MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_017474	ACA	2	6	2817963	2817968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824586
54002	NC_017474	GC	3	6	2817974	2817979	0 %	0 %	50 %	50 %	385824586
54003	NC_017474	TCTT	2	8	2818037	2818044	0 %	75 %	0 %	25 %	385824586
54004	NC_017474	TCA	2	6	2818122	2818127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824586
54005	NC_017474	GCC	2	6	2818138	2818143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824586
54006	NC_017474	TGGA	2	8	2818284	2818291	25 %	25 %	50 %	0 %	385824586
54007	NC_017474	CTT	2	6	2818355	2818360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824586
54008	NC_017474	GCA	2	6	2818512	2818517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824586
54009	NC_017474	TGGA	2	8	2818520	2818527	25 %	25 %	50 %	0 %	385824586
54010	NC_017474	CAA	2	6	2818582	2818587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824586
54011	NC_017474	AAAAG	2	10	2818590	2818599	80 %	0 %	20 %	0 %	385824586
54012	NC_017474	TAG	2	6	2818612	2818617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824586
54013	NC_017474	GAT	2	6	2818652	2818657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824586
54014	NC_017474	TCGCCA	2	12	2818766	2818777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385824586
54015	NC_017474	GCC	2	6	2818883	2818888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824586
54016	NC_017474	GCTC	2	8	2818906	2818913	0 %	25 %	25 %	50 %	385824586
54017	NC_017474	ATG	2	6	2818938	2818943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824586
54018	NC_017474	AT	3	6	2818972	2818977	50 %	50 %	0 %	0 %	385824586
54019	NC_017474	CGTT	2	8	2818987	2818994	0 %	50 %	25 %	25 %	385824586
54020	NC_017474	CCA	2	6	2819002	2819007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824586
54021	NC_017474	AGGT	2	8	2819037	2819044	25 %	25 %	50 %	0 %	385824586
54022	NC_017474	TTG	2	6	2819055	2819060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824586
54023	NC_017474	AAGT	2	8	2819073	2819080	50 %	25 %	25 %	0 %	385824586
54024	NC_017474	TGT	2	6	2819092	2819097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824586
54025	NC_017474	GCC	2	6	2819103	2819108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824586
54026	NC_017474	TG	3	6	2819269	2819274	0 %	50 %	50 %	0 %	385824586
54027	NC_017474	TGA	2	6	2819296	2819301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824586
54028	NC_017474	CCAT	2	8	2819389	2819396	25 %	25 %	0 %	50 %	385824586
54029	NC_017474	TCTAA	2	10	2819430	2819439	40 %	40 %	0 %	20 %	385824587
54030	NC_017474	GTC	2	6	2819463	2819468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824587
54031	NC_017474	TCA	2	6	2819481	2819486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824587
54032	NC_017474	TCA	2	6	2819520	2819525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824587
54033	NC_017474	ATG	2	6	2819562	2819567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824587
54034	NC_017474	ACC	2	6	2819568	2819573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824587
54035	NC_017474	ATT	2	6	2819603	2819608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824587
54036	NC_017474	AAT	2	6	2819659	2819664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824587
54037	NC_017474	GTGA	2	8	2819684	2819691	25 %	25 %	50 %	0 %	385824587
54038	NC_017474	AGCA	2	8	2819713	2819720	50 %	0 %	25 %	25 %	385824587
54039	NC_017474	T	7	7	2819721	2819727	0 %	100 %	0 %	0 %	385824587
54040	NC_017474	TAG	2	6	2819914	2819919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824587
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54042	NC_017474	ATC	2	6	2820052	2820057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824587
54043	NC_017474	AATGGT	2	12	2820073	2820084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824587
54044	NC_017474	TGC	2	6	2820179	2820184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824587
54045	NC_017474	GAT	2	6	2820221	2820226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824587
54046	NC_017474	GGAAA	2	10	2820259	2820268	60 %	0 %	40 %	0 %	385824587
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54050	NC_017474	TGC	2	6	2820413	2820418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824588
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54060	NC_017474	A	6	6	2821020	2821025	100 %	0 %	0 %	0 %	385824588
54061	NC_017474	T	6	6	2821031	2821036	0 %	100 %	0 %	0 %	385824588
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54072	NC_017474	TGGT	2	8	2821707	2821714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54089	NC_017474	TCG	2	6	2822535	2822540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824591
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54107	NC_017474	TCAA	2	8	2823288	2823295	50 %	25 %	0 %	25 %	385824591
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54112	NC_017474	GCA	2	6	2823464	2823469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824592
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54115	NC_017474	CCA	2	6	2823591	2823596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824592
54116	NC_017474	ATC	2	6	2823601	2823606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824592
54117	NC_017474	TCC	2	6	2823680	2823685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824592
54118	NC_017474	ATC	2	6	2823709	2823714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824592
54119	NC_017474	CAGT	2	8	2823723	2823730	25 %	25 %	25 %	25 %	385824592
54120	NC_017474	ATA	3	9	2823770	2823778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824592
54121	NC_017474	GCA	2	6	2823834	2823839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824592
54122	NC_017474	TCCAA	2	10	2823840	2823849	40 %	20 %	0 %	40 %	385824592
54123	NC_017474	AAT	2	6	2823850	2823855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824592
54124	NC_017474	TGT	2	6	2823949	2823954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824592
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54127	NC_017474	TCC	2	6	2824015	2824020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54128	NC_017474	AGC	2	6	2824125	2824130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54129	NC_017474	AG	3	6	2824153	2824158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54130	NC_017474	AAT	2	6	2824252	2824257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54131	NC_017474	CTC	2	6	2824272	2824277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54132	NC_017474	TCA	2	6	2824338	2824343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824593
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54134	NC_017474	CTTC	2	8	2824396	2824403	0 %	50 %	0 %	50 %	385824593
54135	NC_017474	TGAT	2	8	2824467	2824474	25 %	50 %	25 %	0 %	385824593
54136	NC_017474	CGA	2	6	2824483	2824488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824593
54137	NC_017474	ATC	2	6	2824518	2824523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824593
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54140	NC_017474	CGA	2	6	2824696	2824701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824593
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54143	NC_017474	CCA	2	6	2824843	2824848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824593
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54146	NC_017474	TG	3	6	2824930	2824935	0 %	50 %	50 %	0 %	385824593
54147	NC_017474	TTGC	2	8	2824936	2824943	0 %	50 %	25 %	25 %	385824593
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54154	NC_017474	ATCA	2	8	2825276	2825283	50 %	25 %	0 %	25 %	385824593
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54156	NC_017474	GACC	2	8	2825347	2825354	25 %	0 %	25 %	50 %	385824593
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54169	NC_017474	T	6	6	2825939	2825944	0 %	100 %	0 %	0 %	385824594
54170	NC_017474	TTC	2	6	2825972	2825977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824594
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54182	NC_017474	ACA	2	6	2826594	2826599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824594
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54187	NC_017474	TGAA	2	8	2826824	2826831	50 %	25 %	25 %	0 %	385824594
54188	NC_017474	CCA	2	6	2826905	2826910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824594
54189	NC_017474	ATGA	2	8	2826955	2826962	50 %	25 %	25 %	0 %	385824594
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54191	NC_017474	CAG	2	6	2827126	2827131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824594
54192	NC_017474	CTT	4	12	2827153	2827164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824594
54193	NC_017474	CA	3	6	2827186	2827191	50 %	0 %	0 %	50 %	385824594
54194	NC_017474	GGTT	2	8	2827206	2827213	0 %	50 %	50 %	0 %	385824594
54195	NC_017474	ATT	2	6	2827267	2827272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824594
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54198	NC_017474	AAT	2	6	2827444	2827449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54199	NC_017474	TTG	2	6	2827453	2827458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54200	NC_017474	TTG	2	6	2827542	2827547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824595
54201	NC_017474	GGT	2	6	2827548	2827553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824595
54202	NC_017474	GCT	2	6	2827572	2827577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824595
54203	NC_017474	CTA	2	6	2827593	2827598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824595
54204	NC_017474	TGT	2	6	2827656	2827661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54205	NC_017474	GCC	2	6	2827706	2827711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824596
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54207	NC_017474	TCTG	2	8	2827857	2827864	0 %	50 %	25 %	25 %	385824596
54208	NC_017474	CCA	2	6	2827918	2827923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824596
54209	NC_017474	GCA	2	6	2827962	2827967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824596
54210	NC_017474	GCT	2	6	2827974	2827979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824596
54211	NC_017474	CAG	2	6	2828032	2828037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824596
54212	NC_017474	AGC	2	6	2828042	2828047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824596
54213	NC_017474	CAG	2	6	2828065	2828070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824596
54214	NC_017474	CCA	2	6	2828095	2828100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824596
54215	NC_017474	CAT	2	6	2828113	2828118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824596
54216	NC_017474	CTG	2	6	2828126	2828131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824596
54217	NC_017474	GTA	2	6	2828256	2828261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824596
54218	NC_017474	CGTT	2	8	2828344	2828351	0 %	50 %	25 %	25 %	385824596
54219	NC_017474	TTG	2	6	2828457	2828462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824596
54220	NC_017474	TGA	3	9	2828473	2828481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824596
54221	NC_017474	GGCT	2	8	2828486	2828493	0 %	25 %	50 %	25 %	385824596
54222	NC_017474	TTGC	2	8	2828569	2828576	0 %	50 %	25 %	25 %	385824596
54223	NC_017474	CATG	2	8	2828695	2828702	25 %	25 %	25 %	25 %	385824596
54224	NC_017474	TGAT	2	8	2828790	2828797	25 %	50 %	25 %	0 %	385824596
54225	NC_017474	ATA	2	6	2828823	2828828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824596
54226	NC_017474	ATT	2	6	2828837	2828842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824596
54227	NC_017474	TGG	2	6	2828923	2828928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824596
54228	NC_017474	CGG	2	6	2828971	2828976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824596
54229	NC_017474	TCA	2	6	2829018	2829023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824596
54230	NC_017474	GGT	2	6	2829098	2829103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824596
54231	NC_017474	CCA	2	6	2829117	2829122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824596
54232	NC_017474	GAC	2	6	2829147	2829152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824596
54233	NC_017474	T	6	6	2829373	2829378	0 %	100 %	0 %	0 %	385824596
54234	NC_017474	CACC	2	8	2829514	2829521	25 %	0 %	0 %	75 %	385824596
54235	NC_017474	GC	3	6	2829657	2829662	0 %	0 %	50 %	50 %	385824596
54236	NC_017474	TAC	2	6	2829667	2829672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824596
54237	NC_017474	GAACT	2	10	2829752	2829761	40 %	20 %	20 %	20 %	385824596
54238	NC_017474	CG	4	8	2829802	2829809	0 %	0 %	50 %	50 %	385824596
54239	NC_017474	A	6	6	2829851	2829856	100 %	0 %	0 %	0 %	385824596
54240	NC_017474	GT	3	6	2829858	2829863	0 %	50 %	50 %	0 %	385824596
54241	NC_017474	TCT	2	6	2829960	2829965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824596
54242	NC_017474	AAC	3	9	2829966	2829974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824596
54243	NC_017474	CGAAAT	2	12	2829989	2830000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385824596
54244	NC_017474	CAA	2	6	2830067	2830072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824596
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54246	NC_017474	TGT	2	6	2830152	2830157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824596
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54249	NC_017474	AATC	2	8	2830231	2830238	50 %	25 %	0 %	25 %	385824596
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54253	NC_017474	TGC	2	6	2830553	2830558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824596
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54255	NC_017474	ATC	2	6	2830679	2830684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824596
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54258	NC_017474	ATC	2	6	2830801	2830806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54259	NC_017474	AG	3	6	2830880	2830885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54260	NC_017474	ATC	2	6	2830889	2830894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824597
54261	NC_017474	ATC	2	6	2830912	2830917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824597
54262	NC_017474	ATAAA	2	10	2830974	2830983	80 %	20 %	0 %	0 %	385824597
54263	NC_017474	TTA	2	6	2831002	2831007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824597
54264	NC_017474	A	6	6	2831038	2831043	100 %	0 %	0 %	0 %	385824597
54265	NC_017474	CAGC	2	8	2831064	2831071	25 %	0 %	25 %	50 %	385824597
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54268	NC_017474	ATC	2	6	2831310	2831315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824598
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54277	NC_017474	ATC	2	6	2831862	2831867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824598
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54292	NC_017474	AC	3	6	2832515	2832520	50 %	0 %	0 %	50 %	385824598
54293	NC_017474	T	6	6	2832681	2832686	0 %	100 %	0 %	0 %	385824598
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54297	NC_017474	GTT	2	6	2833019	2833024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824598
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54299	NC_017474	ATTG	2	8	2833079	2833086	25 %	50 %	25 %	0 %	385824598
54300	NC_017474	T	6	6	2833108	2833113	0 %	100 %	0 %	0 %	385824598
54301	NC_017474	ACG	2	6	2833117	2833122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824598
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54304	NC_017474	CGG	2	6	2833365	2833370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824599
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54324	NC_017474	A	6	6	2834721	2834726	100 %	0 %	0 %	0 %	385824600
54325	NC_017474	CTG	2	6	2834812	2834817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824600
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54331	NC_017474	CT	4	8	2835230	2835237	0 %	50 %	0 %	50 %	385824600
54332	NC_017474	ACTTCT	2	12	2835268	2835279	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385824600
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54335	NC_017474	A	6	6	2835473	2835478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54336	NC_017474	T	6	6	2835545	2835550	0 %	100 %	0 %	0 %	385824601
54337	NC_017474	TCT	2	6	2835582	2835587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824601
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54339	NC_017474	CTGG	2	8	2835775	2835782	0 %	25 %	50 %	25 %	385824601
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54342	NC_017474	TCA	2	6	2835898	2835903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824601
54343	NC_017474	AAG	2	6	2836053	2836058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824602
54344	NC_017474	TTTG	2	8	2836065	2836072	0 %	75 %	25 %	0 %	385824602
54345	NC_017474	TTA	2	6	2836139	2836144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824602
54346	NC_017474	ATA	2	6	2836226	2836231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824602
54347	NC_017474	T	6	6	2836303	2836308	0 %	100 %	0 %	0 %	385824602
54348	NC_017474	CTGT	2	8	2836385	2836392	0 %	50 %	25 %	25 %	385824602
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54350	NC_017474	TAG	2	6	2836413	2836418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824602
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54469	NC_017474	T	6	6	2842675	2842680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54470	NC_017474	TTA	2	6	2842799	2842804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824611
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54472	NC_017474	TTGC	2	8	2842871	2842878	0 %	50 %	25 %	25 %	385824611
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54500	NC_017474	T	7	7	2844002	2844008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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