MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 29445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015978	AAG	2	6	22037	22042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015978	TAG	3	9	22115	22123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533772
503	NC_015978	TGA	2	6	22218	22223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533772
504	NC_015978	AAG	2	6	22274	22279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533772
505	NC_015978	GAA	2	6	22357	22362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533772
506	NC_015978	CGC	2	6	22365	22370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533772
507	NC_015978	ACATT	2	10	22406	22415	40 %	40 %	0 %	20 %	347533772
508	NC_015978	TGG	2	6	22422	22427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533772
509	NC_015978	TAA	2	6	22554	22559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533772
510	NC_015978	ATAA	2	8	22574	22581	75 %	25 %	0 %	0 %	347533772
511	NC_015978	ATT	2	6	22670	22675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533773
512	NC_015978	TTG	2	6	22680	22685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533773
513	NC_015978	ATG	2	6	22713	22718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533773
514	NC_015978	CAA	2	6	22730	22735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533773
515	NC_015978	ATC	2	6	22917	22922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533773
516	NC_015978	ACA	2	6	22927	22932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533773
517	NC_015978	ACA	2	6	23003	23008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533773
518	NC_015978	TAA	2	6	23046	23051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533773
519	NC_015978	TTA	2	6	23102	23107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533773
520	NC_015978	TGG	2	6	23112	23117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533773
521	NC_015978	CA	3	6	23135	23140	50 %	0 %	0 %	50 %	347533773
522	NC_015978	ATT	2	6	23177	23182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533773
523	NC_015978	ATG	2	6	23330	23335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533773
524	NC_015978	GCA	2	6	23347	23352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533773
525	NC_015978	T	6	6	23366	23371	0 %	100 %	0 %	0 %	347533773
526	NC_015978	GGA	2	6	23452	23457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533773
527	NC_015978	ATG	2	6	23570	23575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533773
528	NC_015978	TTATTC	2	12	23608	23619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347533773
529	NC_015978	TTA	2	6	23749	23754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533774
530	NC_015978	TGG	2	6	23787	23792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533774
531	NC_015978	T	6	6	23811	23816	0 %	100 %	0 %	0 %	347533774
532	NC_015978	TATT	2	8	23843	23850	25 %	75 %	0 %	0 %	347533774
533	NC_015978	CAA	2	6	23944	23949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533774
534	NC_015978	TCA	2	6	23972	23977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533774
535	NC_015978	ATT	2	6	24013	24018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533774
536	NC_015978	ATTGCC	2	12	24169	24180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347533774
537	NC_015978	CGA	2	6	24212	24217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533774
538	NC_015978	TTA	2	6	24247	24252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533774
539	NC_015978	GTT	2	6	24288	24293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533774
540	NC_015978	TTC	2	6	24411	24416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533774
541	NC_015978	AGT	2	6	24423	24428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533774
542	NC_015978	A	7	7	24469	24475	100 %	0 %	0 %	0 %	347533774
543	NC_015978	T	6	6	24517	24522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015978	ATA	2	6	24567	24572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015978	AGG	2	6	24589	24594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015978	GCA	2	6	24626	24631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015978	TGG	2	6	24688	24693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015978	AATT	2	8	24697	24704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015978	GAA	2	6	24725	24730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015978	A	7	7	24729	24735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015978	GCC	2	6	24785	24790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_015978	AGA	2	6	24883	24888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015978	ATT	2	6	24945	24950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015978	T	6	6	24975	24980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015978	AGT	2	6	25003	25008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015978	A	6	6	25158	25163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015978	ATGG	2	8	25319	25326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015978	AGC	2	6	25396	25401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015978	GGA	2	6	25442	25447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015978	GTC	2	6	25527	25532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015978	CAA	2	6	25566	25571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015978	TTG	2	6	25575	25580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015978	TGC	2	6	25591	25596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015978	AGC	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015978	CTA	2	6	25815	25820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015978	TTTG	2	8	25840	25847	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015978	AAG	2	6	26040	26045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015978	ATT	2	6	26139	26144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015978	CTTG	2	8	26203	26210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_015978	ATC	2	6	26226	26231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015978	AGA	2	6	26281	26286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015978	CAA	2	6	26309	26314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015978	ATT	2	6	26341	26346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015978	ACT	2	6	26385	26390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015978	ATG	2	6	26400	26405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015978	A	7	7	26415	26421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015978	A	7	7	26440	26446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015978	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015978	T	6	6	26481	26486	0 %	100 %	0 %	0 %	347533775
580	NC_015978	TAG	2	6	26503	26508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533775
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582	NC_015978	TAA	2	6	26552	26557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533775
583	NC_015978	TAG	2	6	26578	26583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533775
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585	NC_015978	ACC	2	6	26685	26690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533775
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587	NC_015978	AAT	2	6	26761	26766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533775
588	NC_015978	ACC	2	6	26817	26822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533775
589	NC_015978	TAC	2	6	26872	26877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533775
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593	NC_015978	T	6	6	27162	27167	0 %	100 %	0 %	0 %	347533775
594	NC_015978	TAAA	2	8	27177	27184	75 %	25 %	0 %	0 %	347533775
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597	NC_015978	TAA	2	6	27251	27256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533775
598	NC_015978	GATT	2	8	27269	27276	25 %	50 %	25 %	0 %	347533775
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600	NC_015978	AGA	2	6	27323	27328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533775
601	NC_015978	T	6	6	27355	27360	0 %	100 %	0 %	0 %	347533775
602	NC_015978	ATAG	2	8	27386	27393	50 %	25 %	25 %	0 %	347533775
603	NC_015978	TAA	2	6	27461	27466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533775
604	NC_015978	TTTG	2	8	27526	27533	0 %	75 %	25 %	0 %	347533775
605	NC_015978	AAACGA	2	12	27595	27606	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347533775
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608	NC_015978	CTC	2	6	27747	27752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533775
609	NC_015978	TGAA	2	8	27802	27809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015978	TAT	2	6	27860	27865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015978	A	6	6	27910	27915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015978	ATT	2	6	27941	27946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015978	TGA	2	6	27951	27956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015978	ATT	3	9	27961	27969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015978	AAT	2	6	28022	28027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015978	TAA	2	6	28043	28048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015978	AGAA	2	8	28068	28075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015978	A	6	6	28083	28088	100 %	0 %	0 %	0 %	347533776
619	NC_015978	TTA	2	6	28091	28096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533776
620	NC_015978	TTG	2	6	28113	28118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533776
621	NC_015978	TTA	2	6	28136	28141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533776
622	NC_015978	AGT	2	6	28390	28395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533776
623	NC_015978	TTC	2	6	28400	28405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533776
624	NC_015978	ATT	2	6	28430	28435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533776
625	NC_015978	ATT	2	6	28508	28513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533776
626	NC_015978	ATTA	2	8	28516	28523	50 %	50 %	0 %	0 %	347533776
627	NC_015978	TGT	2	6	28658	28663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533776
628	NC_015978	TAT	2	6	28686	28691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533776
629	NC_015978	GATT	2	8	28708	28715	25 %	50 %	25 %	0 %	347533776
630	NC_015978	TGG	2	6	28753	28758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533776
631	NC_015978	AATTGC	2	12	28813	28824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347533776
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