MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_017474	TGAA	2	8	2924454	2924461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56002	NC_017474	T	6	6	2924477	2924482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56003	NC_017474	TTCAG	2	10	2924499	2924508	20 %	40 %	20 %	20 %	385824684
56004	NC_017474	CCT	2	6	2924522	2924527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824684
56005	NC_017474	ATC	2	6	2924535	2924540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824684
56006	NC_017474	GCC	2	6	2924541	2924546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824684
56007	NC_017474	TGC	2	6	2924549	2924554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824684
56008	NC_017474	ATTCG	2	10	2924586	2924595	20 %	40 %	20 %	20 %	385824684
56009	NC_017474	ACCA	2	8	2924802	2924809	50 %	0 %	0 %	50 %	385824684
56010	NC_017474	AAC	2	6	2924844	2924849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824684
56011	NC_017474	AAT	2	6	2924907	2924912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824684
56012	NC_017474	CAG	2	6	2925024	2925029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824684
56013	NC_017474	GCCAA	2	10	2925046	2925055	40 %	0 %	20 %	40 %	385824684
56014	NC_017474	ATG	2	6	2925103	2925108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824684
56015	NC_017474	AGAA	2	8	2925114	2925121	75 %	0 %	25 %	0 %	385824684
56016	NC_017474	CCGCC	2	10	2925230	2925239	0 %	0 %	20 %	80 %	385824684
56017	NC_017474	AAT	2	6	2925253	2925258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824684
56018	NC_017474	CCCT	2	8	2925350	2925357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56019	NC_017474	GCC	2	6	2925387	2925392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56020	NC_017474	AAT	2	6	2925425	2925430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824685
56021	NC_017474	A	6	6	2925453	2925458	100 %	0 %	0 %	0 %	385824685
56022	NC_017474	ACA	2	6	2925534	2925539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824685
56023	NC_017474	ATT	2	6	2925568	2925573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56024	NC_017474	T	6	6	2925572	2925577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56025	NC_017474	ATG	2	6	2925594	2925599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56026	NC_017474	ATT	2	6	2925720	2925725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56027	NC_017474	ACA	2	6	2925795	2925800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824686
56028	NC_017474	TGT	2	6	2925823	2925828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824686
56029	NC_017474	ATT	2	6	2925952	2925957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824686
56030	NC_017474	ACGGC	2	10	2926185	2926194	20 %	0 %	40 %	40 %	385824687
56031	NC_017474	TG	3	6	2926285	2926290	0 %	50 %	50 %	0 %	385824687
56032	NC_017474	T	6	6	2926307	2926312	0 %	100 %	0 %	0 %	385824687
56033	NC_017474	GAT	2	6	2926320	2926325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824687
56034	NC_017474	AT	3	6	2926376	2926381	50 %	50 %	0 %	0 %	385824687
56035	NC_017474	AAC	2	6	2926385	2926390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824687
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56039	NC_017474	TGT	2	6	2926721	2926726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824687
56040	NC_017474	GATC	2	8	2926727	2926734	25 %	25 %	25 %	25 %	385824687
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56042	NC_017474	A	6	6	2926865	2926870	100 %	0 %	0 %	0 %	385824687
56043	NC_017474	TTC	2	6	2926958	2926963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824687
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56047	NC_017474	AATA	2	8	2927006	2927013	75 %	25 %	0 %	0 %	385824687
56048	NC_017474	CCG	2	6	2927024	2927029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824687
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56051	NC_017474	CGT	2	6	2927086	2927091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56052	NC_017474	TCC	2	6	2927092	2927097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56053	NC_017474	GTT	2	6	2927105	2927110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56054	NC_017474	TTA	2	6	2927115	2927120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56055	NC_017474	T	6	6	2927165	2927170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56056	NC_017474	GCT	2	6	2927215	2927220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824688
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56060	NC_017474	CAA	3	9	2927383	2927391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824688
56061	NC_017474	TCG	2	6	2927420	2927425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824688
56062	NC_017474	TGAT	2	8	2927429	2927436	25 %	50 %	25 %	0 %	385824688
56063	NC_017474	CAT	2	6	2927503	2927508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824688
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56068	NC_017474	GCT	3	9	2927704	2927712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824688
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56071	NC_017474	TTGG	2	8	2927792	2927799	0 %	50 %	50 %	0 %	385824688
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56083	NC_017474	A	6	6	2928234	2928239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56084	NC_017474	GT	3	6	2928282	2928287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56085	NC_017474	TCACA	2	10	2928351	2928360	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56086	NC_017474	T	7	7	2928392	2928398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56087	NC_017474	GAC	2	6	2928420	2928425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56090	NC_017474	AACG	2	8	2928626	2928633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56091	NC_017474	T	6	6	2928634	2928639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56092	NC_017474	AT	3	6	2928666	2928671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56093	NC_017474	TCCTAT	2	12	2928672	2928683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56094	NC_017474	T	6	6	2928706	2928711	0 %	100 %	0 %	0 %	385824690
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56106	NC_017474	T	6	6	2929235	2929240	0 %	100 %	0 %	0 %	385824690
56107	NC_017474	CAC	2	6	2929271	2929276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56108	NC_017474	CGC	2	6	2929295	2929300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824691
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56112	NC_017474	CAAAA	2	10	2929643	2929652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56113	NC_017474	TAAA	2	8	2929726	2929733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56114	NC_017474	T	6	6	2929745	2929750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56115	NC_017474	ATG	2	6	2929809	2929814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824692
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56120	NC_017474	ATG	2	6	2930022	2930027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824692
56121	NC_017474	GTT	2	6	2930066	2930071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56122	NC_017474	GC	3	6	2930228	2930233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56123	NC_017474	CCG	2	6	2930248	2930253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56124	NC_017474	CGC	2	6	2930301	2930306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56125	NC_017474	GTGA	2	8	2930404	2930411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56126	NC_017474	TTG	2	6	2930418	2930423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56130	NC_017474	TGT	2	6	2930661	2930666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56234	NC_017474	ATACC	2	10	2937212	2937221	40 %	20 %	0 %	40 %	385824703
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