MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_017474	CCAT	2	8	2870941	2870948	25 %	25 %	0 %	50 %	385824639
55002	NC_017474	TCC	2	6	2871063	2871068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55003	NC_017474	AAT	2	6	2871090	2871095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824640
55004	NC_017474	ACC	2	6	2871105	2871110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824640
55005	NC_017474	AAC	2	6	2871111	2871116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824640
55006	NC_017474	CAA	2	6	2871125	2871130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824640
55007	NC_017474	TTC	2	6	2871160	2871165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824640
55008	NC_017474	AACT	2	8	2871216	2871223	50 %	25 %	0 %	25 %	385824640
55009	NC_017474	GAA	2	6	2871377	2871382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824640
55010	NC_017474	CTT	2	6	2871395	2871400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824640
55011	NC_017474	GAT	2	6	2871447	2871452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824640
55012	NC_017474	TGC	2	6	2871504	2871509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824640
55013	NC_017474	TCG	2	6	2871619	2871624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824640
55014	NC_017474	TTC	2	6	2871651	2871656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824640
55015	NC_017474	CCA	2	6	2871685	2871690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824640
55016	NC_017474	GAA	2	6	2871708	2871713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824640
55017	NC_017474	TGC	2	6	2871732	2871737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824640
55018	NC_017474	TCA	3	9	2871751	2871759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824640
55019	NC_017474	CTT	2	6	2871768	2871773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824640
55020	NC_017474	GTAGTT	2	12	2871822	2871833	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385824640
55021	NC_017474	GAC	2	6	2871870	2871875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824640
55022	NC_017474	T	6	6	2871891	2871896	0 %	100 %	0 %	0 %	385824640
55023	NC_017474	GTT	2	6	2871938	2871943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824640
55024	NC_017474	CTT	2	6	2871945	2871950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824640
55025	NC_017474	TCT	2	6	2871952	2871957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824640
55026	NC_017474	AAT	2	6	2871987	2871992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824641
55027	NC_017474	GAA	2	6	2872082	2872087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824641
55028	NC_017474	TGC	2	6	2872102	2872107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824641
55029	NC_017474	ACC	2	6	2872193	2872198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824641
55030	NC_017474	CAGC	2	8	2872234	2872241	25 %	0 %	25 %	50 %	385824641
55031	NC_017474	CTT	2	6	2872321	2872326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824641
55032	NC_017474	GCC	2	6	2872329	2872334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824641
55033	NC_017474	GCA	2	6	2872375	2872380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824641
55034	NC_017474	CTA	2	6	2872396	2872401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824641
55035	NC_017474	ACCA	2	8	2872592	2872599	50 %	0 %	0 %	50 %	385824641
55036	NC_017474	ATG	2	6	2872623	2872628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824641
55037	NC_017474	TAA	2	6	2872677	2872682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824641
55038	NC_017474	TCC	2	6	2872732	2872737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55039	NC_017474	CAG	2	6	2872748	2872753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824642
55040	NC_017474	TCA	3	9	2872842	2872850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824642
55041	NC_017474	ACC	2	6	2872901	2872906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824642
55042	NC_017474	AAC	2	6	2872910	2872915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824642
55043	NC_017474	TAA	2	6	2872976	2872981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824642
55044	NC_017474	TGACAT	2	12	2873066	2873077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385824642
55045	NC_017474	A	6	6	2873088	2873093	100 %	0 %	0 %	0 %	385824642
55046	NC_017474	CAT	2	6	2873110	2873115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824642
55047	NC_017474	TGACC	2	10	2873164	2873173	20 %	20 %	20 %	40 %	385824642
55048	NC_017474	GCA	2	6	2873308	2873313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824643
55049	NC_017474	CAT	2	6	2873340	2873345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824643
55050	NC_017474	AAT	2	6	2873364	2873369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824643
55051	NC_017474	TAAT	2	8	2873390	2873397	50 %	50 %	0 %	0 %	385824643
55052	NC_017474	TCT	2	6	2873497	2873502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824643
55053	NC_017474	CTT	2	6	2873672	2873677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55054	NC_017474	TCA	2	6	2873690	2873695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55055	NC_017474	ACG	2	6	2873880	2873885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824644
55056	NC_017474	ATGTA	2	10	2874207	2874216	40 %	40 %	20 %	0 %	385824644
55057	NC_017474	TCG	2	6	2874351	2874356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824644
55058	NC_017474	GGCAA	2	10	2874369	2874378	40 %	0 %	40 %	20 %	385824644
55059	NC_017474	CTGG	2	8	2874391	2874398	0 %	25 %	50 %	25 %	385824644
55060	NC_017474	CAT	2	6	2874421	2874426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824644
55061	NC_017474	T	7	7	2874483	2874489	0 %	100 %	0 %	0 %	385824644
55062	NC_017474	GAC	2	6	2874631	2874636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824644
55063	NC_017474	GTC	2	6	2874656	2874661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824644
55064	NC_017474	TGT	2	6	2874720	2874725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824644
55065	NC_017474	AATC	2	8	2874755	2874762	50 %	25 %	0 %	25 %	385824644
55066	NC_017474	ATA	2	6	2874810	2874815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824644
55067	NC_017474	T	6	6	2874828	2874833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55068	NC_017474	ATA	2	6	2874855	2874860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55069	NC_017474	ATT	2	6	2874867	2874872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55070	NC_017474	TTAA	2	8	2874929	2874936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55071	NC_017474	AT	3	6	2874946	2874951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55072	NC_017474	GTTT	2	8	2874986	2874993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55073	NC_017474	ACA	2	6	2875050	2875055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824645
55074	NC_017474	AAT	2	6	2875056	2875061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824645
55075	NC_017474	GTC	2	6	2875163	2875168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824645
55076	NC_017474	GCG	2	6	2875193	2875198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824645
55077	NC_017474	CTAT	2	8	2875226	2875233	25 %	50 %	0 %	25 %	385824645
55078	NC_017474	CAA	2	6	2875246	2875251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824645
55079	NC_017474	AAC	2	6	2875265	2875270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824645
55080	NC_017474	CAC	2	6	2875332	2875337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824645
55081	NC_017474	AGC	2	6	2875338	2875343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824645
55082	NC_017474	TAA	2	6	2875377	2875382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824645
55083	NC_017474	TTG	2	6	2875385	2875390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824645
55084	NC_017474	TCA	2	6	2875391	2875396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824645
55085	NC_017474	TCAA	2	8	2875402	2875409	50 %	25 %	0 %	25 %	385824645
55086	NC_017474	AGA	2	6	2875425	2875430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824645
55087	NC_017474	CCGAT	2	10	2875433	2875442	20 %	20 %	20 %	40 %	385824645
55088	NC_017474	GTC	2	6	2875447	2875452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824645
55089	NC_017474	CTT	2	6	2875453	2875458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824645
55090	NC_017474	GGC	3	9	2875459	2875467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824645
55091	NC_017474	TCT	2	6	2875526	2875531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824645
55092	NC_017474	CTT	2	6	2875542	2875547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824645
55093	NC_017474	A	7	7	2875615	2875621	100 %	0 %	0 %	0 %	385824645
55094	NC_017474	GCA	2	6	2875626	2875631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824645
55095	NC_017474	TTGC	2	8	2875648	2875655	0 %	50 %	25 %	25 %	385824645
55096	NC_017474	CAT	2	6	2875716	2875721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824645
55097	NC_017474	TGA	2	6	2875740	2875745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824645
55098	NC_017474	TCG	2	6	2875756	2875761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824645
55099	NC_017474	ACGA	2	8	2875809	2875816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55100	NC_017474	CTATT	2	10	2875856	2875865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55101	NC_017474	A	6	6	2875961	2875966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55102	NC_017474	TTA	2	6	2876003	2876008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55103	NC_017474	CAAA	2	8	2876017	2876024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55104	NC_017474	ATT	2	6	2876083	2876088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824646
55105	NC_017474	GCT	2	6	2876130	2876135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824646
55106	NC_017474	TCA	2	6	2876281	2876286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824646
55107	NC_017474	GGC	2	6	2876331	2876336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824646
55108	NC_017474	GTT	3	9	2876571	2876579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824646
55109	NC_017474	ACT	2	6	2876743	2876748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824646
55110	NC_017474	GGATC	2	10	2876784	2876793	20 %	20 %	40 %	20 %	385824646
55111	NC_017474	TCG	2	6	2876836	2876841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824646
55112	NC_017474	GTC	2	6	2876890	2876895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824646
55113	NC_017474	TTGG	2	8	2877047	2877054	0 %	50 %	50 %	0 %	385824646
55114	NC_017474	CAT	2	6	2877116	2877121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824646
55115	NC_017474	GGC	2	6	2877165	2877170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824646
55116	NC_017474	TCA	2	6	2877286	2877291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824646
55117	NC_017474	CCA	2	6	2877373	2877378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824646
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55234	NC_017474	CGT	2	6	2883264	2883269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824651
55235	NC_017474	GCGG	2	8	2883294	2883301	0 %	0 %	75 %	25 %	385824651
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55239	NC_017474	ATC	2	6	2883505	2883510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824651
55240	NC_017474	CATTG	2	10	2883567	2883576	20 %	40 %	20 %	20 %	385824651
55241	NC_017474	TGC	2	6	2883606	2883611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824651
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55259	NC_017474	TGTT	2	8	2884500	2884507	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55260	NC_017474	ACG	2	6	2884514	2884519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55262	NC_017474	TGTA	2	8	2884533	2884540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55263	NC_017474	TA	3	6	2884549	2884554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55264	NC_017474	TTTTCG	2	12	2884584	2884595	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385824652
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55271	NC_017474	GT	3	6	2884878	2884883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55272	NC_017474	TGGTC	2	10	2884903	2884912	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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55349	NC_017474	AGA	2	6	2888878	2888883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55353	NC_017474	TTC	2	6	2889055	2889060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55355	NC_017474	GT	3	6	2889108	2889113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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