MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017465	CCA	2	6	143742	143747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811864
3002	NC_017465	ACG	2	6	143885	143890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811864
3003	NC_017465	TTA	2	6	144022	144027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385811864
3004	NC_017465	CCG	2	6	144032	144037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811864
3005	NC_017465	AGA	2	6	144195	144200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811864
3006	NC_017465	TGC	2	6	144204	144209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811864
3007	NC_017465	AG	3	6	144234	144239	50 %	0 %	50 %	0 %	385811864
3008	NC_017465	AACT	2	8	144241	144248	50 %	25 %	0 %	25 %	385811864
3009	NC_017465	GAT	2	6	144249	144254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811864
3010	NC_017465	CCCG	2	8	144266	144273	0 %	0 %	25 %	75 %	385811864
3011	NC_017465	GCC	2	6	144334	144339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811864
3012	NC_017465	CACC	2	8	144444	144451	25 %	0 %	0 %	75 %	385811864
3013	NC_017465	CGT	2	6	144537	144542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017465	AAG	2	6	144568	144573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811865
3015	NC_017465	CGC	2	6	144759	144764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811865
3016	NC_017465	GCG	2	6	144919	144924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811865
3017	NC_017465	GTTC	2	8	144967	144974	0 %	50 %	25 %	25 %	385811865
3018	NC_017465	GAA	2	6	145002	145007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811865
3019	NC_017465	GTG	2	6	145110	145115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811865
3020	NC_017465	GAT	2	6	145178	145183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811865
3021	NC_017465	ATC	2	6	145236	145241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811865
3022	NC_017465	CCGGA	2	10	145260	145269	20 %	0 %	40 %	40 %	385811865
3023	NC_017465	CCGC	2	8	145415	145422	0 %	0 %	25 %	75 %	385811865
3024	NC_017465	AGA	2	6	145463	145468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811865
3025	NC_017465	GGC	2	6	145589	145594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811865
3026	NC_017465	TGA	2	6	145605	145610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811865
3027	NC_017465	TACC	2	8	145617	145624	25 %	25 %	0 %	50 %	385811865
3028	NC_017465	GCA	2	6	145672	145677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811865
3029	NC_017465	ACCA	2	8	145741	145748	50 %	0 %	0 %	50 %	385811865
3030	NC_017465	TCG	2	6	145773	145778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811865
3031	NC_017465	A	7	7	145802	145808	100 %	0 %	0 %	0 %	385811865
3032	NC_017465	TAA	2	6	145857	145862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017465	TGCC	2	8	145942	145949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_017465	GCG	2	6	145972	145977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017465	GCG	2	6	146010	146015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017465	ACG	2	6	146034	146039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017465	AGA	2	6	146042	146047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017465	GAG	2	6	146097	146102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017465	GGC	2	6	146165	146170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017465	CGC	2	6	146183	146188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_017465	CCG	2	6	146194	146199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_017465	ACCG	2	8	146214	146221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_017465	GCTG	2	8	146251	146258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_017465	CCAA	2	8	146277	146284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_017465	GGT	2	6	146285	146290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017465	GTT	2	6	146340	146345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017465	AGC	2	6	146460	146465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017465	GCTG	2	8	146504	146511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_017465	TCG	2	6	146519	146524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017465	TGA	2	6	146534	146539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017465	ACCA	2	8	146605	146612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_017465	GGT	2	6	146613	146618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017465	AAC	2	6	146625	146630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_017465	CTT	2	6	146639	146644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017465	GGT	2	6	146690	146695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017465	CTT	2	6	146855	146860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017465	TGG	2	6	146875	146880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017465	AGG	2	6	146926	146931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017465	AGC	2	6	147081	147086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017465	CCAA	2	8	147136	147143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_017465	GCG	2	6	147146	147151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_017465	CGG	2	6	147168	147173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017465	AAGC	2	8	147176	147183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_017465	C	6	6	147229	147234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3065	NC_017465	GGC	2	6	147275	147280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017465	GTC	2	6	147282	147287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017465	CTA	2	6	147317	147322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017465	CTT	2	6	147497	147502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811866
3069	NC_017465	GGT	2	6	147639	147644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811866
3070	NC_017465	TTA	2	6	147689	147694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385811866
3071	NC_017465	ACG	2	6	147709	147714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811866
3072	NC_017465	ACT	2	6	147760	147765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811866
3073	NC_017465	ACC	2	6	147843	147848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811866
3074	NC_017465	GGC	2	6	147915	147920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811866
3075	NC_017465	GAT	2	6	148097	148102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811866
3076	NC_017465	TGA	2	6	148126	148131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811866
3077	NC_017465	CCGT	2	8	148156	148163	0 %	25 %	25 %	50 %	385811866
3078	NC_017465	GAT	2	6	148173	148178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811866
3079	NC_017465	TAC	2	6	148221	148226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811866
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3081	NC_017465	CGATT	2	10	148265	148274	20 %	40 %	20 %	20 %	385811866
3082	NC_017465	CGGC	2	8	148315	148322	0 %	0 %	50 %	50 %	385811866
3083	NC_017465	AACCA	2	10	148326	148335	60 %	0 %	0 %	40 %	385811866
3084	NC_017465	ACG	2	6	148345	148350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811866
3085	NC_017465	GCA	2	6	148378	148383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811866
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3087	NC_017465	GTGA	2	8	148470	148477	25 %	25 %	50 %	0 %	385811866
3088	NC_017465	ACCA	2	8	148501	148508	50 %	0 %	0 %	50 %	385811866
3089	NC_017465	CCT	2	6	148627	148632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811866
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3091	NC_017465	TTAA	2	8	148786	148793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017465	GATT	2	8	148831	148838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017465	TGG	2	6	148843	148848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017465	CCA	2	6	148868	148873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_017465	CGGTA	2	10	148895	148904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3096	NC_017465	CATC	2	8	148991	148998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_017465	TGA	2	6	149012	149017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017465	CGC	2	6	149041	149046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_017465	TGG	2	6	149053	149058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017465	ACTACC	2	12	149099	149110	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_017465	CAC	2	6	149122	149127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_017465	AGT	2	6	149139	149144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017465	CCT	2	6	149154	149159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_017465	TTC	2	6	149211	149216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_017465	ACA	2	6	149278	149283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_017465	CTT	2	6	149316	149321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017465	T	7	7	149320	149326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017465	GAT	2	6	149341	149346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017465	TTG	2	6	149441	149446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017465	TGA	2	6	149452	149457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017465	ATA	2	6	149506	149511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017465	ATT	2	6	149512	149517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017465	TGT	2	6	149565	149570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017465	ACC	2	6	149597	149602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_017465	GTG	2	6	149624	149629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017465	ACT	2	6	149724	149729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017465	TCA	2	6	149757	149762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017465	GGA	2	6	149869	149874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017465	GAA	2	6	149900	149905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017465	GAC	2	6	149918	149923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_017465	GAC	2	6	149930	149935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017465	GCC	2	6	149954	149959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_017465	GCC	2	6	150012	150017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_017465	CGC	2	6	150036	150041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017465	TGG	2	6	150066	150071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017465	GCC	2	6	150090	150095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_017465	CGA	2	6	150124	150129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_017465	GCC	2	6	150147	150152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_017465	CAC	3	9	150170	150178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_017465	GAC	2	6	150217	150222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_017465	AAG	2	6	150231	150236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017465	AGC	2	6	150253	150258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_017465	AGG	2	6	150264	150269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017465	CCA	2	6	150366	150371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_017465	ACCTAC	2	12	150487	150498	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_017465	GGA	2	6	150507	150512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_017465	GCG	2	6	150593	150598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811867
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3147	NC_017465	ACC	2	6	150998	151003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3148	NC_017465	GGT	2	6	151005	151010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3150	NC_017465	GAT	2	6	151092	151097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3152	NC_017465	AGCG	2	8	151267	151274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3153	NC_017465	AAG	2	6	151372	151377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_017465	CCAA	2	8	151403	151410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3155	NC_017465	TCC	2	6	151421	151426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3156	NC_017465	GGT	2	6	151476	151481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_017465	ACC	2	6	151502	151507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3158	NC_017465	G	6	6	151549	151554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_017465	TCT	2	6	151568	151573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_017465	GCC	2	6	151810	151815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3162	NC_017465	CGA	2	6	151902	151907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3163	NC_017465	CCG	2	6	151925	151930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3164	NC_017465	GCT	2	6	151959	151964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3189	NC_017465	CACCC	2	10	152857	152866	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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3241	NC_017465	GGCG	2	8	155381	155388	0 %	0 %	75 %	25 %	385811869
3242	NC_017465	TTG	2	6	155394	155399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811869
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3248	NC_017465	GAT	2	6	155771	155776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811869
3249	NC_017465	CCGG	3	12	155867	155878	0 %	0 %	50 %	50 %	385811869
3250	NC_017465	GAAGA	2	10	155880	155889	60 %	0 %	40 %	0 %	385811869
3251	NC_017465	ACC	2	6	156018	156023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811869
3252	NC_017465	GAGAA	2	10	156113	156122	60 %	0 %	40 %	0 %	385811869
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3357	NC_017465	GCAAG	2	10	161896	161905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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