MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017473	GATT	2	8	101462	101469	25 %	50 %	25 %	0 %	385818623
2002	NC_017473	CCG	2	6	101495	101500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818623
2003	NC_017473	T	7	7	101604	101610	0 %	100 %	0 %	0 %	385818623
2004	NC_017473	TTTC	2	8	101683	101690	0 %	75 %	0 %	25 %	385818624
2005	NC_017473	AACG	2	8	101758	101765	50 %	0 %	25 %	25 %	385818624
2006	NC_017473	CGG	2	6	101811	101816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818624
2007	NC_017473	GGT	2	6	101842	101847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818624
2008	NC_017473	TG	3	6	101874	101879	0 %	50 %	50 %	0 %	385818624
2009	NC_017473	A	6	6	101916	101921	100 %	0 %	0 %	0 %	385818624
2010	NC_017473	T	6	6	102091	102096	0 %	100 %	0 %	0 %	385818624
2011	NC_017473	GCT	2	6	102389	102394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818624
2012	NC_017473	AGG	2	6	102424	102429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818624
2013	NC_017473	CAT	2	6	102449	102454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818624
2014	NC_017473	ATTGA	2	10	102473	102482	40 %	40 %	20 %	0 %	385818624
2015	NC_017473	CAA	2	6	102548	102553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818624
2016	NC_017473	GTT	2	6	102677	102682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818625
2017	NC_017473	TGG	2	6	102720	102725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818625
2018	NC_017473	GTCT	2	8	102748	102755	0 %	50 %	25 %	25 %	385818625
2019	NC_017473	GAC	2	6	102826	102831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818625
2020	NC_017473	GAT	2	6	102833	102838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818625
2021	NC_017473	CTG	2	6	102870	102875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818625
2022	NC_017473	ATA	2	6	102936	102941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818625
2023	NC_017473	TTG	2	6	102975	102980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818625
2024	NC_017473	CGA	2	6	103044	103049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818625
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2029	NC_017473	GAA	2	6	103418	103423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818625
2030	NC_017473	TCGAAG	2	12	103431	103442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385818625
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2033	NC_017473	GAC	2	6	103508	103513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818625
2034	NC_017473	CAA	2	6	103520	103525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818625
2035	NC_017473	GCA	2	6	103554	103559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818625
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2037	NC_017473	GCT	2	6	103649	103654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818625
2038	NC_017473	GATG	2	8	103681	103688	25 %	25 %	50 %	0 %	385818625
2039	NC_017473	ATC	2	6	103737	103742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818626
2040	NC_017473	CGA	2	6	103766	103771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818626
2041	NC_017473	T	6	6	103779	103784	0 %	100 %	0 %	0 %	385818626
2042	NC_017473	A	6	6	103886	103891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_017473	TGG	2	6	103938	103943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818627
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2045	NC_017473	GCT	2	6	104087	104092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818627
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2047	NC_017473	GCT	2	6	104216	104221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818627
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2049	NC_017473	TCA	2	6	104355	104360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_017473	AT	3	6	104391	104396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_017473	TAA	2	6	104403	104408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_017473	GGCA	2	8	104425	104432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2053	NC_017473	CT	3	6	104447	104452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_017473	TCA	2	6	104466	104471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_017473	GTGA	2	8	104480	104487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_017473	CAT	2	6	104510	104515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_017473	G	7	7	104562	104568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2059	NC_017473	TAT	2	6	104649	104654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818628
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2092	NC_017473	TAA	2	6	106001	106006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_017473	AT	3	6	106120	106125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_017473	ATA	2	6	106164	106169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2107	NC_017473	TGA	2	6	106683	106688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818630
2108	NC_017473	TGCC	2	8	106698	106705	0 %	25 %	25 %	50 %	385818630
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2112	NC_017473	TGG	2	6	106848	106853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818630
2113	NC_017473	ATCA	2	8	106860	106867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2114	NC_017473	AGA	2	6	106880	106885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2118	NC_017473	T	7	7	107197	107203	0 %	100 %	0 %	0 %	385818631
2119	NC_017473	ATGGC	2	10	107390	107399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2124	NC_017473	TGC	2	6	107697	107702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818632
2125	NC_017473	T	6	6	107730	107735	0 %	100 %	0 %	0 %	385818632
2126	NC_017473	AAG	2	6	107811	107816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818632
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2131	NC_017473	GAT	2	6	108167	108172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818632
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2133	NC_017473	CTG	2	6	108275	108280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818632
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2231	NC_017473	CAGC	2	8	112594	112601	25 %	0 %	25 %	50 %	385818635
2232	NC_017473	ATG	2	6	112638	112643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818635
2233	NC_017473	CAT	2	6	112657	112662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818635
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2235	NC_017473	GAT	2	6	112784	112789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818635
2236	NC_017473	T	9	9	112930	112938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2237	NC_017473	GAG	2	6	113116	113121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2238	NC_017473	CGA	2	6	113167	113172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818636
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2240	NC_017473	GTT	2	6	113345	113350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818636
2241	NC_017473	AGC	2	6	113482	113487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818636
2242	NC_017473	GAC	2	6	113509	113514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818636
2243	NC_017473	CGGCC	2	10	113527	113536	0 %	0 %	40 %	60 %	385818636
2244	NC_017473	GCT	2	6	113549	113554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818636
2245	NC_017473	GAA	2	6	113600	113605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818636
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2477	NC_017473	AC	3	6	124386	124391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2490	NC_017473	ATC	2	6	125167	125172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818646
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2493	NC_017473	AAG	2	6	125332	125337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818646
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