MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017473	CTT	2	6	2247469	2247474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43002	NC_017473	CTG	2	6	2247505	2247510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43003	NC_017473	CAAA	2	8	2247519	2247526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43004	NC_017473	CA	3	6	2247589	2247594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43005	NC_017473	TG	3	6	2247610	2247615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43006	NC_017473	CTCA	2	8	2247620	2247627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43007	NC_017473	TTG	2	6	2247696	2247701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43008	NC_017473	CCT	2	6	2247715	2247720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43009	NC_017473	ATTAG	2	10	2247725	2247734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43010	NC_017473	T	7	7	2247798	2247804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_017473	A	6	6	2247827	2247832	100 %	0 %	0 %	0 %	385820836
43012	NC_017473	AAG	2	6	2247903	2247908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385820836
43013	NC_017473	TTG	2	6	2247915	2247920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820836
43014	NC_017473	CA	3	6	2247947	2247952	50 %	0 %	0 %	50 %	385820836
43015	NC_017473	TAA	2	6	2247962	2247967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820836
43016	NC_017473	TGTT	2	8	2248080	2248087	0 %	75 %	25 %	0 %	385820836
43017	NC_017473	TGT	2	6	2248099	2248104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820836
43018	NC_017473	TTGC	2	8	2248127	2248134	0 %	50 %	25 %	25 %	385820836
43019	NC_017473	GTT	2	6	2248175	2248180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43020	NC_017473	TTGC	2	8	2248214	2248221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43021	NC_017473	TTATC	2	10	2248273	2248282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43022	NC_017473	ATTTAA	2	12	2248316	2248327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43023	NC_017473	TCG	2	6	2248349	2248354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43024	NC_017473	ACA	2	6	2248409	2248414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43025	NC_017473	TTAA	2	8	2248451	2248458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43026	NC_017473	GAG	2	6	2248461	2248466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43027	NC_017473	ATT	2	6	2248480	2248485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820837
43028	NC_017473	AAG	2	6	2248620	2248625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385820837
43029	NC_017473	GCG	2	6	2248669	2248674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820837
43030	NC_017473	T	6	6	2248679	2248684	0 %	100 %	0 %	0 %	385820837
43031	NC_017473	TTA	2	6	2248750	2248755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820837
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43034	NC_017473	TTTG	2	8	2248865	2248872	0 %	75 %	25 %	0 %	385820837
43035	NC_017473	TTC	2	6	2248887	2248892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820837
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43037	NC_017473	TGAT	2	8	2248981	2248988	25 %	50 %	25 %	0 %	385820837
43038	NC_017473	ACA	2	6	2249026	2249031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820837
43039	NC_017473	GAC	2	6	2249276	2249281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820838
43040	NC_017473	CAG	2	6	2249376	2249381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820839
43041	NC_017473	ATC	2	6	2249389	2249394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820839
43042	NC_017473	GAT	2	6	2249487	2249492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820839
43043	NC_017473	TCAA	2	8	2249501	2249508	50 %	25 %	0 %	25 %	385820839
43044	NC_017473	ATGA	2	8	2249521	2249528	50 %	25 %	25 %	0 %	385820839
43045	NC_017473	CTC	3	9	2249548	2249556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385820839
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43047	NC_017473	CAT	2	6	2249710	2249715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820839
43048	NC_017473	CTG	2	6	2249776	2249781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43049	NC_017473	TTA	2	6	2249796	2249801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43050	NC_017473	TCA	2	6	2249865	2249870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820840
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43052	NC_017473	CGA	2	6	2249925	2249930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820840
43053	NC_017473	TACG	2	8	2249949	2249956	25 %	25 %	25 %	25 %	385820840
43054	NC_017473	GAA	2	6	2249987	2249992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385820840
43055	NC_017473	TTC	2	6	2250104	2250109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820840
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43057	NC_017473	TTGG	2	8	2250174	2250181	0 %	50 %	50 %	0 %	385820840
43058	NC_017473	TGG	2	6	2250294	2250299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385820840
43059	NC_017473	TCT	2	6	2250316	2250321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820840
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43065	NC_017473	AGGA	2	8	2250718	2250725	50 %	0 %	50 %	0 %	385820840
43066	NC_017473	CTT	2	6	2250778	2250783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820840
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43074	NC_017473	AAGG	2	8	2251346	2251353	50 %	0 %	50 %	0 %	385820840
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43079	NC_017473	CGG	2	6	2251578	2251583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820840
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43085	NC_017473	GAT	2	6	2251706	2251711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820840
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43088	NC_017473	CGAA	2	8	2251899	2251906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43089	NC_017473	AAT	2	6	2252026	2252031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43091	NC_017473	CTG	2	6	2252142	2252147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43092	NC_017473	CTA	2	6	2252193	2252198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43093	NC_017473	CGA	2	6	2252252	2252257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43095	NC_017473	CGA	2	6	2252644	2252649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43099	NC_017473	AGCT	2	8	2252830	2252837	25 %	25 %	25 %	25 %	385820841
43100	NC_017473	TCC	2	6	2252866	2252871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43101	NC_017473	CAT	2	6	2252925	2252930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43102	NC_017473	TTA	2	6	2252947	2252952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43103	NC_017473	CAGT	2	8	2253007	2253014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43104	NC_017473	ATC	2	6	2253020	2253025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43105	NC_017473	ATT	2	6	2253115	2253120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820842
43106	NC_017473	ATT	2	6	2253239	2253244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43107	NC_017473	TAA	2	6	2253407	2253412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43108	NC_017473	CTA	2	6	2253435	2253440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43109	NC_017473	TTG	2	6	2253464	2253469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820843
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43111	NC_017473	ACA	2	6	2253512	2253517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820843
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43116	NC_017473	AAAT	2	8	2253703	2253710	75 %	25 %	0 %	0 %	385820843
43117	NC_017473	ATTTAA	2	12	2253715	2253726	50 %	50 %	0 %	0 %	385820843
43118	NC_017473	ATA	2	6	2253738	2253743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820843
43119	NC_017473	A	6	6	2253863	2253868	100 %	0 %	0 %	0 %	385820843
43120	NC_017473	AT	3	6	2253872	2253877	50 %	50 %	0 %	0 %	385820843
43121	NC_017473	TAAT	2	8	2253938	2253945	50 %	50 %	0 %	0 %	385820843
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43231	NC_017473	CTCA	2	8	2258747	2258754	25 %	25 %	0 %	50 %	385820848
43232	NC_017473	ATT	2	6	2258758	2258763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820848
43233	NC_017473	CGA	2	6	2258765	2258770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820848
43234	NC_017473	AT	3	6	2258793	2258798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43235	NC_017473	CTTT	2	8	2258881	2258888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43236	NC_017473	CAT	2	6	2258953	2258958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43238	NC_017473	ATG	2	6	2259032	2259037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43239	NC_017473	TC	3	6	2259081	2259086	0 %	50 %	0 %	50 %	385820849
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43241	NC_017473	CT	3	6	2259268	2259273	0 %	50 %	0 %	50 %	385820849
43242	NC_017473	ATT	2	6	2259351	2259356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820849
43243	NC_017473	TGA	2	6	2259375	2259380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820849
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43356	NC_017473	GCCA	2	8	2265129	2265136	25 %	0 %	25 %	50 %	385820856
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43360	NC_017473	TGCC	2	8	2265409	2265416	0 %	25 %	25 %	50 %	385820856
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43463	NC_017473	TC	3	6	2270288	2270293	0 %	50 %	0 %	50 %	385820860
43464	NC_017473	CAT	2	6	2270294	2270299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820860
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43466	NC_017473	TCC	2	6	2270421	2270426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385820860
43467	NC_017473	CAT	2	6	2270465	2270470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820860
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43469	NC_017473	ATGGC	2	10	2270545	2270554	20 %	20 %	40 %	20 %	385820860
43470	NC_017473	TCA	3	9	2270566	2270574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820860
43471	NC_017473	GGC	2	6	2270576	2270581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820860
43472	NC_017473	GC	3	6	2270619	2270624	0 %	0 %	50 %	50 %	385820860
43473	NC_017473	ACA	2	6	2270676	2270681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820861
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