MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_017473	TTG	2	6	2221829	2221834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42502	NC_017473	ACG	2	6	2221847	2221852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42503	NC_017473	A	7	7	2221951	2221957	100 %	0 %	0 %	0 %	385820812
42504	NC_017473	TCA	2	6	2221985	2221990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820812
42505	NC_017473	TGT	2	6	2222057	2222062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820812
42506	NC_017473	TCG	2	6	2222145	2222150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820812
42507	NC_017473	T	6	6	2222167	2222172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42508	NC_017473	CATA	2	8	2222222	2222229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42509	NC_017473	ATA	2	6	2222278	2222283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820813
42510	NC_017473	CGG	2	6	2222350	2222355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820813
42511	NC_017473	CAG	2	6	2222404	2222409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42512	NC_017473	CGC	2	6	2222476	2222481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820813
42513	NC_017473	ACA	2	6	2222512	2222517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820813
42514	NC_017473	CAG	2	6	2222520	2222525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42515	NC_017473	CCA	2	6	2222532	2222537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820813
42516	NC_017473	CA	3	6	2222549	2222554	50 %	0 %	0 %	50 %	385820813
42517	NC_017473	CAG	2	6	2222607	2222612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42518	NC_017473	GCA	2	6	2222624	2222629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42519	NC_017473	TGA	2	6	2222818	2222823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820813
42520	NC_017473	GTC	2	6	2222837	2222842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42521	NC_017473	TGA	2	6	2222911	2222916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820813
42522	NC_017473	GTC	2	6	2222943	2222948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42523	NC_017473	ACC	2	6	2222991	2222996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820813
42524	NC_017473	GCT	2	6	2223044	2223049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42525	NC_017473	TGC	2	6	2223100	2223105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820813
42526	NC_017473	TGT	2	6	2223148	2223153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820813
42527	NC_017473	CAAC	2	8	2223166	2223173	50 %	0 %	0 %	50 %	385820813
42528	NC_017473	ATC	2	6	2223234	2223239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820813
42529	NC_017473	CGG	2	6	2223266	2223271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820813
42530	NC_017473	T	7	7	2223408	2223414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42531	NC_017473	GTC	2	6	2223416	2223421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42532	NC_017473	TAA	2	6	2223574	2223579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820814
42533	NC_017473	GTC	2	6	2223586	2223591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820814
42534	NC_017473	TGA	2	6	2223650	2223655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820814
42535	NC_017473	ATG	2	6	2223695	2223700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820814
42536	NC_017473	AC	3	6	2223729	2223734	50 %	0 %	0 %	50 %	385820814
42537	NC_017473	CAA	2	6	2223745	2223750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820814
42538	NC_017473	ACA	2	6	2223756	2223761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820814
42539	NC_017473	GCTCA	2	10	2223769	2223778	20 %	20 %	20 %	40 %	385820814
42540	NC_017473	TGA	2	6	2223882	2223887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820814
42541	NC_017473	TTAGCA	2	12	2223959	2223970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385820814
42542	NC_017473	GTCCA	2	10	2224013	2224022	20 %	20 %	20 %	40 %	385820814
42543	NC_017473	CGC	2	6	2224290	2224295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820814
42544	NC_017473	CTTGCG	2	12	2224383	2224394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820814
42545	NC_017473	TGA	2	6	2224430	2224435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820814
42546	NC_017473	CCA	2	6	2224467	2224472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820814
42547	NC_017473	ACAATC	2	12	2224487	2224498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385820814
42548	NC_017473	CATCGT	2	12	2224516	2224527	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385820814
42549	NC_017473	CAAT	2	8	2224636	2224643	50 %	25 %	0 %	25 %	385820815
42550	NC_017473	GCT	2	6	2224715	2224720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820815
42551	NC_017473	CCG	2	6	2224803	2224808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820815
42552	NC_017473	AAT	2	6	2224820	2224825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820815
42553	NC_017473	AAT	2	6	2224844	2224849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820815
42554	NC_017473	TAG	2	6	2224925	2224930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820815
42555	NC_017473	GTT	2	6	2225200	2225205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820815
42556	NC_017473	GCA	2	6	2225233	2225238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820815
42557	NC_017473	TTG	2	6	2225256	2225261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820815
42558	NC_017473	TGA	2	6	2225316	2225321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820815
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42561	NC_017473	TGC	2	6	2225491	2225496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820815
42562	NC_017473	CAA	2	6	2225507	2225512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820815
42563	NC_017473	ACA	2	6	2225527	2225532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820815
42564	NC_017473	ATT	2	6	2225555	2225560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820815
42565	NC_017473	A	7	7	2225633	2225639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42566	NC_017473	TCGC	2	8	2225650	2225657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42567	NC_017473	ACTG	2	8	2225709	2225716	25 %	25 %	25 %	25 %	385820816
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42569	NC_017473	CAT	2	6	2225803	2225808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820816
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42574	NC_017473	TGCC	2	8	2226007	2226014	0 %	25 %	25 %	50 %	385820816
42575	NC_017473	TTG	2	6	2226192	2226197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820816
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42577	NC_017473	AAT	2	6	2226252	2226257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820816
42578	NC_017473	T	6	6	2226350	2226355	0 %	100 %	0 %	0 %	385820816
42579	NC_017473	GTCATC	2	12	2226366	2226377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385820816
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42582	NC_017473	ATAA	2	8	2226464	2226471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42583	NC_017473	GTT	2	6	2226472	2226477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42586	NC_017473	CG	3	6	2226597	2226602	0 %	0 %	50 %	50 %	385820817
42587	NC_017473	CCT	2	6	2226619	2226624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385820817
42588	NC_017473	CAA	2	6	2226642	2226647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820817
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42591	NC_017473	ATTTTA	2	12	2226696	2226707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820817
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42593	NC_017473	GAA	2	6	2226815	2226820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385820818
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42600	NC_017473	CAAG	2	8	2227024	2227031	50 %	0 %	25 %	25 %	385820818
42601	NC_017473	TTG	2	6	2227083	2227088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820818
42602	NC_017473	TGATCA	2	12	2227099	2227110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385820818
42603	NC_017473	TCA	2	6	2227165	2227170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820818
42604	NC_017473	TCT	2	6	2227189	2227194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820818
42605	NC_017473	A	6	6	2227215	2227220	100 %	0 %	0 %	0 %	385820818
42606	NC_017473	GGC	2	6	2227259	2227264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42607	NC_017473	T	6	6	2227273	2227278	0 %	100 %	0 %	0 %	385820819
42608	NC_017473	GCA	2	6	2227285	2227290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820819
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42610	NC_017473	TTC	2	6	2227340	2227345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820819
42611	NC_017473	TGAAC	2	10	2227422	2227431	40 %	20 %	20 %	20 %	385820819
42612	NC_017473	TGC	2	6	2227507	2227512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820819
42613	NC_017473	ATC	2	6	2227514	2227519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820819
42614	NC_017473	CCG	2	6	2227545	2227550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820819
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42616	NC_017473	T	7	7	2227638	2227644	0 %	100 %	0 %	0 %	385820819
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42733	NC_017473	TCAA	2	8	2233336	2233343	50 %	25 %	0 %	25 %	385820823
42734	NC_017473	TTTC	2	8	2233502	2233509	0 %	75 %	0 %	25 %	385820823
42735	NC_017473	ACTC	2	8	2233598	2233605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42736	NC_017473	TG	4	8	2233666	2233673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42737	NC_017473	TCATTT	2	12	2233691	2233702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42738	NC_017473	CGC	2	6	2233704	2233709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42739	NC_017473	A	7	7	2233748	2233754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42740	NC_017473	ATT	2	6	2233859	2233864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820824
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42751	NC_017473	TTG	2	6	2234612	2234617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42752	NC_017473	GCC	2	6	2234625	2234630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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42754	NC_017473	TGC	2	6	2234684	2234689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42765	NC_017473	TCA	2	6	2235280	2235285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820826
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42787	NC_017473	TCCG	2	8	2236627	2236634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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42791	NC_017473	ACTC	2	8	2236754	2236761	25 %	25 %	0 %	50 %	385820827
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42835	NC_017473	ATC	2	6	2238863	2238868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820828
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42838	NC_017473	AATCTA	2	12	2238970	2238981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385820828
42839	NC_017473	ACAA	2	8	2239026	2239033	75 %	0 %	0 %	25 %	385820828
42840	NC_017473	CTT	2	6	2239039	2239044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820828
42841	NC_017473	TGA	2	6	2239089	2239094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820828
42842	NC_017473	GAA	2	6	2239120	2239125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42843	NC_017473	GATATG	2	12	2239153	2239164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42844	NC_017473	GCG	2	6	2239263	2239268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820829
42845	NC_017473	ATT	2	6	2239277	2239282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820829
42846	NC_017473	ACA	2	6	2239358	2239363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820829
42847	NC_017473	CTA	2	6	2239389	2239394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820829
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42967	NC_017473	GCTT	2	8	2245786	2245793	0 %	50 %	25 %	25 %	385820834
42968	NC_017473	GGC	2	6	2245897	2245902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820834
42969	NC_017473	AGC	2	6	2246095	2246100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820834
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42988	NC_017473	TCT	2	6	2246931	2246936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385820835
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42991	NC_017473	TCG	2	6	2247124	2247129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820835
42992	NC_017473	TGGC	2	8	2247138	2247145	0 %	25 %	50 %	25 %	385820835
42993	NC_017473	AGC	2	6	2247146	2247151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820835
42994	NC_017473	CTTTG	2	10	2247169	2247178	0 %	60 %	20 %	20 %	385820835
42995	NC_017473	GCC	2	6	2247219	2247224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820835
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42997	NC_017473	GCT	2	6	2247331	2247336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820835
42998	NC_017473	ATT	2	6	2247371	2247376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42999	NC_017473	TCC	2	6	2247378	2247383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43000	NC_017473	GCC	2	6	2247448	2247453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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