MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_015697	GTC	2	6	2058659	2058664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204370
45002	NC_015697	ATG	2	6	2058705	2058710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204370
45003	NC_015697	CTT	2	6	2058785	2058790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204370
45004	NC_015697	CGT	2	6	2058797	2058802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204370
45005	NC_015697	TGA	2	6	2058844	2058849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204370
45006	NC_015697	TTG	2	6	2059002	2059007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204370
45007	NC_015697	CA	3	6	2059041	2059046	50 %	0 %	0 %	50 %	338204370
45008	NC_015697	GCT	2	6	2059076	2059081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204370
45009	NC_015697	TGT	2	6	2059114	2059119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204370
45010	NC_015697	GGC	2	6	2059169	2059174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338204370
45011	NC_015697	CTG	2	6	2059242	2059247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204370
45012	NC_015697	GTTAAG	2	12	2059256	2059267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204370
45013	NC_015697	TGAACG	2	12	2059285	2059296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338204370
45014	NC_015697	GAT	2	6	2059337	2059342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204370
45015	NC_015697	GAA	2	6	2059346	2059351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204370
45016	NC_015697	CA	3	6	2059464	2059469	50 %	0 %	0 %	50 %	338204370
45017	NC_015697	AAG	2	6	2059509	2059514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204370
45018	NC_015697	GAA	2	6	2059580	2059585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204370
45019	NC_015697	ACA	2	6	2059605	2059610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204370
45020	NC_015697	AAC	2	6	2059613	2059618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204370
45021	NC_015697	GTC	3	9	2059635	2059643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204370
45022	NC_015697	CGT	2	6	2059649	2059654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204370
45023	NC_015697	AAC	2	6	2059661	2059666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204370
45024	NC_015697	AAC	2	6	2059679	2059684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204370
45025	NC_015697	AGA	3	9	2059690	2059698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204370
45026	NC_015697	ATTA	2	8	2059765	2059772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45027	NC_015697	T	6	6	2059813	2059818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45028	NC_015697	GCTG	2	8	2059845	2059852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45029	NC_015697	CTT	2	6	2059930	2059935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45030	NC_015697	TAAAA	2	10	2059958	2059967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45031	NC_015697	AAG	2	6	2059971	2059976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45032	NC_015697	GTT	2	6	2060007	2060012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204371
45033	NC_015697	GTC	2	6	2060014	2060019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204371
45034	NC_015697	ATT	2	6	2060039	2060044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204371
45035	NC_015697	TTG	2	6	2060074	2060079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204371
45036	NC_015697	TGAT	2	8	2060149	2060156	25 %	50 %	25 %	0 %	338204371
45037	NC_015697	ATT	2	6	2060186	2060191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204371
45038	NC_015697	CAA	2	6	2060205	2060210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204371
45039	NC_015697	TGA	2	6	2060225	2060230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204371
45040	NC_015697	TAA	2	6	2060239	2060244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204371
45041	NC_015697	CTGATG	2	12	2060275	2060286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338204371
45042	NC_015697	TAA	2	6	2060339	2060344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204371
45043	NC_015697	CGG	2	6	2060361	2060366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338204371
45044	NC_015697	TTA	2	6	2060461	2060466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204371
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45047	NC_015697	ATC	2	6	2060546	2060551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204371
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45049	NC_015697	CTG	2	6	2060674	2060679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204371
45050	NC_015697	A	6	6	2060688	2060693	100 %	0 %	0 %	0 %	338204371
45051	NC_015697	TGA	2	6	2060750	2060755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204371
45052	NC_015697	TGT	2	6	2060762	2060767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204371
45053	NC_015697	TTG	2	6	2060770	2060775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204371
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45055	NC_015697	TTA	2	6	2060851	2060856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204371
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45058	NC_015697	AAAAGA	2	12	2060882	2060893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338204371
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45061	NC_015697	TGC	2	6	2061089	2061094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204371
45062	NC_015697	ACC	2	6	2061161	2061166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204371
45063	NC_015697	A	6	6	2061325	2061330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45064	NC_015697	CAG	2	6	2061369	2061374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45065	NC_015697	AATGA	2	10	2061398	2061407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45066	NC_015697	ACA	2	6	2061504	2061509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45070	NC_015697	TGC	2	6	2061676	2061681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204372
45071	NC_015697	GAA	2	6	2061710	2061715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204372
45072	NC_015697	GCAA	2	8	2061728	2061735	50 %	0 %	25 %	25 %	338204372
45073	NC_015697	TCTTT	2	10	2061837	2061846	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45074	NC_015697	ATC	2	6	2061871	2061876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45075	NC_015697	AT	3	6	2061884	2061889	50 %	50 %	0 %	0 %	338204373
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45089	NC_015697	GGA	2	6	2062276	2062281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338204373
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45099	NC_015697	GCT	2	6	2063012	2063017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204373
45100	NC_015697	AATT	3	12	2063055	2063066	50 %	50 %	0 %	0 %	338204373
45101	NC_015697	AAT	2	6	2063181	2063186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204373
45102	NC_015697	TTTAA	2	10	2063188	2063197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45103	NC_015697	AAG	2	6	2063267	2063272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45104	NC_015697	TGA	2	6	2063276	2063281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45105	NC_015697	AAAAT	2	10	2063283	2063292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45106	NC_015697	AGC	2	6	2063303	2063308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204374
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45108	NC_015697	AGG	2	6	2063382	2063387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338204374
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45110	NC_015697	T	7	7	2063591	2063597	0 %	100 %	0 %	0 %	338204374
45111	NC_015697	TTCT	2	8	2063600	2063607	0 %	75 %	0 %	25 %	338204374
45112	NC_015697	AGA	2	6	2063682	2063687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204374
45113	NC_015697	ATGA	2	8	2063690	2063697	50 %	25 %	25 %	0 %	338204374
45114	NC_015697	AAT	2	6	2063743	2063748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204374
45115	NC_015697	CAA	2	6	2063884	2063889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204374
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