MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_015697	TTGG	2	8	2202006	2202013	0 %	50 %	50 %	0 %	338204538
48003	NC_015697	ATT	2	6	2202023	2202028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204538
48004	NC_015697	AAT	2	6	2202033	2202038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204538
48005	NC_015697	AT	3	6	2202090	2202095	50 %	50 %	0 %	0 %	338204538
48006	NC_015697	AGA	2	6	2202206	2202211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204538
48007	NC_015697	A	6	6	2202216	2202221	100 %	0 %	0 %	0 %	338204538
48008	NC_015697	TAAA	2	8	2202259	2202266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48009	NC_015697	GGT	2	6	2202268	2202273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48010	NC_015697	TCT	3	9	2202287	2202295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204539
48011	NC_015697	CAG	2	6	2202426	2202431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204539
48012	NC_015697	TTA	2	6	2202440	2202445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204539
48013	NC_015697	A	6	6	2202469	2202474	100 %	0 %	0 %	0 %	338204539
48014	NC_015697	TTA	2	6	2202516	2202521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204539
48015	NC_015697	TAT	2	6	2202563	2202568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204539
48016	NC_015697	CAG	2	6	2202591	2202596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204539
48017	NC_015697	CAA	2	6	2202597	2202602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204539
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48019	NC_015697	ATT	2	6	2202644	2202649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204539
48020	NC_015697	TCG	2	6	2202658	2202663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204539
48021	NC_015697	ATT	2	6	2202680	2202685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204539
48022	NC_015697	TGT	2	6	2202691	2202696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204539
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48024	NC_015697	TGC	2	6	2202826	2202831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204539
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48029	NC_015697	TAC	2	6	2202931	2202936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204539
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48032	NC_015697	TAGT	2	8	2203032	2203039	25 %	50 %	25 %	0 %	338204539
48033	NC_015697	TCT	2	6	2203086	2203091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204539
48034	NC_015697	ATT	2	6	2203127	2203132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204539
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48036	NC_015697	ATT	2	6	2203188	2203193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204539
48037	NC_015697	A	7	7	2203194	2203200	100 %	0 %	0 %	0 %	338204539
48038	NC_015697	ATA	2	6	2203205	2203210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48039	NC_015697	TAT	2	6	2203245	2203250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48040	NC_015697	TTA	2	6	2203270	2203275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204540
48041	NC_015697	TGAACT	2	12	2203342	2203353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338204540
48042	NC_015697	TGA	2	6	2203369	2203374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204540
48043	NC_015697	TTG	2	6	2203391	2203396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204540
48044	NC_015697	TTC	2	6	2203399	2203404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204540
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48052	NC_015697	GTGG	2	8	2203707	2203714	0 %	25 %	75 %	0 %	338204540
48053	NC_015697	GTC	2	6	2203811	2203816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204540
48054	NC_015697	GTCGA	2	10	2203843	2203852	20 %	20 %	40 %	20 %	338204540
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48104	NC_015697	TAT	2	6	2206190	2206195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48105	NC_015697	TGAT	2	8	2206214	2206221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48106	NC_015697	GAT	2	6	2206226	2206231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48107	NC_015697	AT	3	6	2206310	2206315	50 %	50 %	0 %	0 %	338204542
48108	NC_015697	GAT	3	9	2206321	2206329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204542
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48114	NC_015697	T	7	7	2206581	2206587	0 %	100 %	0 %	0 %	338204542
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48233	NC_015697	A	6	6	2211566	2211571	100 %	0 %	0 %	0 %	338204549
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48351	NC_015697	ATTA	2	8	2217768	2217775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48352	NC_015697	CAT	2	6	2217786	2217791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48353	NC_015697	ATG	2	6	2217804	2217809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48354	NC_015697	TGGT	2	8	2217828	2217835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48355	NC_015697	TAT	2	6	2217865	2217870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48356	NC_015697	ATT	2	6	2217897	2217902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48357	NC_015697	AGAA	2	8	2217997	2218004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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48453	NC_015697	GA	3	6	2222906	2222911	50 %	0 %	50 %	0 %	338204558
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