MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 82273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015638	AAC	2	6	522561	522566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_015638	ATC	2	6	522630	522635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171623
13003	NC_015638	AAG	2	6	522645	522650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171623
13004	NC_015638	CTA	2	6	522668	522673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171623
13005	NC_015638	T	6	6	522722	522727	0 %	100 %	0 %	0 %	336171623
13006	NC_015638	ACCAA	2	10	522794	522803	60 %	0 %	0 %	40 %	336171623
13007	NC_015638	A	6	6	522824	522829	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13008	NC_015638	ACA	2	6	522841	522846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171623
13009	NC_015638	AGA	2	6	522847	522852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171623
13010	NC_015638	TTG	2	6	522867	522872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171623
13011	NC_015638	TAT	2	6	522877	522882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171623
13012	NC_015638	ACA	2	6	522892	522897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171623
13013	NC_015638	T	7	7	522906	522912	0 %	100 %	0 %	0 %	336171623
13014	NC_015638	TAA	2	6	522967	522972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171623
13015	NC_015638	A	6	6	522971	522976	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13016	NC_015638	TTG	2	6	523032	523037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171623
13017	NC_015638	TTACC	2	10	523051	523060	20 %	40 %	0 %	40 %	336171623
13018	NC_015638	TAG	2	6	523089	523094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171623
13019	NC_015638	AGA	2	6	523102	523107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171623
13020	NC_015638	T	7	7	523117	523123	0 %	100 %	0 %	0 %	336171623
13021	NC_015638	GAT	2	6	523166	523171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171623
13022	NC_015638	TAAAAC	2	12	523188	523199	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336171623
13023	NC_015638	AAT	2	6	523202	523207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171623
13024	NC_015638	TTTAA	2	10	523208	523217	40 %	60 %	0 %	0 %	336171623
13025	NC_015638	TAC	2	6	523220	523225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171623
13026	NC_015638	TC	3	6	523236	523241	0 %	50 %	0 %	50 %	336171623
13027	NC_015638	TA	3	6	523254	523259	50 %	50 %	0 %	0 %	336171623
13028	NC_015638	A	6	6	523290	523295	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13029	NC_015638	CAA	2	6	523332	523337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171623
13030	NC_015638	TAA	2	6	523380	523385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171623
13031	NC_015638	ATT	2	6	523415	523420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171623
13032	NC_015638	CAT	2	6	523433	523438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171623
13033	NC_015638	T	8	8	523450	523457	0 %	100 %	0 %	0 %	336171623
13034	NC_015638	CAA	2	6	523470	523475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171623
13035	NC_015638	AC	5	10	523527	523536	50 %	0 %	0 %	50 %	336171623
13036	NC_015638	TGA	2	6	523555	523560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171623
13037	NC_015638	AATTA	2	10	523606	523615	60 %	40 %	0 %	0 %	336171623
13038	NC_015638	GAA	2	6	523619	523624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171623
13039	NC_015638	ACT	2	6	523646	523651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171623
13040	NC_015638	TGC	2	6	523711	523716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171623
13041	NC_015638	A	6	6	523717	523722	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13042	NC_015638	GTT	2	6	523733	523738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171623
13043	NC_015638	TGA	2	6	523765	523770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171623
13044	NC_015638	A	7	7	523770	523776	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13045	NC_015638	TA	4	8	523863	523870	50 %	50 %	0 %	0 %	336171623
13046	NC_015638	GAAA	2	8	523871	523878	75 %	0 %	25 %	0 %	336171623
13047	NC_015638	AATA	2	8	523879	523886	75 %	25 %	0 %	0 %	336171623
13048	NC_015638	ATAA	2	8	523985	523992	75 %	25 %	0 %	0 %	336171623
13049	NC_015638	A	6	6	524048	524053	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13050	NC_015638	AAG	2	6	524133	524138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171623
13051	NC_015638	TAT	2	6	524143	524148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171623
13052	NC_015638	A	7	7	524174	524180	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13053	NC_015638	TTA	2	6	524228	524233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171623
13054	NC_015638	TATT	2	8	524333	524340	25 %	75 %	0 %	0 %	336171623
13055	NC_015638	AAT	2	6	524345	524350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171623
13056	NC_015638	ATT	2	6	524504	524509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171623
13057	NC_015638	A	7	7	524520	524526	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13058	NC_015638	A	6	6	524536	524541	100 %	0 %	0 %	0 %	336171623
13059	NC_015638	TAA	2	6	524542	524547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171623
13060	NC_015638	TAAT	2	8	524587	524594	50 %	50 %	0 %	0 %	336171623
13061	NC_015638	CAG	2	6	524651	524656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171624
13062	NC_015638	T	6	6	524663	524668	0 %	100 %	0 %	0 %	336171624
13063	NC_015638	AC	3	6	524699	524704	50 %	0 %	0 %	50 %	336171624
13064	NC_015638	TTTGG	2	10	524725	524734	0 %	60 %	40 %	0 %	336171624
13065	NC_015638	TAAA	2	8	524771	524778	75 %	25 %	0 %	0 %	336171624
13066	NC_015638	A	6	6	524776	524781	100 %	0 %	0 %	0 %	336171624
13067	NC_015638	AGA	2	6	524822	524827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171624
13068	NC_015638	TTA	2	6	524857	524862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171624
13069	NC_015638	A	6	6	524862	524867	100 %	0 %	0 %	0 %	336171624
13070	NC_015638	T	6	6	524909	524914	0 %	100 %	0 %	0 %	336171624
13071	NC_015638	ATTTT	2	10	524936	524945	20 %	80 %	0 %	0 %	336171624
13072	NC_015638	T	7	7	524942	524948	0 %	100 %	0 %	0 %	336171624
13073	NC_015638	T	6	6	524953	524958	0 %	100 %	0 %	0 %	336171624
13074	NC_015638	GTT	2	6	525051	525056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171625
13075	NC_015638	T	6	6	525095	525100	0 %	100 %	0 %	0 %	336171625
13076	NC_015638	TAAA	2	8	525116	525123	75 %	25 %	0 %	0 %	336171625
13077	NC_015638	TA	3	6	525161	525166	50 %	50 %	0 %	0 %	336171625
13078	NC_015638	TAAAA	2	10	525200	525209	80 %	20 %	0 %	0 %	336171625
13079	NC_015638	CTTT	2	8	525277	525284	0 %	75 %	0 %	25 %	336171625
13080	NC_015638	T	6	6	525282	525287	0 %	100 %	0 %	0 %	336171625
13081	NC_015638	CTT	2	6	525303	525308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171625
13082	NC_015638	AAC	2	6	525348	525353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171625
13083	NC_015638	GCA	2	6	525453	525458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171625
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13085	NC_015638	TG	3	6	525539	525544	0 %	50 %	50 %	0 %	336171625
13086	NC_015638	ATC	2	6	525554	525559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171625
13087	NC_015638	TTA	2	6	525621	525626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171625
13088	NC_015638	GTTA	2	8	525629	525636	25 %	50 %	25 %	0 %	336171625
13089	NC_015638	TTC	2	6	525725	525730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171625
13090	NC_015638	CAT	2	6	525745	525750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171625
13091	NC_015638	TGT	2	6	525775	525780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171625
13092	NC_015638	GAA	2	6	525856	525861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171625
13093	NC_015638	T	6	6	525862	525867	0 %	100 %	0 %	0 %	336171625
13094	NC_015638	TG	3	6	525921	525926	0 %	50 %	50 %	0 %	336171625
13095	NC_015638	AAT	2	6	525950	525955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171625
13096	NC_015638	T	6	6	525968	525973	0 %	100 %	0 %	0 %	336171625
13097	NC_015638	AAC	2	6	526003	526008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_015638	A	7	7	526020	526026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_015638	AATTA	2	10	526033	526042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_015638	TAAA	2	8	526053	526060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_015638	TTA	2	6	526081	526086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171626
13102	NC_015638	T	6	6	526094	526099	0 %	100 %	0 %	0 %	336171626
13103	NC_015638	GCT	2	6	526138	526143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171626
13104	NC_015638	T	7	7	526197	526203	0 %	100 %	0 %	0 %	336171626
13105	NC_015638	CTT	2	6	526208	526213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171626
13106	NC_015638	TTG	2	6	526241	526246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171626
13107	NC_015638	TTA	2	6	526261	526266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171626
13108	NC_015638	ATT	2	6	526275	526280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171626
13109	NC_015638	CTT	2	6	526316	526321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171626
13110	NC_015638	ACC	2	6	526329	526334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336171626
13111	NC_015638	CTA	3	9	526346	526354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171626
13112	NC_015638	TTA	2	6	526376	526381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171626
13113	NC_015638	CAC	2	6	526532	526537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336171626
13114	NC_015638	ACC	2	6	526596	526601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336171626
13115	NC_015638	A	6	6	526648	526653	100 %	0 %	0 %	0 %	336171626
13116	NC_015638	TAA	2	6	526680	526685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171626
13117	NC_015638	CAT	2	6	526695	526700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171626
13118	NC_015638	TTG	2	6	526718	526723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171626
13119	NC_015638	TTCC	2	8	526760	526767	0 %	50 %	0 %	50 %	336171626
13120	NC_015638	ATT	2	6	526768	526773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171626
13121	NC_015638	GAC	2	6	526793	526798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171626
13122	NC_015638	CTT	2	6	526802	526807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171626
13123	NC_015638	TGC	2	6	526821	526826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171626
13124	NC_015638	CATT	2	8	526838	526845	25 %	50 %	0 %	25 %	336171626
13125	NC_015638	ACT	2	6	526861	526866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171626
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13127	NC_015638	ATAGC	2	10	526886	526895	40 %	20 %	20 %	20 %	336171626
13128	NC_015638	AGC	2	6	526950	526955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171626
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13132	NC_015638	CTCA	2	8	527073	527080	25 %	25 %	0 %	50 %	336171626
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13162	NC_015638	A	6	6	528042	528047	100 %	0 %	0 %	0 %	336171626
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13174	NC_015638	AAAT	2	8	528472	528479	75 %	25 %	0 %	0 %	336171626
13175	NC_015638	ATT	2	6	528495	528500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13229	NC_015638	CTC	2	6	530825	530830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336171627
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13231	NC_015638	TGT	3	9	530848	530856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171627
13232	NC_015638	TG	3	6	530858	530863	0 %	50 %	50 %	0 %	336171627
13233	NC_015638	TGT	2	6	530895	530900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171627
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13235	NC_015638	T	7	7	530970	530976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13236	NC_015638	AAT	2	6	530979	530984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13237	NC_015638	TTA	2	6	531027	531032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171628
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13239	NC_015638	TTA	3	9	531085	531093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171628
13240	NC_015638	AT	3	6	531094	531099	50 %	50 %	0 %	0 %	336171628
13241	NC_015638	T	7	7	531112	531118	0 %	100 %	0 %	0 %	336171628
13242	NC_015638	TATTT	2	10	531141	531150	20 %	80 %	0 %	0 %	336171628
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13365	NC_015638	TAA	2	6	535865	535870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171632
13366	NC_015638	ATG	2	6	535876	535881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171632
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13368	NC_015638	TAC	2	6	535955	535960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171632
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13373	NC_015638	TGC	2	6	536048	536053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171632
13374	NC_015638	CGGTTA	2	12	536110	536121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171632
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13398	NC_015638	CCAA	2	8	536913	536920	50 %	0 %	0 %	50 %	336171632
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13400	NC_015638	TGA	2	6	537020	537025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171632
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13427	NC_015638	ACAA	2	8	538121	538128	75 %	0 %	0 %	25 %	336171632
13428	NC_015638	ACGATT	2	12	538132	538143	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336171632
13429	NC_015638	ATAACG	2	12	538165	538176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336171632
13430	NC_015638	CTA	2	6	538180	538185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171632
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13432	NC_015638	CTA	2	6	538246	538251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171632
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13442	NC_015638	ATC	2	6	538718	538723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171632
13443	NC_015638	CTG	2	6	538735	538740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171632
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13445	NC_015638	GTTACA	2	12	538863	538874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336171632
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13471	NC_015638	AAG	2	6	539702	539707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13472	NC_015638	GCA	2	6	539759	539764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171633
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13477	NC_015638	TAT	2	6	540002	540007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171633
13478	NC_015638	ATAAC	2	10	540031	540040	60 %	20 %	0 %	20 %	336171633
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13481	NC_015638	GAT	2	6	540153	540158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171633
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