MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24119	NC_015697	CTT	2	6	1110930	1110935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338203491
24120	NC_015697	CAACA	2	10	1110936	1110945	60 %	0 %	0 %	40 %	338203491
24121	NC_015697	GTC	2	6	1111000	1111005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203491
24122	NC_015697	CAA	2	6	1111006	1111011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203491
24123	NC_015697	T	6	6	1111108	1111113	0 %	100 %	0 %	0 %	338203491
24124	NC_015697	GTT	2	6	1111184	1111189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338203491
24125	NC_015697	CTT	2	6	1111217	1111222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338203491
24126	NC_015697	TGA	2	6	1111269	1111274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203491
24127	NC_015697	T	6	6	1111366	1111371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24128	NC_015697	ATC	2	6	1111401	1111406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24129	NC_015697	CT	3	6	1111423	1111428	0 %	50 %	0 %	50 %	338203492
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24131	NC_015697	ATC	2	6	1111493	1111498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203492
24132	NC_015697	A	8	8	1111700	1111707	100 %	0 %	0 %	0 %	338203493
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24140	NC_015697	TAC	2	6	1112010	1112015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203493
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24142	NC_015697	CGTA	2	8	1112154	1112161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24143	NC_015697	CGG	2	6	1112174	1112179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24144	NC_015697	ATTGA	2	10	1112197	1112206	40 %	40 %	20 %	0 %	338203494
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24148	NC_015697	AGTT	3	12	1112461	1112472	25 %	50 %	25 %	0 %	338203494
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24151	NC_015697	TTC	2	6	1112519	1112524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24154	NC_015697	GTT	2	6	1112590	1112595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338203495
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24174	NC_015697	GCTT	2	8	1113697	1113704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24175	NC_015697	AGT	2	6	1113817	1113822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24178	NC_015697	CTTC	2	8	1113912	1113919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24179	NC_015697	ACT	2	6	1113967	1113972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24182	NC_015697	CAT	2	6	1114091	1114096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203496
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24213	NC_015697	AT	3	6	1115292	1115297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24214	NC_015697	TAA	2	6	1115310	1115315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24235	NC_015697	TCA	2	6	1116406	1116411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203498
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24354	NC_015697	CAA	2	6	1122374	1122379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203501
24355	NC_015697	GGC	2	6	1122410	1122415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338203501
24356	NC_015697	ACA	2	6	1122441	1122446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203501
24357	NC_015697	TTC	2	6	1122514	1122519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338203501
24358	NC_015697	TAA	2	6	1122601	1122606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203502
24359	NC_015697	CAT	2	6	1122654	1122659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203502
24360	NC_015697	CAT	2	6	1122687	1122692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203502
24361	NC_015697	CATTA	2	10	1122733	1122742	40 %	40 %	0 %	20 %	338203502
24362	NC_015697	TTG	2	6	1122764	1122769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338203502
24363	NC_015697	GAT	3	9	1122910	1122918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203502
24364	NC_015697	GCT	2	6	1122921	1122926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203502
24365	NC_015697	ATCA	2	8	1122982	1122989	50 %	25 %	0 %	25 %	338203502
24366	NC_015697	GCG	2	6	1123007	1123012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338203502
24367	NC_015697	CTG	2	6	1123077	1123082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203502
24368	NC_015697	TTGACA	2	12	1123109	1123120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338203502
24369	NC_015697	TTC	2	6	1123123	1123128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338203502
24370	NC_015697	GAT	2	6	1123228	1123233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203502
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24373	NC_015697	TCG	2	6	1123335	1123340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203502
24374	NC_015697	TTC	2	6	1123345	1123350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338203502
24375	NC_015697	CAT	2	6	1123356	1123361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203502
24376	NC_015697	GAC	2	6	1123536	1123541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338203502
24377	NC_015697	AAG	2	6	1123547	1123552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338203502
24378	NC_015697	GC	4	8	1123686	1123693	0 %	0 %	50 %	50 %	338203502
24379	NC_015697	TCA	2	6	1123712	1123717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203502
24380	NC_015697	CAA	2	6	1123740	1123745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203502
24381	NC_015697	CAT	2	6	1123824	1123829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203502
24382	NC_015697	TGC	2	6	1123882	1123887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203502
24383	NC_015697	A	7	7	1123937	1123943	100 %	0 %	0 %	0 %	338203502
24384	NC_015697	TAA	2	6	1123962	1123967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24385	NC_015697	ACT	2	6	1123998	1124003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24386	NC_015697	CAA	2	6	1124060	1124065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24390	NC_015697	ACT	2	6	1124219	1124224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203503
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24400	NC_015697	TGC	2	6	1124726	1124731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203503
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24406	NC_015697	TAAA	2	8	1124887	1124894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24407	NC_015697	CAA	2	6	1124903	1124908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24408	NC_015697	TAA	2	6	1124927	1124932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24424	NC_015697	GAT	3	9	1125558	1125566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203504
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24427	NC_015697	T	6	6	1125782	1125787	0 %	100 %	0 %	0 %	338203505
24428	NC_015697	TAA	2	6	1125918	1125923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203505
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24431	NC_015697	T	6	6	1126099	1126104	0 %	100 %	0 %	0 %	338203505
24432	NC_015697	CTGCC	2	10	1126215	1126224	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24433	NC_015697	CA	3	6	1126226	1126231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24434	NC_015697	A	7	7	1126234	1126240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24435	NC_015697	ATA	2	6	1126271	1126276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203506
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24438	NC_015697	TGGTT	2	10	1126425	1126434	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24439	NC_015697	GTA	2	6	1126473	1126478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24441	NC_015697	TAA	2	6	1126497	1126502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24442	NC_015697	T	7	7	1126523	1126529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24443	NC_015697	ATT	2	6	1126531	1126536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24444	NC_015697	AAT	2	6	1126551	1126556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24445	NC_015697	CAA	2	6	1126597	1126602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24446	NC_015697	CT	3	6	1126678	1126683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24447	NC_015697	AT	3	6	1126706	1126711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24448	NC_015697	ATT	2	6	1126772	1126777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24450	NC_015697	T	6	6	1126803	1126808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24451	NC_015697	ATT	2	6	1126809	1126814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24454	NC_015697	TC	5	10	1126995	1127004	0 %	50 %	0 %	50 %	338203507
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24462	NC_015697	G	7	7	1127325	1127331	0 %	0 %	100 %	0 %	338203507
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24467	NC_015697	A	6	6	1127592	1127597	100 %	0 %	0 %	0 %	338203507
24468	NC_015697	CTC	2	6	1127695	1127700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338203507
24469	NC_015697	ATATTG	2	12	1127752	1127763	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338203507
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24471	NC_015697	CGG	2	6	1128098	1128103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338203507
24472	NC_015697	ACC	2	6	1128114	1128119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338203507
24473	NC_015697	A	6	6	1128155	1128160	100 %	0 %	0 %	0 %	338203507
24474	NC_015697	TAA	2	6	1128230	1128235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24475	NC_015697	CTA	3	9	1128324	1128332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24476	NC_015697	AT	3	6	1128355	1128360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24477	NC_015697	TA	3	6	1128362	1128367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24478	NC_015697	CATT	2	8	1128416	1128423	25 %	50 %	0 %	25 %	338203508
24479	NC_015697	ATA	2	6	1128434	1128439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203508
24480	NC_015697	CAATTC	2	12	1128467	1128478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203508
24481	NC_015697	ACA	2	6	1128509	1128514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203508
24482	NC_015697	TTA	2	6	1128557	1128562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338203508
24483	NC_015697	ATG	2	6	1128569	1128574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203508
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24497	NC_015697	TA	3	6	1129543	1129548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24498	NC_015697	A	6	6	1129557	1129562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24499	NC_015697	GTTTT	2	10	1129576	1129585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24500	NC_015697	T	6	6	1129594	1129599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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