MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_015214	TCT	2	6	2063378	2063383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957747
44002	NC_015214	TGA	2	6	2063413	2063418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957747
44003	NC_015214	TCA	2	6	2063470	2063475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957747
44004	NC_015214	GATC	2	8	2063593	2063600	25 %	25 %	25 %	25 %	325957747
44005	NC_015214	TATT	2	8	2063653	2063660	25 %	75 %	0 %	0 %	325957747
44006	NC_015214	AAT	2	6	2063888	2063893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957747
44007	NC_015214	AG	3	6	2063950	2063955	50 %	0 %	50 %	0 %	325957747
44008	NC_015214	TTTA	2	8	2063971	2063978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_015214	TG	3	6	2063987	2063992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44010	NC_015214	T	6	6	2064026	2064031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44011	NC_015214	A	6	6	2064037	2064042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44012	NC_015214	ATAG	2	8	2064063	2064070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44013	NC_015214	TCA	2	6	2064072	2064077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44014	NC_015214	T	6	6	2064128	2064133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44015	NC_015214	TAT	2	6	2064149	2064154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44016	NC_015214	ATT	2	6	2064168	2064173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44017	NC_015214	TTA	2	6	2064175	2064180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44018	NC_015214	TTA	2	6	2064225	2064230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44019	NC_015214	T	6	6	2064272	2064277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44020	NC_015214	GTT	2	6	2064283	2064288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44021	NC_015214	TG	3	6	2064332	2064337	0 %	50 %	50 %	0 %	325957748
44022	NC_015214	TCT	2	6	2064420	2064425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957748
44023	NC_015214	T	6	6	2064451	2064456	0 %	100 %	0 %	0 %	325957748
44024	NC_015214	ATA	2	6	2064463	2064468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957748
44025	NC_015214	CAA	2	6	2064618	2064623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957748
44026	NC_015214	AT	3	6	2064721	2064726	50 %	50 %	0 %	0 %	325957748
44027	NC_015214	TAC	2	6	2064843	2064848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957748
44028	NC_015214	TTC	2	6	2065126	2065131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957748
44029	NC_015214	ATA	2	6	2065132	2065137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957748
44030	NC_015214	ATTGA	2	10	2065201	2065210	40 %	40 %	20 %	0 %	325957748
44031	NC_015214	TAT	2	6	2065248	2065253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957748
44032	NC_015214	ATT	2	6	2065261	2065266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957748
44033	NC_015214	CTT	2	6	2065276	2065281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957748
44034	NC_015214	TAC	2	6	2065480	2065485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957748
44035	NC_015214	AGA	2	6	2065495	2065500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957748
44036	NC_015214	ATA	2	6	2065526	2065531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957748
44037	NC_015214	TCA	2	6	2065539	2065544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957748
44038	NC_015214	TTAC	2	8	2065667	2065674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44039	NC_015214	A	6	6	2065688	2065693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44040	NC_015214	TTTTA	2	10	2065722	2065731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44041	NC_015214	CTT	2	6	2065800	2065805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957749
44042	NC_015214	TCTT	2	8	2065807	2065814	0 %	75 %	0 %	25 %	325957749
44043	NC_015214	TTC	2	6	2065845	2065850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957749
44044	NC_015214	TCT	2	6	2065871	2065876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957749
44045	NC_015214	TA	3	6	2065977	2065982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44046	NC_015214	A	6	6	2065982	2065987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44047	NC_015214	ATC	2	6	2066044	2066049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957750
44048	NC_015214	CAT	3	9	2066144	2066152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957750
44049	NC_015214	ATT	2	6	2066212	2066217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957750
44050	NC_015214	TCT	2	6	2066221	2066226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957750
44051	NC_015214	TTC	2	6	2066232	2066237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957750
44052	NC_015214	TC	3	6	2066355	2066360	0 %	50 %	0 %	50 %	325957750
44053	NC_015214	TCA	3	9	2066455	2066463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957750
44054	NC_015214	TCA	2	6	2066503	2066508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957750
44055	NC_015214	AAAT	2	8	2066521	2066528	75 %	25 %	0 %	0 %	325957750
44056	NC_015214	TAAT	2	8	2066725	2066732	50 %	50 %	0 %	0 %	325957750
44057	NC_015214	GTA	2	6	2066874	2066879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957750
44058	NC_015214	TAT	2	6	2066894	2066899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957750
44059	NC_015214	TCT	2	6	2066920	2066925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957750
44060	NC_015214	TAA	2	6	2066927	2066932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957750
44061	NC_015214	ACC	2	6	2066940	2066945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957750
44062	NC_015214	ATG	2	6	2066988	2066993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957750
44063	NC_015214	AAT	2	6	2067000	2067005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957750
44064	NC_015214	ATA	2	6	2067015	2067020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957750
44065	NC_015214	TCCA	2	8	2067054	2067061	25 %	25 %	0 %	50 %	325957750
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44067	NC_015214	A	6	6	2067172	2067177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44068	NC_015214	GCC	2	6	2067194	2067199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44069	NC_015214	CGC	2	6	2067299	2067304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957751
44070	NC_015214	AAT	2	6	2067309	2067314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957751
44071	NC_015214	ATC	2	6	2067372	2067377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957751
44072	NC_015214	GCT	2	6	2067480	2067485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957751
44073	NC_015214	GCC	2	6	2067525	2067530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957751
44074	NC_015214	AGT	2	6	2067532	2067537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957751
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44077	NC_015214	AACC	2	8	2067596	2067603	50 %	0 %	0 %	50 %	325957751
44078	NC_015214	AAT	2	6	2067618	2067623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957751
44079	NC_015214	GCA	2	6	2067649	2067654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957751
44080	NC_015214	TAA	2	6	2067705	2067710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957751
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44082	NC_015214	GTA	2	6	2067837	2067842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957751
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44084	NC_015214	AAT	2	6	2068083	2068088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957751
44085	NC_015214	AAT	2	6	2068118	2068123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957751
44086	NC_015214	CTT	2	6	2068238	2068243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957751
44087	NC_015214	TTG	2	6	2068373	2068378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957751
44088	NC_015214	AGG	2	6	2068391	2068396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957751
44089	NC_015214	GCC	2	6	2068440	2068445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957751
44090	NC_015214	CCA	2	6	2068528	2068533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957751
44091	NC_015214	TGA	2	6	2068621	2068626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957751
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44093	NC_015214	CGA	2	6	2068712	2068717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957751
44094	NC_015214	T	6	6	2068849	2068854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_015214	ATT	2	6	2068873	2068878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957752
44096	NC_015214	TTC	2	6	2068880	2068885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957752
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44098	NC_015214	GATT	2	8	2068994	2069001	25 %	50 %	25 %	0 %	325957752
44099	NC_015214	AGT	2	6	2069005	2069010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957752
44100	NC_015214	TGC	2	6	2069015	2069020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957752
44101	NC_015214	ATG	2	6	2069077	2069082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957752
44102	NC_015214	CTT	2	6	2069138	2069143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957752
44103	NC_015214	AGC	2	6	2069255	2069260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957752
44104	NC_015214	GTTT	2	8	2069406	2069413	0 %	75 %	25 %	0 %	325957752
44105	NC_015214	ATG	2	6	2069535	2069540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957752
44106	NC_015214	ATC	2	6	2069555	2069560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957752
44107	NC_015214	TAAG	2	8	2069594	2069601	50 %	25 %	25 %	0 %	325957752
44108	NC_015214	ATG	2	6	2069706	2069711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957752
44109	NC_015214	CTT	2	6	2069791	2069796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957752
44110	NC_015214	AGC	2	6	2069804	2069809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957752
44111	NC_015214	CTT	2	6	2069845	2069850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957752
44112	NC_015214	CAC	2	6	2069854	2069859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957752
44113	NC_015214	CTT	2	6	2069890	2069895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957752
44114	NC_015214	CAC	2	6	2069896	2069901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957752
44115	NC_015214	ACG	2	6	2069954	2069959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957752
44116	NC_015214	ACC	2	6	2069984	2069989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957752
44117	NC_015214	TCA	2	6	2070042	2070047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957752
44118	NC_015214	TTC	2	6	2070110	2070115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957752
44119	NC_015214	CTGAAA	2	12	2070193	2070204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325957752
44120	NC_015214	TTG	2	6	2070269	2070274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957752
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44234	NC_015214	CAT	2	6	2075419	2075424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957755
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.