MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015214	ATATG	2	10	189275	189284	40 %	40 %	20 %	0 %	325955900
4002	NC_015214	ATAA	2	8	189343	189350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015214	ATA	2	6	189401	189406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015214	GAA	2	6	189441	189446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955901
4005	NC_015214	GCAA	2	8	189511	189518	50 %	0 %	25 %	25 %	325955901
4006	NC_015214	CAA	2	6	189645	189650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955901
4007	NC_015214	CAAG	2	8	189668	189675	50 %	0 %	25 %	25 %	325955901
4008	NC_015214	TATTT	2	10	189683	189692	20 %	80 %	0 %	0 %	325955901
4009	NC_015214	TAT	2	6	189706	189711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955901
4010	NC_015214	AGT	2	6	189786	189791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955901
4011	NC_015214	AAG	2	6	189799	189804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955901
4012	NC_015214	ATG	2	6	189812	189817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955901
4013	NC_015214	ATC	2	6	189821	189826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955901
4014	NC_015214	GTG	2	6	189842	189847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955901
4015	NC_015214	A	6	6	190046	190051	100 %	0 %	0 %	0 %	325955901
4016	NC_015214	ATTCC	2	10	190288	190297	20 %	40 %	0 %	40 %	325955901
4017	NC_015214	CAA	2	6	190337	190342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955901
4018	NC_015214	TACC	2	8	190509	190516	25 %	25 %	0 %	50 %	325955901
4019	NC_015214	ATTAA	2	10	190529	190538	60 %	40 %	0 %	0 %	325955901
4020	NC_015214	GGT	2	6	190665	190670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015214	GTGG	2	8	190710	190717	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015214	GAT	2	6	190731	190736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015214	GTC	2	6	190742	190747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015214	T	6	6	190773	190778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015214	AGA	2	6	190813	190818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4026	NC_015214	GGCGC	2	10	190827	190836	0 %	0 %	60 %	40 %	325955902
4027	NC_015214	CAA	2	6	190844	190849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955902
4028	NC_015214	GAA	2	6	190856	190861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4029	NC_015214	AAG	2	6	190868	190873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4030	NC_015214	GAT	2	6	190889	190894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955902
4031	NC_015214	GGT	3	9	191012	191020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955902
4032	NC_015214	TTC	2	6	191064	191069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955902
4033	NC_015214	CTG	2	6	191073	191078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955902
4034	NC_015214	GAA	2	6	191096	191101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4035	NC_015214	GAA	2	6	191119	191124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4036	NC_015214	GTT	2	6	191125	191130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955902
4037	NC_015214	CTT	2	6	191194	191199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955902
4038	NC_015214	AAC	2	6	191228	191233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955902
4039	NC_015214	CAA	2	6	191239	191244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955902
4040	NC_015214	TGT	2	6	191248	191253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955902
4041	NC_015214	TTCA	2	8	191278	191285	25 %	50 %	0 %	25 %	325955902
4042	NC_015214	TGG	2	6	191362	191367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955902
4043	NC_015214	CCATT	2	10	191451	191460	20 %	40 %	0 %	40 %	325955902
4044	NC_015214	TGG	2	6	191500	191505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955902
4045	NC_015214	GTT	2	6	191582	191587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955902
4046	NC_015214	GAA	2	6	191621	191626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4047	NC_015214	TGC	2	6	191671	191676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955902
4048	NC_015214	GAA	2	6	191693	191698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4049	NC_015214	GTTC	2	8	191707	191714	0 %	50 %	25 %	25 %	325955902
4050	NC_015214	GAAG	2	8	191731	191738	50 %	0 %	50 %	0 %	325955902
4051	NC_015214	GAA	2	6	191812	191817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4052	NC_015214	AGA	2	6	191847	191852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955902
4053	NC_015214	CTT	2	6	191863	191868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955902
4054	NC_015214	AAT	2	6	192051	192056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955902
4055	NC_015214	AT	3	6	192062	192067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015214	T	7	7	192114	192120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015214	T	6	6	192124	192129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015214	A	6	6	192147	192152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015214	T	6	6	192155	192160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015214	AAATT	2	10	192173	192182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015214	TAA	2	6	192234	192239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015214	A	6	6	192299	192304	100 %	0 %	0 %	0 %	325955903
4063	NC_015214	TTA	2	6	192333	192338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955903
4064	NC_015214	CAA	2	6	192476	192481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955903
4065	NC_015214	TCG	2	6	192505	192510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955903
4066	NC_015214	AAG	2	6	192539	192544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955903
4067	NC_015214	T	6	6	192575	192580	0 %	100 %	0 %	0 %	325955903
4068	NC_015214	CTG	2	6	192621	192626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955903
4069	NC_015214	AAG	3	9	192767	192775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955903
4070	NC_015214	AAC	2	6	192792	192797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955903
4071	NC_015214	TAA	2	6	192811	192816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955903
4072	NC_015214	GAC	2	6	192872	192877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955903
4073	NC_015214	TGC	2	6	192882	192887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955903
4074	NC_015214	ATT	2	6	192923	192928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955903
4075	NC_015214	GCT	2	6	192947	192952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955903
4076	NC_015214	AATG	2	8	192958	192965	50 %	25 %	25 %	0 %	325955903
4077	NC_015214	GCAA	2	8	192981	192988	50 %	0 %	25 %	25 %	325955903
4078	NC_015214	ATCT	2	8	193053	193060	25 %	50 %	0 %	25 %	325955903
4079	NC_015214	TAT	2	6	193091	193096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955903
4080	NC_015214	CTT	2	6	193110	193115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955903
4081	NC_015214	AG	3	6	193132	193137	50 %	0 %	50 %	0 %	325955903
4082	NC_015214	ATTC	2	8	193159	193166	25 %	50 %	0 %	25 %	325955903
4083	NC_015214	ACT	2	6	193188	193193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955903
4084	NC_015214	CT	3	6	193192	193197	0 %	50 %	0 %	50 %	325955903
4085	NC_015214	CAA	2	6	193199	193204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955903
4086	NC_015214	CATTGA	2	12	193207	193218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325955903
4087	NC_015214	AAGA	2	8	193240	193247	75 %	0 %	25 %	0 %	325955903
4088	NC_015214	TTA	2	6	193331	193336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_015214	T	6	6	193355	193360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015214	AAT	2	6	193396	193401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015214	TTATT	2	10	193420	193429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015214	TGTCGG	2	12	193485	193496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325955904
4093	NC_015214	GTG	2	6	193499	193504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955904
4094	NC_015214	TTCA	2	8	193518	193525	25 %	50 %	0 %	25 %	325955904
4095	NC_015214	GTT	2	6	193552	193557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955904
4096	NC_015214	AAG	2	6	193651	193656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955904
4097	NC_015214	AAG	2	6	193705	193710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955904
4098	NC_015214	AAG	2	6	193720	193725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955904
4099	NC_015214	CAA	2	6	193737	193742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955904
4100	NC_015214	GTT	2	6	193768	193773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955904
4101	NC_015214	ACT	2	6	193798	193803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_015214	TAA	2	6	193812	193817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015214	A	7	7	193862	193868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015214	TTGTCT	2	12	193891	193902	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4105	NC_015214	T	6	6	193902	193907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015214	CGC	2	6	193921	193926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_015214	CCG	2	6	193948	193953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_015214	AGG	3	9	193959	193967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015214	T	7	7	193994	194000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015214	AAT	2	6	194010	194015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015214	ATG	2	6	194022	194027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015214	TGAT	2	8	194037	194044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015214	TGT	2	6	194152	194157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955905
4114	NC_015214	TAA	2	6	194158	194163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955905
4115	NC_015214	AAC	2	6	194186	194191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955905
4116	NC_015214	GTT	2	6	194278	194283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955905
4117	NC_015214	GAA	2	6	194332	194337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955905
4118	NC_015214	TC	3	6	194346	194351	0 %	50 %	0 %	50 %	325955905
4119	NC_015214	T	7	7	194363	194369	0 %	100 %	0 %	0 %	325955905
4120	NC_015214	ATA	2	6	194403	194408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955905
4121	NC_015214	CTG	2	6	194418	194423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955905
4122	NC_015214	TGA	2	6	194434	194439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955905
4123	NC_015214	TGG	2	6	194479	194484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955905
4124	NC_015214	CAA	2	6	194563	194568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955905
4125	NC_015214	TGGTT	2	10	194614	194623	0 %	60 %	40 %	0 %	325955905
4126	NC_015214	AAGAA	2	10	194640	194649	80 %	0 %	20 %	0 %	325955905
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4247	NC_015214	TTTA	2	8	200910	200917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_015214	A	6	6	200985	200990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_015214	T	6	6	201037	201042	0 %	100 %	0 %	0 %	325955910
4252	NC_015214	TCT	2	6	201082	201087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955910
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4254	NC_015214	CAT	2	6	201152	201157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955910
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4258	NC_015214	CAACTG	2	12	201397	201408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325955910
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4322	NC_015214	TGA	2	6	204018	204023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955912
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4324	NC_015214	GCA	2	6	204058	204063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4325	NC_015214	A	7	7	204083	204089	100 %	0 %	0 %	0 %	325955913
4326	NC_015214	TGA	2	6	204156	204161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955913
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4343	NC_015214	TC	3	6	205035	205040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4344	NC_015214	TAAA	2	8	205041	205048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_015214	A	6	6	205046	205051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4346	NC_015214	TATT	2	8	205098	205105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4347	NC_015214	AAT	2	6	205109	205114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4348	NC_015214	GGAT	2	8	205151	205158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4349	NC_015214	T	7	7	205178	205184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4350	NC_015214	ATTT	2	8	205196	205203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4351	NC_015214	TAAA	2	8	205251	205258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4352	NC_015214	GACTT	2	10	205369	205378	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4353	NC_015214	GTC	2	6	205413	205418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4354	NC_015214	GCT	2	6	205474	205479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955914
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4356	NC_015214	ATA	2	6	205627	205632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955914
4357	NC_015214	AGT	2	6	205656	205661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955914
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4359	NC_015214	GTTTCT	2	12	205785	205796	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325955914
4360	NC_015214	ACT	2	6	205810	205815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955914
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4363	NC_015214	CTT	2	6	205949	205954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955914
4364	NC_015214	T	6	6	205953	205958	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
4365	NC_015214	CTGC	2	8	205968	205975	0 %	25 %	25 %	50 %	325955914
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4368	NC_015214	T	6	6	206182	206187	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
4369	NC_015214	AAGC	2	8	206223	206230	50 %	0 %	25 %	25 %	325955914
4370	NC_015214	T	6	6	206388	206393	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
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4372	NC_015214	AAT	2	6	206539	206544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955914
4373	NC_015214	ATT	2	6	206547	206552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955914
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4482	NC_015214	TGTT	2	8	211426	211433	0 %	75 %	25 %	0 %	325955920
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4485	NC_015214	A	6	6	211646	211651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4486	NC_015214	TAA	2	6	211659	211664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_015214	AAG	2	6	211676	211681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4488	NC_015214	TTA	2	6	211698	211703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955921
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4490	NC_015214	ACT	2	6	211888	211893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955921
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4493	NC_015214	TAC	2	6	211971	211976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955921
4494	NC_015214	GAAA	2	8	212004	212011	75 %	0 %	25 %	0 %	325955921
4495	NC_015214	ATTCC	2	10	212053	212062	20 %	40 %	0 %	40 %	325955921
4496	NC_015214	TAT	2	6	212123	212128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955921
4497	NC_015214	ACA	2	6	212200	212205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955921
4498	NC_015214	CCA	2	6	212238	212243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955921
4499	NC_015214	GTC	2	6	212254	212259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955921
4500	NC_015214	TGA	2	6	212321	212326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955921

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