MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015214	AC	3	6	537982	537987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11502	NC_015214	A	6	6	537999	538004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_015214	AAC	2	6	538026	538031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_015214	GGC	2	6	538076	538081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_015214	T	6	6	538088	538093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_015214	GTT	2	6	538200	538205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_015214	AGC	2	6	538321	538326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_015214	TGA	2	6	538362	538367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_015214	CAA	2	6	538374	538379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_015214	TGA	2	6	538539	538544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_015214	GT	3	6	538548	538553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_015214	GTG	2	6	538589	538594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_015214	TCA	2	6	538633	538638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_015214	ACG	2	6	538649	538654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_015214	A	6	6	538724	538729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_015214	ATG	2	6	538758	538763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_015214	GAT	2	6	538847	538852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_015214	GCG	2	6	538923	538928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_015214	AAGG	2	8	538973	538980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_015214	TTAA	2	8	539020	539027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_015214	TGA	2	6	539043	539048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_015214	T	7	7	539057	539063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_015214	A	6	6	539069	539074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_015214	T	6	6	539112	539117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_015214	TAG	2	6	539135	539140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_015214	GAA	2	6	539194	539199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_015214	TA	3	6	539213	539218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_015214	CAA	2	6	539296	539301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956224
11529	NC_015214	TGC	2	6	539331	539336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956224
11530	NC_015214	CTA	2	6	539441	539446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956224
11531	NC_015214	ATG	2	6	539459	539464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956224
11532	NC_015214	AGA	2	6	539472	539477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956224
11533	NC_015214	GAT	2	6	539503	539508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956224
11534	NC_015214	GCT	2	6	539512	539517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956224
11535	NC_015214	GAA	2	6	539536	539541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956224
11536	NC_015214	GCT	2	6	539599	539604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956224
11537	NC_015214	CAAG	2	8	539607	539614	50 %	0 %	25 %	25 %	325956224
11538	NC_015214	CTGTAA	2	12	539633	539644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325956224
11539	NC_015214	CAG	2	6	539711	539716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956224
11540	NC_015214	TAC	2	6	539727	539732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956224
11541	NC_015214	AGC	2	6	539736	539741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956224
11542	NC_015214	CTA	2	6	539768	539773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956224
11543	NC_015214	AGA	2	6	539835	539840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956224
11544	NC_015214	GAC	2	6	539874	539879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956224
11545	NC_015214	CAA	2	6	539912	539917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956225
11546	NC_015214	TAC	2	6	539930	539935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956225
11547	NC_015214	TAAC	2	8	540049	540056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11548	NC_015214	ACA	2	6	540142	540147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956226
11549	NC_015214	GAT	2	6	540219	540224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956226
11550	NC_015214	TAA	2	6	540293	540298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956226
11551	NC_015214	A	6	6	540427	540432	100 %	0 %	0 %	0 %	325956226
11552	NC_015214	AAG	2	6	540669	540674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956226
11553	NC_015214	TGA	2	6	540728	540733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956226
11554	NC_015214	AGT	2	6	540804	540809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956226
11555	NC_015214	TAA	2	6	540884	540889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956226
11556	NC_015214	ATG	2	6	540927	540932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956226
11557	NC_015214	TGC	2	6	541082	541087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956226
11558	NC_015214	TGA	2	6	541150	541155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_015214	GTG	2	6	541227	541232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956227
11560	NC_015214	TTG	2	6	541347	541352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956227
11561	NC_015214	ACA	2	6	541390	541395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956227
11562	NC_015214	ATG	2	6	541416	541421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956227
11563	NC_015214	GTC	2	6	541428	541433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956227
11564	NC_015214	CAA	2	6	541456	541461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956227
11565	NC_015214	GCA	2	6	541464	541469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956227
11566	NC_015214	ACA	2	6	541472	541477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956227
11567	NC_015214	GCT	2	6	541511	541516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956227
11568	NC_015214	TGT	2	6	541558	541563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956227
11569	NC_015214	CAAC	2	8	541688	541695	50 %	0 %	0 %	50 %	325956227
11570	NC_015214	CAAG	2	8	541710	541717	50 %	0 %	25 %	25 %	325956227
11571	NC_015214	GCCAA	2	10	541721	541730	40 %	0 %	20 %	40 %	325956227
11572	NC_015214	AC	3	6	541747	541752	50 %	0 %	0 %	50 %	325956227
11573	NC_015214	AAG	2	6	541772	541777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956227
11574	NC_015214	TTACAA	2	12	541786	541797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325956227
11575	NC_015214	ACAA	2	8	541850	541857	75 %	0 %	0 %	25 %	325956227
11576	NC_015214	AGC	2	6	541900	541905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956227
11577	NC_015214	CTCGGC	2	12	542057	542068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325956227
11578	NC_015214	CGC	2	6	542080	542085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956227
11579	NC_015214	ATC	2	6	542087	542092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956227
11580	NC_015214	AGA	2	6	542114	542119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956227
11581	NC_015214	G	7	7	542179	542185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_015214	T	6	6	542211	542216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_015214	A	6	6	542223	542228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_015214	TAAA	2	8	542255	542262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_015214	TTAAG	2	10	542287	542296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_015214	T	6	6	542349	542354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_015214	TAAAA	2	10	542360	542369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_015214	TAT	2	6	542486	542491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956228
11589	NC_015214	ACA	2	6	542506	542511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956228
11590	NC_015214	TGATT	2	10	542570	542579	20 %	60 %	20 %	0 %	325956228
11591	NC_015214	AAC	2	6	542674	542679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956228
11592	NC_015214	AAT	2	6	542739	542744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956228
11593	NC_015214	ATT	2	6	542753	542758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956228
11594	NC_015214	GTT	2	6	542775	542780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956228
11595	NC_015214	AT	3	6	542856	542861	50 %	50 %	0 %	0 %	325956228
11596	NC_015214	ATG	2	6	542887	542892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956228
11597	NC_015214	A	6	6	542935	542940	100 %	0 %	0 %	0 %	325956228
11598	NC_015214	CAA	2	6	542985	542990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956228
11599	NC_015214	TTTAA	2	10	543033	543042	40 %	60 %	0 %	0 %	325956228
11600	NC_015214	ATT	3	9	543178	543186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956228
11601	NC_015214	TTC	2	6	543214	543219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956228
11602	NC_015214	TTC	2	6	543226	543231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956228
11603	NC_015214	GTTC	2	8	543255	543262	0 %	50 %	25 %	25 %	325956228
11604	NC_015214	A	6	6	543263	543268	100 %	0 %	0 %	0 %	325956228
11605	NC_015214	TG	3	6	543301	543306	0 %	50 %	50 %	0 %	325956228
11606	NC_015214	AATC	2	8	543335	543342	50 %	25 %	0 %	25 %	325956228
11607	NC_015214	TCA	2	6	543373	543378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956228
11608	NC_015214	CTAG	2	8	543405	543412	25 %	25 %	25 %	25 %	325956228
11609	NC_015214	ATC	2	6	543427	543432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956228
11610	NC_015214	CTT	2	6	543451	543456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956228
11611	NC_015214	A	6	6	543501	543506	100 %	0 %	0 %	0 %	325956228
11612	NC_015214	AAT	2	6	543569	543574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956228
11613	NC_015214	ATATCA	2	12	543605	543616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325956228
11614	NC_015214	TGT	2	6	543636	543641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956228
11615	NC_015214	CGA	2	6	543648	543653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956228
11616	NC_015214	CA	3	6	543689	543694	50 %	0 %	0 %	50 %	325956228
11617	NC_015214	CTG	2	6	543699	543704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956228
11618	NC_015214	TTTA	2	8	543715	543722	25 %	75 %	0 %	0 %	325956228
11619	NC_015214	GAA	2	6	543739	543744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956228
11620	NC_015214	TAG	2	6	543772	543777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956228
11621	NC_015214	AGC	2	6	543797	543802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956228
11622	NC_015214	A	7	7	543850	543856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_015214	AATAA	2	10	543868	543877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_015214	TCA	2	6	543901	543906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_015214	CTTAA	2	10	543920	543929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11626	NC_015214	TTTTTA	2	12	543955	543966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_015214	GTG	2	6	544044	544049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956229
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11632	NC_015214	GTG	2	6	544249	544254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956229
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11634	NC_015214	TCA	2	6	544303	544308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956229
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11646	NC_015214	CTG	2	6	544941	544946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956229
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11650	NC_015214	GTT	2	6	545202	545207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11651	NC_015214	AAT	2	6	545215	545220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11652	NC_015214	ATCG	2	8	545283	545290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11653	NC_015214	GAA	3	9	545329	545337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956230
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11685	NC_015214	AAC	2	6	546868	546873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11686	NC_015214	T	7	7	546900	546906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11687	NC_015214	TTGA	2	8	546917	546924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11725	NC_015214	ATCA	2	8	548499	548506	50 %	25 %	0 %	25 %	325956232
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11731	NC_015214	T	6	6	548763	548768	0 %	100 %	0 %	0 %	325956232
11732	NC_015214	GCC	2	6	548851	548856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956233
11733	NC_015214	GCA	2	6	548892	548897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956233
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11736	NC_015214	AACA	2	8	548995	549002	75 %	0 %	0 %	25 %	325956233
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