MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_017473	GT	3	6	2603284	2603289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50003	NC_017473	CCAT	2	8	2603437	2603444	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50004	NC_017473	GT	3	6	2603453	2603458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50005	NC_017473	ATG	2	6	2603478	2603483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50006	NC_017473	TCC	2	6	2603504	2603509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50007	NC_017473	CACGA	2	10	2603603	2603612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50008	NC_017473	GAC	2	6	2603616	2603621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50009	NC_017473	CAC	2	6	2603629	2603634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50010	NC_017473	TC	3	6	2603666	2603671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50011	NC_017473	TTC	2	6	2603704	2603709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50012	NC_017473	CAGAC	2	10	2603937	2603946	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50013	NC_017473	GCC	2	6	2603948	2603953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50014	NC_017473	TTC	2	6	2603967	2603972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50017	NC_017473	GCT	2	6	2604158	2604163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821205
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50019	NC_017473	TTC	2	6	2604231	2604236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821205
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50021	NC_017473	CTT	2	6	2604267	2604272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50022	NC_017473	CTG	2	6	2604326	2604331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50027	NC_017473	CGC	2	6	2604664	2604669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50028	NC_017473	TGT	2	6	2604734	2604739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50032	NC_017473	CAAT	2	8	2604877	2604884	50 %	25 %	0 %	25 %	385821206
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50039	NC_017473	A	6	6	2605087	2605092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50041	NC_017473	ATGG	2	8	2605161	2605168	25 %	25 %	50 %	0 %	385821207
50042	NC_017473	TCAG	2	8	2605173	2605180	25 %	25 %	25 %	25 %	385821207
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50054	NC_017473	CAT	2	6	2605585	2605590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821207
50055	NC_017473	GTCTT	2	10	2605623	2605632	0 %	60 %	20 %	20 %	385821207
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50105	NC_017473	ATTG	2	8	2608885	2608892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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50122	NC_017473	GCT	2	6	2609773	2609778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821210
50123	NC_017473	TCC	2	6	2609873	2609878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50124	NC_017473	T	6	6	2609887	2609892	0 %	100 %	0 %	0 %	385821211
50125	NC_017473	CAT	2	6	2609894	2609899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821211
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50132	NC_017473	AGT	2	6	2610157	2610162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821212
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50141	NC_017473	TGCT	2	8	2611023	2611030	0 %	50 %	25 %	25 %	385821212
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50145	NC_017473	CGTT	2	8	2611251	2611258	0 %	50 %	25 %	25 %	385821213
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50150	NC_017473	ACC	2	6	2611629	2611634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821213
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50153	NC_017473	TGA	2	6	2611765	2611770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821213
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50157	NC_017473	TTGC	2	8	2612029	2612036	0 %	50 %	25 %	25 %	385821213
50158	NC_017473	GTT	2	6	2612070	2612075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821213
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50207	NC_017473	CCCT	2	8	2614657	2614664	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50208	NC_017473	ATT	2	6	2614679	2614684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50209	NC_017473	TAA	2	6	2614697	2614702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50210	NC_017473	TTTAT	2	10	2614708	2614717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50211	NC_017473	A	6	6	2614736	2614741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50212	NC_017473	CAA	2	6	2614742	2614747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50213	NC_017473	TA	5	10	2614755	2614764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50214	NC_017473	GAT	2	6	2614830	2614835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50215	NC_017473	TATT	2	8	2614836	2614843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50216	NC_017473	ATT	2	6	2614919	2614924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50217	NC_017473	GATC	2	8	2614935	2614942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50218	NC_017473	T	7	7	2614948	2614954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50219	NC_017473	AC	3	6	2614966	2614971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50220	NC_017473	CTG	2	6	2615000	2615005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50221	NC_017473	CAT	2	6	2615012	2615017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50222	NC_017473	AAG	2	6	2615037	2615042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50223	NC_017473	A	6	6	2615046	2615051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50224	NC_017473	AAG	2	6	2615073	2615078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50225	NC_017473	CTG	2	6	2615116	2615121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821215
50226	NC_017473	ATC	2	6	2615122	2615127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821215
50227	NC_017473	GTT	2	6	2615128	2615133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821215
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50229	NC_017473	TCG	2	6	2615192	2615197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821215
50230	NC_017473	CTT	2	6	2615247	2615252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821215
50231	NC_017473	TGCT	2	8	2615257	2615264	0 %	50 %	25 %	25 %	385821215
50232	NC_017473	GCT	2	6	2615288	2615293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821215
50233	NC_017473	CAT	2	6	2615361	2615366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821215
50234	NC_017473	TTCA	2	8	2615389	2615396	25 %	50 %	0 %	25 %	385821215
50235	NC_017473	TCG	2	6	2615483	2615488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821215
50236	NC_017473	CGA	2	6	2615495	2615500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821215
50237	NC_017473	TCA	3	9	2615504	2615512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821215
50238	NC_017473	CGT	2	6	2615524	2615529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821215
50239	NC_017473	GGT	2	6	2615540	2615545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821215
50240	NC_017473	CTT	2	6	2615758	2615763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821215
50241	NC_017473	ATC	2	6	2615779	2615784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821215
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50345	NC_017473	AACTA	2	10	2620315	2620324	60 %	20 %	0 %	20 %	385821220
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50355	NC_017473	AT	3	6	2620883	2620888	50 %	50 %	0 %	0 %	385821222
50356	NC_017473	ATG	2	6	2620961	2620966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821222
50357	NC_017473	CCA	2	6	2621004	2621009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821222
50358	NC_017473	GCG	2	6	2621039	2621044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821222
50359	NC_017473	ATA	2	6	2621137	2621142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821222
50360	NC_017473	GA	3	6	2621168	2621173	50 %	0 %	50 %	0 %	385821222
50361	NC_017473	CAC	2	6	2621181	2621186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821222
50362	NC_017473	TGA	2	6	2621226	2621231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821222
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50384	NC_017473	TCA	2	6	2622493	2622498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50385	NC_017473	AATG	2	8	2622520	2622527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50386	NC_017473	ACA	2	6	2622578	2622583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821223
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50455	NC_017473	TCT	2	6	2626800	2626805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50457	NC_017473	GCTT	2	8	2627196	2627203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50458	NC_017473	GTA	2	6	2627228	2627233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50459	NC_017473	T	6	6	2627247	2627252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50460	NC_017473	TGCA	2	8	2627335	2627342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50461	NC_017473	GAT	2	6	2627353	2627358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50462	NC_017473	GACAA	2	10	2627497	2627506	60 %	0 %	20 %	20 %	385821225
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50469	NC_017473	GTT	2	6	2627800	2627805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821225
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50474	NC_017473	ATC	2	6	2628046	2628051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821225
50475	NC_017473	ACG	2	6	2628119	2628124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821225
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