MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_017473	ATC	2	6	2144246	2144251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820733
41003	NC_017473	ACA	2	6	2144258	2144263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820733
41004	NC_017473	GCA	2	6	2144268	2144273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820733
41005	NC_017473	TCA	2	6	2144274	2144279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820733
41006	NC_017473	GCC	2	6	2144305	2144310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820733
41007	NC_017473	CAA	2	6	2144332	2144337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820733
41008	NC_017473	CAG	2	6	2144371	2144376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820733
41009	NC_017473	AAT	2	6	2144394	2144399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820733
41010	NC_017473	CAA	2	6	2144464	2144469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820733
41011	NC_017473	CCA	2	6	2144483	2144488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820733
41012	NC_017473	GCT	2	6	2144523	2144528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820733
41013	NC_017473	ATC	2	6	2144558	2144563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820733
41014	NC_017473	CCA	2	6	2144738	2144743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820733
41015	NC_017473	GCCGG	2	10	2144747	2144756	0 %	0 %	60 %	40 %	385820733
41016	NC_017473	AAAC	2	8	2144772	2144779	75 %	0 %	0 %	25 %	385820733
41017	NC_017473	ATC	2	6	2144858	2144863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820733
41018	NC_017473	CAA	2	6	2144940	2144945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385820733
41019	NC_017473	T	6	6	2144978	2144983	0 %	100 %	0 %	0 %	385820733
41020	NC_017473	CTG	2	6	2145068	2145073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820733
41021	NC_017473	CCG	2	6	2145087	2145092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385820733
41022	NC_017473	TAA	2	6	2145139	2145144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385820733
41023	NC_017473	CAT	2	6	2145148	2145153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820733
41024	NC_017473	GC	3	6	2145183	2145188	0 %	0 %	50 %	50 %	385820733
41025	NC_017473	TCA	2	6	2145198	2145203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820733
41026	NC_017473	ATT	2	6	2145254	2145259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41027	NC_017473	TTGA	2	8	2145280	2145287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41028	NC_017473	CTG	2	6	2145309	2145314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41029	NC_017473	TTG	2	6	2145353	2145358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41030	NC_017473	AAC	2	6	2145506	2145511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41031	NC_017473	GTT	2	6	2145537	2145542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41032	NC_017473	ATG	2	6	2145632	2145637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41033	NC_017473	ATG	2	6	2145659	2145664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41034	NC_017473	AAG	2	6	2145669	2145674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41035	NC_017473	CAA	2	6	2145710	2145715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41036	NC_017473	CAC	2	6	2145765	2145770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41037	NC_017473	CGG	2	6	2145935	2145940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385820734
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41039	NC_017473	TCGA	2	8	2146018	2146025	25 %	25 %	25 %	25 %	385820734
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41041	NC_017473	GCT	2	6	2146211	2146216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820734
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41043	NC_017473	GCT	2	6	2146475	2146480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820734
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41046	NC_017473	AGACCT	2	12	2146667	2146678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385820734
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41049	NC_017473	A	7	7	2146811	2146817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41050	NC_017473	CA	3	6	2146819	2146824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41051	NC_017473	ATT	2	6	2146826	2146831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41052	NC_017473	TG	3	6	2146835	2146840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41053	NC_017473	ATT	2	6	2146858	2146863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385820735
41054	NC_017473	GTCG	2	8	2146892	2146899	0 %	25 %	50 %	25 %	385820735
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41061	NC_017473	GTC	2	6	2147189	2147194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820735
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41068	NC_017473	A	6	6	2147799	2147804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41069	NC_017473	CTT	2	6	2147810	2147815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41084	NC_017473	TCGT	2	8	2148311	2148318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41085	NC_017473	ATT	2	6	2148335	2148340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41089	NC_017473	TGAATC	2	12	2148595	2148606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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41092	NC_017473	TGGA	2	8	2148730	2148737	25 %	25 %	50 %	0 %	385820738
41093	NC_017473	TGA	2	6	2148742	2148747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385820738
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41104	NC_017473	CGGC	2	8	2149296	2149303	0 %	0 %	50 %	50 %	385820738
41105	NC_017473	A	6	6	2149323	2149328	100 %	0 %	0 %	0 %	385820738
41106	NC_017473	TGC	2	6	2149371	2149376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820739
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41108	NC_017473	GCA	2	6	2149469	2149474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385820739
41109	NC_017473	GTTT	2	8	2149480	2149487	0 %	75 %	25 %	0 %	385820739
41110	NC_017473	CAT	2	6	2149548	2149553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820739
41111	NC_017473	GCCAAC	2	12	2149602	2149613	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385820739
41112	NC_017473	CAT	2	6	2149662	2149667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820739
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41118	NC_017473	CTTC	2	8	2150078	2150085	0 %	50 %	0 %	50 %	385820739
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41120	NC_017473	CG	3	6	2150263	2150268	0 %	0 %	50 %	50 %	385820739
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41345	NC_017473	CCAG	2	8	2161448	2161455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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41349	NC_017473	ATGA	2	8	2161695	2161702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41350	NC_017473	GTT	2	6	2161782	2161787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385820750
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41355	NC_017473	A	6	6	2162023	2162028	100 %	0 %	0 %	0 %	385820750
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41357	NC_017473	CAT	2	6	2162083	2162088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385820750
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41476	NC_017473	CAC	2	6	2168543	2168548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385820757
41477	NC_017473	AGTC	2	8	2168603	2168610	25 %	25 %	25 %	25 %	385820757
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41480	NC_017473	TTGG	2	8	2168680	2168687	0 %	50 %	50 %	0 %	385820757
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41491	NC_017473	TGC	2	6	2169382	2169387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385820757
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