MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017474	GAT	2	6	522644	522649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822221
10003	NC_017474	CCG	2	6	522670	522675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822221
10004	NC_017474	CTT	2	6	522683	522688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822221
10005	NC_017474	AGC	2	6	522758	522763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822222
10006	NC_017474	A	7	7	522783	522789	100 %	0 %	0 %	0 %	385822222
10007	NC_017474	TGC	2	6	522794	522799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822222
10008	NC_017474	TCTGAT	2	12	522801	522812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385822222
10009	NC_017474	TGG	2	6	522833	522838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822222
10010	NC_017474	TGA	2	6	522869	522874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822222
10011	NC_017474	TGG	2	6	522933	522938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822222
10012	NC_017474	ATT	2	6	522943	522948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822222
10013	NC_017474	T	6	6	522995	523000	0 %	100 %	0 %	0 %	385822222
10014	NC_017474	GCC	2	6	523017	523022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822222
10015	NC_017474	TGA	3	9	523095	523103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822222
10016	NC_017474	TAG	2	6	523115	523120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822222
10017	NC_017474	TGA	2	6	523182	523187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822222
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10019	NC_017474	CGC	2	6	523229	523234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822222
10020	NC_017474	GAA	2	6	523276	523281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822222
10021	NC_017474	GCCA	2	8	523283	523290	25 %	0 %	25 %	50 %	385822222
10022	NC_017474	AAC	2	6	523339	523344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822222
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10025	NC_017474	GACA	2	8	523500	523507	50 %	0 %	25 %	25 %	385822222
10026	NC_017474	AAT	2	6	523561	523566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385822222
10027	NC_017474	GCCA	2	8	523649	523656	25 %	0 %	25 %	50 %	385822222
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10030	NC_017474	GCG	2	6	523801	523806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822222
10031	NC_017474	A	7	7	523889	523895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_017474	TTG	2	6	523899	523904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_017474	AGG	2	6	523949	523954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_017474	T	6	6	523956	523961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_017474	GGC	2	6	524010	524015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822223
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10040	NC_017474	GTC	2	6	524241	524246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822224
10041	NC_017474	TAAAA	2	10	524354	524363	80 %	20 %	0 %	0 %	385822224
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10097	NC_017474	T	6	6	526948	526953	0 %	100 %	0 %	0 %	385822227
10098	NC_017474	AGGCG	2	10	526961	526970	20 %	0 %	60 %	20 %	385822227
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10223	NC_017474	AAT	2	6	533700	533705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10224	NC_017474	ATT	2	6	533729	533734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10226	NC_017474	TCAA	2	8	533850	533857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10227	NC_017474	A	6	6	533890	533895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10238	NC_017474	TCT	2	6	534468	534473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822228
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10240	NC_017474	ATGA	2	8	534556	534563	50 %	25 %	25 %	0 %	385822228
10241	NC_017474	GAA	2	6	534572	534577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822228
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10269	NC_017474	TTCTT	2	10	535829	535838	0 %	80 %	0 %	20 %	385822228
10270	NC_017474	CTG	2	6	535878	535883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822228
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10274	NC_017474	TCA	2	6	536171	536176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822228
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10331	NC_017474	CGT	2	6	539245	539250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822228
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10334	NC_017474	TCC	2	6	539425	539430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10335	NC_017474	AGC	2	6	539468	539473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10337	NC_017474	ATAAA	2	10	539556	539565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10338	NC_017474	GTT	2	6	539587	539592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10339	NC_017474	AGC	2	6	539675	539680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10340	NC_017474	T	7	7	539776	539782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10341	NC_017474	CAAC	2	8	539830	539837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10342	NC_017474	GAG	2	6	539912	539917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10343	NC_017474	CAAA	2	8	539997	540004	75 %	0 %	0 %	25 %	385822229
10344	NC_017474	AAC	2	6	540019	540024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822229
10345	NC_017474	TCA	2	6	540061	540066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822229
10346	NC_017474	TGA	2	6	540124	540129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822229
10347	NC_017474	ATG	2	6	540215	540220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822229
10348	NC_017474	TTA	2	6	540235	540240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822229
10349	NC_017474	ATT	2	6	540266	540271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822229
10350	NC_017474	TGA	2	6	540319	540324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822229
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10353	NC_017474	ATC	2	6	540386	540391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822229
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10355	NC_017474	ACC	2	6	540440	540445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822229
10356	NC_017474	AAAC	2	8	540497	540504	75 %	0 %	0 %	25 %	385822229
10357	NC_017474	GTG	2	6	540516	540521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822229
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10359	NC_017474	CTTTG	2	10	540571	540580	0 %	60 %	20 %	20 %	385822229
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