MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015697	CTT	2	6	203767	203772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202569
4502	NC_015697	GGTATC	2	12	203900	203911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338202569
4503	NC_015697	AAAT	2	8	203951	203958	75 %	25 %	0 %	0 %	338202569
4504	NC_015697	AAT	2	6	203964	203969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202569
4505	NC_015697	TAA	2	6	204144	204149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015697	CAA	2	6	204163	204168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015697	ACA	2	6	204186	204191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_015697	T	6	6	204255	204260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015697	TTA	2	6	204267	204272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015697	TTA	2	6	204275	204280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015697	ATTA	2	8	204283	204290	50 %	50 %	0 %	0 %	338202570
4512	NC_015697	TCA	2	6	204415	204420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202570
4513	NC_015697	TCA	2	6	204514	204519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202570
4514	NC_015697	TGG	2	6	204531	204536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202570
4515	NC_015697	GTT	2	6	204540	204545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202570
4516	NC_015697	CAG	2	6	204575	204580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202570
4517	NC_015697	CTG	2	6	204611	204616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202570
4518	NC_015697	GTG	2	6	204668	204673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202570
4519	NC_015697	TCA	2	6	204785	204790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202570
4520	NC_015697	TCA	2	6	204841	204846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202570
4521	NC_015697	AAG	2	6	204847	204852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202570
4522	NC_015697	CTT	2	6	204954	204959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202570
4523	NC_015697	AAC	2	6	204972	204977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202570
4524	NC_015697	AGC	2	6	205068	205073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202570
4525	NC_015697	ACG	2	6	205116	205121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202570
4526	NC_015697	CTG	2	6	205139	205144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202570
4527	NC_015697	TCA	2	6	205201	205206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202570
4528	NC_015697	GAA	2	6	205218	205223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202570
4529	NC_015697	GTT	2	6	205293	205298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202570
4530	NC_015697	TTC	2	6	205431	205436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202570
4531	NC_015697	GAA	2	6	205459	205464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202570
4532	NC_015697	TAA	2	6	205539	205544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202570
4533	NC_015697	ATA	2	6	205667	205672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015697	ATCT	2	8	205686	205693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4535	NC_015697	TC	3	6	205704	205709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_015697	TAA	2	6	205776	205781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015697	A	8	8	205780	205787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015697	CTTCC	2	10	205789	205798	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4539	NC_015697	T	7	7	205807	205813	0 %	100 %	0 %	0 %	338202571
4540	NC_015697	ATC	2	6	205849	205854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202571
4541	NC_015697	T	6	6	205947	205952	0 %	100 %	0 %	0 %	338202571
4542	NC_015697	GGCTA	2	10	205963	205972	20 %	20 %	40 %	20 %	338202571
4543	NC_015697	AAT	2	6	205994	205999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202571
4544	NC_015697	CTG	2	6	206022	206027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202571
4545	NC_015697	TCC	2	6	206038	206043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202571
4546	NC_015697	CTT	2	6	206064	206069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202571
4547	NC_015697	ATC	2	6	206087	206092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202571
4548	NC_015697	TTA	2	6	206105	206110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202571
4549	NC_015697	AGT	2	6	206137	206142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202571
4550	NC_015697	TTG	2	6	206166	206171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202571
4551	NC_015697	TGGT	2	8	206182	206189	0 %	50 %	50 %	0 %	338202571
4552	NC_015697	AAT	2	6	206195	206200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202571
4553	NC_015697	TTG	2	6	206365	206370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202571
4554	NC_015697	AAT	2	6	206440	206445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202571
4555	NC_015697	T	6	6	206478	206483	0 %	100 %	0 %	0 %	338202571
4556	NC_015697	TTC	2	6	206569	206574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202571
4557	NC_015697	GGC	2	6	206604	206609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202571
4558	NC_015697	GAG	2	6	206826	206831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015697	TTATG	2	10	206835	206844	20 %	60 %	20 %	0 %	338202572
4560	NC_015697	TGC	2	6	206889	206894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202572
4561	NC_015697	GAA	5	15	206944	206958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202572
4562	NC_015697	GCT	2	6	206980	206985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202572
4563	NC_015697	TTTA	2	8	207020	207027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015697	GAA	2	6	207120	207125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015697	TTC	2	6	207135	207140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_015697	T	6	6	207148	207153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_015697	T	6	6	207246	207251	0 %	100 %	0 %	0 %	338202573
4568	NC_015697	CTT	2	6	207262	207267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202573
4569	NC_015697	CACG	2	8	207281	207288	25 %	0 %	25 %	50 %	338202573
4570	NC_015697	GGT	2	6	207312	207317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202573
4571	NC_015697	TCA	2	6	207371	207376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202573
4572	NC_015697	TTG	2	6	207415	207420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202573
4573	NC_015697	GAT	2	6	207607	207612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202573
4574	NC_015697	ATC	2	6	207632	207637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202573
4575	NC_015697	AGC	2	6	207716	207721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202574
4576	NC_015697	CAT	2	6	207736	207741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202574
4577	NC_015697	CCA	2	6	207852	207857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202574
4578	NC_015697	TCA	2	6	207930	207935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202574
4579	NC_015697	ACA	2	6	207936	207941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202574
4580	NC_015697	ATCA	2	8	208010	208017	50 %	25 %	0 %	25 %	338202574
4581	NC_015697	TTC	2	6	208046	208051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202574
4582	NC_015697	CAC	2	6	208168	208173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202574
4583	NC_015697	CCA	3	9	208218	208226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202574
4584	NC_015697	TAA	2	6	208243	208248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202574
4585	NC_015697	GCA	2	6	208299	208304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202574
4586	NC_015697	TCT	2	6	208356	208361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202574
4587	NC_015697	TA	3	6	208480	208485	50 %	50 %	0 %	0 %	338202574
4588	NC_015697	GGT	2	6	208492	208497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202574
4589	NC_015697	ATG	2	6	208512	208517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202574
4590	NC_015697	TG	3	6	208528	208533	0 %	50 %	50 %	0 %	338202574
4591	NC_015697	CAT	2	6	208537	208542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202574
4592	NC_015697	TTG	2	6	208571	208576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202574
4593	NC_015697	TAG	2	6	208612	208617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202574
4594	NC_015697	ACC	2	6	208619	208624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202574
4595	NC_015697	AATT	2	8	208637	208644	50 %	50 %	0 %	0 %	338202574
4596	NC_015697	TTCCT	2	10	208660	208669	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4597	NC_015697	TTC	2	6	208712	208717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202575
4598	NC_015697	TGAT	2	8	208778	208785	25 %	50 %	25 %	0 %	338202575
4599	NC_015697	AAC	2	6	208980	208985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202576
4600	NC_015697	CAA	2	6	209023	209028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202576
4601	NC_015697	CCA	2	6	209046	209051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202576
4602	NC_015697	GCC	2	6	209057	209062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202576
4603	NC_015697	A	6	6	209094	209099	100 %	0 %	0 %	0 %	338202576
4604	NC_015697	TAA	3	9	209113	209121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202576
4605	NC_015697	A	6	6	209130	209135	100 %	0 %	0 %	0 %	338202576
4606	NC_015697	AAT	2	6	209202	209207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202576
4607	NC_015697	A	6	6	209276	209281	100 %	0 %	0 %	0 %	338202576
4608	NC_015697	TA	3	6	209295	209300	50 %	50 %	0 %	0 %	338202576
4609	NC_015697	AT	3	6	209346	209351	50 %	50 %	0 %	0 %	338202576
4610	NC_015697	ACT	2	6	209370	209375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202576
4611	NC_015697	CCA	2	6	209420	209425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202576
4612	NC_015697	TAC	2	6	209449	209454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202576
4613	NC_015697	AGG	2	6	209469	209474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202576
4614	NC_015697	ATT	2	6	209535	209540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202576
4615	NC_015697	TCT	2	6	209584	209589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202576
4616	NC_015697	ACA	2	6	209605	209610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202577
4617	NC_015697	TTC	2	6	209633	209638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202577
4618	NC_015697	TTC	2	6	209654	209659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202577
4619	NC_015697	T	6	6	209706	209711	0 %	100 %	0 %	0 %	338202577
4620	NC_015697	ATA	2	6	209723	209728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202577
4621	NC_015697	CCG	2	6	209730	209735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202577
4622	NC_015697	AAC	2	6	209780	209785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202577
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4624	NC_015697	CAT	2	6	209821	209826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202577
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4992	NC_015697	ATC	2	6	226584	226589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202593
4993	NC_015697	CAT	2	6	226611	226616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202593
4994	NC_015697	AATTC	2	10	226655	226664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4995	NC_015697	TAAT	2	8	226695	226702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_015697	AAACGA	2	12	226739	226750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338202594
4997	NC_015697	TGG	2	6	226762	226767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202594
4998	NC_015697	CTT	3	9	226784	226792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202594
4999	NC_015697	GTTT	2	8	226834	226841	0 %	75 %	25 %	0 %	338202594
5000	NC_015697	AGCC	2	8	226885	226892	25 %	0 %	25 %	50 %	338202594

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