MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 43672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_015975	CTT	2	6	1654231	1654236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526032
35002	NC_015975	GAC	2	6	1654250	1654255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526032
35003	NC_015975	CGTCC	2	10	1654262	1654271	0 %	20 %	20 %	60 %	347526032
35004	NC_015975	TCGT	2	8	1654295	1654302	0 %	50 %	25 %	25 %	347526032
35005	NC_015975	CGC	2	6	1654342	1654347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526032
35006	NC_015975	CACT	2	8	1654375	1654382	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35007	NC_015975	GAT	2	6	1654484	1654489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526033
35008	NC_015975	GTACCG	2	12	1654551	1654562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526033
35009	NC_015975	GTT	2	6	1654598	1654603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526033
35010	NC_015975	GTT	2	6	1654616	1654621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526033
35011	NC_015975	GTT	2	6	1654649	1654654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526033
35012	NC_015975	ATCG	2	8	1654727	1654734	25 %	25 %	25 %	25 %	347526033
35013	NC_015975	TTG	2	6	1654839	1654844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526033
35014	NC_015975	AAC	2	6	1654911	1654916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526033
35015	NC_015975	GTA	2	6	1654952	1654957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526033
35016	NC_015975	ACG	2	6	1654995	1655000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526033
35017	NC_015975	CGT	2	6	1655156	1655161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526033
35018	NC_015975	GTT	2	6	1655231	1655236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526033
35019	NC_015975	TCC	2	6	1655314	1655319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35020	NC_015975	GCA	2	6	1655358	1655363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35021	NC_015975	GCT	2	6	1655380	1655385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526034
35022	NC_015975	TAA	2	6	1655449	1655454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526034
35023	NC_015975	GTTCT	2	10	1655457	1655466	0 %	60 %	20 %	20 %	347526034
35024	NC_015975	T	7	7	1655673	1655679	0 %	100 %	0 %	0 %	347526034
35025	NC_015975	TGATTT	2	12	1655697	1655708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347526034
35026	NC_015975	CAT	2	6	1655732	1655737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526034
35027	NC_015975	ATA	2	6	1655771	1655776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526035
35028	NC_015975	TTC	2	6	1655850	1655855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526035
35029	NC_015975	TCA	2	6	1655856	1655861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526035
35030	NC_015975	CTGTTG	2	12	1655897	1655908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347526035
35031	NC_015975	ATC	2	6	1655913	1655918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526035
35032	NC_015975	CGT	2	6	1655924	1655929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526035
35033	NC_015975	AGTC	2	8	1655992	1655999	25 %	25 %	25 %	25 %	347526035
35034	NC_015975	TGACGA	2	12	1656011	1656022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347526035
35035	NC_015975	AAT	2	6	1656059	1656064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526035
35036	NC_015975	AAG	2	6	1656069	1656074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526035
35037	NC_015975	TCG	2	6	1656088	1656093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526035
35038	NC_015975	GTT	3	9	1656095	1656103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526035
35039	NC_015975	T	6	6	1656111	1656116	0 %	100 %	0 %	0 %	347526035
35040	NC_015975	ACT	2	6	1656198	1656203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526035
35041	NC_015975	TCG	2	6	1656249	1656254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35042	NC_015975	T	6	6	1656265	1656270	0 %	100 %	0 %	0 %	347526036
35043	NC_015975	TTGA	2	8	1656349	1656356	25 %	50 %	25 %	0 %	347526036
35044	NC_015975	CAG	2	6	1656385	1656390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35045	NC_015975	GCG	2	6	1656414	1656419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526036
35046	NC_015975	GCA	2	6	1656537	1656542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35047	NC_015975	CCG	2	6	1656665	1656670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526036
35048	NC_015975	CGAC	2	8	1656678	1656685	25 %	0 %	25 %	50 %	347526036
35049	NC_015975	GCT	2	6	1656725	1656730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35050	NC_015975	CTG	2	6	1656777	1656782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35051	NC_015975	TTG	2	6	1656809	1656814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526036
35052	NC_015975	GCTT	2	8	1656850	1656857	0 %	50 %	25 %	25 %	347526036
35053	NC_015975	TCG	2	6	1656927	1656932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35054	NC_015975	CTG	2	6	1656958	1656963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35055	NC_015975	TTTG	2	8	1657028	1657035	0 %	75 %	25 %	0 %	347526036
35056	NC_015975	GCTT	2	8	1657076	1657083	0 %	50 %	25 %	25 %	347526036
35057	NC_015975	T	7	7	1657082	1657088	0 %	100 %	0 %	0 %	347526036
35058	NC_015975	GGTT	2	8	1657220	1657227	0 %	50 %	50 %	0 %	347526036
35059	NC_015975	CTT	2	6	1657272	1657277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526036
35060	NC_015975	TCA	2	6	1657340	1657345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526036
35061	NC_015975	CTG	2	6	1657348	1657353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526036
35062	NC_015975	T	6	6	1657369	1657374	0 %	100 %	0 %	0 %	347526036
35063	NC_015975	CTTG	2	8	1657386	1657393	0 %	50 %	25 %	25 %	347526036
35064	NC_015975	T	6	6	1657408	1657413	0 %	100 %	0 %	0 %	347526036
35065	NC_015975	TTGA	2	8	1657453	1657460	25 %	50 %	25 %	0 %	347526036
35066	NC_015975	TTG	2	6	1657487	1657492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526036
35067	NC_015975	GCTT	2	8	1657519	1657526	0 %	50 %	25 %	25 %	347526036
35068	NC_015975	T	6	6	1657533	1657538	0 %	100 %	0 %	0 %	347526036
35069	NC_015975	T	6	6	1657599	1657604	0 %	100 %	0 %	0 %	347526036
35070	NC_015975	TCA	2	6	1657663	1657668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526037
35071	NC_015975	GTT	2	6	1657670	1657675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526037
35072	NC_015975	TTC	2	6	1657680	1657685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526037
35073	NC_015975	TCT	2	6	1657708	1657713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526037
35074	NC_015975	TC	3	6	1657804	1657809	0 %	50 %	0 %	50 %	347526037
35075	NC_015975	GCC	2	6	1657822	1657827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526037
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35078	NC_015975	CAT	2	6	1657902	1657907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526037
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35083	NC_015975	TTC	2	6	1658142	1658147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526038
35084	NC_015975	TTC	2	6	1658160	1658165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526038
35085	NC_015975	GCT	2	6	1658171	1658176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526038
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35087	NC_015975	AATC	2	8	1658216	1658223	50 %	25 %	0 %	25 %	347526038
35088	NC_015975	TTC	2	6	1658325	1658330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526038
35089	NC_015975	TCA	2	6	1658345	1658350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526038
35090	NC_015975	GAC	2	6	1658351	1658356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526038
35091	NC_015975	GACT	2	8	1658360	1658367	25 %	25 %	25 %	25 %	347526038
35092	NC_015975	GTCC	2	8	1658426	1658433	0 %	25 %	25 %	50 %	347526038
35093	NC_015975	GTC	2	6	1658472	1658477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526038
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35096	NC_015975	T	6	6	1658670	1658675	0 %	100 %	0 %	0 %	347526038
35097	NC_015975	GC	3	6	1658717	1658722	0 %	0 %	50 %	50 %	347526038
35098	NC_015975	GCG	3	9	1658738	1658746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526038
35099	NC_015975	CTT	2	6	1658786	1658791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526038
35100	NC_015975	CGATCA	2	12	1658849	1658860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347526038
35101	NC_015975	ATC	2	6	1658884	1658889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526038
35102	NC_015975	TCT	2	6	1659012	1659017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526038
35103	NC_015975	GAC	2	6	1659168	1659173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526038
35104	NC_015975	CGA	2	6	1659299	1659304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526038
35105	NC_015975	CGA	2	6	1659338	1659343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526038
35106	NC_015975	ATCA	2	8	1659423	1659430	50 %	25 %	0 %	25 %	347526038
35107	NC_015975	TCT	2	6	1659473	1659478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526039
35108	NC_015975	CTT	2	6	1659576	1659581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526039
35109	NC_015975	ATCA	2	8	1659601	1659608	50 %	25 %	0 %	25 %	347526039
35110	NC_015975	GCT	2	6	1659612	1659617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526039
35111	NC_015975	TCA	2	6	1659650	1659655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526039
35112	NC_015975	TCG	2	6	1659699	1659704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526039
35113	NC_015975	GCT	2	6	1659720	1659725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526039
35114	NC_015975	TCT	3	9	1659770	1659778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526039
35115	NC_015975	T	6	6	1659828	1659833	0 %	100 %	0 %	0 %	347526039
35116	NC_015975	CGT	2	6	1659903	1659908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526039
35117	NC_015975	T	8	8	1659916	1659923	0 %	100 %	0 %	0 %	347526039
35118	NC_015975	TCT	2	6	1659929	1659934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526039
35119	NC_015975	GAT	2	6	1659967	1659972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526039
35120	NC_015975	TCCG	2	8	1660034	1660041	0 %	25 %	25 %	50 %	347526039
35121	NC_015975	TTC	2	6	1660057	1660062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526039
35122	NC_015975	T	6	6	1660087	1660092	0 %	100 %	0 %	0 %	347526039
35123	NC_015975	CAA	2	6	1660095	1660100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526039
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35130	NC_015975	TCT	2	6	1660362	1660367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526040
35131	NC_015975	CGT	2	6	1660396	1660401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526040
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35133	NC_015975	TCG	2	6	1660518	1660523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526040
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35135	NC_015975	TGC	2	6	1660540	1660545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526040
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35139	NC_015975	TGA	2	6	1660673	1660678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526040
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35151	NC_015975	CCTT	2	8	1661212	1661219	0 %	50 %	0 %	50 %	347526041
35152	NC_015975	GTTTCT	2	12	1661314	1661325	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347526041
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35154	NC_015975	CCT	3	9	1661387	1661395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526041
35155	NC_015975	CTT	2	6	1661396	1661401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526041
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35163	NC_015975	CAAT	2	8	1661537	1661544	50 %	25 %	0 %	25 %	347526041
35164	NC_015975	TCT	2	6	1661555	1661560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526041
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35167	NC_015975	GCT	2	6	1661642	1661647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526041
35168	NC_015975	TGA	2	6	1661717	1661722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526041
35169	NC_015975	GATC	2	8	1661745	1661752	25 %	25 %	25 %	25 %	347526041
35170	NC_015975	TGA	2	6	1661762	1661767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526041
35171	NC_015975	TCG	2	6	1661771	1661776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526041
35172	NC_015975	GTT	2	6	1661793	1661798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526041
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35174	NC_015975	CATTGT	2	12	1661819	1661830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347526041
35175	NC_015975	TCTGA	2	10	1661928	1661937	20 %	40 %	20 %	20 %	347526041
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35177	NC_015975	TCT	2	6	1662047	1662052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526041
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35180	NC_015975	TCT	2	6	1662127	1662132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526041
35181	NC_015975	CGA	2	6	1662164	1662169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526041
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35184	NC_015975	AGC	2	6	1662369	1662374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526041
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35187	NC_015975	TTG	2	6	1662493	1662498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526041
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35190	NC_015975	CG	3	6	1662662	1662667	0 %	0 %	50 %	50 %	347526041
35191	NC_015975	GTA	2	6	1662675	1662680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526041
35192	NC_015975	TGA	2	6	1662707	1662712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526041
35193	NC_015975	GGC	2	6	1662740	1662745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526041
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35196	NC_015975	TTG	2	6	1662868	1662873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526042
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35201	NC_015975	GTTC	2	8	1663395	1663402	0 %	50 %	25 %	25 %	347526043
35202	NC_015975	T	8	8	1663438	1663445	0 %	100 %	0 %	0 %	347526043
35203	NC_015975	TGTT	2	8	1663493	1663500	0 %	75 %	25 %	0 %	347526043
35204	NC_015975	ATTA	2	8	1663593	1663600	50 %	50 %	0 %	0 %	347526044
35205	NC_015975	TCA	2	6	1663607	1663612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526044
35206	NC_015975	TCAACG	2	12	1663690	1663701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347526044
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35208	NC_015975	TCAGAT	2	12	1663793	1663804	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347526044
35209	NC_015975	ACG	2	6	1663837	1663842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526044
35210	NC_015975	TGTA	2	8	1663940	1663947	25 %	50 %	25 %	0 %	347526044
35211	NC_015975	CTC	2	6	1663963	1663968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35212	NC_015975	A	6	6	1663981	1663986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35213	NC_015975	AACT	2	8	1664033	1664040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35214	NC_015975	ATTC	2	8	1664096	1664103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35215	NC_015975	AAT	2	6	1664129	1664134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35216	NC_015975	ATT	2	6	1664145	1664150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35217	NC_015975	T	8	8	1664149	1664156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35218	NC_015975	AAT	2	6	1664192	1664197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35219	NC_015975	A	8	8	1664201	1664208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35220	NC_015975	CA	3	6	1664211	1664216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35221	NC_015975	TAT	2	6	1664219	1664224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35222	NC_015975	GCA	2	6	1664238	1664243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35223	NC_015975	TTC	2	6	1664299	1664304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35224	NC_015975	TTTC	2	8	1664335	1664342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35225	NC_015975	CAA	2	6	1664382	1664387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526045
35226	NC_015975	A	7	7	1664418	1664424	100 %	0 %	0 %	0 %	347526045
35227	NC_015975	A	6	6	1664448	1664453	100 %	0 %	0 %	0 %	347526045
35228	NC_015975	A	6	6	1664469	1664474	100 %	0 %	0 %	0 %	347526045
35229	NC_015975	TGG	2	6	1664506	1664511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526045
35230	NC_015975	A	6	6	1664618	1664623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35231	NC_015975	AGC	2	6	1664698	1664703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35233	NC_015975	TTCG	2	8	1664750	1664757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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35351	NC_015975	GC	3	6	1671645	1671650	0 %	0 %	50 %	50 %	347526051
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