MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017465	TCT	2	6	636783	636788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812109
13002	NC_017465	GGC	2	6	636813	636818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812109
13003	NC_017465	A	6	6	636838	636843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_017465	TGTT	2	8	636869	636876	0 %	75 %	25 %	0 %	385812110
13005	NC_017465	AAAGA	2	10	636884	636893	80 %	0 %	20 %	0 %	385812110
13006	NC_017465	AGTT	2	8	636896	636903	25 %	50 %	25 %	0 %	385812110
13007	NC_017465	ACA	2	6	637035	637040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812110
13008	NC_017465	CTGGTG	2	12	637125	637136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385812110
13009	NC_017465	GAA	2	6	637148	637153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812110
13010	NC_017465	TGG	2	6	637177	637182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812110
13011	NC_017465	TCT	2	6	637197	637202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812110
13012	NC_017465	ACA	2	6	637212	637217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812110
13013	NC_017465	GCC	2	6	637229	637234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812110
13014	NC_017465	TCAC	2	8	637251	637258	25 %	25 %	0 %	50 %	385812110
13015	NC_017465	GGT	2	6	637262	637267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812110
13016	NC_017465	GAC	2	6	637355	637360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812110
13017	NC_017465	GAC	2	6	637409	637414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812110
13018	NC_017465	AGC	2	6	637612	637617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812110
13019	NC_017465	TAAGT	2	10	637646	637655	40 %	40 %	20 %	0 %	385812110
13020	NC_017465	GA	3	6	637665	637670	50 %	0 %	50 %	0 %	385812110
13021	NC_017465	TC	3	6	637681	637686	0 %	50 %	0 %	50 %	385812110
13022	NC_017465	AACG	2	8	637717	637724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_017465	AT	3	6	637744	637749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_017465	TTTC	2	8	637820	637827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13025	NC_017465	ATAA	2	8	637857	637864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_017465	GCC	2	6	637947	637952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_017465	ATT	2	6	638079	638084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_017465	CGG	2	6	638137	638142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_017465	CGA	2	6	638161	638166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_017465	CTA	2	6	638173	638178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_017465	AGC	2	6	638271	638276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_017465	TAGT	2	8	638281	638288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_017465	GCT	2	6	638298	638303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_017465	CTA	2	6	638314	638319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_017465	CAAC	2	8	638332	638339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_017465	GTT	2	6	638340	638345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_017465	CCG	2	6	638356	638361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_017465	TCT	2	6	638421	638426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_017465	CCA	2	6	638428	638433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_017465	TGC	2	6	638441	638446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_017465	TCA	2	6	638523	638528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_017465	TCA	2	6	638535	638540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_017465	ACC	2	6	638544	638549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_017465	GAC	2	6	638723	638728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_017465	CAA	3	9	638733	638741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_017465	ACG	2	6	638761	638766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_017465	TCT	2	6	638794	638799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812111
13048	NC_017465	ACG	2	6	638824	638829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812111
13049	NC_017465	CTA	2	6	638918	638923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812111
13050	NC_017465	TAA	2	6	638937	638942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812111
13051	NC_017465	T	7	7	638953	638959	0 %	100 %	0 %	0 %	385812111
13052	NC_017465	T	7	7	638992	638998	0 %	100 %	0 %	0 %	385812111
13053	NC_017465	GGTC	2	8	639305	639312	0 %	25 %	50 %	25 %	385812111
13054	NC_017465	GCC	2	6	639367	639372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812111
13055	NC_017465	AAC	2	6	639418	639423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812111
13056	NC_017465	TGGTAT	2	12	639503	639514	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385812111
13057	NC_017465	TAC	2	6	639589	639594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812111
13058	NC_017465	TACT	2	8	639626	639633	25 %	50 %	0 %	25 %	385812111
13059	NC_017465	TTC	2	6	639732	639737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812111
13060	NC_017465	G	6	6	639811	639816	0 %	0 %	100 %	0 %	385812111
13061	NC_017465	GGT	2	6	639874	639879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_017465	G	6	6	639888	639893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_017465	GAA	2	6	639951	639956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812112
13064	NC_017465	G	6	6	639970	639975	0 %	0 %	100 %	0 %	385812112
13065	NC_017465	AGT	2	6	639997	640002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812112
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13068	NC_017465	AAG	3	9	640195	640203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812112
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13072	NC_017465	CTT	2	6	640290	640295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812112
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13078	NC_017465	ACC	2	6	640441	640446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812112
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13081	NC_017465	ATG	2	6	640531	640536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812112
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13083	NC_017465	CAA	2	6	640722	640727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812112
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13088	NC_017465	GAA	2	6	640840	640845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812112
13089	NC_017465	AAC	2	6	640907	640912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812112
13090	NC_017465	A	6	6	640931	640936	100 %	0 %	0 %	0 %	385812112
13091	NC_017465	TGG	2	6	640966	640971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812112
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13093	NC_017465	CTAA	2	8	641103	641110	50 %	25 %	0 %	25 %	385812112
13094	NC_017465	T	6	6	641176	641181	0 %	100 %	0 %	0 %	385812112
13095	NC_017465	TCC	2	6	641209	641214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812112
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13098	NC_017465	CCA	2	6	641313	641318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812112
13099	NC_017465	CCT	2	6	641336	641341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812112
13100	NC_017465	CGTT	2	8	641368	641375	0 %	50 %	25 %	25 %	385812112
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13102	NC_017465	CGG	2	6	641446	641451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812112
13103	NC_017465	AAGG	2	8	641482	641489	50 %	0 %	50 %	0 %	385812112
13104	NC_017465	GAC	2	6	641673	641678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812112
13105	NC_017465	GC	3	6	641695	641700	0 %	0 %	50 %	50 %	385812112
13106	NC_017465	A	6	6	641707	641712	100 %	0 %	0 %	0 %	385812112
13107	NC_017465	GGT	2	6	641718	641723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812112
13108	NC_017465	GCGG	2	8	641895	641902	0 %	0 %	75 %	25 %	385812112
13109	NC_017465	CTAG	2	8	642043	642050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13110	NC_017465	GCG	2	6	642058	642063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_017465	AGGAAA	2	12	642092	642103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_017465	CGG	2	6	642176	642181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812113
13113	NC_017465	TGA	2	6	642325	642330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812113
13114	NC_017465	TACT	2	8	642397	642404	25 %	50 %	0 %	25 %	385812113
13115	NC_017465	GCAA	2	8	642478	642485	50 %	0 %	25 %	25 %	385812113
13116	NC_017465	TCC	2	6	642576	642581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812113
13117	NC_017465	GCGGG	2	10	642603	642612	0 %	0 %	80 %	20 %	385812113
13118	NC_017465	ACT	2	6	642664	642669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812113
13119	NC_017465	AGC	2	6	642717	642722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812113
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13122	NC_017465	CTA	2	6	642781	642786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812113
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13124	NC_017465	TTTA	2	8	642879	642886	25 %	75 %	0 %	0 %	385812113
13125	NC_017465	GAC	2	6	642921	642926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812113
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13130	NC_017465	GTC	2	6	643066	643071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812113
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13497	NC_017465	AG	3	6	662116	662121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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