MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 1257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015979	TAA	2	6	46766	46771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015979	TAA	3	9	46790	46798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015979	TAA	2	6	46868	46873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015979	TAA	2	6	46880	46885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015979	TAG	2	6	46889	46894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015979	GTT	2	6	46947	46952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015979	CTT	2	6	46979	46984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015979	TGC	2	6	47048	47053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015979	TGA	2	6	47095	47100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015979	TA	3	6	47152	47157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015979	TATG	2	8	47215	47222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015979	CTT	2	6	47234	47239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015979	CAA	2	6	47288	47293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015979	TAAC	2	8	47368	47375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_015979	TTA	2	6	47395	47400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015979	ATT	2	6	47406	47411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015979	CTT	2	6	47520	47525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015979	TAC	2	6	47556	47561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015979	TAC	2	6	47610	47615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015979	ACG	2	6	47642	47647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015979	TGG	2	6	47660	47665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015979	TAA	2	6	47684	47689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015979	TAA	2	6	47792	47797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015979	CAA	2	6	47800	47805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015979	GAC	2	6	47924	47929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015979	CA	3	6	48103	48108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_015979	CAA	2	6	48155	48160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015979	TCAA	2	8	48199	48206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_015979	ACT	2	6	48306	48311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015979	CCAA	2	8	48318	48325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_015979	AAG	2	6	48373	48378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015979	AAG	2	6	48391	48396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015979	GTG	2	6	48529	48534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015979	GGTCAG	2	12	48537	48548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1035	NC_015979	GGT	2	6	48558	48563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015979	CTA	2	6	48737	48742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015979	GTA	2	6	48760	48765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015979	TAC	2	6	48779	48784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015979	ATT	2	6	48811	48816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015979	CGAA	2	8	48820	48827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_015979	GCA	2	6	48840	48845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015979	CTA	2	6	48853	48858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015979	ACT	2	6	48864	48869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_015979	GCT	2	6	48900	48905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015979	GCA	2	6	48912	48917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015979	GCT	2	6	48924	48929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015979	GCT	2	6	48936	48941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015979	CAG	2	6	48949	48954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015979	ACT	2	6	48960	48965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015979	TAA	2	6	49022	49027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015979	GTA	2	6	49029	49034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015979	ATC	2	6	49116	49121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015979	TAA	2	6	49226	49231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015979	GAA	2	6	49232	49237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015979	AAC	2	6	49269	49274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1057	NC_015979	TAAA	2	8	49367	49374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015979	TTA	3	9	49442	49450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015979	TAA	2	6	49456	49461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015979	GAA	2	6	49560	49565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015979	GATT	2	8	49608	49615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015979	AAC	2	6	49666	49671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015979	ATT	2	6	49696	49701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015979	TTATA	2	10	49717	49726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015979	ATT	2	6	49781	49786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015979	TAT	3	9	49855	49863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015979	AT	3	6	49862	49867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015979	TA	3	6	49869	49874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015979	TTA	2	6	49879	49884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015979	T	6	6	49904	49909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015979	T	6	6	49918	49923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015979	A	6	6	49971	49976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015979	ATT	2	6	50034	50039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533741
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1075	NC_015979	GCTA	2	8	50054	50061	25 %	25 %	25 %	25 %	347533741
1076	NC_015979	AAGA	2	8	50071	50078	75 %	0 %	25 %	0 %	347533741
1077	NC_015979	A	8	8	50093	50100	100 %	0 %	0 %	0 %	347533741
1078	NC_015979	A	7	7	50141	50147	100 %	0 %	0 %	0 %	347533741
1079	NC_015979	TTTAA	2	10	50180	50189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015979	ATGCT	2	10	50256	50265	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_015979	TAA	2	6	50280	50285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015979	A	6	6	50284	50289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015979	TAT	2	6	50310	50315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533742
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1085	NC_015979	AAG	2	6	50363	50368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533742
1086	NC_015979	AT	3	6	50406	50411	50 %	50 %	0 %	0 %	347533742
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1088	NC_015979	CAT	2	6	50488	50493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533742
1089	NC_015979	CTA	2	6	50570	50575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533742
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1091	NC_015979	TAA	2	6	50622	50627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533742
1092	NC_015979	AG	3	6	50644	50649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015979	AGG	2	6	50748	50753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015979	ATGA	2	8	50762	50769	50 %	25 %	25 %	0 %	347533743
1095	NC_015979	CAC	2	6	50831	50836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533743
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1098	NC_015979	AACTT	2	10	50976	50985	40 %	40 %	0 %	20 %	347533743
1099	NC_015979	AAC	2	6	51064	51069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533744
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1102	NC_015979	TCT	2	6	51240	51245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533744
1103	NC_015979	ACTT	2	8	51254	51261	25 %	50 %	0 %	25 %	347533744
1104	NC_015979	AAG	2	6	51288	51293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533744
1105	NC_015979	AAG	2	6	51333	51338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533744
1106	NC_015979	CTG	2	6	51389	51394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533744
1107	NC_015979	TGT	2	6	51429	51434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533744
1108	NC_015979	AGTT	2	8	51447	51454	25 %	50 %	25 %	0 %	347533744
1109	NC_015979	TGA	2	6	51531	51536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533744
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1111	NC_015979	AGC	2	6	51610	51615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533744
1112	NC_015979	AACTGA	2	12	51618	51629	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347533744
1113	NC_015979	CAA	2	6	51640	51645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533744
1114	NC_015979	CCA	2	6	51719	51724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533744
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1116	NC_015979	CAC	2	6	51787	51792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533744
1117	NC_015979	CCA	2	6	51793	51798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533744
1118	NC_015979	CAT	2	6	51924	51929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015979	CATTT	2	10	51965	51974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1120	NC_015979	TGA	2	6	52027	52032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015979	ATT	3	9	52129	52137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015979	T	8	8	52143	52150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015979	ATT	2	6	52178	52183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015979	AAC	2	6	52224	52229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_015979	TAC	2	6	52291	52296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015979	GTTT	2	8	52364	52371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015979	T	7	7	52369	52375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015979	ACC	2	6	52445	52450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533745
1130	NC_015979	AATT	2	8	52451	52458	50 %	50 %	0 %	0 %	347533745
1131	NC_015979	CCA	2	6	52647	52652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533745
1132	NC_015979	ATC	2	6	52886	52891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533745
1133	NC_015979	AT	3	6	53082	53087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_015979	GTA	2	6	53230	53235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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