MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26005	NC_015214	AT	3	6	1218700	1218705	50 %	50 %	0 %	0 %	325956895
26006	NC_015214	ATA	2	6	1218725	1218730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956895
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26009	NC_015214	ATT	2	6	1218870	1218875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956895
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26011	NC_015214	TCTT	2	8	1218907	1218914	0 %	75 %	0 %	25 %	325956895
26012	NC_015214	ATC	2	6	1218915	1218920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956895
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26014	NC_015214	AT	3	6	1218943	1218948	50 %	50 %	0 %	0 %	325956895
26015	NC_015214	CAT	2	6	1218959	1218964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956895
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26116	NC_015214	T	6	6	1224411	1224416	0 %	100 %	0 %	0 %	325956899
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26236	NC_015214	A	6	6	1230102	1230107	100 %	0 %	0 %	0 %	325956900
26237	NC_015214	CTG	2	6	1230137	1230142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956900
26238	NC_015214	CAA	2	6	1230157	1230162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956900
26239	NC_015214	TTG	2	6	1230268	1230273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956900
26240	NC_015214	TCTT	2	8	1230317	1230324	0 %	75 %	0 %	25 %	325956900
26241	NC_015214	CTG	2	6	1230353	1230358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956900
26242	NC_015214	TAGTCG	2	12	1230366	1230377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325956900
26243	NC_015214	TGAACT	2	12	1230558	1230569	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325956900
26244	NC_015214	TAA	2	6	1230604	1230609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956900
26245	NC_015214	AAT	2	6	1230620	1230625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956900
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26247	NC_015214	CAT	2	6	1230700	1230705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956900
26248	NC_015214	ATTA	2	8	1230734	1230741	50 %	50 %	0 %	0 %	325956900
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26250	NC_015214	CAT	2	6	1230823	1230828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956900
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26253	NC_015214	AAAG	2	8	1230888	1230895	75 %	0 %	25 %	0 %	325956900
26254	NC_015214	TTA	2	6	1230948	1230953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956900
26255	NC_015214	TGC	2	6	1231020	1231025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956900
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26258	NC_015214	CAA	2	6	1231134	1231139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26259	NC_015214	TTA	2	6	1231151	1231156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26260	NC_015214	GAT	2	6	1231171	1231176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26262	NC_015214	T	6	6	1231194	1231199	0 %	100 %	0 %	0 %	325956901
26263	NC_015214	ATT	3	9	1231216	1231224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956901
26264	NC_015214	ATG	2	6	1231250	1231255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956901
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26282	NC_015214	TCA	2	6	1232649	1232654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956902
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26289	NC_015214	AGTG	2	8	1233014	1233021	25 %	25 %	50 %	0 %	325956902
26290	NC_015214	TAGA	2	8	1233073	1233080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26291	NC_015214	TA	3	6	1233127	1233132	50 %	50 %	0 %	0 %	325956903
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26293	NC_015214	TAG	2	6	1233178	1233183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956903
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26302	NC_015214	TGA	2	6	1233748	1233753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956903
26303	NC_015214	TGA	2	6	1233794	1233799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956903
26304	NC_015214	GCT	2	6	1233816	1233821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956903
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26318	NC_015214	CAATG	2	10	1234379	1234388	40 %	20 %	20 %	20 %	325956904
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26325	NC_015214	ATT	3	9	1234734	1234742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956904
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26331	NC_015214	GTT	2	6	1234908	1234913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956904
26332	NC_015214	A	6	6	1234929	1234934	100 %	0 %	0 %	0 %	325956904
26333	NC_015214	TGG	2	6	1234958	1234963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956904
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26335	NC_015214	TCAAA	2	10	1235153	1235162	60 %	20 %	0 %	20 %	325956904
26336	NC_015214	TAT	2	6	1235166	1235171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956904
26337	NC_015214	AAATC	2	10	1235186	1235195	60 %	20 %	0 %	20 %	325956904
26338	NC_015214	TCA	2	6	1235262	1235267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956905
26339	NC_015214	AAAG	2	8	1235284	1235291	75 %	0 %	25 %	0 %	325956905
26340	NC_015214	CAT	2	6	1235427	1235432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956906
26341	NC_015214	GAA	2	6	1235436	1235441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956906
26342	NC_015214	AAC	2	6	1235486	1235491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956906
26343	NC_015214	GAA	2	6	1235590	1235595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956906
26344	NC_015214	AT	3	6	1235664	1235669	50 %	50 %	0 %	0 %	325956906
26345	NC_015214	TAAT	3	12	1235779	1235790	50 %	50 %	0 %	0 %	325956906
26346	NC_015214	TATTT	2	10	1235825	1235834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26347	NC_015214	AAT	2	6	1235913	1235918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956907
26348	NC_015214	CTT	2	6	1235939	1235944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956907
26349	NC_015214	CATCT	2	10	1236177	1236186	20 %	40 %	0 %	40 %	325956907
26350	NC_015214	TCA	2	6	1236229	1236234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956907
26351	NC_015214	CTT	2	6	1236267	1236272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956907
26352	NC_015214	ACTA	2	8	1236318	1236325	50 %	25 %	0 %	25 %	325956907
26353	NC_015214	TCA	2	6	1236388	1236393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956907
26354	NC_015214	ATCA	2	8	1236468	1236475	50 %	25 %	0 %	25 %	325956907
26355	NC_015214	TCA	2	6	1236491	1236496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956907
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26359	NC_015214	AATT	2	8	1236630	1236637	50 %	50 %	0 %	0 %	325956907
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26381	NC_015214	TCAT	2	8	1237926	1237933	25 %	50 %	0 %	25 %	325956908
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26456	NC_015214	A	7	7	1241871	1241877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26457	NC_015214	CAAT	2	8	1241879	1241886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26458	NC_015214	CT	4	8	1241896	1241903	0 %	50 %	0 %	50 %	325956913
26459	NC_015214	AACA	2	8	1241939	1241946	75 %	0 %	0 %	25 %	325956913
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26465	NC_015214	TAC	2	6	1242218	1242223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956913
26466	NC_015214	CA	3	6	1242311	1242316	50 %	0 %	0 %	50 %	325956913
26467	NC_015214	TAG	2	6	1242328	1242333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956913
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26471	NC_015214	TCTT	2	8	1242421	1242428	0 %	75 %	0 %	25 %	325956913
26472	NC_015214	CAG	2	6	1242436	1242441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956913
26473	NC_015214	AAAT	2	8	1242513	1242520	75 %	25 %	0 %	0 %	325956913
26474	NC_015214	AGC	2	6	1242527	1242532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956913
26475	NC_015214	AAAG	2	8	1242578	1242585	75 %	0 %	25 %	0 %	325956913
26476	NC_015214	GAAA	2	8	1242621	1242628	75 %	0 %	25 %	0 %	325956913
26477	NC_015214	AAAT	2	8	1242660	1242667	75 %	25 %	0 %	0 %	325956913
26478	NC_015214	AT	3	6	1242666	1242671	50 %	50 %	0 %	0 %	325956913
26479	NC_015214	TTTG	2	8	1242691	1242698	0 %	75 %	25 %	0 %	325956913
26480	NC_015214	TCAT	2	8	1242723	1242730	25 %	50 %	0 %	25 %	325956913
26481	NC_015214	AAG	2	6	1242776	1242781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956914
26482	NC_015214	TAA	2	6	1242787	1242792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956914
26483	NC_015214	AAAT	2	8	1242875	1242882	75 %	25 %	0 %	0 %	325956914
26484	NC_015214	GCAAT	2	10	1242919	1242928	40 %	20 %	20 %	20 %	325956914
26485	NC_015214	CAA	2	6	1242937	1242942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956914
26486	NC_015214	AGT	2	6	1242977	1242982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956914
26487	NC_015214	TTC	2	6	1243082	1243087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956914
26488	NC_015214	ATG	2	6	1243157	1243162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956914
26489	NC_015214	TAC	2	6	1243181	1243186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956914
26490	NC_015214	TAC	2	6	1243267	1243272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956914
26491	NC_015214	T	6	6	1243312	1243317	0 %	100 %	0 %	0 %	325956914
26492	NC_015214	A	6	6	1243358	1243363	100 %	0 %	0 %	0 %	325956914
26493	NC_015214	GTA	2	6	1243365	1243370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956914
26494	NC_015214	CAA	2	6	1243414	1243419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956914
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26496	NC_015214	ATTGCC	2	12	1243445	1243456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325956914
26497	NC_015214	TAAA	2	8	1243555	1243562	75 %	25 %	0 %	0 %	325956914
26498	NC_015214	CCT	2	6	1243585	1243590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325956915
26499	NC_015214	TAA	2	6	1243642	1243647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956915
26500	NC_015214	AAT	2	6	1243740	1243745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956915

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