MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_017465	C	6	6	1519285	1519290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31002	NC_017465	GTAG	2	8	1519346	1519353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31003	NC_017465	TCG	2	6	1519378	1519383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31004	NC_017465	GAT	2	6	1519413	1519418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_017465	CCA	2	6	1519439	1519444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31006	NC_017465	GTAG	2	8	1519451	1519458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31007	NC_017465	TCT	2	6	1519471	1519476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31008	NC_017465	GGC	2	6	1519548	1519553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31009	NC_017465	GAA	2	6	1519554	1519559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_017465	T	6	6	1519653	1519658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_017465	GTG	2	6	1519729	1519734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_017465	GCTT	2	8	1519747	1519754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31013	NC_017465	CTT	2	6	1519796	1519801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31014	NC_017465	GTT	2	6	1519802	1519807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_017465	TAA	2	6	1519813	1519818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_017465	TGG	2	6	1519868	1519873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_017465	GCGG	2	8	1519894	1519901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31018	NC_017465	AGA	2	6	1519969	1519974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_017465	AGT	2	6	1519992	1519997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_017465	TCG	2	6	1520045	1520050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_017465	C	6	6	1520051	1520056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31022	NC_017465	T	6	6	1520129	1520134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_017465	ATCGTG	2	12	1520143	1520154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31024	NC_017465	AAT	2	6	1520232	1520237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31025	NC_017465	CCG	2	6	1520277	1520282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31026	NC_017465	ACAA	2	8	1520327	1520334	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31027	NC_017465	TCG	2	6	1520336	1520341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31028	NC_017465	CCA	2	6	1520400	1520405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31029	NC_017465	TGT	2	6	1520414	1520419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31030	NC_017465	ATT	2	6	1520522	1520527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31031	NC_017465	ATG	2	6	1520530	1520535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_017465	GTA	2	6	1520553	1520558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31033	NC_017465	A	6	6	1520575	1520580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31034	NC_017465	TCA	2	6	1520594	1520599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31035	NC_017465	CAG	2	6	1520612	1520617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31036	NC_017465	ACC	2	6	1520638	1520643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31037	NC_017465	T	6	6	1520683	1520688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31038	NC_017465	TCC	2	6	1520711	1520716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31039	NC_017465	CTA	2	6	1520721	1520726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31040	NC_017465	TTG	2	6	1520752	1520757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_017465	CGA	2	6	1520808	1520813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31042	NC_017465	CAA	2	6	1520814	1520819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31043	NC_017465	AAC	2	6	1520866	1520871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31044	NC_017465	ATG	2	6	1520929	1520934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31045	NC_017465	AAG	2	6	1520956	1520961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31046	NC_017465	A	6	6	1521019	1521024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31047	NC_017465	TAC	3	9	1521073	1521081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31048	NC_017465	GAAGAT	2	12	1521132	1521143	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31049	NC_017465	TGAT	2	8	1521200	1521207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31050	NC_017465	ACCA	2	8	1521245	1521252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31051	NC_017465	GGCAC	2	10	1521260	1521269	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31052	NC_017465	CACC	2	8	1521365	1521372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31053	NC_017465	CAC	2	6	1521380	1521385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31054	NC_017465	AACTG	2	10	1521465	1521474	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31055	NC_017465	GGC	2	6	1521477	1521482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31056	NC_017465	CGT	2	6	1521498	1521503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812548
31057	NC_017465	GCT	2	6	1521511	1521516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812548
31058	NC_017465	GTTG	2	8	1521587	1521594	0 %	50 %	50 %	0 %	385812548
31059	NC_017465	GTCG	2	8	1521615	1521622	0 %	25 %	50 %	25 %	385812548
31060	NC_017465	AGC	2	6	1521639	1521644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812548
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31062	NC_017465	GCCG	2	8	1521758	1521765	0 %	0 %	50 %	50 %	385812548
31063	NC_017465	ACC	2	6	1521810	1521815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812548
31064	NC_017465	ATC	2	6	1521900	1521905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812548
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31066	NC_017465	GCTG	2	8	1521976	1521983	0 %	25 %	50 %	25 %	385812548
31067	NC_017465	AGCGT	2	10	1522000	1522009	20 %	20 %	40 %	20 %	385812548
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31071	NC_017465	CGGC	2	8	1522190	1522197	0 %	0 %	50 %	50 %	385812548
31072	NC_017465	GGT	2	6	1522211	1522216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812548
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31079	NC_017465	GTG	2	6	1522420	1522425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31082	NC_017465	CCT	2	6	1522453	1522458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31083	NC_017465	T	6	6	1522523	1522528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31091	NC_017465	GTT	2	6	1522929	1522934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_017465	TGG	2	6	1522937	1522942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_017465	GTC	2	6	1523008	1523013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31094	NC_017465	CAG	2	6	1523019	1523024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31095	NC_017465	CGTC	2	8	1523027	1523034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31096	NC_017465	TGG	2	6	1523042	1523047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31097	NC_017465	CTTAAA	2	12	1523118	1523129	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31098	NC_017465	TTG	2	6	1523155	1523160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31099	NC_017465	GCG	2	6	1523185	1523190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31100	NC_017465	TGA	2	6	1523231	1523236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31101	NC_017465	TCT	2	6	1523285	1523290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31102	NC_017465	CTT	2	6	1523301	1523306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31103	NC_017465	CGG	2	6	1523387	1523392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31104	NC_017465	CTT	2	6	1523550	1523555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31105	NC_017465	TAGT	2	8	1523602	1523609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31106	NC_017465	TGG	2	6	1523630	1523635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31107	NC_017465	T	7	7	1523714	1523720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31108	NC_017465	CGT	2	6	1523735	1523740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31109	NC_017465	GCT	2	6	1523773	1523778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31110	NC_017465	GTG	2	6	1523838	1523843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31111	NC_017465	GTA	2	6	1523844	1523849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_017465	CCA	2	6	1523866	1523871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31113	NC_017465	CGG	2	6	1523882	1523887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31114	NC_017465	C	6	6	1523894	1523899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31115	NC_017465	GA	3	6	1523992	1523997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31116	NC_017465	A	6	6	1523997	1524002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31117	NC_017465	ACCGC	2	10	1524004	1524013	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31118	NC_017465	AGGG	2	8	1524025	1524032	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31119	NC_017465	ACC	2	6	1524107	1524112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31120	NC_017465	GCC	2	6	1524146	1524151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31121	NC_017465	ATC	2	6	1524164	1524169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31122	NC_017465	CGATCA	2	12	1524198	1524209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31123	NC_017465	ATC	2	6	1524266	1524271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812549
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31125	NC_017465	CTT	3	9	1524309	1524317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812549
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31348	NC_017465	GTC	2	6	1534643	1534648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812554
31349	NC_017465	TAAGCG	2	12	1534664	1534675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812554
31350	NC_017465	GCC	2	6	1534728	1534733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812554
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31352	NC_017465	T	7	7	1534788	1534794	0 %	100 %	0 %	0 %	385812554
31353	NC_017465	TGG	2	6	1534798	1534803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812554
31354	NC_017465	CTA	2	6	1534813	1534818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812554
31355	NC_017465	CAT	2	6	1534856	1534861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31356	NC_017465	ATC	2	6	1534955	1534960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31357	NC_017465	GCC	2	6	1534988	1534993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31358	NC_017465	C	6	6	1535011	1535016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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31360	NC_017465	GGC	2	6	1535044	1535049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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