MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_015697	CTAC	2	8	530213	530220	25 %	25 %	0 %	50 %	338202895
11503	NC_015697	TCT	2	6	530257	530262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202895
11504	NC_015697	CCT	2	6	530388	530393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202895
11505	NC_015697	T	6	6	530423	530428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_015697	TGA	2	6	530532	530537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202896
11507	NC_015697	CAAGCC	2	12	530551	530562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338202896
11508	NC_015697	AGA	2	6	530568	530573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202896
11509	NC_015697	AATC	2	8	530592	530599	50 %	25 %	0 %	25 %	338202896
11510	NC_015697	GAA	2	6	530611	530616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202896
11511	NC_015697	CAC	2	6	530645	530650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202896
11512	NC_015697	CA	3	6	530707	530712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_015697	TGA	2	6	530714	530719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_015697	AGG	2	6	530721	530726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_015697	GCT	2	6	530795	530800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202897
11516	NC_015697	TGA	2	6	530824	530829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202897
11517	NC_015697	AAG	2	6	530832	530837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202897
11518	NC_015697	CAA	2	6	530852	530857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202897
11519	NC_015697	CAG	2	6	530879	530884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202897
11520	NC_015697	GCT	2	6	530896	530901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202897
11521	NC_015697	CTA	2	6	530911	530916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202897
11522	NC_015697	ACTG	2	8	531044	531051	25 %	25 %	25 %	25 %	338202897
11523	NC_015697	AAC	2	6	531075	531080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202897
11524	NC_015697	GAAA	2	8	531103	531110	75 %	0 %	25 %	0 %	338202897
11525	NC_015697	CAAT	2	8	531182	531189	50 %	25 %	0 %	25 %	338202897
11526	NC_015697	ATT	2	6	531243	531248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202897
11527	NC_015697	C	6	6	531254	531259	0 %	0 %	0 %	100 %	338202897
11528	NC_015697	TAA	2	6	531291	531296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202897
11529	NC_015697	GTG	2	6	531317	531322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202897
11530	NC_015697	ACGAA	2	10	531401	531410	60 %	0 %	20 %	20 %	338202897
11531	NC_015697	GAT	2	6	531497	531502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202897
11532	NC_015697	ACC	2	6	531507	531512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202897
11533	NC_015697	ATC	2	6	531542	531547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202897
11534	NC_015697	GAA	2	6	531551	531556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202897
11535	NC_015697	CAC	2	6	531557	531562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202897
11536	NC_015697	ATT	2	6	531569	531574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202897
11537	NC_015697	ATC	2	6	531605	531610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202897
11538	NC_015697	CTG	2	6	531733	531738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202897
11539	NC_015697	AAC	2	6	531876	531881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202897
11540	NC_015697	AAG	2	6	531942	531947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202897
11541	NC_015697	CTT	2	6	532006	532011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202897
11542	NC_015697	AAG	2	6	532141	532146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202897
11543	NC_015697	ATT	2	6	532187	532192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202897
11544	NC_015697	AATC	2	8	532194	532201	50 %	25 %	0 %	25 %	338202897
11545	NC_015697	CAT	2	6	532271	532276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202897
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11549	NC_015697	TAACT	2	10	532409	532418	40 %	40 %	0 %	20 %	338202898
11550	NC_015697	AAAT	2	8	532448	532455	75 %	25 %	0 %	0 %	338202898
11551	NC_015697	TGG	2	6	532460	532465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202898
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11553	NC_015697	CCA	2	6	532567	532572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202898
11554	NC_015697	ATC	2	6	532587	532592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202898
11555	NC_015697	TGA	2	6	532604	532609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202898
11556	NC_015697	AATT	2	8	532639	532646	50 %	50 %	0 %	0 %	338202898
11557	NC_015697	GAA	2	6	532726	532731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202899
11558	NC_015697	AAGCT	2	10	532736	532745	40 %	20 %	20 %	20 %	338202899
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11560	NC_015697	TGA	2	6	532875	532880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202899
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11564	NC_015697	CAAG	2	8	532941	532948	50 %	0 %	25 %	25 %	338202899
11565	NC_015697	AT	3	6	533016	533021	50 %	50 %	0 %	0 %	338202899
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11588	NC_015697	CTT	2	6	534114	534119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202899
11589	NC_015697	TGA	2	6	534150	534155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202899
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11591	NC_015697	ACTTT	2	10	534209	534218	20 %	60 %	0 %	20 %	338202899
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11596	NC_015697	AGT	2	6	534425	534430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202900
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11599	NC_015697	CAT	2	6	534554	534559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202900
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11603	NC_015697	CTTT	2	8	534635	534642	0 %	75 %	0 %	25 %	338202901
11604	NC_015697	CAC	2	6	534747	534752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202901
11605	NC_015697	A	6	6	534794	534799	100 %	0 %	0 %	0 %	338202901
11606	NC_015697	TATC	2	8	534804	534811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11607	NC_015697	T	6	6	534841	534846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_015697	CGT	2	6	534924	534929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202902
11609	NC_015697	CTTT	2	8	535040	535047	0 %	75 %	0 %	25 %	338202902
11610	NC_015697	GTG	2	6	535097	535102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202902
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11616	NC_015697	GTG	2	6	535412	535417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202902
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11979	NC_015697	ACTTA	2	10	552146	552155	40 %	40 %	0 %	20 %	338202917
11980	NC_015697	TAA	2	6	552173	552178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202917
11981	NC_015697	AGC	2	6	552188	552193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202917
11982	NC_015697	A	6	6	552195	552200	100 %	0 %	0 %	0 %	338202917
11983	NC_015697	GAA	2	6	552209	552214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202917
11984	NC_015697	ATA	2	6	552231	552236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202917
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11995	NC_015697	CTG	2	6	552660	552665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202918
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11999	NC_015697	TCA	2	6	552803	552808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202918
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