MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_015214	ATC	2	6	608556	608561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956286
13003	NC_015214	CAA	2	6	608588	608593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956286
13004	NC_015214	T	6	6	608618	608623	0 %	100 %	0 %	0 %	325956286
13005	NC_015214	ATA	2	6	608650	608655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956286
13006	NC_015214	GCA	2	6	608679	608684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956286
13007	NC_015214	AATT	2	8	608734	608741	50 %	50 %	0 %	0 %	325956286
13008	NC_015214	CTA	2	6	608815	608820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956286
13009	NC_015214	CTTT	2	8	608890	608897	0 %	75 %	0 %	25 %	325956286
13010	NC_015214	GGT	2	6	608907	608912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956286
13011	NC_015214	CAT	2	6	608920	608925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956286
13012	NC_015214	TAT	2	6	609001	609006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956286
13013	NC_015214	AATC	2	8	609079	609086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13014	NC_015214	AAG	2	6	609156	609161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_015214	GAAG	2	8	609182	609189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_015214	AAG	2	6	609193	609198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_015214	ATT	2	6	609249	609254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_015214	GCA	2	6	609369	609374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956287
13019	NC_015214	GCC	2	6	609446	609451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956287
13020	NC_015214	TAT	2	6	609500	609505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956287
13021	NC_015214	TAC	2	6	609594	609599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956287
13022	NC_015214	TCT	2	6	609643	609648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956287
13023	NC_015214	AAG	2	6	609654	609659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956287
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13027	NC_015214	T	7	7	609733	609739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_015214	CGT	2	6	609795	609800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956288
13029	NC_015214	GAT	2	6	609820	609825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956288
13030	NC_015214	GAC	2	6	609942	609947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956288
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13032	NC_015214	TAAA	2	8	610017	610024	75 %	25 %	0 %	0 %	325956288
13033	NC_015214	AAT	3	9	610042	610050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956288
13034	NC_015214	CTT	2	6	610082	610087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956288
13035	NC_015214	GTA	2	6	610240	610245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956288
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13037	NC_015214	ACC	2	6	610339	610344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956288
13038	NC_015214	ATA	2	6	610355	610360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956288
13039	NC_015214	CAT	2	6	610408	610413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_015214	ATTC	2	8	610470	610477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_015214	TTGC	2	8	610493	610500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13042	NC_015214	T	6	6	610501	610506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_015214	AGA	2	6	610556	610561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_015214	ATT	2	6	610618	610623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_015214	AGC	2	6	610637	610642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_015214	TAG	2	6	610664	610669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_015214	GAG	2	6	610723	610728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_015214	GGT	2	6	610752	610757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_015214	T	8	8	610797	610804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_015214	A	6	6	610811	610816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_015214	AGAA	2	8	610884	610891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_015214	AAC	2	6	610914	610919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_015214	A	7	7	610974	610980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_015214	AAT	2	6	610986	610991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_015214	ATT	2	6	610992	610997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_015214	A	6	6	611001	611006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_015214	GGA	2	6	611008	611013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_015214	ATT	2	6	611035	611040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956289
13059	NC_015214	TAC	2	6	611062	611067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956289
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13061	NC_015214	ATT	2	6	611128	611133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956289
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13063	NC_015214	ACA	2	6	611300	611305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956289
13064	NC_015214	GCTC	2	8	611331	611338	0 %	25 %	25 %	50 %	325956289
13065	NC_015214	GGT	2	6	611449	611454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956289
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13070	NC_015214	TCT	2	6	611654	611659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956289
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13074	NC_015214	GC	3	6	611771	611776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13075	NC_015214	A	6	6	611781	611786	100 %	0 %	0 %	0 %	325956290
13076	NC_015214	TTTCT	2	10	611796	611805	0 %	80 %	0 %	20 %	325956290
13077	NC_015214	TGC	2	6	611818	611823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956290
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13079	NC_015214	CAGC	2	8	612025	612032	25 %	0 %	25 %	50 %	325956290
13080	NC_015214	TAC	3	9	612038	612046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956290
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13090	NC_015214	GCTT	2	8	612373	612380	0 %	50 %	25 %	25 %	325956290
13091	NC_015214	AAG	2	6	612543	612548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956290
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13096	NC_015214	TTC	2	6	612701	612706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956291
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13100	NC_015214	TA	3	6	612876	612881	50 %	50 %	0 %	0 %	325956291
13101	NC_015214	GCAA	2	8	612976	612983	50 %	0 %	25 %	25 %	325956291
13102	NC_015214	CGTTA	2	10	612986	612995	20 %	40 %	20 %	20 %	325956291
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13106	NC_015214	CTAA	2	8	613230	613237	50 %	25 %	0 %	25 %	325956291
13107	NC_015214	AGGG	2	8	613239	613246	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_015214	CTT	2	6	613296	613301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956292
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13112	NC_015214	ACG	2	6	613519	613524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956292
13113	NC_015214	TCGT	2	8	613574	613581	0 %	50 %	25 %	25 %	325956292
13114	NC_015214	CAA	2	6	613745	613750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956292
13115	NC_015214	CTT	2	6	613768	613773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956292
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13117	NC_015214	ACTT	2	8	613807	613814	25 %	50 %	0 %	25 %	325956292
13118	NC_015214	TCTGCT	2	12	613856	613867	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325956292
13119	NC_015214	ACT	2	6	613883	613888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956292
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13121	NC_015214	A	6	6	613929	613934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_015214	CTA	2	6	613945	613950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_015214	TGG	2	6	613951	613956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_015214	T	7	7	613966	613972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_015214	ACCG	2	8	614009	614016	25 %	0 %	25 %	50 %	325956293
13126	NC_015214	GTT	2	6	614099	614104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956293
13127	NC_015214	A	6	6	614198	614203	100 %	0 %	0 %	0 %	325956293
13128	NC_015214	TGA	2	6	614224	614229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956293
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13130	NC_015214	TGGT	2	8	614580	614587	0 %	50 %	50 %	0 %	325956293
13131	NC_015214	AGC	2	6	614628	614633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956293
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13133	NC_015214	GCT	2	6	614728	614733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956293
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13137	NC_015214	GAAT	2	8	614878	614885	50 %	25 %	25 %	0 %	325956293
13138	NC_015214	AGC	2	6	614922	614927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956294
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13140	NC_015214	TGAT	2	8	614951	614958	25 %	50 %	25 %	0 %	325956294
13141	NC_015214	TTC	2	6	614995	615000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956294
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13143	NC_015214	TGA	2	6	615051	615056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956294
13144	NC_015214	T	6	6	615068	615073	0 %	100 %	0 %	0 %	325956294
13145	NC_015214	ATG	2	6	615083	615088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956294
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13148	NC_015214	TGG	2	6	615182	615187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956294
13149	NC_015214	GAG	2	6	615220	615225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325956294
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13152	NC_015214	AAT	2	6	615351	615356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13153	NC_015214	AAT	2	6	615392	615397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13154	NC_015214	AAT	2	6	615425	615430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13155	NC_015214	A	6	6	615456	615461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13156	NC_015214	ATCT	2	8	615501	615508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13157	NC_015214	AAG	2	6	615520	615525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956295
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13159	NC_015214	AAG	2	6	615654	615659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956295
13160	NC_015214	TTG	2	6	615713	615718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956295
13161	NC_015214	AGC	2	6	615737	615742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956295
13162	NC_015214	TTTGC	2	10	615766	615775	0 %	60 %	20 %	20 %	325956295
13163	NC_015214	TGA	2	6	615788	615793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956295
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13172	NC_015214	CAT	2	6	616151	616156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956295
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13180	NC_015214	AGTTA	2	10	616433	616442	40 %	40 %	20 %	0 %	325956295
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13187	NC_015214	AGT	2	6	616676	616681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956295
13188	NC_015214	CTT	2	6	616682	616687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956295
13189	NC_015214	TAG	2	6	616696	616701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956295
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13192	NC_015214	TGC	3	9	616772	616780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956295
13193	NC_015214	T	7	7	616816	616822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13194	NC_015214	TTTC	2	8	616834	616841	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13195	NC_015214	TAATA	2	10	616891	616900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13196	NC_015214	ATA	2	6	616912	616917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13197	NC_015214	TAG	2	6	616944	616949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13198	NC_015214	GTAAGC	2	12	617008	617019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325956296
13199	NC_015214	GACTAC	2	12	617025	617036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325956296
13200	NC_015214	GCTG	2	8	617061	617068	0 %	25 %	50 %	25 %	325956296
13201	NC_015214	ACC	2	6	617191	617196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956296
13202	NC_015214	TGA	2	6	617239	617244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956296
13203	NC_015214	GT	3	6	617296	617301	0 %	50 %	50 %	0 %	325956296
13204	NC_015214	CA	3	6	617350	617355	50 %	0 %	0 %	50 %	325956296
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13213	NC_015214	A	6	6	617781	617786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13214	NC_015214	T	7	7	617809	617815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13215	NC_015214	AAG	2	6	617847	617852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13216	NC_015214	GAA	2	6	617863	617868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956297
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13220	NC_015214	ACTT	2	8	618023	618030	25 %	50 %	0 %	25 %	325956297
13221	NC_015214	TGG	2	6	618058	618063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956297
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13226	NC_015214	TAC	2	6	618295	618300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956297
13227	NC_015214	AGGC	2	8	618324	618331	25 %	0 %	50 %	25 %	325956297
13228	NC_015214	TCCTGC	2	12	618349	618360	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325956297
13229	NC_015214	CAG	2	6	618375	618380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956297
13230	NC_015214	ATC	2	6	618401	618406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956297
13231	NC_015214	CTA	2	6	618471	618476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956297
13232	NC_015214	CTTG	2	8	618493	618500	0 %	50 %	25 %	25 %	325956297
13233	NC_015214	ATT	2	6	618515	618520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956297
13234	NC_015214	AT	3	6	618541	618546	50 %	50 %	0 %	0 %	325956297
13235	NC_015214	TAC	2	6	618601	618606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956297
13236	NC_015214	GAA	2	6	618671	618676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956297
13237	NC_015214	GCT	2	6	618677	618682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956297
13238	NC_015214	TCA	2	6	618701	618706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956297
13239	NC_015214	AAG	2	6	618753	618758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956297
13240	NC_015214	AGCA	2	8	618762	618769	50 %	0 %	25 %	25 %	325956297
13241	NC_015214	GGA	2	6	618772	618777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325956297
13242	NC_015214	AAT	2	6	618783	618788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956297
13243	NC_015214	A	6	6	618814	618819	100 %	0 %	0 %	0 %	325956298
13244	NC_015214	AGC	2	6	618834	618839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956298
13245	NC_015214	GAT	2	6	618858	618863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956298
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13253	NC_015214	GGAT	2	8	619277	619284	25 %	25 %	50 %	0 %	325956298
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13261	NC_015214	T	6	6	619526	619531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13262	NC_015214	AT	3	6	619549	619554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13263	NC_015214	ATTA	2	8	619573	619580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13264	NC_015214	ATTTT	2	10	619596	619605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13338	NC_015214	T	6	6	623441	623446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13357	NC_015214	TATT	2	8	624305	624312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_015214	TAT	2	6	624316	624321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13359	NC_015214	T	7	7	624368	624374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13488	NC_015214	GA	3	6	630049	630054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13489	NC_015214	TCGA	2	8	630095	630102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13490	NC_015214	GAG	2	6	630110	630115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13491	NC_015214	GTT	2	6	630150	630155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13492	NC_015214	AACT	2	8	630170	630177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13493	NC_015214	ATTT	2	8	630223	630230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_015214	TTTC	2	8	630233	630240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13495	NC_015214	ATT	2	6	630253	630258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_015214	ATG	2	6	630259	630264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956308
13497	NC_015214	TGG	2	6	630429	630434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956308
13498	NC_015214	AAG	2	6	630452	630457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956308
13499	NC_015214	CAA	2	6	630495	630500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956308
13500	NC_015214	AGC	2	6	630513	630518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956308

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