MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 40490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017470	AAT	2	6	23879	23884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017470	AGG	2	6	23928	23933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017470	ACA	2	6	23951	23956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816636
504	NC_017470	A	6	6	23969	23974	100 %	0 %	0 %	0 %	385816636
505	NC_017470	CTA	2	6	23976	23981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816636
506	NC_017470	GAA	2	6	24166	24171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816636
507	NC_017470	TGG	2	6	24179	24184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816636
508	NC_017470	CAC	2	6	24238	24243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816636
509	NC_017470	GAA	2	6	24293	24298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816636
510	NC_017470	AT	3	6	24322	24327	50 %	50 %	0 %	0 %	385816636
511	NC_017470	CCA	2	6	24451	24456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816636
512	NC_017470	TGA	2	6	24478	24483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816636
513	NC_017470	TGC	2	6	24493	24498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816636
514	NC_017470	GACTTT	2	12	24521	24532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385816636
515	NC_017470	CGA	2	6	24538	24543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816636
516	NC_017470	GAT	2	6	24571	24576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816636
517	NC_017470	ATT	2	6	24585	24590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816636
518	NC_017470	ATC	2	6	24600	24605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816636
519	NC_017470	ACA	2	6	24666	24671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816636
520	NC_017470	GTT	2	6	24697	24702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816636
521	NC_017470	A	6	6	24751	24756	100 %	0 %	0 %	0 %	385816636
522	NC_017470	AC	3	6	24814	24819	50 %	0 %	0 %	50 %	385816636
523	NC_017470	AAC	2	6	24923	24928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816636
524	NC_017470	A	6	6	24936	24941	100 %	0 %	0 %	0 %	385816636
525	NC_017470	TAC	2	6	24998	25003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816636
526	NC_017470	ACA	2	6	25091	25096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816636
527	NC_017470	GCT	2	6	25160	25165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816636
528	NC_017470	GTC	2	6	25167	25172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816636
529	NC_017470	AAG	2	6	25194	25199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816636
530	NC_017470	ATT	2	6	25335	25340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816636
531	NC_017470	T	7	7	25370	25376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017470	A	6	6	25403	25408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017470	TTTG	2	8	25414	25421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017470	GAA	2	6	25461	25466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017470	A	6	6	25509	25514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017470	CTTT	2	8	25557	25564	0 %	75 %	0 %	25 %	385816637
537	NC_017470	T	6	6	25567	25572	0 %	100 %	0 %	0 %	385816637
538	NC_017470	GATG	2	8	25612	25619	25 %	25 %	50 %	0 %	385816637
539	NC_017470	AG	3	6	25656	25661	50 %	0 %	50 %	0 %	385816637
540	NC_017470	ATG	2	6	25671	25676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816637
541	NC_017470	TGTGCA	2	12	25681	25692	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816637
542	NC_017470	AGA	2	6	25709	25714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816637
543	NC_017470	TGA	2	6	25737	25742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816637
544	NC_017470	GGT	2	6	25763	25768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816637
545	NC_017470	ATA	2	6	25794	25799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816637
546	NC_017470	TGT	2	6	25849	25854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816637
547	NC_017470	GTA	2	6	26009	26014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816637
548	NC_017470	AAT	2	6	26021	26026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816637
549	NC_017470	AGA	2	6	26032	26037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816637
550	NC_017470	A	6	6	26107	26112	100 %	0 %	0 %	0 %	385816637
551	NC_017470	AAT	2	6	26243	26248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816637
552	NC_017470	A	6	6	26270	26275	100 %	0 %	0 %	0 %	385816637
553	NC_017470	TGC	2	6	26323	26328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816637
554	NC_017470	AAC	2	6	26377	26382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816637
555	NC_017470	AGA	2	6	26469	26474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816637
556	NC_017470	TGG	2	6	26541	26546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816637
557	NC_017470	GAA	2	6	26562	26567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816637
558	NC_017470	GAA	2	6	26570	26575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816637
559	NC_017470	GAT	3	9	26732	26740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816637
560	NC_017470	AAG	2	6	26745	26750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816637
561	NC_017470	CTT	2	6	26787	26792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816637
562	NC_017470	ATC	2	6	26840	26845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816637
563	NC_017470	A	6	6	26887	26892	100 %	0 %	0 %	0 %	385816637
564	NC_017470	TAA	2	6	26908	26913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017470	CT	3	6	26940	26945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_017470	TTA	2	6	26951	26956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017470	AT	3	6	26960	26965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017470	ATT	2	6	27017	27022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816638
569	NC_017470	T	6	6	27029	27034	0 %	100 %	0 %	0 %	385816638
570	NC_017470	AT	3	6	27068	27073	50 %	50 %	0 %	0 %	385816638
571	NC_017470	ATC	2	6	27087	27092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816638
572	NC_017470	TTTG	2	8	27112	27119	0 %	75 %	25 %	0 %	385816638
573	NC_017470	TAC	2	6	27151	27156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816638
574	NC_017470	TCT	2	6	27192	27197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816638
575	NC_017470	TCG	2	6	27207	27212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816638
576	NC_017470	CTA	2	6	27365	27370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816638
577	NC_017470	TGGT	2	8	27430	27437	0 %	50 %	50 %	0 %	385816638
578	NC_017470	ACG	2	6	27639	27644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816638
579	NC_017470	AAAG	2	8	27739	27746	75 %	0 %	25 %	0 %	385816638
580	NC_017470	CAAA	2	8	27771	27778	75 %	0 %	0 %	25 %	385816638
581	NC_017470	GCT	2	6	27785	27790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816638
582	NC_017470	T	7	7	27807	27813	0 %	100 %	0 %	0 %	385816639
583	NC_017470	CCA	2	6	28038	28043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816639
584	NC_017470	TTA	2	6	28086	28091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816639
585	NC_017470	TCT	2	6	28098	28103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816639
586	NC_017470	TG	3	6	28107	28112	0 %	50 %	50 %	0 %	385816639
587	NC_017470	ATG	2	6	28133	28138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816639
588	NC_017470	CAC	2	6	28238	28243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816639
589	NC_017470	TCC	2	6	28383	28388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385816640
590	NC_017470	TA	3	6	28422	28427	50 %	50 %	0 %	0 %	385816640
591	NC_017470	GGTA	2	8	28461	28468	25 %	25 %	50 %	0 %	385816640
592	NC_017470	ACC	2	6	28513	28518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816640
593	NC_017470	AAAT	2	8	28694	28701	75 %	25 %	0 %	0 %	385816640
594	NC_017470	AGC	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816640
595	NC_017470	ATC	2	6	28769	28774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816640
596	NC_017470	AAT	2	6	28810	28815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816640
597	NC_017470	AATTT	2	10	28925	28934	40 %	60 %	0 %	0 %	385816641
598	NC_017470	TTGT	2	8	28954	28961	0 %	75 %	25 %	0 %	385816641
599	NC_017470	TAA	2	6	29049	29054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816641
600	NC_017470	TAT	2	6	29220	29225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816641
601	NC_017470	ATA	2	6	29271	29276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816641
602	NC_017470	TGTT	2	8	29288	29295	0 %	75 %	25 %	0 %	385816641
603	NC_017470	TCT	2	6	29307	29312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017470	ATC	2	6	29382	29387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816642
605	NC_017470	TTTGC	2	10	29390	29399	0 %	60 %	20 %	20 %	385816642
606	NC_017470	CTT	2	6	29405	29410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816642
607	NC_017470	CAT	2	6	29414	29419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816642
608	NC_017470	AGC	2	6	29430	29435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816642
609	NC_017470	TCTT	2	8	29436	29443	0 %	75 %	0 %	25 %	385816642
610	NC_017470	GCTT	2	8	29476	29483	0 %	50 %	25 %	25 %	385816642
611	NC_017470	ACC	2	6	29490	29495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816642
612	NC_017470	GTA	2	6	29496	29501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816642
613	NC_017470	GAA	2	6	29504	29509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816642
614	NC_017470	TTGAT	2	10	29516	29525	20 %	60 %	20 %	0 %	385816642
615	NC_017470	GT	3	6	29527	29532	0 %	50 %	50 %	0 %	385816642
616	NC_017470	GAA	2	6	29543	29548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816642
617	NC_017470	AGC	2	6	29700	29705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816642
618	NC_017470	AC	3	6	29861	29866	50 %	0 %	0 %	50 %	385816642
619	NC_017470	TGGG	2	8	29919	29926	0 %	25 %	75 %	0 %	385816642
620	NC_017470	ACT	2	6	30070	30075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816642
621	NC_017470	AGC	2	6	30094	30099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816642
622	NC_017470	AAT	2	6	30147	30152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816642
623	NC_017470	CT	3	6	30191	30196	0 %	50 %	0 %	50 %	385816642
624	NC_017470	CCT	2	6	30224	30229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385816642
625	NC_017470	CAA	2	6	30365	30370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816642
626	NC_017470	ATT	2	6	30453	30458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816642
627	NC_017470	TGT	2	6	30482	30487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816642
628	NC_017470	GGT	2	6	30500	30505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816642
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