MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_017473	GAT	2	6	2400973	2400978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820991
46002	NC_017473	TTG	2	6	2401000	2401005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820991
46003	NC_017473	AAC	2	6	2401223	2401228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46004	NC_017473	TGT	2	6	2401252	2401257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46005	NC_017473	AATTTA	2	12	2401329	2401340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46006	NC_017473	A	6	6	2401354	2401359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46007	NC_017473	AGT	2	6	2401372	2401377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46008	NC_017473	AGC	2	6	2401389	2401394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46009	NC_017473	TTG	2	6	2401421	2401426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46010	NC_017473	TGGC	2	8	2401503	2401510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46011	NC_017473	CAAAT	2	10	2401531	2401540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46012	NC_017473	TGC	2	6	2401607	2401612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46013	NC_017473	ATT	2	6	2401710	2401715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820992
46014	NC_017473	CGT	2	6	2401725	2401730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820992
46015	NC_017473	CAAT	2	8	2401839	2401846	50 %	25 %	0 %	25 %	385820992
46016	NC_017473	CGA	2	6	2401886	2401891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820992
46017	NC_017473	TTATTT	2	12	2401937	2401948	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385820992
46018	NC_017473	AGCAT	2	10	2402018	2402027	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46019	NC_017473	GATT	2	8	2402028	2402035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46020	NC_017473	TAG	2	6	2402061	2402066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46021	NC_017473	AAGAC	2	10	2402071	2402080	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46022	NC_017473	GCCTT	2	10	2402105	2402114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46023	NC_017473	CTGCG	2	10	2402140	2402149	0 %	20 %	40 %	40 %	385820993
46024	NC_017473	CTT	2	6	2402151	2402156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820993
46025	NC_017473	GAT	2	6	2402185	2402190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820993
46026	NC_017473	ATG	2	6	2402249	2402254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820993
46027	NC_017473	CTT	2	6	2402391	2402396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820993
46028	NC_017473	CTT	2	6	2402496	2402501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820993
46029	NC_017473	AGT	2	6	2402526	2402531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820993
46030	NC_017473	ATCA	2	8	2402539	2402546	50 %	25 %	0 %	25 %	385820993
46031	NC_017473	ACA	2	6	2402630	2402635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820993
46032	NC_017473	T	7	7	2402691	2402697	0 %	100 %	0 %	0 %	385820993
46033	NC_017473	GAT	2	6	2402782	2402787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820993
46034	NC_017473	CAT	2	6	2402806	2402811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820993
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46036	NC_017473	TTCG	2	8	2402882	2402889	0 %	50 %	25 %	25 %	385820994
46037	NC_017473	GCC	2	6	2402896	2402901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820994
46038	NC_017473	CAAG	2	8	2402945	2402952	50 %	0 %	25 %	25 %	385820994
46039	NC_017473	CGC	2	6	2402961	2402966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820994
46040	NC_017473	CCCA	2	8	2403053	2403060	25 %	0 %	0 %	75 %	385820994
46041	NC_017473	CTTCGT	2	12	2403119	2403130	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385820994
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46043	NC_017473	ACC	2	6	2403240	2403245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820994
46044	NC_017473	GAT	2	6	2403246	2403251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820994
46045	NC_017473	GAT	2	6	2403255	2403260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820994
46046	NC_017473	CCG	2	6	2403307	2403312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820994
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46052	NC_017473	CCG	2	6	2403641	2403646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820994
46053	NC_017473	GCC	2	6	2403652	2403657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820994
46054	NC_017473	AC	3	6	2403677	2403682	50 %	0 %	0 %	50 %	385820994
46055	NC_017473	GAT	2	6	2403695	2403700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820994
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46057	NC_017473	GTC	2	6	2403732	2403737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820994
46058	NC_017473	GCT	2	6	2403775	2403780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820994
46059	NC_017473	T	6	6	2403923	2403928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46060	NC_017473	GAG	2	6	2404015	2404020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46061	NC_017473	CTG	2	6	2404105	2404110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46062	NC_017473	TCA	2	6	2404122	2404127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46063	NC_017473	AAG	2	6	2404130	2404135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46064	NC_017473	CAA	2	6	2404137	2404142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46065	NC_017473	GC	3	6	2404204	2404209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46066	NC_017473	TTG	2	6	2404398	2404403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820995
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46071	NC_017473	AAAAC	2	10	2404620	2404629	80 %	0 %	0 %	20 %	385820995
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46075	NC_017473	T	7	7	2404869	2404875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46076	NC_017473	TCA	2	6	2404880	2404885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46082	NC_017473	GA	3	6	2405106	2405111	50 %	0 %	50 %	0 %	385820996
46083	NC_017473	ACG	2	6	2405144	2405149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820996
46084	NC_017473	GCG	2	6	2405163	2405168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820996
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46087	NC_017473	CATCG	2	10	2405281	2405290	20 %	20 %	20 %	40 %	385820996
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46092	NC_017473	ATC	2	6	2405555	2405560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820997
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46105	NC_017473	T	6	6	2406224	2406229	0 %	100 %	0 %	0 %	385820997
46106	NC_017473	CTT	2	6	2406247	2406252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820998
46107	NC_017473	TGC	2	6	2406272	2406277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820998
46108	NC_017473	CAC	2	6	2406359	2406364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820998
46109	NC_017473	CGTG	2	8	2406379	2406386	0 %	25 %	50 %	25 %	385820998
46110	NC_017473	TCA	2	6	2406426	2406431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820998
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46116	NC_017473	ATTC	2	8	2406834	2406841	25 %	50 %	0 %	25 %	385820999
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46118	NC_017473	GCT	2	6	2406990	2406995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820999
46119	NC_017473	CGA	3	9	2407031	2407039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820999
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46122	NC_017473	TCG	2	6	2407229	2407234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820999
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46145	NC_017473	A	6	6	2408195	2408200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46188	NC_017473	AACA	2	8	2410595	2410602	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46189	NC_017473	ACG	2	6	2410650	2410655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46228	NC_017473	CAT	2	6	2412776	2412781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821005
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46231	NC_017473	GCT	2	6	2412974	2412979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821005
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