MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 43672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015975	ACA	2	6	607477	607482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_015975	A	6	6	607522	607527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_015975	A	6	6	607575	607580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_015975	A	6	6	607599	607604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_015975	TCA	2	6	607684	607689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_015975	GAA	2	6	607732	607737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525046
13007	NC_015975	CCG	2	6	607850	607855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525046
13008	NC_015975	AGCA	2	8	607861	607868	50 %	0 %	25 %	25 %	347525046
13009	NC_015975	ACG	2	6	607883	607888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525046
13010	NC_015975	GAA	2	6	607912	607917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525046
13011	NC_015975	GAC	2	6	607932	607937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525046
13012	NC_015975	CACG	2	8	607971	607978	25 %	0 %	25 %	50 %	347525046
13013	NC_015975	GAC	2	6	608122	608127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525046
13014	NC_015975	CTG	2	6	608152	608157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525046
13015	NC_015975	CGC	2	6	608190	608195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525046
13016	NC_015975	GTC	4	12	608227	608238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525046
13017	NC_015975	GCC	2	6	608272	608277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525046
13018	NC_015975	ATC	3	9	608299	608307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525046
13019	NC_015975	AGA	2	6	608330	608335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525046
13020	NC_015975	GGC	2	6	608413	608418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525046
13021	NC_015975	GC	3	6	608450	608455	0 %	0 %	50 %	50 %	347525046
13022	NC_015975	CGAC	2	8	608462	608469	25 %	0 %	25 %	50 %	347525046
13023	NC_015975	CGT	2	6	608481	608486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525046
13024	NC_015975	CGG	2	6	608493	608498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525046
13025	NC_015975	CGG	2	6	608577	608582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525046
13026	NC_015975	GAC	2	6	608595	608600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525046
13027	NC_015975	ATCA	2	8	608689	608696	50 %	25 %	0 %	25 %	347525046
13028	NC_015975	TCA	2	6	608741	608746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525046
13029	NC_015975	T	7	7	608784	608790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_015975	TG	3	6	608794	608799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_015975	TAAGC	2	10	608821	608830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13032	NC_015975	TCTG	2	8	608832	608839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13033	NC_015975	CGG	2	6	608844	608849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_015975	TGG	2	6	608892	608897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_015975	CCA	2	6	608914	608919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_015975	A	7	7	608938	608944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_015975	CA	3	6	608981	608986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13038	NC_015975	AGGA	2	8	609098	609105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_015975	TCA	2	6	609184	609189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525047
13040	NC_015975	TGG	2	6	609234	609239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347525047
13041	NC_015975	TGA	2	6	609406	609411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525047
13042	NC_015975	AGG	2	6	609429	609434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347525047
13043	NC_015975	CTT	2	6	609497	609502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525047
13044	NC_015975	GCC	2	6	609560	609565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525047
13045	NC_015975	ACG	2	6	609581	609586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525047
13046	NC_015975	TCC	2	6	609644	609649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347525047
13047	NC_015975	CGGAC	2	10	609661	609670	20 %	0 %	40 %	40 %	347525047
13048	NC_015975	AGA	2	6	609691	609696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525047
13049	NC_015975	CAT	2	6	609754	609759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525047
13050	NC_015975	CCG	2	6	609798	609803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525047
13051	NC_015975	GC	3	6	609811	609816	0 %	0 %	50 %	50 %	347525047
13052	NC_015975	GAA	3	9	609911	609919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525047
13053	NC_015975	CTG	2	6	609984	609989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525047
13054	NC_015975	GC	3	6	610015	610020	0 %	0 %	50 %	50 %	347525047
13055	NC_015975	GAAC	2	8	610093	610100	50 %	0 %	25 %	25 %	347525047
13056	NC_015975	TCT	2	6	610117	610122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525047
13057	NC_015975	GGA	2	6	610123	610128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347525047
13058	NC_015975	ATC	2	6	610187	610192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525047
13059	NC_015975	AGA	2	6	610271	610276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525047
13060	NC_015975	GGC	2	6	610279	610284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525047
13061	NC_015975	AGA	2	6	610303	610308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525047
13062	NC_015975	GAA	2	6	610327	610332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525047
13063	NC_015975	GAC	2	6	610398	610403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525048
13064	NC_015975	GCC	2	6	610440	610445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525048
13065	NC_015975	CGG	2	6	610544	610549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525048
13066	NC_015975	ACC	2	6	610572	610577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347525048
13067	NC_015975	CAGGG	2	10	610659	610668	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13068	NC_015975	T	6	6	610706	610711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_015975	TG	3	6	610720	610725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_015975	TTGTG	2	10	610746	610755	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_015975	AAT	2	6	610828	610833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347525049
13072	NC_015975	CTT	2	6	610848	610853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525049
13073	NC_015975	T	6	6	610861	610866	0 %	100 %	0 %	0 %	347525049
13074	NC_015975	TGA	2	6	610946	610951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525049
13075	NC_015975	T	6	6	610961	610966	0 %	100 %	0 %	0 %	347525049
13076	NC_015975	T	6	6	611034	611039	0 %	100 %	0 %	0 %	347525049
13077	NC_015975	ATGA	2	8	611044	611051	50 %	25 %	25 %	0 %	347525049
13078	NC_015975	A	6	6	611070	611075	100 %	0 %	0 %	0 %	347525049
13079	NC_015975	GAA	2	6	611076	611081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525049
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13081	NC_015975	A	7	7	611208	611214	100 %	0 %	0 %	0 %	347525049
13082	NC_015975	CAG	2	6	611304	611309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525049
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13088	NC_015975	TCG	2	6	611448	611453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525049
13089	NC_015975	CATT	2	8	611454	611461	25 %	50 %	0 %	25 %	347525049
13090	NC_015975	TGA	2	6	611517	611522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525049
13091	NC_015975	TGA	2	6	611553	611558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525049
13092	NC_015975	TAT	2	6	611569	611574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525049
13093	NC_015975	TGCGG	2	10	611592	611601	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13094	NC_015975	GGA	2	6	611621	611626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_015975	AT	3	6	611645	611650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_015975	GGT	2	6	611669	611674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_015975	TGC	2	6	611715	611720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525050
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13102	NC_015975	GAT	2	6	611855	611860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525050
13103	NC_015975	TGATT	2	10	611965	611974	20 %	60 %	20 %	0 %	347525050
13104	NC_015975	A	6	6	611996	612001	100 %	0 %	0 %	0 %	347525050
13105	NC_015975	CTG	2	6	612033	612038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525050
13106	NC_015975	CAG	2	6	612045	612050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525050
13107	NC_015975	GA	3	6	612076	612081	50 %	0 %	50 %	0 %	347525050
13108	NC_015975	GAT	2	6	612092	612097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525050
13109	NC_015975	ATG	2	6	612121	612126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525051
13110	NC_015975	GATAAA	2	12	612159	612170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347525051
13111	NC_015975	TGC	2	6	612191	612196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525051
13112	NC_015975	AATT	2	8	612199	612206	50 %	50 %	0 %	0 %	347525051
13113	NC_015975	ATG	2	6	612211	612216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525051
13114	NC_015975	TTA	2	6	612289	612294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525051
13115	NC_015975	ATTT	2	8	612478	612485	25 %	75 %	0 %	0 %	347525051
13116	NC_015975	CAT	2	6	612509	612514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525051
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13118	NC_015975	AGTT	2	8	612572	612579	25 %	50 %	25 %	0 %	347525051
13119	NC_015975	TGA	2	6	612623	612628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525051
13120	NC_015975	TGC	2	6	612638	612643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525051
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13122	NC_015975	GAA	2	6	612744	612749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525051
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13220	NC_015975	TAAT	2	8	617371	617378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13221	NC_015975	TA	3	6	617410	617415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13222	NC_015975	TAG	2	6	617426	617431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13223	NC_015975	A	7	7	617460	617466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13224	NC_015975	AATC	2	8	617470	617477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13225	NC_015975	TGC	2	6	617505	617510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13228	NC_015975	TGA	2	6	617665	617670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525054
13229	NC_015975	TCAG	2	8	617673	617680	25 %	25 %	25 %	25 %	347525054
13230	NC_015975	TCG	2	6	617710	617715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525054
13231	NC_015975	AGC	2	6	617724	617729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525054
13232	NC_015975	TCC	2	6	617783	617788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347525054
13233	NC_015975	GTTC	2	8	617794	617801	0 %	50 %	25 %	25 %	347525054
13234	NC_015975	AAG	2	6	617813	617818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525054
13235	NC_015975	AGA	2	6	617898	617903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525054
13236	NC_015975	CTT	2	6	617911	617916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
13237	NC_015975	T	6	6	617965	617970	0 %	100 %	0 %	0 %	347525054
13238	NC_015975	CAG	2	6	617993	617998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525054
13239	NC_015975	CTGAT	2	10	618046	618055	20 %	40 %	20 %	20 %	347525054
13240	NC_015975	TCAA	2	8	618075	618082	50 %	25 %	0 %	25 %	347525054
13241	NC_015975	GTC	2	6	618150	618155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525054
13242	NC_015975	TCT	2	6	618172	618177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
13243	NC_015975	TCT	2	6	618245	618250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
13244	NC_015975	AAG	2	6	618272	618277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525054
13245	NC_015975	CCG	2	6	618309	618314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525054
13246	NC_015975	TCT	2	6	618346	618351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
13247	NC_015975	CTT	2	6	618369	618374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
13248	NC_015975	GCT	2	6	618376	618381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525054
13249	NC_015975	ATC	2	6	618486	618491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525054
13250	NC_015975	TGA	3	9	618535	618543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525054
13251	NC_015975	ATC	2	6	618567	618572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525054
13252	NC_015975	CAG	3	9	618623	618631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525054
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13254	NC_015975	ACTG	2	8	618715	618722	25 %	25 %	25 %	25 %	347525054
13255	NC_015975	A	6	6	618871	618876	100 %	0 %	0 %	0 %	347525054
13256	NC_015975	C	7	7	618931	618937	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13257	NC_015975	GTA	2	6	618966	618971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13258	NC_015975	TGT	2	6	619033	619038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525055
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13267	NC_015975	CGGC	2	8	619395	619402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13268	NC_015975	T	7	7	619479	619485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13269	NC_015975	ATG	2	6	619547	619552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525056
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13282	NC_015975	CTG	2	6	620337	620342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525056
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13307	NC_015975	ATT	2	6	621516	621521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13332	NC_015975	T	7	7	622857	622863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13333	NC_015975	ATT	2	6	622872	622877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13334	NC_015975	ATA	2	6	622900	622905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13335	NC_015975	TGA	2	6	622977	622982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525059
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13344	NC_015975	TAATA	2	10	623568	623577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13354	NC_015975	A	6	6	623766	623771	100 %	0 %	0 %	0 %	347525060
13355	NC_015975	TCG	2	6	623791	623796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13356	NC_015975	TCAA	2	8	623828	623835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13357	NC_015975	CTTG	2	8	623846	623853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13358	NC_015975	ACG	2	6	623862	623867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13359	NC_015975	CG	3	6	623970	623975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13360	NC_015975	T	6	6	624023	624028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_015975	T	6	6	624097	624102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_015975	T	6	6	624171	624176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_015975	CG	3	6	624192	624197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13364	NC_015975	CTCTGT	2	12	624241	624252	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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