MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 1257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015979	AT	3	6	23436	23441	50 %	50 %	0 %	0 %	347533724
502	NC_015979	GCA	2	6	23442	23447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533724
503	NC_015979	AG	3	6	23563	23568	50 %	0 %	50 %	0 %	347533724
504	NC_015979	TCG	2	6	23591	23596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533724
505	NC_015979	GCAA	2	8	23600	23607	50 %	0 %	25 %	25 %	347533724
506	NC_015979	ACG	2	6	23616	23621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533724
507	NC_015979	TTGA	2	8	23655	23662	25 %	50 %	25 %	0 %	347533724
508	NC_015979	CAG	2	6	23778	23783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533724
509	NC_015979	AAATT	2	10	23806	23815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015979	TA	3	6	23846	23851	50 %	50 %	0 %	0 %	347533725
511	NC_015979	CAT	2	6	23879	23884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533725
512	NC_015979	TGG	2	6	23931	23936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533725
513	NC_015979	TCT	2	6	23956	23961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533725
514	NC_015979	CAT	2	6	23987	23992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533725
515	NC_015979	A	6	6	24028	24033	100 %	0 %	0 %	0 %	347533725
516	NC_015979	ATT	2	6	24042	24047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533725
517	NC_015979	GATT	2	8	24066	24073	25 %	50 %	25 %	0 %	347533725
518	NC_015979	CCT	2	6	24074	24079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533725
519	NC_015979	TTAG	2	8	24172	24179	25 %	50 %	25 %	0 %	347533725
520	NC_015979	A	6	6	24235	24240	100 %	0 %	0 %	0 %	347533725
521	NC_015979	TAC	2	6	24388	24393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533725
522	NC_015979	AGA	2	6	24417	24422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533725
523	NC_015979	GAAC	2	8	24498	24505	50 %	0 %	25 %	25 %	347533725
524	NC_015979	ATG	2	6	24527	24532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533725
525	NC_015979	CATT	2	8	24551	24558	25 %	50 %	0 %	25 %	347533725
526	NC_015979	CAT	2	6	24627	24632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533725
527	NC_015979	TGT	2	6	24789	24794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533725
528	NC_015979	AGTA	2	8	24805	24812	50 %	25 %	25 %	0 %	347533725
529	NC_015979	CTC	2	6	24853	24858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533725
530	NC_015979	GGT	2	6	24885	24890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533725
531	NC_015979	AGA	2	6	24911	24916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533725
532	NC_015979	GCA	2	6	24928	24933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015979	TGC	2	6	24968	24973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015979	GATTA	2	10	24994	25003	40 %	40 %	20 %	0 %	347533726
535	NC_015979	GAA	2	6	25047	25052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533726
536	NC_015979	ATCC	2	8	25065	25072	25 %	25 %	0 %	50 %	347533726
537	NC_015979	GTT	3	9	25079	25087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533726
538	NC_015979	TGG	2	6	25092	25097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533726
539	NC_015979	TGAA	2	8	25143	25150	50 %	25 %	25 %	0 %	347533726
540	NC_015979	GAA	2	6	25216	25221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533726
541	NC_015979	ATT	2	6	25248	25253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533726
542	NC_015979	TGAT	2	8	25302	25309	25 %	50 %	25 %	0 %	347533726
543	NC_015979	ATT	2	6	25345	25350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533726
544	NC_015979	GAC	2	6	25356	25361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533726
545	NC_015979	A	7	7	25467	25473	100 %	0 %	0 %	0 %	347533726
546	NC_015979	GTG	2	6	25474	25479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533726
547	NC_015979	CAAG	2	8	25486	25493	50 %	0 %	25 %	25 %	347533726
548	NC_015979	ATT	2	6	25514	25519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533726
549	NC_015979	TTA	2	6	25532	25537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533726
550	NC_015979	A	6	6	25542	25547	100 %	0 %	0 %	0 %	347533726
551	NC_015979	GAA	2	6	25625	25630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533726
552	NC_015979	GAAC	2	8	25655	25662	50 %	0 %	25 %	25 %	347533726
553	NC_015979	CAT	2	6	25697	25702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533726
554	NC_015979	TATC	2	8	25740	25747	25 %	50 %	0 %	25 %	347533727
555	NC_015979	TAA	2	6	25766	25771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533727
556	NC_015979	A	6	6	25777	25782	100 %	0 %	0 %	0 %	347533727
557	NC_015979	TGT	2	6	25909	25914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533727
558	NC_015979	GAA	2	6	25923	25928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533727
559	NC_015979	AGC	2	6	26083	26088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533727
560	NC_015979	AATT	2	8	26164	26171	50 %	50 %	0 %	0 %	347533727
561	NC_015979	AGC	2	6	26210	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533727
562	NC_015979	TGG	2	6	26255	26260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533727
563	NC_015979	GAA	2	6	26263	26268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533727
564	NC_015979	AAAC	2	8	26328	26335	75 %	0 %	0 %	25 %	347533727
565	NC_015979	CAT	2	6	26412	26417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533727
566	NC_015979	GATG	2	8	26519	26526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015979	CTTA	2	8	26539	26546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_015979	CTTT	2	8	26598	26605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_015979	AT	5	10	26622	26631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015979	AGG	2	6	26639	26644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015979	GTT	2	6	26705	26710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533728
572	NC_015979	A	7	7	26797	26803	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
573	NC_015979	TCAA	2	8	26805	26812	50 %	25 %	0 %	25 %	347533728
574	NC_015979	ATT	2	6	26823	26828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533728
575	NC_015979	AAC	2	6	26922	26927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533728
576	NC_015979	TTG	2	6	27057	27062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533728
577	NC_015979	ATT	2	6	27126	27131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533728
578	NC_015979	T	7	7	27136	27142	0 %	100 %	0 %	0 %	347533728
579	NC_015979	A	6	6	27185	27190	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
580	NC_015979	ACT	2	6	27224	27229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533728
581	NC_015979	A	6	6	27236	27241	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
582	NC_015979	A	6	6	27549	27554	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
583	NC_015979	AGAAA	2	10	27710	27719	80 %	0 %	20 %	0 %	347533728
584	NC_015979	GAC	2	6	27776	27781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533728
585	NC_015979	AT	3	6	27820	27825	50 %	50 %	0 %	0 %	347533728
586	NC_015979	TAAC	2	8	27855	27862	50 %	25 %	0 %	25 %	347533728
587	NC_015979	ACC	2	6	27901	27906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_015979	T	6	6	28066	28071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015979	AGTC	2	8	28174	28181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_015979	TTC	2	6	28287	28292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015979	CA	3	6	28327	28332	50 %	0 %	0 %	50 %	347533729
592	NC_015979	T	7	7	28412	28418	0 %	100 %	0 %	0 %	347533729
593	NC_015979	A	6	6	28426	28431	100 %	0 %	0 %	0 %	347533729
594	NC_015979	CTA	2	6	28530	28535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533729
595	NC_015979	GAA	2	6	28609	28614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533729
596	NC_015979	TCA	2	6	28806	28811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015979	AG	3	6	28928	28933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015979	TC	3	6	28952	28957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_015979	AGGA	2	8	28961	28968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015979	CAAA	2	8	29003	29010	75 %	0 %	0 %	25 %	347533730
601	NC_015979	CAT	2	6	29012	29017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533730
602	NC_015979	TA	3	6	29023	29028	50 %	50 %	0 %	0 %	347533730
603	NC_015979	GCC	2	6	29043	29048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533730
604	NC_015979	GCCAA	2	10	29104	29113	40 %	0 %	20 %	40 %	347533730
605	NC_015979	GGCT	2	8	29161	29168	0 %	25 %	50 %	25 %	347533730
606	NC_015979	GAG	2	6	29178	29183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533730
607	NC_015979	A	7	7	29195	29201	100 %	0 %	0 %	0 %	347533730
608	NC_015979	CAC	2	6	29264	29269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533731
609	NC_015979	TAT	2	6	29315	29320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533731
610	NC_015979	GCCGG	2	10	29349	29358	0 %	0 %	60 %	40 %	347533731
611	NC_015979	AAC	2	6	29373	29378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533731
612	NC_015979	AGC	2	6	29406	29411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533731
613	NC_015979	CCA	2	6	29431	29436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533731
614	NC_015979	TGAAT	2	10	29437	29446	40 %	40 %	20 %	0 %	347533731
615	NC_015979	CAT	2	6	29683	29688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533731
616	NC_015979	ACG	2	6	29701	29706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533731
617	NC_015979	ATTC	2	8	29718	29725	25 %	50 %	0 %	25 %	347533731
618	NC_015979	A	6	6	29728	29733	100 %	0 %	0 %	0 %	347533731
619	NC_015979	CA	3	6	29810	29815	50 %	0 %	0 %	50 %	347533731
620	NC_015979	GAT	2	6	29840	29845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533731
621	NC_015979	CAAC	2	8	29848	29855	50 %	0 %	0 %	50 %	347533731
622	NC_015979	GCT	2	6	29996	30001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533731
623	NC_015979	GCC	2	6	30110	30115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533731
624	NC_015979	TTA	2	6	30146	30151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015979	ATTT	2	8	30165	30172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015979	GAT	3	9	30275	30283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015979	GCC	2	6	30354	30359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015979	GCA	2	6	30392	30397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015979	CAC	2	6	30442	30447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_015979	AC	3	6	30449	30454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_015979	GCT	2	6	30468	30473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015979	GAC	2	6	30477	30482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_015979	AATTG	2	10	30515	30524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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