MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 48681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_015428	TC	3	6	2417534	2417539	0 %	50 %	0 %	50 %	331702626
47002	NC_015428	AG	4	8	2417568	2417575	50 %	0 %	50 %	0 %	331702626
47003	NC_015428	TGGC	2	8	2417696	2417703	0 %	25 %	50 %	25 %	331702626
47004	NC_015428	CAT	2	6	2417820	2417825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47005	NC_015428	TTTA	2	8	2417854	2417861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47006	NC_015428	TAA	2	6	2417896	2417901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47007	NC_015428	AATG	2	8	2418065	2418072	50 %	25 %	25 %	0 %	331702627
47008	NC_015428	AAC	2	6	2418078	2418083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702627
47009	NC_015428	TGC	2	6	2418099	2418104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702627
47010	NC_015428	TAATAT	2	12	2418105	2418116	50 %	50 %	0 %	0 %	331702627
47011	NC_015428	AGA	2	6	2418130	2418135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702627
47012	NC_015428	ATT	2	6	2418136	2418141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702627
47013	NC_015428	TTG	2	6	2418149	2418154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702627
47014	NC_015428	AAT	2	6	2418175	2418180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702627
47015	NC_015428	TAT	2	6	2418204	2418209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702627
47016	NC_015428	A	7	7	2418211	2418217	100 %	0 %	0 %	0 %	331702627
47017	NC_015428	ATT	2	6	2418375	2418380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47018	NC_015428	CTGATC	2	12	2418407	2418418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47019	NC_015428	CCT	2	6	2418433	2418438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47020	NC_015428	AAT	2	6	2418463	2418468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47021	NC_015428	CCG	2	6	2418470	2418475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47022	NC_015428	ACG	2	6	2418487	2418492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47023	NC_015428	CTC	2	6	2418494	2418499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47024	NC_015428	ATA	2	6	2418528	2418533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47025	NC_015428	CGTA	2	8	2418534	2418541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47026	NC_015428	TGG	2	6	2418710	2418715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702628
47027	NC_015428	ACC	2	6	2418894	2418899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702628
47028	NC_015428	GCATG	2	10	2418932	2418941	20 %	20 %	40 %	20 %	331702628
47029	NC_015428	TCGC	2	8	2418983	2418990	0 %	25 %	25 %	50 %	331702628
47030	NC_015428	CGT	2	6	2419067	2419072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702628
47031	NC_015428	CAG	2	6	2419085	2419090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702628
47032	NC_015428	ATA	2	6	2419123	2419128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702628
47033	NC_015428	T	7	7	2419178	2419184	0 %	100 %	0 %	0 %	331702628
47034	NC_015428	AGA	2	6	2419330	2419335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702628
47035	NC_015428	AATT	2	8	2419397	2419404	50 %	50 %	0 %	0 %	331702628
47036	NC_015428	TTG	2	6	2419409	2419414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702628
47037	NC_015428	CTT	2	6	2419500	2419505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47038	NC_015428	CAT	2	6	2419547	2419552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47039	NC_015428	ATTT	2	8	2419553	2419560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47040	NC_015428	TGA	2	6	2419617	2419622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702629
47041	NC_015428	ATTA	2	8	2419643	2419650	50 %	50 %	0 %	0 %	331702629
47042	NC_015428	TGC	2	6	2419658	2419663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702629
47043	NC_015428	TCA	2	6	2419671	2419676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702629
47044	NC_015428	GAA	2	6	2419709	2419714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702629
47045	NC_015428	ATGG	2	8	2419768	2419775	25 %	25 %	50 %	0 %	331702629
47046	NC_015428	GTT	2	6	2420055	2420060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702629
47047	NC_015428	GTT	2	6	2420065	2420070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702629
47048	NC_015428	AGCC	2	8	2420163	2420170	25 %	0 %	25 %	50 %	331702629
47049	NC_015428	TGC	2	6	2420276	2420281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702629
47050	NC_015428	ACG	2	6	2420294	2420299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702629
47051	NC_015428	TTGG	2	8	2420515	2420522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47052	NC_015428	CTA	2	6	2420529	2420534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47053	NC_015428	ATTA	2	8	2420577	2420584	50 %	50 %	0 %	0 %	331702630
47054	NC_015428	TAA	2	6	2420597	2420602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702630
47055	NC_015428	ATA	2	6	2420650	2420655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702630
47056	NC_015428	CCA	2	6	2420764	2420769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702630
47057	NC_015428	AAC	2	6	2420829	2420834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702630
47058	NC_015428	CAT	2	6	2420843	2420848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702630
47059	NC_015428	TCTT	2	8	2420872	2420879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47060	NC_015428	ATTT	2	8	2420913	2420920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47061	NC_015428	ATT	2	6	2420935	2420940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47062	NC_015428	AC	3	6	2420951	2420956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47063	NC_015428	TTGC	2	8	2420971	2420978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47064	NC_015428	ATA	2	6	2421033	2421038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47065	NC_015428	CA	3	6	2421063	2421068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47066	NC_015428	AAT	2	6	2421142	2421147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702631
47067	NC_015428	ATT	2	6	2421187	2421192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702631
47068	NC_015428	GTC	2	6	2421212	2421217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702631
47069	NC_015428	TAAA	2	8	2421346	2421353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47070	NC_015428	CA	3	6	2421380	2421385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47071	NC_015428	ATT	2	6	2421446	2421451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47072	NC_015428	GTC	2	6	2421484	2421489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47073	NC_015428	TGA	2	6	2421493	2421498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47074	NC_015428	GAGTA	2	10	2421507	2421516	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47075	NC_015428	AATC	2	8	2421806	2421813	50 %	25 %	0 %	25 %	331702632
47076	NC_015428	GCT	2	6	2421857	2421862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702632
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47080	NC_015428	AGCA	2	8	2422203	2422210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47081	NC_015428	GGA	2	6	2422284	2422289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331702633
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47084	NC_015428	AAAT	2	8	2422408	2422415	75 %	25 %	0 %	0 %	331702633
47085	NC_015428	GGC	2	6	2422482	2422487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702633
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47087	NC_015428	TTA	3	9	2422600	2422608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47088	NC_015428	ATT	2	6	2422613	2422618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47089	NC_015428	ATA	2	6	2422677	2422682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47090	NC_015428	TTA	2	6	2422758	2422763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47091	NC_015428	GCC	2	6	2422898	2422903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331702634
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47094	NC_015428	CCGG	2	8	2423169	2423176	0 %	0 %	50 %	50 %	331702634
47095	NC_015428	CCAA	2	8	2423205	2423212	50 %	0 %	0 %	50 %	331702634
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47099	NC_015428	AAC	2	6	2423331	2423336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702634
47100	NC_015428	GAA	2	6	2423384	2423389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702634
47101	NC_015428	TGAT	2	8	2423421	2423428	25 %	50 %	25 %	0 %	331702634
47102	NC_015428	ACA	2	6	2423505	2423510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702634
47103	NC_015428	CCAAG	2	10	2423521	2423530	40 %	0 %	20 %	40 %	331702634
47104	NC_015428	GGAAT	2	10	2423600	2423609	40 %	20 %	40 %	0 %	331702634
47105	NC_015428	AAG	2	6	2423673	2423678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702634
47106	NC_015428	ATT	2	6	2423777	2423782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47107	NC_015428	CAA	2	6	2423835	2423840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47108	NC_015428	TAAT	2	8	2424015	2424022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47109	NC_015428	AAT	2	6	2424034	2424039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47110	NC_015428	AAT	2	6	2424055	2424060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47111	NC_015428	AAC	2	6	2424091	2424096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702635
47112	NC_015428	TCA	2	6	2424106	2424111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702635
47113	NC_015428	TCA	2	6	2424124	2424129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702635
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47115	NC_015428	CTA	2	6	2424207	2424212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702635
47116	NC_015428	CGA	2	6	2424268	2424273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702635
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47118	NC_015428	ATTA	2	8	2424323	2424330	50 %	50 %	0 %	0 %	331702635
47119	NC_015428	AATT	2	8	2424395	2424402	50 %	50 %	0 %	0 %	331702635
47120	NC_015428	ACT	2	6	2424454	2424459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702635
47121	NC_015428	TCG	2	6	2424498	2424503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702635
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47239	NC_015428	AT	3	6	2429905	2429910	50 %	50 %	0 %	0 %	331702640
47240	NC_015428	TG	3	6	2429984	2429989	0 %	50 %	50 %	0 %	331702641
47241	NC_015428	TCA	2	6	2429990	2429995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702641
47242	NC_015428	CGTT	2	8	2430009	2430016	0 %	50 %	25 %	25 %	331702641
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47244	NC_015428	CTT	2	6	2430057	2430062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702641
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47271	NC_015428	CT	3	6	2431356	2431361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47272	NC_015428	CAA	2	6	2431452	2431457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47303	NC_015428	CAAC	2	8	2433576	2433583	50 %	0 %	0 %	50 %	331702644
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47345	NC_015428	TGC	2	6	2435640	2435645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702645
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47347	NC_015428	TGG	2	6	2435677	2435682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702645
47348	NC_015428	T	6	6	2435685	2435690	0 %	100 %	0 %	0 %	331702645
47349	NC_015428	TGT	2	6	2435748	2435753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702645
47350	NC_015428	AATT	2	8	2435837	2435844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47351	NC_015428	TGA	2	6	2435862	2435867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47352	NC_015428	CTT	2	6	2435967	2435972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702646
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47355	NC_015428	T	6	6	2436034	2436039	0 %	100 %	0 %	0 %	331702646
47356	NC_015428	GAC	2	6	2436065	2436070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702646
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47358	NC_015428	CCG	2	6	2436181	2436186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331702646
47359	NC_015428	TCCG	2	8	2436279	2436286	0 %	25 %	25 %	50 %	331702646
47360	NC_015428	CATCA	2	10	2436374	2436383	40 %	20 %	0 %	40 %	331702646
47361	NC_015428	TGGA	2	8	2436408	2436415	25 %	25 %	50 %	0 %	331702646
47362	NC_015428	CAC	2	6	2436419	2436424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702646
47363	NC_015428	CTT	2	6	2436431	2436436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702646
47364	NC_015428	TCT	2	6	2436501	2436506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702646
47365	NC_015428	GAT	2	6	2436511	2436516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702646
47366	NC_015428	TTC	2	6	2436614	2436619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702646
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47368	NC_015428	TCA	2	6	2436789	2436794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702646
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47378	NC_015428	CAAT	2	8	2437653	2437660	50 %	25 %	0 %	25 %	331702647
47379	NC_015428	GTA	2	6	2437708	2437713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702647
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47382	NC_015428	TTG	2	6	2437963	2437968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702647
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47386	NC_015428	CGT	2	6	2438148	2438153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702647
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47388	NC_015428	TAA	2	6	2438214	2438219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702647
47389	NC_015428	TCA	2	6	2438321	2438326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702647
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47391	NC_015428	T	6	6	2438356	2438361	0 %	100 %	0 %	0 %	331702647
47392	NC_015428	TTCT	2	8	2438363	2438370	0 %	75 %	0 %	25 %	331702647
47393	NC_015428	TAA	2	6	2438421	2438426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702647
47394	NC_015428	T	6	6	2438494	2438499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47395	NC_015428	ATA	2	6	2438511	2438516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47398	NC_015428	AAG	2	6	2438644	2438649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702648
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47400	NC_015428	AAATT	2	10	2438725	2438734	60 %	40 %	0 %	0 %	331702648
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47404	NC_015428	TGA	2	6	2438945	2438950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702648
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47424	NC_015428	CGTC	2	8	2439984	2439991	0 %	25 %	25 %	50 %	331702648
47425	NC_015428	CAAA	2	8	2440032	2440039	75 %	0 %	0 %	25 %	331702648
47426	NC_015428	GAG	2	6	2440045	2440050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331702648
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47428	NC_015428	GGTT	2	8	2440099	2440106	0 %	50 %	50 %	0 %	331702649
47429	NC_015428	TAT	2	6	2440133	2440138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702649
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47436	NC_015428	TGC	2	6	2440587	2440592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702649
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47446	NC_015428	TCGA	2	8	2441364	2441371	25 %	25 %	25 %	25 %	331702650
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47449	NC_015428	GTT	2	6	2441498	2441503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47450	NC_015428	ATA	2	6	2441517	2441522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47460	NC_015428	GGC	2	6	2442046	2442051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702651
47461	NC_015428	T	7	7	2442075	2442081	0 %	100 %	0 %	0 %	331702651
47462	NC_015428	GCG	2	6	2442087	2442092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702651
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47464	NC_015428	TTCA	2	8	2442229	2442236	25 %	50 %	0 %	25 %	331702651
47465	NC_015428	GGCT	2	8	2442277	2442284	0 %	25 %	50 %	25 %	331702651
47466	NC_015428	TTA	2	6	2442324	2442329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702651
47467	NC_015428	AGC	2	6	2442409	2442414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702651
47468	NC_015428	GCTG	2	8	2442423	2442430	0 %	25 %	50 %	25 %	331702651
47469	NC_015428	TAT	2	6	2442438	2442443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702651
47470	NC_015428	CTT	2	6	2442463	2442468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702651
47471	NC_015428	CAC	2	6	2442483	2442488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702651
47472	NC_015428	CCAG	2	8	2442512	2442519	25 %	0 %	25 %	50 %	331702651
47473	NC_015428	TCA	2	6	2442753	2442758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702651
47474	NC_015428	GCT	2	6	2442842	2442847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702651
47475	NC_015428	ATC	2	6	2442851	2442856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702651
47476	NC_015428	TTGT	2	8	2442875	2442882	0 %	75 %	25 %	0 %	331702651
47477	NC_015428	TTGA	2	8	2442968	2442975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47478	NC_015428	GCA	2	6	2443030	2443035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47479	NC_015428	TAA	2	6	2443085	2443090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47480	NC_015428	TAT	2	6	2443122	2443127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47481	NC_015428	GCA	2	6	2443155	2443160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47482	NC_015428	CAA	2	6	2443166	2443171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47483	NC_015428	T	7	7	2443204	2443210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47484	NC_015428	AAT	2	6	2443232	2443237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702652
47485	NC_015428	CAT	2	6	2443246	2443251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702652
47486	NC_015428	CTGC	2	8	2443357	2443364	0 %	25 %	25 %	50 %	331702652
47487	NC_015428	TCA	3	9	2443488	2443496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702652
47488	NC_015428	CATT	2	8	2443507	2443514	25 %	50 %	0 %	25 %	331702652
47489	NC_015428	ACC	2	6	2443691	2443696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702652
47490	NC_015428	CTG	2	6	2443789	2443794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702652
47491	NC_015428	TCA	2	6	2443882	2443887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702652
47492	NC_015428	TGC	2	6	2443978	2443983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702652
47493	NC_015428	GCC	2	6	2443988	2443993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331702652
47494	NC_015428	TTGG	2	8	2444051	2444058	0 %	50 %	50 %	0 %	331702652
47495	NC_015428	ATA	2	6	2444136	2444141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702652
47496	NC_015428	TCC	2	6	2444145	2444150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47497	NC_015428	AAGT	2	8	2444198	2444205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47498	NC_015428	ATG	2	6	2444327	2444332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702653
47499	NC_015428	ATT	2	6	2444351	2444356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702653
47500	NC_015428	CGT	2	6	2444473	2444478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702653

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