MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_015214	AT	4	8	1504820	1504827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32003	NC_015214	TAC	2	6	1504829	1504834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32004	NC_015214	TAA	2	6	1504862	1504867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32005	NC_015214	TTA	2	6	1504888	1504893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957188
32006	NC_015214	ATT	2	6	1504945	1504950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957188
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32008	NC_015214	TCG	2	6	1504976	1504981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957188
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32010	NC_015214	TC	3	6	1505033	1505038	0 %	50 %	0 %	50 %	325957188
32011	NC_015214	TGCT	2	8	1505113	1505120	0 %	50 %	25 %	25 %	325957188
32012	NC_015214	TTC	2	6	1505131	1505136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957188
32013	NC_015214	TAT	2	6	1505212	1505217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32016	NC_015214	TTTTA	2	10	1505257	1505266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32017	NC_015214	ATC	2	6	1505314	1505319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32022	NC_015214	ATT	2	6	1505538	1505543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957189
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32219	NC_015214	AATA	2	8	1514778	1514785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32234	NC_015214	CA	3	6	1515203	1515208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32235	NC_015214	A	6	6	1515208	1515213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32236	NC_015214	TAGTTT	2	12	1515224	1515235	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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32238	NC_015214	AAT	2	6	1515303	1515308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32356	NC_015214	TCAA	2	8	1521096	1521103	50 %	25 %	0 %	25 %	325957208
32357	NC_015214	GTC	2	6	1521163	1521168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957208
32358	NC_015214	CTC	2	6	1521176	1521181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957208
32359	NC_015214	TTG	2	6	1521388	1521393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957208
32360	NC_015214	ATC	2	6	1521404	1521409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957208
32361	NC_015214	AATCT	2	10	1521432	1521441	40 %	40 %	0 %	20 %	325957208
32362	NC_015214	TAC	2	6	1521458	1521463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957208
32363	NC_015214	TAT	2	6	1521702	1521707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32364	NC_015214	AT	3	6	1521720	1521725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32365	NC_015214	AAACA	2	10	1521779	1521788	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32366	NC_015214	GAT	2	6	1521805	1521810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32367	NC_015214	AGT	2	6	1521821	1521826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32368	NC_015214	ATG	2	6	1521894	1521899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32369	NC_015214	AGC	2	6	1522078	1522083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957209
32370	NC_015214	TGA	2	6	1522125	1522130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957209
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32372	NC_015214	ATG	2	6	1522279	1522284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957209
32373	NC_015214	AAAG	2	8	1522301	1522308	75 %	0 %	25 %	0 %	325957209
32374	NC_015214	CAAAG	2	10	1522405	1522414	60 %	0 %	20 %	20 %	325957209
32375	NC_015214	ACT	2	6	1522556	1522561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957209
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32377	NC_015214	ATC	2	6	1522621	1522626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957209
32378	NC_015214	CTT	2	6	1522629	1522634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957209
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32380	NC_015214	GCTC	2	8	1522821	1522828	0 %	25 %	25 %	50 %	325957209
32381	NC_015214	AAC	2	6	1522924	1522929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957209
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32383	NC_015214	TCT	2	6	1523128	1523133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957209
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32385	NC_015214	ATT	2	6	1523178	1523183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957209
32386	NC_015214	TTAA	2	8	1523200	1523207	50 %	50 %	0 %	0 %	325957209
32387	NC_015214	TA	3	6	1523219	1523224	50 %	50 %	0 %	0 %	325957209
32388	NC_015214	T	6	6	1523297	1523302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32389	NC_015214	AAAAT	2	10	1523395	1523404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32390	NC_015214	A	6	6	1523441	1523446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32391	NC_015214	TAA	2	6	1523478	1523483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957210
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32403	NC_015214	ATT	2	6	1524028	1524033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32404	NC_015214	T	6	6	1524036	1524041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32405	NC_015214	TA	4	8	1524046	1524053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32406	NC_015214	ATA	2	6	1524133	1524138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32427	NC_015214	CCAAG	2	10	1525226	1525235	40 %	0 %	20 %	40 %	325957211
32428	NC_015214	TAAA	2	8	1525236	1525243	75 %	25 %	0 %	0 %	325957211
32429	NC_015214	T	6	6	1525280	1525285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32430	NC_015214	A	6	6	1525307	1525312	100 %	0 %	0 %	0 %	325957212
32431	NC_015214	TGA	2	6	1525449	1525454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957212
32432	NC_015214	TC	3	6	1525459	1525464	0 %	50 %	0 %	50 %	325957212
32433	NC_015214	GCTT	2	8	1525467	1525474	0 %	50 %	25 %	25 %	325957212
32434	NC_015214	GCT	2	6	1525535	1525540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957212
32435	NC_015214	A	6	6	1525541	1525546	100 %	0 %	0 %	0 %	325957212
32436	NC_015214	GCTC	2	8	1525579	1525586	0 %	25 %	25 %	50 %	325957212
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32438	NC_015214	A	6	6	1525655	1525660	100 %	0 %	0 %	0 %	325957212
32439	NC_015214	TGA	2	6	1525714	1525719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957212
32440	NC_015214	CAA	3	9	1525745	1525753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957212
32441	NC_015214	TGA	2	6	1525804	1525809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957212
32442	NC_015214	ATT	2	6	1525889	1525894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957212
32443	NC_015214	AAG	2	6	1525985	1525990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957212
32444	NC_015214	CAA	2	6	1526000	1526005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957212
32445	NC_015214	TGGT	2	8	1526019	1526026	0 %	50 %	50 %	0 %	325957212
32446	NC_015214	GAAAT	2	10	1526036	1526045	60 %	20 %	20 %	0 %	325957212
32447	NC_015214	A	6	6	1526051	1526056	100 %	0 %	0 %	0 %	325957212
32448	NC_015214	AAAG	2	8	1526105	1526112	75 %	0 %	25 %	0 %	325957212
32449	NC_015214	ATT	2	6	1526255	1526260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957212
32450	NC_015214	AAAGAT	2	12	1526261	1526272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325957212
32451	NC_015214	CCA	2	6	1526286	1526291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957212
32452	NC_015214	CCG	2	6	1526325	1526330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957212
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32457	NC_015214	GAAA	2	8	1526561	1526568	75 %	0 %	25 %	0 %	325957212
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32459	NC_015214	ATT	2	6	1526641	1526646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957212
32460	NC_015214	CAT	2	6	1526735	1526740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957212
32461	NC_015214	ACC	2	6	1526774	1526779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957212
32462	NC_015214	GAA	2	6	1526812	1526817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957212
32463	NC_015214	AAT	2	6	1526909	1526914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957213
32464	NC_015214	CTT	2	6	1527021	1527026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957213
32465	NC_015214	TTC	2	6	1527066	1527071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957213
32466	NC_015214	CAAGCT	2	12	1527090	1527101	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325957213
32467	NC_015214	GTTTG	2	10	1527117	1527126	0 %	60 %	40 %	0 %	325957213
32468	NC_015214	GCA	2	6	1527308	1527313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957213
32469	NC_015214	TAC	2	6	1527347	1527352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957213
32470	NC_015214	ATT	2	6	1527444	1527449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957213
32471	NC_015214	ATT	2	6	1527453	1527458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957213
32472	NC_015214	TGA	2	6	1527472	1527477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957213
32473	NC_015214	TGG	2	6	1527605	1527610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957213
32474	NC_015214	ACT	2	6	1527640	1527645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957213
32475	NC_015214	AGT	2	6	1527657	1527662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957213
32476	NC_015214	TTGG	2	8	1527670	1527677	0 %	50 %	50 %	0 %	325957213
32477	NC_015214	ATT	2	6	1527695	1527700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957213
32478	NC_015214	TGC	2	6	1527731	1527736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957213
32479	NC_015214	TGG	2	6	1527761	1527766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957213
32480	NC_015214	CGC	2	6	1527821	1527826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957213
32481	NC_015214	CAT	2	6	1527827	1527832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957213
32482	NC_015214	CTT	2	6	1527833	1527838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957213
32483	NC_015214	AG	3	6	1527895	1527900	50 %	0 %	50 %	0 %	325957213
32484	NC_015214	TAA	2	6	1527917	1527922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957213
32485	NC_015214	AAG	2	6	1527955	1527960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957213
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32487	NC_015214	TTC	2	6	1528003	1528008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957214
32488	NC_015214	CTC	2	6	1528026	1528031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957214
32489	NC_015214	GGT	2	6	1528049	1528054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957214
32490	NC_015214	TAT	2	6	1528099	1528104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957214
32491	NC_015214	ATT	2	6	1528127	1528132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957214
32492	NC_015214	TAACC	2	10	1528135	1528144	40 %	20 %	0 %	40 %	325957214
32493	NC_015214	CAT	2	6	1528261	1528266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957214
32494	NC_015214	CTC	2	6	1528293	1528298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957214
32495	NC_015214	TTC	2	6	1528418	1528423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957214
32496	NC_015214	CAT	2	6	1528453	1528458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957214
32497	NC_015214	GTTC	2	8	1528477	1528484	0 %	50 %	25 %	25 %	325957214
32498	NC_015214	GGT	2	6	1528616	1528621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957214
32499	NC_015214	TTG	2	6	1528668	1528673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957214
32500	NC_015214	GCT	2	6	1528694	1528699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957214

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