MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_017474	AAT	2	6	2844043	2844048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54502	NC_017474	CTG	2	6	2844097	2844102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54503	NC_017474	AATT	2	8	2844156	2844163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54504	NC_017474	CAA	2	6	2844168	2844173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54505	NC_017474	GCTT	2	8	2844209	2844216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54506	NC_017474	CCA	2	6	2844298	2844303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824612
54507	NC_017474	TCT	2	6	2844336	2844341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824612
54508	NC_017474	GAA	2	6	2844427	2844432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824612
54509	NC_017474	GCC	2	6	2844458	2844463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824612
54510	NC_017474	GGTT	2	8	2844464	2844471	0 %	50 %	50 %	0 %	385824612
54511	NC_017474	CTT	2	6	2844520	2844525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824612
54512	NC_017474	GCC	2	6	2844536	2844541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824612
54513	NC_017474	GAA	2	6	2844548	2844553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824612
54514	NC_017474	TCA	2	6	2844891	2844896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824612
54515	NC_017474	CAC	2	6	2844923	2844928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824612
54516	NC_017474	TGGA	2	8	2844969	2844976	25 %	25 %	50 %	0 %	385824612
54517	NC_017474	ATG	2	6	2845124	2845129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824613
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54519	NC_017474	TGG	2	6	2845215	2845220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824613
54520	NC_017474	CCG	2	6	2845233	2845238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824613
54521	NC_017474	CG	3	6	2845237	2845242	0 %	0 %	50 %	50 %	385824613
54522	NC_017474	CTT	2	6	2845272	2845277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824613
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54538	NC_017474	CGT	2	6	2846573	2846578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824614
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54544	NC_017474	CG	3	6	2846804	2846809	0 %	0 %	50 %	50 %	385824614
54545	NC_017474	TGT	2	6	2846966	2846971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824614
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54551	NC_017474	GTT	2	6	2847221	2847226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824614
54552	NC_017474	CTG	2	6	2847266	2847271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824614
54553	NC_017474	TG	3	6	2847291	2847296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54554	NC_017474	GAA	3	9	2847564	2847572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824615
54555	NC_017474	GAT	2	6	2847591	2847596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824615
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54599	NC_017474	GAACG	2	10	2849542	2849551	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54600	NC_017474	GCCA	2	8	2849569	2849576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54601	NC_017474	CAA	2	6	2849695	2849700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54604	NC_017474	TCC	2	6	2849790	2849795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54605	NC_017474	TAT	2	6	2849796	2849801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54606	NC_017474	GTTT	2	8	2849922	2849929	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54607	NC_017474	AAGT	2	8	2849935	2849942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54608	NC_017474	ACA	2	6	2849951	2849956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54616	NC_017474	CCA	2	6	2850427	2850432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824619
54617	NC_017474	ATC	2	6	2850440	2850445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824619
54618	NC_017474	CAT	2	6	2850509	2850514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824619
54619	NC_017474	TTG	3	9	2850541	2850549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824619
54620	NC_017474	TGC	2	6	2850555	2850560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
54621	NC_017474	AATA	2	8	2850571	2850578	75 %	25 %	0 %	0 %	385824619
54622	NC_017474	CTG	2	6	2850599	2850604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
54623	NC_017474	TGT	2	6	2850609	2850614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824619
54624	NC_017474	ACT	2	6	2850642	2850647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824619
54625	NC_017474	GCT	2	6	2850649	2850654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
54626	NC_017474	T	6	6	2850686	2850691	0 %	100 %	0 %	0 %	385824619
54627	NC_017474	CTC	2	6	2850700	2850705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824619
54628	NC_017474	AC	3	6	2850781	2850786	50 %	0 %	0 %	50 %	385824619
54629	NC_017474	TGA	2	6	2850787	2850792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
54630	NC_017474	CAT	2	6	2850829	2850834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824619
54631	NC_017474	GCT	2	6	2850886	2850891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
54632	NC_017474	AAAC	2	8	2851000	2851007	75 %	0 %	0 %	25 %	385824619
54633	NC_017474	T	6	6	2851054	2851059	0 %	100 %	0 %	0 %	385824619
54634	NC_017474	GACT	2	8	2851146	2851153	25 %	25 %	25 %	25 %	385824619
54635	NC_017474	CAAC	2	8	2851207	2851214	50 %	0 %	0 %	50 %	385824619
54636	NC_017474	GAT	2	6	2851229	2851234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
54637	NC_017474	ATA	2	6	2851301	2851306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824619
54638	NC_017474	CTG	2	6	2851376	2851381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
54639	NC_017474	GAT	2	6	2851405	2851410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
54640	NC_017474	TCGGT	2	10	2851594	2851603	0 %	40 %	40 %	20 %	385824619
54641	NC_017474	CTG	2	6	2851655	2851660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
54642	NC_017474	TGA	2	6	2851663	2851668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
54643	NC_017474	CGG	2	6	2851683	2851688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824619
54644	NC_017474	ATA	2	6	2851721	2851726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824619
54645	NC_017474	TTC	2	6	2851776	2851781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824619
54646	NC_017474	CTG	2	6	2851829	2851834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
54647	NC_017474	GTG	2	6	2851839	2851844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824619
54648	NC_017474	ATC	2	6	2851922	2851927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824619
54649	NC_017474	CGC	2	6	2852015	2852020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824619
54650	NC_017474	ACTG	2	8	2852066	2852073	25 %	25 %	25 %	25 %	385824619
54651	NC_017474	C	6	6	2852174	2852179	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54652	NC_017474	ACA	2	6	2852224	2852229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54653	NC_017474	CAA	2	6	2852306	2852311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54654	NC_017474	GC	3	6	2852359	2852364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54655	NC_017474	TTAT	2	8	2852365	2852372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54656	NC_017474	A	7	7	2852415	2852421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54657	NC_017474	A	6	6	2852464	2852469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54658	NC_017474	T	6	6	2852499	2852504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54659	NC_017474	CTG	2	6	2852515	2852520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54660	NC_017474	TGAA	2	8	2852537	2852544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54661	NC_017474	TGC	2	6	2852553	2852558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54662	NC_017474	T	6	6	2852629	2852634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54663	NC_017474	AAATT	2	10	2852636	2852645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54664	NC_017474	CAT	2	6	2852657	2852662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54665	NC_017474	CTT	2	6	2852718	2852723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824620
54666	NC_017474	CAT	2	6	2852742	2852747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824620
54667	NC_017474	GCT	2	6	2852750	2852755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824620
54668	NC_017474	GTT	2	6	2852769	2852774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824620
54669	NC_017474	TG	4	8	2852871	2852878	0 %	50 %	50 %	0 %	385824620
54670	NC_017474	GAAT	2	8	2852893	2852900	50 %	25 %	25 %	0 %	385824620
54671	NC_017474	ACG	2	6	2852981	2852986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824620
54672	NC_017474	AAT	2	6	2853089	2853094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824620
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54675	NC_017474	CCAA	2	8	2853185	2853192	50 %	0 %	0 %	50 %	385824620
54676	NC_017474	CCTT	2	8	2853257	2853264	0 %	50 %	0 %	50 %	385824620
54677	NC_017474	TGG	2	6	2853282	2853287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824620
54678	NC_017474	ATT	2	6	2853360	2853365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54679	NC_017474	TTA	2	6	2853494	2853499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824621
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54681	NC_017474	CCG	2	6	2853644	2853649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824622
54682	NC_017474	TCG	2	6	2853667	2853672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824622
54683	NC_017474	TCA	2	6	2853677	2853682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824622
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54687	NC_017474	CAA	3	9	2853928	2853936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824623
54688	NC_017474	CTT	2	6	2854009	2854014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824623
54689	NC_017474	GCAG	2	8	2854074	2854081	25 %	0 %	50 %	25 %	385824623
54690	NC_017474	GAAA	2	8	2854176	2854183	75 %	0 %	25 %	0 %	385824623
54691	NC_017474	GTG	2	6	2854237	2854242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824623
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54693	NC_017474	CAA	2	6	2854303	2854308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824623
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54696	NC_017474	TGG	2	6	2854504	2854509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824623
54697	NC_017474	TGC	2	6	2854547	2854552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824623
54698	NC_017474	TGAT	2	8	2854610	2854617	25 %	50 %	25 %	0 %	385824623
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54700	NC_017474	AT	3	6	2854689	2854694	50 %	50 %	0 %	0 %	385824623
54701	NC_017474	TTC	2	6	2854749	2854754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824623
54702	NC_017474	GCC	2	6	2854778	2854783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824623
54703	NC_017474	CAA	2	6	2854864	2854869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824623
54704	NC_017474	GCC	2	6	2854895	2854900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824623
54705	NC_017474	GCC	2	6	2854952	2854957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824623
54706	NC_017474	GCC	2	6	2854961	2854966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824623
54707	NC_017474	CCT	2	6	2855023	2855028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54708	NC_017474	CTT	2	6	2855046	2855051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824624
54709	NC_017474	GTTT	2	8	2855099	2855106	0 %	75 %	25 %	0 %	385824624
54710	NC_017474	CCG	2	6	2855141	2855146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824624
54711	NC_017474	TCA	2	6	2855154	2855159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824624
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54713	NC_017474	GTA	2	6	2855329	2855334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824624
54714	NC_017474	AAG	2	6	2855342	2855347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824624
54715	NC_017474	TGC	2	6	2855386	2855391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824624
54716	NC_017474	TTC	2	6	2855461	2855466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824624
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54718	NC_017474	TCA	2	6	2855490	2855495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824624
54719	NC_017474	CAA	2	6	2855500	2855505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824624
54720	NC_017474	AATG	2	8	2855542	2855549	50 %	25 %	25 %	0 %	385824624
54721	NC_017474	TAAATT	2	12	2855623	2855634	50 %	50 %	0 %	0 %	385824625
54722	NC_017474	TTC	2	6	2855638	2855643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824625
54723	NC_017474	ATT	2	6	2855757	2855762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824625
54724	NC_017474	TCA	2	6	2855921	2855926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824625
54725	NC_017474	ATC	2	6	2855946	2855951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824625
54726	NC_017474	CGC	2	6	2856099	2856104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824625
54727	NC_017474	ATT	2	6	2856195	2856200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824626
54728	NC_017474	CGC	2	6	2856204	2856209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824626
54729	NC_017474	TTCA	2	8	2856210	2856217	25 %	50 %	0 %	25 %	385824626
54730	NC_017474	CAG	2	6	2856231	2856236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824626
54731	NC_017474	TCC	2	6	2856256	2856261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824626
54732	NC_017474	T	6	6	2856267	2856272	0 %	100 %	0 %	0 %	385824626
54733	NC_017474	TAAC	2	8	2856307	2856314	50 %	25 %	0 %	25 %	385824626
54734	NC_017474	CCA	2	6	2856322	2856327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824626
54735	NC_017474	TGG	2	6	2856431	2856436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824626
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54834	NC_017474	T	6	6	2861928	2861933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54835	NC_017474	GCTAA	2	10	2861948	2861957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54836	NC_017474	GCTT	2	8	2861970	2861977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54837	NC_017474	GAC	2	6	2862043	2862048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824631
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54843	NC_017474	CCG	3	9	2862504	2862512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824631
54844	NC_017474	TAAT	2	8	2862525	2862532	50 %	50 %	0 %	0 %	385824631
54845	NC_017474	CAC	2	6	2862568	2862573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824631
54846	NC_017474	AACCA	2	10	2862586	2862595	60 %	0 %	0 %	40 %	385824631
54847	NC_017474	CGT	2	6	2862649	2862654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824631
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54849	NC_017474	TGCT	2	8	2862797	2862804	0 %	50 %	25 %	25 %	385824632
54850	NC_017474	GAT	2	6	2862822	2862827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824632
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