MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017474	CGT	2	6	420707	420712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822127
8002	NC_017474	ATT	2	6	420791	420796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822128
8003	NC_017474	TCC	2	6	420812	420817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385822128
8004	NC_017474	GGC	2	6	420926	420931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822128
8005	NC_017474	CAA	2	6	421011	421016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822128
8006	NC_017474	CAGGT	2	10	421083	421092	20 %	20 %	40 %	20 %	385822128
8007	NC_017474	TGC	2	6	421135	421140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822128
8008	NC_017474	CAT	2	6	421174	421179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822128
8009	NC_017474	TTG	2	6	421239	421244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822128
8010	NC_017474	AGA	2	6	421261	421266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822128
8011	NC_017474	GGA	2	6	421307	421312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385822128
8012	NC_017474	GGA	2	6	421325	421330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385822128
8013	NC_017474	GTT	2	6	421340	421345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822128
8014	NC_017474	ATG	2	6	421367	421372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822128
8015	NC_017474	TTC	2	6	421394	421399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822128
8016	NC_017474	CGG	2	6	421417	421422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822128
8017	NC_017474	ATA	2	6	421515	421520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385822128
8018	NC_017474	AGA	2	6	421582	421587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822128
8019	NC_017474	GAC	2	6	421595	421600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822128
8020	NC_017474	TAAA	2	8	421644	421651	75 %	25 %	0 %	0 %	385822129
8021	NC_017474	CAA	2	6	421709	421714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822129
8022	NC_017474	CAA	2	6	421770	421775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822129
8023	NC_017474	GAA	2	6	421792	421797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822129
8024	NC_017474	AGA	2	6	421798	421803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822129
8025	NC_017474	AACAC	2	10	421841	421850	60 %	0 %	0 %	40 %	385822129
8026	NC_017474	TG	3	6	421857	421862	0 %	50 %	50 %	0 %	385822129
8027	NC_017474	TTG	2	6	421869	421874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822129
8028	NC_017474	AGA	2	6	421891	421896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822129
8029	NC_017474	GAT	2	6	421922	421927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822129
8030	NC_017474	ATTCT	2	10	422066	422075	20 %	60 %	0 %	20 %	385822129
8031	NC_017474	TCT	2	6	422173	422178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822129
8032	NC_017474	TCA	2	6	422217	422222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822129
8033	NC_017474	GTT	2	6	422267	422272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822129
8034	NC_017474	ACA	2	6	422297	422302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822129
8035	NC_017474	GAAA	2	8	422388	422395	75 %	0 %	25 %	0 %	385822129
8036	NC_017474	TTG	2	6	422439	422444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822129
8037	NC_017474	ATCA	2	8	422486	422493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8038	NC_017474	TAA	2	6	422502	422507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017474	AAG	2	6	422567	422572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822130
8040	NC_017474	AGGG	2	8	422640	422647	25 %	0 %	75 %	0 %	385822130
8041	NC_017474	GTT	2	6	422648	422653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017474	AAAT	2	8	422703	422710	75 %	25 %	0 %	0 %	385822131
8043	NC_017474	ATT	2	6	422758	422763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822131
8044	NC_017474	AT	3	6	422847	422852	50 %	50 %	0 %	0 %	385822131
8045	NC_017474	GCA	2	6	422860	422865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822131
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8047	NC_017474	TGC	2	6	422924	422929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822131
8048	NC_017474	ACA	2	6	423001	423006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822131
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8052	NC_017474	TGA	2	6	423159	423164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822131
8053	NC_017474	GCG	2	6	423206	423211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822131
8054	NC_017474	AAC	2	6	423239	423244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822131
8055	NC_017474	TGG	2	6	423279	423284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822131
8056	NC_017474	ATA	2	6	423299	423304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385822131
8057	NC_017474	ATG	2	6	423430	423435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822131
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8061	NC_017474	CTT	2	6	423603	423608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_017474	ATC	2	6	423622	423627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8064	NC_017474	CTGA	2	8	423709	423716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_017474	TTTA	2	8	423717	423724	25 %	75 %	0 %	0 %	385822132
8066	NC_017474	GAC	2	6	423763	423768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822132
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8088	NC_017474	CA	4	8	424627	424634	50 %	0 %	0 %	50 %	385822132
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8094	NC_017474	GA	3	6	424853	424858	50 %	0 %	50 %	0 %	385822132
8095	NC_017474	AAAG	2	8	424899	424906	75 %	0 %	25 %	0 %	385822132
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8099	NC_017474	AGTTA	2	10	425270	425279	40 %	40 %	20 %	0 %	385822133
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8101	NC_017474	ATTT	2	8	425468	425475	25 %	75 %	0 %	0 %	385822133
8102	NC_017474	T	6	6	425489	425494	0 %	100 %	0 %	0 %	385822133
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8105	NC_017474	CTCG	2	8	425610	425617	0 %	25 %	25 %	50 %	385822133
8106	NC_017474	ATT	2	6	425625	425630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822133
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8108	NC_017474	TGT	2	6	425706	425711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822133
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8241	NC_017474	TCA	2	6	431840	431845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8243	NC_017474	T	7	7	431881	431887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8495	NC_017474	CAGC	2	8	444116	444123	25 %	0 %	25 %	50 %	385822153
8496	NC_017474	AAT	2	6	444140	444145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385822153
8497	NC_017474	CAT	2	6	444160	444165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822153
8498	NC_017474	CAA	2	6	444182	444187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822153
8499	NC_017474	TTGGG	2	10	444241	444250	0 %	40 %	60 %	0 %	385822153
8500	NC_017474	GAA	2	6	444289	444294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822153

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