MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017465	TGT	2	6	193368	193373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811883
4002	NC_017465	CTT	2	6	193387	193392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811883
4003	NC_017465	A	6	6	193410	193415	100 %	0 %	0 %	0 %	385811883
4004	NC_017465	GTT	2	6	193416	193421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811883
4005	NC_017465	TCAAA	2	10	193427	193436	60 %	20 %	0 %	20 %	385811883
4006	NC_017465	AAT	2	6	193499	193504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385811883
4007	NC_017465	CGA	2	6	193509	193514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811883
4008	NC_017465	TTA	2	6	193583	193588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017465	CTT	2	6	193605	193610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017465	CGG	2	6	193650	193655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017465	ATTG	2	8	193692	193699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017465	TGAT	2	8	193714	193721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017465	ACA	2	6	193785	193790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017465	AAC	2	6	193817	193822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017465	GTT	2	6	193823	193828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017465	AAC	2	6	193835	193840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017465	TGGA	2	8	193871	193878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017465	TTG	2	6	193895	193900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017465	GAT	2	6	193924	193929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017465	GA	3	6	193943	193948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017465	GCA	2	6	193997	194002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017465	GTGA	2	8	194050	194057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017465	TGT	2	6	194083	194088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017465	AGA	2	6	194092	194097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017465	CAG	2	6	194165	194170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_017465	AG	3	6	194220	194225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017465	AGA	2	6	194306	194311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017465	AT	3	6	194350	194355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017465	GAA	2	6	194357	194362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017465	GGC	2	6	194376	194381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017465	GAA	2	6	194620	194625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017465	GGT	2	6	194694	194699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017465	GTC	3	9	194705	194713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017465	TCGTG	2	10	194717	194726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_017465	GGA	2	6	194820	194825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017465	GAC	2	6	194833	194838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017465	ATC	2	6	194844	194849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017465	AC	3	6	194871	194876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_017465	GCAA	2	8	194918	194925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_017465	AC	3	6	195040	195045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_017465	AGCC	2	8	195103	195110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_017465	GAT	2	6	195126	195131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017465	CCT	2	6	195182	195187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_017465	ATA	2	6	195277	195282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017465	TAA	2	6	195291	195296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017465	AACT	2	8	195358	195365	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_017465	ATC	2	6	195517	195522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017465	GAT	2	6	195529	195534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017465	TAG	2	6	195592	195597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017465	AGAA	2	8	195608	195615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017465	GCG	2	6	195634	195639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_017465	TC	3	6	195782	195787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_017465	CGG	2	6	195806	195811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_017465	GGGAG	2	10	195919	195928	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017465	TC	3	6	196243	196248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_017465	AT	3	6	196443	196448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017465	AGC	2	6	196502	196507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017465	CAT	2	6	196508	196513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017465	CGA	2	6	196637	196642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017465	TCC	2	6	196757	196762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_017465	ATG	2	6	196850	196855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017465	AGG	2	6	196865	196870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017465	GAG	2	6	197061	197066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017465	CGG	2	6	197310	197315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017465	GA	3	6	197408	197413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017465	AATTG	2	10	197422	197431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017465	TAC	2	6	197510	197515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017465	TAGG	2	8	197526	197533	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017465	TGG	2	6	197572	197577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017465	TAC	2	6	197580	197585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017465	TAT	2	6	197591	197596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017465	CAC	2	6	197612	197617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_017465	GTG	2	6	197623	197628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017465	GACA	2	8	197761	197768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_017465	GGT	2	6	197804	197809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017465	CGT	2	6	197999	198004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_017465	GTT	2	6	198102	198107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017465	TATG	2	8	198132	198139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017465	GAT	2	6	198225	198230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017465	TGGAAG	2	12	198244	198255	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017465	GTG	2	6	198373	198378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017465	ATG	2	6	198379	198384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017465	AGT	2	6	198444	198449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017465	CCAA	2	8	198488	198495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_017465	T	7	7	198522	198528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017465	CCG	2	6	198569	198574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_017465	GCCT	2	8	198599	198606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_017465	G	6	6	198747	198752	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017465	ATA	2	6	198829	198834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017465	GAG	2	6	198867	198872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017465	TA	3	6	198890	198895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017465	CGG	2	6	198899	198904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017465	GCAA	2	8	198919	198926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_017465	ACT	2	6	198993	198998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017465	AAC	2	6	199114	199119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017465	AAG	2	6	199141	199146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017465	CGG	2	6	199228	199233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017465	CGGT	2	8	199262	199269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_017465	TTC	2	6	199291	199296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017465	CTG	2	6	199471	199476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811884
4101	NC_017465	ACC	2	6	199522	199527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811884
4102	NC_017465	GGC	2	6	199653	199658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811884
4103	NC_017465	CCT	2	6	199745	199750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811884
4104	NC_017465	AAC	2	6	199786	199791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811884
4105	NC_017465	GCC	2	6	199792	199797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811884
4106	NC_017465	AAC	2	6	199814	199819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811884
4107	NC_017465	A	6	6	199885	199890	100 %	0 %	0 %	0 %	385811884
4108	NC_017465	ATTGT	2	10	199917	199926	20 %	60 %	20 %	0 %	385811884
4109	NC_017465	CAA	2	6	199940	199945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811884
4110	NC_017465	GAT	2	6	199956	199961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811884
4111	NC_017465	TTG	2	6	199985	199990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811884
4112	NC_017465	CAT	2	6	200143	200148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811884
4113	NC_017465	GAC	2	6	200150	200155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811884
4114	NC_017465	GAA	2	6	200188	200193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811884
4115	NC_017465	TGA	2	6	200244	200249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811884
4116	NC_017465	CAT	2	6	200254	200259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811884
4117	NC_017465	CGG	2	6	200335	200340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017465	TCA	2	6	200346	200351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_017465	GTG	2	6	200426	200431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017465	CCG	2	6	200491	200496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_017465	CGA	2	6	200564	200569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017465	CGT	2	6	200585	200590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017465	G	6	6	200591	200596	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017465	CAA	2	6	200669	200674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017465	CCG	2	6	200719	200724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_017465	ACT	2	6	200770	200775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017465	ACC	2	6	200794	200799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811885
4128	NC_017465	AAG	2	6	200857	200862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811885
4129	NC_017465	CCA	2	6	200888	200893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811885
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4131	NC_017465	CCT	2	6	201061	201066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811885
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4262	NC_017465	GCC	2	6	207999	208004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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