MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_017465	TTC	2	6	1616714	1616719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33002	NC_017465	TG	3	6	1616739	1616744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33003	NC_017465	TCA	2	6	1616757	1616762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33004	NC_017465	GTG	3	9	1616833	1616841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33005	NC_017465	GTAA	2	8	1616847	1616854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_017465	GTA	2	6	1616875	1616880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33007	NC_017465	ATA	2	6	1616900	1616905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33008	NC_017465	TCT	2	6	1616912	1616917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33009	NC_017465	CGG	2	6	1616987	1616992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33010	NC_017465	TTC	2	6	1617026	1617031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33011	NC_017465	GGC	2	6	1617196	1617201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33012	NC_017465	TAG	2	6	1617235	1617240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33013	NC_017465	GTTTG	2	10	1617246	1617255	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33014	NC_017465	TAGGT	2	10	1617319	1617328	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33015	NC_017465	CGT	2	6	1617356	1617361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33016	NC_017465	C	6	6	1617367	1617372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33017	NC_017465	GGC	2	6	1617457	1617462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33018	NC_017465	CAC	2	6	1617492	1617497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33019	NC_017465	TTAA	2	8	1617499	1617506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33020	NC_017465	GTC	2	6	1617567	1617572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33021	NC_017465	GAG	2	6	1617624	1617629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33022	NC_017465	TGA	2	6	1617662	1617667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33023	NC_017465	GTCC	2	8	1617680	1617687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33024	NC_017465	ATC	2	6	1617729	1617734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33025	NC_017465	TGA	2	6	1617773	1617778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33026	NC_017465	CCA	2	6	1617779	1617784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33027	NC_017465	CCA	2	6	1617800	1617805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33028	NC_017465	TC	3	6	1617895	1617900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33029	NC_017465	CT	3	6	1617920	1617925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33030	NC_017465	TTG	2	6	1617948	1617953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33031	NC_017465	CTC	2	6	1617994	1617999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33032	NC_017465	TCA	2	6	1618054	1618059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33033	NC_017465	GTT	2	6	1618060	1618065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33034	NC_017465	CTTG	2	8	1618074	1618081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33035	NC_017465	GCCA	2	8	1618082	1618089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33036	NC_017465	CGG	2	6	1618169	1618174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812592
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33040	NC_017465	GGTT	2	8	1618334	1618341	0 %	50 %	50 %	0 %	385812592
33041	NC_017465	GGC	2	6	1618375	1618380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812592
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33052	NC_017465	CTG	2	6	1618705	1618710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812592
33053	NC_017465	AAC	2	6	1619050	1619055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812592
33054	NC_017465	TGA	2	6	1619073	1619078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812592
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33058	NC_017465	AAG	2	6	1619346	1619351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812593
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33063	NC_017465	CCCA	2	8	1619613	1619620	25 %	0 %	0 %	75 %	385812593
33064	NC_017465	T	6	6	1619622	1619627	0 %	100 %	0 %	0 %	385812593
33065	NC_017465	TCCA	2	8	1619676	1619683	25 %	25 %	0 %	50 %	385812593
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33073	NC_017465	CATA	2	8	1620050	1620057	50 %	25 %	0 %	25 %	385812593
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33089	NC_017465	TCA	2	6	1620844	1620849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33100	NC_017465	AT	3	6	1621665	1621670	50 %	50 %	0 %	0 %	385812594
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33103	NC_017465	GGCT	2	8	1621847	1621854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33104	NC_017465	ATT	2	6	1621877	1621882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33105	NC_017465	GAT	2	6	1621892	1621897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33106	NC_017465	TTG	2	6	1621922	1621927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33107	NC_017465	A	6	6	1621933	1621938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33108	NC_017465	GAT	2	6	1621942	1621947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33109	NC_017465	CACT	2	8	1622149	1622156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33110	NC_017465	CAT	2	6	1622186	1622191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33111	NC_017465	TAA	2	6	1622339	1622344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33121	NC_017465	GGC	2	6	1623023	1623028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812595
33122	NC_017465	CAT	2	6	1623035	1623040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812595
33123	NC_017465	TTC	2	6	1623279	1623284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812595
33124	NC_017465	AGG	2	6	1623297	1623302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812595
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33129	NC_017465	AAT	2	6	1623416	1623421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33134	NC_017465	TAC	2	6	1623573	1623578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812596
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33224	NC_017465	C	7	7	1628040	1628046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33225	NC_017465	TCG	2	6	1628084	1628089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33226	NC_017465	TCA	2	6	1628121	1628126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33228	NC_017465	GC	3	6	1628207	1628212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33229	NC_017465	GGC	2	6	1628240	1628245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33230	NC_017465	TTC	2	6	1628270	1628275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33231	NC_017465	TGCT	2	8	1628349	1628356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33232	NC_017465	TCC	2	6	1628406	1628411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33233	NC_017465	CCG	2	6	1628485	1628490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33234	NC_017465	GTC	2	6	1628508	1628513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33235	NC_017465	GCG	2	6	1628517	1628522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33236	NC_017465	AAT	2	6	1628555	1628560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33237	NC_017465	T	6	6	1628588	1628593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33238	NC_017465	TAC	2	6	1628601	1628606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33240	NC_017465	GAAAT	2	10	1628637	1628646	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33241	NC_017465	TCA	2	6	1628653	1628658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33243	NC_017465	GTT	2	6	1628679	1628684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33245	NC_017465	AACG	2	8	1628827	1628834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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33481	NC_017465	CCT	2	6	1640422	1640427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33482	NC_017465	TGG	2	6	1640433	1640438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33483	NC_017465	GCG	2	6	1640439	1640444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33484	NC_017465	ACT	2	6	1640466	1640471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33485	NC_017465	CAA	2	6	1640507	1640512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33486	NC_017465	GAC	2	6	1640552	1640557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33488	NC_017465	T	6	6	1640607	1640612	0 %	100 %	0 %	0 %	385812604
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33499	NC_017465	TAAG	2	8	1641100	1641107	50 %	25 %	25 %	0 %	385812604
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