MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015214	TCAT	2	8	2016841	2016848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43002	NC_015214	CTC	2	6	2016854	2016859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43003	NC_015214	TAA	2	6	2016875	2016880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_015214	CCTTTT	2	12	2016901	2016912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43005	NC_015214	T	6	6	2016909	2016914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43006	NC_015214	TTAG	2	8	2016926	2016933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43007	NC_015214	GAA	2	6	2016978	2016983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957702
43008	NC_015214	AAG	2	6	2017030	2017035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957702
43009	NC_015214	AGATAA	2	12	2017100	2017111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325957702
43010	NC_015214	AGT	2	6	2017115	2017120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957702
43011	NC_015214	ATAAA	2	10	2017231	2017240	80 %	20 %	0 %	0 %	325957702
43012	NC_015214	TTG	2	6	2017243	2017248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957702
43013	NC_015214	CGT	2	6	2017301	2017306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957702
43014	NC_015214	GAT	2	6	2017308	2017313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957702
43015	NC_015214	TCT	2	6	2017331	2017336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957702
43016	NC_015214	CA	3	6	2017377	2017382	50 %	0 %	0 %	50 %	325957702
43017	NC_015214	A	6	6	2017405	2017410	100 %	0 %	0 %	0 %	325957702
43018	NC_015214	T	6	6	2017453	2017458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43019	NC_015214	TAA	2	6	2017462	2017467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43020	NC_015214	TAA	2	6	2017472	2017477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43021	NC_015214	AGAA	2	8	2017500	2017507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43022	NC_015214	AGTAA	2	10	2017523	2017532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43023	NC_015214	CTG	2	6	2017535	2017540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43024	NC_015214	TAA	2	6	2017603	2017608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957703
43025	NC_015214	T	6	6	2017614	2017619	0 %	100 %	0 %	0 %	325957703
43026	NC_015214	TAC	2	6	2017649	2017654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43027	NC_015214	ATT	2	6	2017689	2017694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957703
43028	NC_015214	CTA	2	6	2017804	2017809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43029	NC_015214	CAA	2	6	2017817	2017822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957703
43030	NC_015214	GAT	2	6	2017838	2017843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957703
43031	NC_015214	TGG	2	6	2017859	2017864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957703
43032	NC_015214	CAA	2	6	2017943	2017948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957703
43033	NC_015214	CAA	2	6	2018025	2018030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957703
43034	NC_015214	ATC	2	6	2018049	2018054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43035	NC_015214	AAG	2	6	2018182	2018187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957703
43036	NC_015214	TCA	2	6	2018229	2018234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43037	NC_015214	TCATT	2	10	2018293	2018302	20 %	60 %	0 %	20 %	325957703
43038	NC_015214	ATT	2	6	2018304	2018309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957703
43039	NC_015214	CTA	2	6	2018341	2018346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43040	NC_015214	ATT	2	6	2018445	2018450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957703
43041	NC_015214	CTTTTG	2	12	2018494	2018505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325957703
43042	NC_015214	AGA	2	6	2018561	2018566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957703
43043	NC_015214	GCT	2	6	2018598	2018603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957703
43044	NC_015214	AAC	2	6	2018611	2018616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957703
43045	NC_015214	CTA	2	6	2018653	2018658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43046	NC_015214	ACT	2	6	2018697	2018702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43047	NC_015214	CTG	2	6	2018800	2018805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957703
43048	NC_015214	ATG	2	6	2018919	2018924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957703
43049	NC_015214	CCG	2	6	2019097	2019102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957703
43050	NC_015214	CTG	2	6	2019139	2019144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957703
43051	NC_015214	ATC	2	6	2019270	2019275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43052	NC_015214	AATT	2	8	2019280	2019287	50 %	50 %	0 %	0 %	325957703
43053	NC_015214	CTT	2	6	2019366	2019371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957703
43054	NC_015214	ACT	2	6	2019378	2019383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957703
43055	NC_015214	A	8	8	2019430	2019437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43056	NC_015214	ATTT	2	8	2019462	2019469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43057	NC_015214	CTT	2	6	2019512	2019517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43058	NC_015214	AAG	2	6	2019524	2019529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43059	NC_015214	T	6	6	2019540	2019545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43060	NC_015214	AATT	2	8	2019587	2019594	50 %	50 %	0 %	0 %	325957704
43061	NC_015214	GAC	2	6	2019606	2019611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957704
43062	NC_015214	ATT	2	6	2019627	2019632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957704
43063	NC_015214	CAG	2	6	2019650	2019655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957704
43064	NC_015214	TTA	2	6	2019682	2019687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957704
43065	NC_015214	GACTTG	2	12	2019787	2019798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325957704
43066	NC_015214	TGGCGT	2	12	2019834	2019845	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325957704
43067	NC_015214	GTT	2	6	2019856	2019861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957704
43068	NC_015214	CTT	2	6	2019882	2019887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957704
43069	NC_015214	AAG	2	6	2019968	2019973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957704
43070	NC_015214	TGA	2	6	2020026	2020031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957704
43071	NC_015214	GTA	2	6	2020042	2020047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957704
43072	NC_015214	CAC	2	6	2020062	2020067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957704
43073	NC_015214	GGT	2	6	2020081	2020086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957704
43074	NC_015214	TAAC	2	8	2020097	2020104	50 %	25 %	0 %	25 %	325957704
43075	NC_015214	TTC	2	6	2020108	2020113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957704
43076	NC_015214	TCG	2	6	2020142	2020147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957704
43077	NC_015214	TTG	2	6	2020274	2020279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957704
43078	NC_015214	CCG	2	6	2020286	2020291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957704
43079	NC_015214	TTC	2	6	2020303	2020308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957704
43080	NC_015214	GGT	2	6	2020309	2020314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957704
43081	NC_015214	AAG	2	6	2020343	2020348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957704
43082	NC_015214	TCT	2	6	2020354	2020359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957704
43083	NC_015214	TTC	2	6	2020396	2020401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957704
43084	NC_015214	CTT	2	6	2020434	2020439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957704
43085	NC_015214	TCA	2	6	2020454	2020459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957704
43086	NC_015214	GTG	2	6	2020574	2020579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957704
43087	NC_015214	T	6	6	2020766	2020771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43088	NC_015214	A	6	6	2020820	2020825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43089	NC_015214	GCG	2	6	2020832	2020837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43090	NC_015214	T	6	6	2020868	2020873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43091	NC_015214	GTCT	2	8	2020913	2020920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43092	NC_015214	A	7	7	2021012	2021018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43093	NC_015214	GCT	2	6	2021021	2021026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43094	NC_015214	TTAT	2	8	2021048	2021055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43095	NC_015214	A	6	6	2021064	2021069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43096	NC_015214	GTC	2	6	2021082	2021087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43097	NC_015214	T	6	6	2021132	2021137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43098	NC_015214	CAAT	2	8	2021171	2021178	50 %	25 %	0 %	25 %	325957705
43099	NC_015214	TCA	2	6	2021247	2021252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957705
43100	NC_015214	ATTT	2	8	2021254	2021261	25 %	75 %	0 %	0 %	325957705
43101	NC_015214	CTG	2	6	2021308	2021313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957705
43102	NC_015214	TCA	2	6	2021371	2021376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957705
43103	NC_015214	TAC	2	6	2021395	2021400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957705
43104	NC_015214	GAT	2	6	2021437	2021442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957705
43105	NC_015214	AAT	2	6	2021507	2021512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957705
43106	NC_015214	TGC	2	6	2021545	2021550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957705
43107	NC_015214	CTAAT	2	10	2021668	2021677	40 %	40 %	0 %	20 %	325957706
43108	NC_015214	TCGA	2	8	2021682	2021689	25 %	25 %	25 %	25 %	325957706
43109	NC_015214	TTA	2	6	2021733	2021738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957706
43110	NC_015214	CTC	2	6	2021776	2021781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957706
43111	NC_015214	TCA	2	6	2021824	2021829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957707
43112	NC_015214	AT	3	6	2021834	2021839	50 %	50 %	0 %	0 %	325957707
43113	NC_015214	TGG	2	6	2021891	2021896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957707
43114	NC_015214	TAA	2	6	2021926	2021931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957707
43115	NC_015214	TGA	2	6	2021936	2021941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957707
43116	NC_015214	AG	3	6	2021966	2021971	50 %	0 %	50 %	0 %	325957707
43117	NC_015214	TCA	2	6	2021981	2021986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957707
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43119	NC_015214	TCA	2	6	2022306	2022311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957707
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43332	NC_015214	TTTA	2	8	2032572	2032579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43333	NC_015214	GAG	2	6	2032628	2032633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43350	NC_015214	TTG	2	6	2033538	2033543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957718
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