MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_017465	ACG	2	6	1352467	1352472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27502	NC_017465	GA	3	6	1352532	1352537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27503	NC_017465	CGC	2	6	1352556	1352561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27504	NC_017465	CGT	2	6	1352594	1352599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27505	NC_017465	CAG	2	6	1352620	1352625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27506	NC_017465	CCCA	2	8	1352659	1352666	25 %	0 %	0 %	75 %	385812471
27507	NC_017465	TTA	2	6	1352731	1352736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812471
27508	NC_017465	CTG	2	6	1352770	1352775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812471
27509	NC_017465	CCAT	2	8	1352788	1352795	25 %	25 %	0 %	50 %	385812471
27510	NC_017465	TCA	2	6	1352805	1352810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812471
27511	NC_017465	CCT	2	6	1352876	1352881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812471
27512	NC_017465	CAGT	2	8	1352941	1352948	25 %	25 %	25 %	25 %	385812471
27513	NC_017465	TAT	2	6	1352978	1352983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812471
27514	NC_017465	CAT	2	6	1352984	1352989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812471
27515	NC_017465	CCGG	2	8	1353018	1353025	0 %	0 %	50 %	50 %	385812471
27516	NC_017465	CGT	2	6	1353107	1353112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812471
27517	NC_017465	CGT	2	6	1353206	1353211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812471
27518	NC_017465	CAA	2	6	1353212	1353217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812471
27519	NC_017465	TGA	2	6	1353295	1353300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812471
27520	NC_017465	GGT	2	6	1353315	1353320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812471
27521	NC_017465	TGA	2	6	1353376	1353381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812471
27522	NC_017465	TCG	2	6	1353403	1353408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812471
27523	NC_017465	GCCCTG	2	12	1353414	1353425	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385812471
27524	NC_017465	TCGG	2	8	1353435	1353442	0 %	25 %	50 %	25 %	385812471
27525	NC_017465	ATC	2	6	1353531	1353536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27526	NC_017465	TTC	2	6	1353537	1353542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27527	NC_017465	TCG	2	6	1353547	1353552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27528	NC_017465	CGA	2	6	1353662	1353667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812472
27529	NC_017465	ACG	2	6	1353676	1353681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812472
27530	NC_017465	GCC	2	6	1353728	1353733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812472
27531	NC_017465	TGATCA	2	12	1353738	1353749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385812472
27532	NC_017465	GC	3	6	1353905	1353910	0 %	0 %	50 %	50 %	385812472
27533	NC_017465	GAG	2	6	1353946	1353951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812472
27534	NC_017465	CACT	2	8	1353961	1353968	25 %	25 %	0 %	50 %	385812472
27535	NC_017465	TC	3	6	1353969	1353974	0 %	50 %	0 %	50 %	385812472
27536	NC_017465	TCT	2	6	1353982	1353987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812472
27537	NC_017465	GGTC	2	8	1354006	1354013	0 %	25 %	50 %	25 %	385812472
27538	NC_017465	TTC	2	6	1354041	1354046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812472
27539	NC_017465	CGG	2	6	1354084	1354089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812472
27540	NC_017465	GGT	2	6	1354109	1354114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812472
27541	NC_017465	CGG	2	6	1354190	1354195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812472
27542	NC_017465	CGA	2	6	1354201	1354206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812472
27543	NC_017465	GCC	2	6	1354281	1354286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812472
27544	NC_017465	CGT	2	6	1354354	1354359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812472
27545	NC_017465	CGG	2	6	1354363	1354368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812472
27546	NC_017465	CGG	2	6	1354375	1354380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812472
27547	NC_017465	GCAA	2	8	1354433	1354440	50 %	0 %	25 %	25 %	385812472
27548	NC_017465	TGT	2	6	1354465	1354470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812472
27549	NC_017465	GCG	2	6	1354567	1354572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812472
27550	NC_017465	C	6	6	1354597	1354602	0 %	0 %	0 %	100 %	385812472
27551	NC_017465	AGG	2	6	1354651	1354656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812472
27552	NC_017465	ATC	2	6	1354657	1354662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812472
27553	NC_017465	TGA	2	6	1354676	1354681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812472
27554	NC_017465	CCG	2	6	1354725	1354730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812472
27555	NC_017465	GGACG	2	10	1354785	1354794	20 %	0 %	60 %	20 %	385812472
27556	NC_017465	TCC	2	6	1354858	1354863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812472
27557	NC_017465	GTC	2	6	1354893	1354898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812472
27558	NC_017465	GCGCA	2	10	1354945	1354954	20 %	0 %	40 %	40 %	385812472
27559	NC_017465	TGA	2	6	1354970	1354975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812472
27560	NC_017465	GCCG	2	8	1355070	1355077	0 %	0 %	50 %	50 %	385812472
27561	NC_017465	CGG	2	6	1355078	1355083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812472
27562	NC_017465	CAG	2	6	1355088	1355093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812472
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27565	NC_017465	GAA	2	6	1355232	1355237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27566	NC_017465	TTG	2	6	1355271	1355276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27567	NC_017465	GTC	3	9	1355352	1355360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27568	NC_017465	ACG	2	6	1355422	1355427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27569	NC_017465	GCC	2	6	1355460	1355465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27570	NC_017465	G	6	6	1355555	1355560	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27571	NC_017465	CCA	2	6	1355616	1355621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27572	NC_017465	GCT	2	6	1355693	1355698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27573	NC_017465	GCT	2	6	1355703	1355708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27574	NC_017465	GTC	2	6	1355740	1355745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27575	NC_017465	GGT	2	6	1355811	1355816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27576	NC_017465	GCC	2	6	1355884	1355889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27577	NC_017465	CGT	2	6	1356001	1356006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27578	NC_017465	GCC	2	6	1356031	1356036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27579	NC_017465	GCC	2	6	1356210	1356215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27580	NC_017465	GAG	2	6	1356233	1356238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27581	NC_017465	ACC	2	6	1356285	1356290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27582	NC_017465	ACTC	2	8	1356358	1356365	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27583	NC_017465	ACCA	2	8	1356456	1356463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27584	NC_017465	CCG	2	6	1356469	1356474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27585	NC_017465	GCG	2	6	1356498	1356503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27586	NC_017465	GAT	2	6	1356595	1356600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27587	NC_017465	CTGG	2	8	1356607	1356614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27588	NC_017465	TTG	2	6	1356616	1356621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27589	NC_017465	GTG	2	6	1356644	1356649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27590	NC_017465	CAC	2	6	1356676	1356681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27591	NC_017465	CAG	2	6	1356682	1356687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27592	NC_017465	C	6	6	1356720	1356725	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27593	NC_017465	TTA	3	9	1356816	1356824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27594	NC_017465	TTAA	2	8	1356830	1356837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27595	NC_017465	ATT	3	9	1356849	1356857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27596	NC_017465	GCCC	2	8	1356880	1356887	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27597	NC_017465	CTA	2	6	1356888	1356893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27598	NC_017465	CGT	2	6	1356906	1356911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27599	NC_017465	CGC	2	6	1357125	1357130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27600	NC_017465	GTTG	2	8	1357298	1357305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27601	NC_017465	CCCG	2	8	1357306	1357313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27602	NC_017465	GCC	2	6	1357351	1357356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27603	NC_017465	CGC	2	6	1357367	1357372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27604	NC_017465	TGC	2	6	1357388	1357393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27605	NC_017465	ACC	2	6	1357398	1357403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27606	NC_017465	CTGG	2	8	1357524	1357531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27607	NC_017465	CAAG	2	8	1357565	1357572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27608	NC_017465	GGT	2	6	1357629	1357634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27609	NC_017465	GTC	2	6	1357767	1357772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27610	NC_017465	ACG	2	6	1357774	1357779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27611	NC_017465	GGC	2	6	1357815	1357820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27612	NC_017465	CCT	2	6	1357974	1357979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27613	NC_017465	CAC	2	6	1357981	1357986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27614	NC_017465	GCA	2	6	1358037	1358042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27615	NC_017465	CCG	2	6	1358066	1358071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27616	NC_017465	TCG	2	6	1358105	1358110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27617	NC_017465	GCG	2	6	1358216	1358221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27618	NC_017465	GC	3	6	1358240	1358245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27619	NC_017465	TCA	2	6	1358317	1358322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812473
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27621	NC_017465	GGCA	2	8	1358364	1358371	25 %	0 %	50 %	25 %	385812473
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