MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 43672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_015975	TGC	2	6	1020722	1020727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525436
21502	NC_015975	T	6	6	1020728	1020733	0 %	100 %	0 %	0 %	347525436
21503	NC_015975	ATCGT	2	10	1020769	1020778	20 %	40 %	20 %	20 %	347525436
21504	NC_015975	TCCG	2	8	1020855	1020862	0 %	25 %	25 %	50 %	347525436
21505	NC_015975	CTT	2	6	1020867	1020872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525436
21506	NC_015975	TAA	2	6	1020889	1020894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347525436
21507	NC_015975	TAA	2	6	1020898	1020903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347525436
21508	NC_015975	TGTT	2	8	1020967	1020974	0 %	75 %	25 %	0 %	347525436
21509	NC_015975	ATA	2	6	1020981	1020986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347525436
21510	NC_015975	AG	3	6	1021009	1021014	50 %	0 %	50 %	0 %	347525436
21511	NC_015975	T	6	6	1021053	1021058	0 %	100 %	0 %	0 %	347525436
21512	NC_015975	TGCT	2	8	1021082	1021089	0 %	50 %	25 %	25 %	347525436
21513	NC_015975	T	7	7	1021089	1021095	0 %	100 %	0 %	0 %	347525436
21514	NC_015975	T	6	6	1021103	1021108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21515	NC_015975	CAT	2	6	1021153	1021158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525437
21516	NC_015975	AGT	2	6	1021201	1021206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525437
21517	NC_015975	TCA	2	6	1021215	1021220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525437
21518	NC_015975	CAT	2	6	1021349	1021354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525437
21519	NC_015975	TCG	2	6	1021397	1021402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525438
21520	NC_015975	TCAAG	2	10	1021461	1021470	40 %	20 %	20 %	20 %	347525438
21521	NC_015975	GTT	2	6	1021522	1021527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525438
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21523	NC_015975	ATA	2	6	1021747	1021752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347525438
21524	NC_015975	ATTG	2	8	1021753	1021760	25 %	50 %	25 %	0 %	347525438
21525	NC_015975	T	6	6	1021827	1021832	0 %	100 %	0 %	0 %	347525438
21526	NC_015975	TTCTG	2	10	1021839	1021848	0 %	60 %	20 %	20 %	347525438
21527	NC_015975	A	6	6	1021888	1021893	100 %	0 %	0 %	0 %	347525438
21528	NC_015975	TCAT	2	8	1021989	1021996	25 %	50 %	0 %	25 %	347525438
21529	NC_015975	AT	3	6	1022056	1022061	50 %	50 %	0 %	0 %	347525439
21530	NC_015975	T	6	6	1022070	1022075	0 %	100 %	0 %	0 %	347525439
21531	NC_015975	CAGA	2	8	1022099	1022106	50 %	0 %	25 %	25 %	347525439
21532	NC_015975	TTTGA	2	10	1022150	1022159	20 %	60 %	20 %	0 %	347525439
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21534	NC_015975	TCT	2	6	1022198	1022203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525439
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21536	NC_015975	CGA	2	6	1022249	1022254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525439
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21539	NC_015975	TGT	2	6	1022393	1022398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525439
21540	NC_015975	CAT	2	6	1022435	1022440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525439
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21542	NC_015975	GCA	2	6	1022482	1022487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525439
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21550	NC_015975	TAA	2	6	1022935	1022940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21551	NC_015975	TGT	2	6	1023016	1023021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21552	NC_015975	TTC	2	6	1023026	1023031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21553	NC_015975	ATT	2	6	1023095	1023100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525440
21554	NC_015975	TCG	2	6	1023102	1023107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525440
21555	NC_015975	GCTTT	2	10	1023121	1023130	0 %	60 %	20 %	20 %	347525440
21556	NC_015975	GGCATC	2	12	1023143	1023154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347525440
21557	NC_015975	GAC	2	6	1023196	1023201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525440
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21559	NC_015975	CATG	2	8	1023225	1023232	25 %	25 %	25 %	25 %	347525440
21560	NC_015975	TA	3	6	1023236	1023241	50 %	50 %	0 %	0 %	347525440
21561	NC_015975	ATT	2	6	1023251	1023256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525440
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21565	NC_015975	TTCG	2	8	1023388	1023395	0 %	50 %	25 %	25 %	347525440
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21570	NC_015975	T	6	6	1023749	1023754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21571	NC_015975	TTTC	2	8	1023764	1023771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21572	NC_015975	CGTC	2	8	1023807	1023814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21573	NC_015975	TTC	2	6	1023823	1023828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21574	NC_015975	TAAA	2	8	1023939	1023946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21575	NC_015975	AACG	2	8	1023961	1023968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21576	NC_015975	ACG	2	6	1024027	1024032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21577	NC_015975	GAA	2	6	1024103	1024108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21578	NC_015975	T	7	7	1024130	1024136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21579	NC_015975	ATC	2	6	1024144	1024149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21580	NC_015975	TGTC	2	8	1024161	1024168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21581	NC_015975	ATG	2	6	1024227	1024232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21582	NC_015975	AT	4	8	1024250	1024257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21583	NC_015975	TGCCGG	2	12	1024304	1024315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347525441
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21587	NC_015975	GTT	2	6	1024417	1024422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525441
21588	NC_015975	AATA	2	8	1024447	1024454	75 %	25 %	0 %	0 %	347525441
21589	NC_015975	CG	3	6	1024504	1024509	0 %	0 %	50 %	50 %	347525441
21590	NC_015975	CAG	2	6	1024523	1024528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525441
21591	NC_015975	A	7	7	1024560	1024566	100 %	0 %	0 %	0 %	347525441
21592	NC_015975	CGT	2	6	1024606	1024611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525441
21593	NC_015975	AATG	2	8	1024629	1024636	50 %	25 %	25 %	0 %	347525441
21594	NC_015975	AGG	2	6	1024640	1024645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347525441
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21596	NC_015975	TGATC	2	10	1024738	1024747	20 %	40 %	20 %	20 %	347525441
21597	NC_015975	T	6	6	1024817	1024822	0 %	100 %	0 %	0 %	347525441
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21599	NC_015975	A	6	6	1024855	1024860	100 %	0 %	0 %	0 %	347525441
21600	NC_015975	T	6	6	1024964	1024969	0 %	100 %	0 %	0 %	347525441
21601	NC_015975	AAG	2	6	1025006	1025011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525441
21602	NC_015975	GTC	2	6	1025085	1025090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525441
21603	NC_015975	ATC	2	6	1025165	1025170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525441
21604	NC_015975	T	6	6	1025171	1025176	0 %	100 %	0 %	0 %	347525441
21605	NC_015975	TTC	2	6	1025219	1025224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525441
21606	NC_015975	CAT	2	6	1025234	1025239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525441
21607	NC_015975	TCC	2	6	1025242	1025247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21608	NC_015975	CTT	2	6	1025286	1025291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525442
21609	NC_015975	GTT	2	6	1025362	1025367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525442
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21611	NC_015975	TCA	2	6	1025396	1025401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525442
21612	NC_015975	GTC	2	6	1025404	1025409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525442
21613	NC_015975	T	6	6	1025463	1025468	0 %	100 %	0 %	0 %	347525442
21614	NC_015975	GAA	2	6	1025495	1025500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525442
21615	NC_015975	GCT	2	6	1025506	1025511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525442
21616	NC_015975	T	7	7	1025511	1025517	0 %	100 %	0 %	0 %	347525442
21617	NC_015975	CTTT	2	8	1025528	1025535	0 %	75 %	0 %	25 %	347525442
21618	NC_015975	T	6	6	1025533	1025538	0 %	100 %	0 %	0 %	347525442
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21769	NC_015975	T	6	6	1032443	1032448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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