MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017473	GCA	2	6	650937	650942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819200
12502	NC_017473	GAT	2	6	650944	650949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385819200
12503	NC_017473	AAG	2	6	650996	651001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385819200
12504	NC_017473	AAGC	2	8	651014	651021	50 %	0 %	25 %	25 %	385819200
12505	NC_017473	CGA	2	6	651035	651040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819200
12506	NC_017473	TTG	2	6	651065	651070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385819200
12507	NC_017473	AGC	2	6	651081	651086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819200
12508	NC_017473	ATA	2	6	651092	651097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385819200
12509	NC_017473	CTT	2	6	651143	651148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385819200
12510	NC_017473	AGC	2	6	651167	651172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819200
12511	NC_017473	ATT	2	6	651190	651195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385819200
12512	NC_017473	TTGA	2	8	651205	651212	25 %	50 %	25 %	0 %	385819200
12513	NC_017473	TTC	2	6	651342	651347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385819200
12514	NC_017473	GAT	2	6	651411	651416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385819200
12515	NC_017473	GATC	2	8	651423	651430	25 %	25 %	25 %	25 %	385819200
12516	NC_017473	GTT	2	6	651435	651440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385819200
12517	NC_017473	ACTT	2	8	651465	651472	25 %	50 %	0 %	25 %	385819200
12518	NC_017473	TGAA	2	8	651490	651497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_017473	TTC	2	6	651521	651526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385819201
12520	NC_017473	T	6	6	651546	651551	0 %	100 %	0 %	0 %	385819201
12521	NC_017473	T	6	6	651567	651572	0 %	100 %	0 %	0 %	385819201
12522	NC_017473	TGA	2	6	651589	651594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385819201
12523	NC_017473	A	7	7	651599	651605	100 %	0 %	0 %	0 %	385819201
12524	NC_017473	CG	3	6	651680	651685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_017473	TTC	2	6	651744	651749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385819202
12526	NC_017473	TGAC	2	8	651913	651920	25 %	25 %	25 %	25 %	385819202
12527	NC_017473	CGA	3	9	651974	651982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819202
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12529	NC_017473	GAT	2	6	652089	652094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385819202
12530	NC_017473	CCAAA	2	10	652100	652109	60 %	0 %	0 %	40 %	385819202
12531	NC_017473	AAG	2	6	652120	652125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385819202
12532	NC_017473	GCA	2	6	652201	652206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819202
12533	NC_017473	GTG	2	6	652222	652227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385819202
12534	NC_017473	GTCAAC	2	12	652234	652245	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385819202
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12538	NC_017473	T	6	6	652444	652449	0 %	100 %	0 %	0 %	385819202
12539	NC_017473	CATC	2	8	652508	652515	25 %	25 %	0 %	50 %	385819202
12540	NC_017473	GCT	2	6	652564	652569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385819202
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12543	NC_017473	TAGGA	2	10	652696	652705	40 %	20 %	40 %	0 %	385819202
12544	NC_017473	GGC	3	9	652710	652718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385819202
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12549	NC_017473	AC	3	6	652937	652942	50 %	0 %	0 %	50 %	385819202
12550	NC_017473	AGC	2	6	652945	652950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819202
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12552	NC_017473	AAATT	2	10	653033	653042	60 %	40 %	0 %	0 %	385819202
12553	NC_017473	GAA	2	6	653052	653057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385819202
12554	NC_017473	GAC	2	6	653082	653087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385819202
12555	NC_017473	CTT	2	6	653106	653111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385819202
12556	NC_017473	TCC	2	6	653133	653138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_017473	CA	3	6	653408	653413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12558	NC_017473	A	8	8	653413	653420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_017473	ACC	2	6	653459	653464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_017473	TTTAG	2	10	653684	653693	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_017473	A	7	7	653735	653741	100 %	0 %	0 %	0 %	385819203
12562	NC_017473	A	6	6	653761	653766	100 %	0 %	0 %	0 %	385819203
12563	NC_017473	AAG	2	6	653773	653778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385819203
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12568	NC_017473	TA	3	6	653990	653995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_017473	ATA	2	6	654052	654057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_017473	TTC	2	6	654138	654143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_017473	TAT	2	6	654157	654162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_017473	AG	4	8	654172	654179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_017473	TGA	2	6	654216	654221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385819204
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12581	NC_017473	GTCT	2	8	654709	654716	0 %	50 %	25 %	25 %	385819204
12582	NC_017473	TGC	2	6	654727	654732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385819204
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12590	NC_017473	AC	3	6	655241	655246	50 %	0 %	0 %	50 %	385819205
12591	NC_017473	GCG	2	6	655417	655422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385819205
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12593	NC_017473	GTT	2	6	655467	655472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385819205
12594	NC_017473	GATG	2	8	655514	655521	25 %	25 %	50 %	0 %	385819205
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12605	NC_017473	CGC	2	6	656186	656191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385819206
12606	NC_017473	ATT	2	6	656269	656274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385819206
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12608	NC_017473	A	6	6	656323	656328	100 %	0 %	0 %	0 %	385819206
12609	NC_017473	CAGT	2	8	656394	656401	25 %	25 %	25 %	25 %	385819207
12610	NC_017473	TGA	2	6	656525	656530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385819207
12611	NC_017473	GAATT	2	10	656536	656545	40 %	40 %	20 %	0 %	385819207
12612	NC_017473	CCA	2	6	656557	656562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385819207
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12615	NC_017473	GGC	2	6	656751	656756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385819207
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12619	NC_017473	TAA	2	6	657020	657025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385819207
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