MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_015214	A	7	7	1453827	1453833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31002	NC_015214	TAT	2	6	1453858	1453863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31003	NC_015214	A	7	7	1453866	1453872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31004	NC_015214	GC	4	8	1453873	1453880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31005	NC_015214	T	7	7	1453911	1453917	0 %	100 %	0 %	0 %	325957138
31006	NC_015214	GTA	3	9	1453958	1453966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957138
31007	NC_015214	TTGC	2	8	1454103	1454110	0 %	50 %	25 %	25 %	325957138
31008	NC_015214	GTA	2	6	1454177	1454182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957138
31009	NC_015214	TAA	2	6	1454193	1454198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957138
31010	NC_015214	GTA	2	6	1454204	1454209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957138
31011	NC_015214	CTT	2	6	1454228	1454233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957138
31012	NC_015214	CTT	2	6	1454249	1454254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957138
31013	NC_015214	GAA	2	6	1454316	1454321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957138
31014	NC_015214	GTT	2	6	1454327	1454332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957138
31015	NC_015214	AGT	2	6	1454333	1454338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957138
31016	NC_015214	GTT	2	6	1454378	1454383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957138
31017	NC_015214	GAA	2	6	1454413	1454418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957138
31018	NC_015214	TGT	2	6	1454593	1454598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957138
31019	NC_015214	TGA	2	6	1454609	1454614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957138
31020	NC_015214	TGGT	2	8	1454630	1454637	0 %	50 %	50 %	0 %	325957138
31021	NC_015214	ACC	2	6	1454696	1454701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957138
31022	NC_015214	TGT	2	6	1454707	1454712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957138
31023	NC_015214	AT	3	6	1454742	1454747	50 %	50 %	0 %	0 %	325957138
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31029	NC_015214	TCT	2	6	1455146	1455151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31031	NC_015214	A	6	6	1455168	1455173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_015214	TTG	2	6	1455187	1455192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31033	NC_015214	TTC	2	6	1455331	1455336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957139
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31036	NC_015214	CAT	2	6	1455418	1455423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957139
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31038	NC_015214	CTG	2	6	1455472	1455477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957139
31039	NC_015214	TCT	2	6	1455554	1455559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957139
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31041	NC_015214	CTTT	2	8	1455630	1455637	0 %	75 %	0 %	25 %	325957139
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31052	NC_015214	TTAAG	2	10	1456051	1456060	40 %	40 %	20 %	0 %	325957140
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31055	NC_015214	TTC	2	6	1456181	1456186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957140
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31059	NC_015214	TCA	2	6	1456389	1456394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957140
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31061	NC_015214	TAT	2	6	1456589	1456594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31062	NC_015214	TAAAA	2	10	1456625	1456634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31063	NC_015214	A	7	7	1456631	1456637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31064	NC_015214	T	7	7	1456641	1456647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31067	NC_015214	A	6	6	1456837	1456842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31068	NC_015214	ATTG	2	8	1456881	1456888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31069	NC_015214	T	7	7	1456895	1456901	0 %	100 %	0 %	0 %	325957141
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31084	NC_015214	AGTA	2	8	1457425	1457432	50 %	25 %	25 %	0 %	325957141
31085	NC_015214	CTT	2	6	1457475	1457480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957141
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31100	NC_015214	TG	3	6	1458539	1458544	0 %	50 %	50 %	0 %	325957142
31101	NC_015214	ATC	2	6	1458547	1458552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957142
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31109	NC_015214	GCTTA	2	10	1458945	1458954	20 %	40 %	20 %	20 %	325957142
31110	NC_015214	TAA	2	6	1458975	1458980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957142
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31114	NC_015214	T	6	6	1459148	1459153	0 %	100 %	0 %	0 %	325957142
31115	NC_015214	TC	3	6	1459171	1459176	0 %	50 %	0 %	50 %	325957142
31116	NC_015214	CAG	2	6	1459256	1459261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957142
31117	NC_015214	TGA	2	6	1459285	1459290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957142
31118	NC_015214	AAAAT	2	10	1459295	1459304	80 %	20 %	0 %	0 %	325957142
31119	NC_015214	TGA	2	6	1459411	1459416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957142
31120	NC_015214	ATTT	2	8	1459448	1459455	25 %	75 %	0 %	0 %	325957142
31121	NC_015214	TTC	2	6	1459470	1459475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957142
31122	NC_015214	TAA	2	6	1459563	1459568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957142
31123	NC_015214	CCA	2	6	1459613	1459618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957142
31124	NC_015214	AAATC	2	10	1459664	1459673	60 %	20 %	0 %	20 %	325957142
31125	NC_015214	CAT	2	6	1459694	1459699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957142
31126	NC_015214	ATC	2	6	1459714	1459719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957142
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31130	NC_015214	AATT	2	8	1459896	1459903	50 %	50 %	0 %	0 %	325957142
31131	NC_015214	AATA	2	8	1459905	1459912	75 %	25 %	0 %	0 %	325957142
31132	NC_015214	AAGT	2	8	1459957	1459964	50 %	25 %	25 %	0 %	325957142
31133	NC_015214	AGT	2	6	1459971	1459976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957142
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31137	NC_015214	TTA	2	6	1460070	1460075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31138	NC_015214	CATTCG	2	12	1460141	1460152	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31139	NC_015214	CAA	2	6	1460164	1460169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31141	NC_015214	A	6	6	1460229	1460234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31142	NC_015214	A	6	6	1460245	1460250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31143	NC_015214	TTAA	2	8	1460338	1460345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31144	NC_015214	ATC	2	6	1460351	1460356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31145	NC_015214	ATTTTT	2	12	1460378	1460389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	325957143
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31149	NC_015214	TTA	2	6	1460686	1460691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957143
31150	NC_015214	CTT	2	6	1460696	1460701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957143
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31156	NC_015214	A	6	6	1461210	1461215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31157	NC_015214	T	6	6	1461216	1461221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31162	NC_015214	ATT	2	6	1461621	1461626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31163	NC_015214	T	6	6	1461699	1461704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31164	NC_015214	AAG	2	6	1461732	1461737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31211	NC_015214	GCTT	2	8	1463882	1463889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31212	NC_015214	TGTC	2	8	1463900	1463907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31213	NC_015214	TCAA	2	8	1463986	1463993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31214	NC_015214	GA	3	6	1464035	1464040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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31229	NC_015214	A	8	8	1465360	1465367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31230	NC_015214	AAT	2	6	1465555	1465560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957149
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31233	NC_015214	TCA	2	6	1465791	1465796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957149
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31357	NC_015214	A	6	6	1472590	1472595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31360	NC_015214	GCT	2	6	1472813	1472818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957155
31361	NC_015214	GCC	2	6	1472904	1472909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957155
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31452	NC_015214	CCCGAT	2	12	1477125	1477136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325957159
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31459	NC_015214	GAT	2	6	1477405	1477410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957160
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31472	NC_015214	CGA	2	6	1478184	1478189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957160
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31474	NC_015214	AGA	2	6	1478202	1478207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957160
31475	NC_015214	GC	3	6	1478216	1478221	0 %	0 %	50 %	50 %	325957160
31476	NC_015214	ACT	2	6	1478252	1478257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957160
31477	NC_015214	TAAAT	2	10	1478265	1478274	60 %	40 %	0 %	0 %	325957160
31478	NC_015214	TCT	2	6	1478358	1478363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957161
31479	NC_015214	TCA	2	6	1478379	1478384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957161
31480	NC_015214	AAG	2	6	1478393	1478398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957161
31481	NC_015214	CA	3	6	1478450	1478455	50 %	0 %	0 %	50 %	325957161
31482	NC_015214	AG	3	6	1478629	1478634	50 %	0 %	50 %	0 %	325957161
31483	NC_015214	GCC	2	6	1478725	1478730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957161
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31491	NC_015214	TGC	2	6	1479013	1479018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957161
31492	NC_015214	CA	3	6	1479106	1479111	50 %	0 %	0 %	50 %	325957161
31493	NC_015214	GCGACT	2	12	1479140	1479151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325957161
31494	NC_015214	TCC	2	6	1479182	1479187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31495	NC_015214	A	7	7	1479361	1479367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31497	NC_015214	T	6	6	1479420	1479425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31498	NC_015214	T	7	7	1479434	1479440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31499	NC_015214	T	6	6	1479473	1479478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31500	NC_015214	GTTAT	2	10	1479541	1479550	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

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