 %	385822242
10570	NC_017474	GGATT	2	10	552295	552304	20 %	40 %	40 %	0 %	385822242
10571	NC_017474	GCT	2	6	552325	552330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822242
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10577	NC_017474	ATC	2	6	552458	552463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822242
10578	NC_017474	ATCA	2	8	552485	552492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10579	NC_017474	CAG	3	9	552521	552529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822243
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10591	NC_017474	A	6	6	552895	552900	100 %	0 %	0 %	0 %	385822243
10592	NC_017474	CTT	2	6	552930	552935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822243
10593	NC_017474	CAC	2	6	552981	552986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822243
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10599	NC_017474	CGG	2	6	553158	553163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822243
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10602	NC_017474	TGA	2	6	553467	553472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_017474	ATGAA	2	10	553481	553490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_017474	TGA	2	6	553594	553599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_017474	TTCT	3	12	553620	553631	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10606	NC_017474	ATG	2	6	553643	553648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822244
10607	NC_017474	GCC	2	6	553705	553710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822244
10608	NC_017474	CATGAT	2	12	553739	553750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385822244
10609	NC_017474	TTC	2	6	553773	553778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822244
10610	NC_017474	ATAA	2	8	553865	553872	75 %	25 %	0 %	0 %	385822244
10611	NC_017474	CAT	2	6	553939	553944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822244
10612	NC_017474	GTT	2	6	553974	553979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822244
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10614	NC_017474	CGAAA	2	10	554119	554128	60 %	0 %	20 %	20 %	385822244
10615	NC_017474	GAA	2	6	554141	554146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822244
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10618	NC_017474	ATT	2	6	554169	554174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822244
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10620	NC_017474	ATT	2	6	554375	554380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10990	NC_017474	AATTT	2	10	571381	571390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10991	NC_017474	CAA	2	6	571413	571418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10992	NC_017474	A	6	6	571417	571422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10993	NC_017474	AAC	2	6	571453	571458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10994	NC_017474	AGC	2	6	571482	571487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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